MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pantoea sp. At-9b plasmid pPAT9B03

Total Repeats: 6618

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_014840	AAC	2	6	316207	316212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317053474
6502	NC_014840	CCA	2	6	316265	316270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317053474
6503	NC_014840	GCAG	2	8	316331	316338	25 %	0 %	50 %	25 %	317053474
6504	NC_014840	AAG	2	6	316390	316395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317053474
6505	NC_014840	GCC	2	6	316420	316425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317053474
6506	NC_014840	GC	3	6	316428	316433	0 %	0 %	50 %	50 %	317053474
6507	NC_014840	GGCA	2	8	316498	316505	25 %	0 %	50 %	25 %	317053474
6508	NC_014840	GCC	2	6	316611	316616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317053475
6509	NC_014840	GCCCC	2	10	316664	316673	0 %	0 %	20 %	80 %	317053475
6510	NC_014840	GT	3	6	316683	316688	0 %	50 %	50 %	0 %	317053475
6511	NC_014840	CAT	2	6	316780	316785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317053475
6512	NC_014840	CGGG	2	8	316806	316813	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6513	NC_014840	GGT	2	6	316945	316950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317053476
6514	NC_014840	TGG	2	6	316964	316969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317053476
6515	NC_014840	CTTT	2	8	317141	317148	0 %	75 %	0 %	25 %	317053476
6516	NC_014840	TGC	2	6	317199	317204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053476
6517	NC_014840	CAC	2	6	317218	317223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317053476
6518	NC_014840	CAG	2	6	317245	317250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053476
6519	NC_014840	T	6	6	317299	317304	0 %	100 %	0 %	0 %	317053476
6520	NC_014840	CAT	2	6	317332	317337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317053476
6521	NC_014840	CCA	2	6	317340	317345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317053476
6522	NC_014840	TCA	2	6	317406	317411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317053476
6523	NC_014840	GGTT	2	8	317462	317469	0 %	50 %	50 %	0 %	317053476
6524	NC_014840	CAC	2	6	317482	317487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317053476
6525	NC_014840	T	6	6	317488	317493	0 %	100 %	0 %	0 %	317053476
6526	NC_014840	GCA	2	6	317517	317522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053476
6527	NC_014840	CTG	2	6	317560	317565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053476
6528	NC_014840	TG	3	6	317564	317569	0 %	50 %	50 %	0 %	317053476
6529	NC_014840	CAG	2	6	317635	317640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053476
6530	NC_014840	CAT	2	6	317665	317670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317053476
6531	NC_014840	TCTT	2	8	317876	317883	0 %	75 %	0 %	25 %	317053476
6532	NC_014840	ATC	2	6	317908	317913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317053476
6533	NC_014840	GGT	2	6	317935	317940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317053476
6534	NC_014840	GAT	2	6	317950	317955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317053476
6535	NC_014840	TGT	2	6	318000	318005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317053476
6536	NC_014840	GCC	2	6	318010	318015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317053476
6537	NC_014840	CCG	2	6	318021	318026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317053476
6538	NC_014840	CA	3	6	318103	318108	50 %	0 %	0 %	50 %	317053476
6539	NC_014840	GTAGG	2	10	318127	318136	20 %	20 %	60 %	0 %	317053476
6540	NC_014840	GAGCA	2	10	318155	318164	40 %	0 %	40 %	20 %	317053476
6541	NC_014840	GTG	2	6	318245	318250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317053476
6542	NC_014840	CCT	2	6	318264	318269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317053476
6543	NC_014840	CTT	2	6	318291	318296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317053476
6544	NC_014840	TCC	2	6	318395	318400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6545	NC_014840	ATT	2	6	318488	318493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317053477
6546	NC_014840	CATATC	2	12	318500	318511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317053477
6547	NC_014840	AGT	2	6	318556	318561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317053477
6548	NC_014840	TCT	2	6	318595	318600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317053477
6549	NC_014840	CTG	2	6	318678	318683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053477
6550	NC_014840	TCG	2	6	318687	318692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053477
6551	NC_014840	AAC	2	6	318693	318698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317053477
6552	NC_014840	CCT	2	6	318706	318711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317053477
6553	NC_014840	GTC	2	6	318737	318742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053477
6554	NC_014840	CGG	2	6	318763	318768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317053477
6555	NC_014840	GAT	2	6	318770	318775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317053477
6556	NC_014840	C	7	7	318824	318830	0 %	0 %	0 %	100 %	317053477
6557	NC_014840	AGC	2	6	318837	318842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053477
6558	NC_014840	GAT	2	6	318878	318883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317053477
6559	NC_014840	CGT	2	6	318886	318891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053477
6560	NC_014840	TCA	2	6	318942	318947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317053477
6561	NC_014840	AAG	2	6	318996	319001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317053477
6562	NC_014840	TCCA	2	8	319008	319015	25 %	25 %	0 %	50 %	317053477
6563	NC_014840	CCA	2	6	319114	319119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317053477
6564	NC_014840	ACC	2	6	319146	319151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317053477
6565	NC_014840	TCC	2	6	319164	319169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317053477
6566	NC_014840	CGC	2	6	319195	319200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317053477
6567	NC_014840	TGT	2	6	319204	319209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317053477
6568	NC_014840	AAT	2	6	319217	319222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317053477
6569	NC_014840	GTG	2	6	319239	319244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317053477
6570	NC_014840	CAT	2	6	319291	319296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317053477
6571	NC_014840	CGC	2	6	319327	319332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317053477
6572	NC_014840	CAC	2	6	319355	319360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317053477
6573	NC_014840	TTG	2	6	319365	319370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317053477
6574	NC_014840	TGC	2	6	319378	319383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053477
6575	NC_014840	CGG	2	6	319396	319401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317053477
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6577	NC_014840	TCC	2	6	319473	319478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317053477
6578	NC_014840	TCAA	2	8	319485	319492	50 %	25 %	0 %	25 %	317053477
6579	NC_014840	T	6	6	319502	319507	0 %	100 %	0 %	0 %	317053477
6580	NC_014840	ACC	2	6	319680	319685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317053477
6581	NC_014840	ACGG	2	8	319712	319719	25 %	0 %	50 %	25 %	317053477
6582	NC_014840	TCA	2	6	319720	319725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317053477
6583	NC_014840	GAT	2	6	319751	319756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317053477
6584	NC_014840	CAT	2	6	319793	319798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317053477
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6586	NC_014840	CCT	2	6	319846	319851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317053477
6587	NC_014840	CCG	2	6	319921	319926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317053478
6588	NC_014840	GAT	2	6	319937	319942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317053478
6589	NC_014840	AGC	2	6	319980	319985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053478
6590	NC_014840	GAC	2	6	320018	320023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053478
6591	NC_014840	GTT	2	6	320033	320038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317053478
6592	NC_014840	CGG	2	6	320112	320117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317053478
6593	NC_014840	ATC	2	6	320160	320165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317053478
6594	NC_014840	GAT	2	6	320192	320197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317053478
6595	NC_014840	TCT	2	6	320205	320210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317053478
6596	NC_014840	CGGT	2	8	320211	320218	0 %	25 %	50 %	25 %	317053478
6597	NC_014840	TTG	2	6	320295	320300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317053478
6598	NC_014840	CAT	2	6	320315	320320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317053478
6599	NC_014840	ACC	2	6	320381	320386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317053478
6600	NC_014840	AC	3	6	320387	320392	50 %	0 %	0 %	50 %	317053478
6601	NC_014840	CTT	3	9	320446	320454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317053478
6602	NC_014840	TGA	2	6	320473	320478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317053478
6603	NC_014840	GCC	2	6	320513	320518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317053478
6604	NC_014840	GCGCA	2	10	320526	320535	20 %	0 %	40 %	40 %	317053478
6605	NC_014840	GCA	2	6	320554	320559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053478
6606	NC_014840	TCC	2	6	320577	320582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317053478
6607	NC_014840	CAGCG	2	10	320705	320714	20 %	0 %	40 %	40 %	317053478
6608	NC_014840	AGT	2	6	320726	320731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317053478
6609	NC_014840	ACC	2	6	320747	320752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317053478
6610	NC_014840	TTGGT	2	10	320799	320808	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_014840	ATA	2	6	320859	320864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_014840	AT	3	6	320874	320879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_014840	CAGA	2	8	320903	320910	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6614	NC_014840	AGA	2	6	320915	320920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_014840	TTG	2	6	320938	320943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_014840	ACA	2	6	320947	320952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6617	NC_014840	GCTGT	2	10	321016	321025	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6618	NC_014840	A	7	7	321059	321065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.