MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pantoea sp. At-9b chromosome

Total Repeats: 95783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014837	TCT	2	6	154	159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014837	CGAT	2	8	162	169	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014837	CGG	2	6	170	175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014837	T	6	6	177	182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014837	CGCT	2	8	234	241	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014837	TC	3	6	322	327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014837	TGA	2	6	359	364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014837	A	6	6	432	437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014837	TTA	2	6	450	455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014837	CCG	2	6	493	498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317046239
11	NC_014837	GCT	2	6	680	685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046239
12	NC_014837	GAAT	2	8	686	693	50 %	25 %	25 %	0 %	317046239
13	NC_014837	TGCGG	2	10	696	705	0 %	20 %	60 %	20 %	317046239
14	NC_014837	TGC	2	6	715	720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046239
15	NC_014837	CCAG	2	8	760	767	25 %	0 %	25 %	50 %	317046239
16	NC_014837	GC	3	6	787	792	0 %	0 %	50 %	50 %	317046239
17	NC_014837	TCCGGC	2	12	812	823	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	317046239
18	NC_014837	TTG	2	6	916	921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317046239
19	NC_014837	GC	4	8	942	949	0 %	0 %	50 %	50 %	317046239
20	NC_014837	GGC	2	6	950	955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317046239
21	NC_014837	GTG	2	6	979	984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046239
22	NC_014837	GTT	2	6	995	1000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317046239
23	NC_014837	CAT	2	6	1058	1063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317046239
24	NC_014837	GC	3	6	1065	1070	0 %	0 %	50 %	50 %	317046239
25	NC_014837	GTG	2	6	1086	1091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046239
26	NC_014837	AAC	2	6	1140	1145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317046239
27	NC_014837	TTA	2	6	1166	1171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317046239
28	NC_014837	TTC	2	6	1209	1214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317046239
29	NC_014837	GAA	2	6	1236	1241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317046239
30	NC_014837	GCT	2	6	1262	1267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046239
31	NC_014837	ATC	2	6	1284	1289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317046239
32	NC_014837	GACT	2	8	1360	1367	25 %	25 %	25 %	25 %	317046239
33	NC_014837	GCC	2	6	1379	1384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317046239
34	NC_014837	CG	3	6	1396	1401	0 %	0 %	50 %	50 %	317046239
35	NC_014837	TGA	2	6	1411	1416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317046239
36	NC_014837	GCCAAC	2	12	1527	1538	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	317046239
37	NC_014837	CGTG	2	8	1568	1575	0 %	25 %	50 %	25 %	317046239
38	NC_014837	CTG	2	6	1590	1595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046239
39	NC_014837	CTG	2	6	1674	1679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046239
40	NC_014837	CACGTC	2	12	1705	1716	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	317046239
41	NC_014837	GATGGC	3	18	1718	1735	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	317046239
42	NC_014837	ACCA	2	8	1746	1753	50 %	0 %	0 %	50 %	317046239
43	NC_014837	TGG	2	6	1781	1786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046239
44	NC_014837	ACC	2	6	1797	1802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317046239
45	NC_014837	AGC	2	6	1828	1833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046239
46	NC_014837	AG	3	6	1841	1846	50 %	0 %	50 %	0 %	317046239
47	NC_014837	AGA	2	6	1859	1864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317046239
48	NC_014837	TTG	2	6	1913	1918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317046240
49	NC_014837	CAA	2	6	1945	1950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317046240
50	NC_014837	TGG	2	6	1965	1970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046240
51	NC_014837	TGC	3	9	2000	2008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046240
52	NC_014837	TGC	2	6	2027	2032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046240
53	NC_014837	TGGAAA	2	12	2048	2059	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	317046240
54	NC_014837	TGG	2	6	2060	2065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046240
55	NC_014837	CG	3	6	2066	2071	0 %	0 %	50 %	50 %	317046240
56	NC_014837	ACC	2	6	2104	2109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317046240
57	NC_014837	CTGC	2	8	2233	2240	0 %	25 %	25 %	50 %	317046240
58	NC_014837	TAC	2	6	2359	2364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317046240
59	NC_014837	GAA	2	6	2395	2400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317046240
60	NC_014837	CGG	2	6	2526	2531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317046240
61	NC_014837	AGC	2	6	2560	2565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046240
62	NC_014837	CGC	2	6	2635	2640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317046240
63	NC_014837	GAA	2	6	2649	2654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317046240
64	NC_014837	CG	3	6	2707	2712	0 %	0 %	50 %	50 %	317046240
65	NC_014837	CAA	2	6	2784	2789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317046240
66	NC_014837	GAA	2	6	2800	2805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317046240
67	NC_014837	CTG	3	9	2914	2922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046240
68	NC_014837	CGG	2	6	2969	2974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317046240
69	NC_014837	TGT	2	6	2979	2984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317046240
70	NC_014837	GGC	2	6	3004	3009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014837	CCT	2	6	3103	3108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317046241
72	NC_014837	TGC	2	6	3294	3299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046241
73	NC_014837	AGCG	2	8	3317	3324	25 %	0 %	50 %	25 %	317046241
74	NC_014837	GTT	2	6	3418	3423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317046241
75	NC_014837	TTTAC	2	10	3452	3461	20 %	60 %	0 %	20 %	317046241
76	NC_014837	CGG	2	6	3466	3471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317046241
77	NC_014837	GCT	2	6	3504	3509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046241
78	NC_014837	TGC	2	6	3514	3519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046241
79	NC_014837	T	6	6	3526	3531	0 %	100 %	0 %	0 %	317046241
80	NC_014837	AGC	2	6	3564	3569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046241
81	NC_014837	CGC	2	6	3574	3579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317046241
82	NC_014837	CTG	2	6	3785	3790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046241
83	NC_014837	CG	3	6	3812	3817	0 %	0 %	50 %	50 %	317046241
84	NC_014837	GCA	2	6	3960	3965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046241
85	NC_014837	CGT	2	6	3971	3976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046241
86	NC_014837	TGAT	2	8	3987	3994	25 %	50 %	25 %	0 %	317046241
87	NC_014837	CGC	2	6	4025	4030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317046241
88	NC_014837	CGCAGG	2	12	4056	4067	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	317046241
89	NC_014837	CTC	2	6	4209	4214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317046242
90	NC_014837	CGA	2	6	4335	4340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046242
91	NC_014837	GAT	2	6	4408	4413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317046242
92	NC_014837	CGA	2	6	4503	4508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046242
93	NC_014837	GGT	2	6	4528	4533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046242
94	NC_014837	TCG	2	6	4593	4598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046242
95	NC_014837	GGT	2	6	4656	4661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046242
96	NC_014837	CG	3	6	4685	4690	0 %	0 %	50 %	50 %	317046242
97	NC_014837	GT	3	6	4790	4795	0 %	50 %	50 %	0 %	317046242
98	NC_014837	TGA	2	6	4818	4823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317046242
99	NC_014837	A	6	6	4825	4830	100 %	0 %	0 %	0 %	317046242
100	NC_014837	TTG	2	6	4865	4870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317046242
101	NC_014837	CAA	2	6	4884	4889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317046242
102	NC_014837	CAA	2	6	5001	5006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317046242
103	NC_014837	TGG	2	6	5022	5027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046242
104	NC_014837	AAG	2	6	5087	5092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317046242
105	NC_014837	A	6	6	5101	5106	100 %	0 %	0 %	0 %	317046242
106	NC_014837	TGA	2	6	5127	5132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317046242
107	NC_014837	CG	3	6	5133	5138	0 %	0 %	50 %	50 %	317046242
108	NC_014837	CGG	2	6	5231	5236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317046242
109	NC_014837	CAG	2	6	5242	5247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046242
110	NC_014837	GAAC	2	8	5250	5257	50 %	0 %	25 %	25 %	317046242
111	NC_014837	CTG	2	6	5272	5277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046242
112	NC_014837	ATT	2	6	5314	5319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317046242
113	NC_014837	AGC	2	6	5340	5345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046242
114	NC_014837	TGG	2	6	5456	5461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046242
115	NC_014837	TTC	2	6	5577	5582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317046242
116	NC_014837	CAT	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317046242
117	NC_014837	CTG	2	6	5716	5721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046242
118	NC_014837	CTT	2	6	5727	5732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317046242
119	NC_014837	GCC	2	6	5784	5789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317046242
120	NC_014837	GAA	2	6	5802	5807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317046242
121	NC_014837	GAC	2	6	5833	5838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046242
122	NC_014837	GATCGC	2	12	5859	5870	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	317046242
123	NC_014837	TGG	2	6	5939	5944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046242
124	NC_014837	GCT	2	6	6003	6008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046242
125	NC_014837	GC	4	8	6009	6016	0 %	0 %	50 %	50 %	317046242
126	NC_014837	GGCT	2	8	6067	6074	0 %	25 %	50 %	25 %	317046242
127	NC_014837	TGG	2	6	6083	6088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046242
128	NC_014837	GCA	2	6	6116	6121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046242
129	NC_014837	TGC	2	6	6173	6178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046242
130	NC_014837	AGC	2	6	6269	6274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046242
131	NC_014837	GAA	2	6	6289	6294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317046242
132	NC_014837	CGT	2	6	6319	6324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046242
133	NC_014837	CTGG	2	8	6357	6364	0 %	25 %	50 %	25 %	317046242
134	NC_014837	CCG	2	6	6375	6380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317046242
135	NC_014837	GCC	2	6	6461	6466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317046242
136	NC_014837	GCC	2	6	6580	6585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317046242
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138	NC_014837	T	6	6	6661	6666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014837	A	6	6	6671	6676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014837	TTTG	2	8	6691	6698	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014837	T	6	6	6705	6710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_014837	CAA	2	6	11520	11525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317046247
250	NC_014837	TGA	2	6	11579	11584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317046247
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253	NC_014837	TCA	2	6	11684	11689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317046247
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255	NC_014837	CTTT	2	8	11747	11754	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
256	NC_014837	TC	3	6	11757	11762	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
257	NC_014837	CACC	2	8	11763	11770	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
258	NC_014837	GCG	2	6	11775	11780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_014837	CG	3	6	11789	11794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
260	NC_014837	CG	3	6	11811	11816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
261	NC_014837	AAC	2	6	11864	11869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317046248
262	NC_014837	TCA	3	9	11886	11894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317046248
263	NC_014837	TGGC	2	8	11932	11939	0 %	25 %	50 %	25 %	317046248
264	NC_014837	GCG	2	6	12005	12010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317046248
265	NC_014837	GCT	2	6	12018	12023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046248
266	NC_014837	TCA	2	6	12141	12146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317046248
267	NC_014837	GCA	2	6	12165	12170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046248
268	NC_014837	TGCGC	2	10	12225	12234	0 %	20 %	40 %	40 %	317046248
269	NC_014837	GTGA	2	8	12319	12326	25 %	25 %	50 %	0 %	317046248
270	NC_014837	ATT	2	6	12410	12415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317046248
271	NC_014837	CA	4	8	12430	12437	50 %	0 %	0 %	50 %	317046248
272	NC_014837	GAG	2	6	12481	12486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317046248
273	NC_014837	TGG	2	6	12602	12607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046248
274	NC_014837	GCA	2	6	12699	12704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046248
275	NC_014837	GCG	2	6	12705	12710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317046248
276	NC_014837	GCCAC	2	10	12741	12750	20 %	0 %	20 %	60 %	317046248
277	NC_014837	ACA	2	6	12800	12805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317046248
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279	NC_014837	CAC	2	6	12848	12853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317046248
280	NC_014837	CAG	2	6	12873	12878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046248
281	NC_014837	TCAG	2	8	12882	12889	25 %	25 %	25 %	25 %	317046248
282	NC_014837	TG	4	8	12927	12934	0 %	50 %	50 %	0 %	317046248
283	NC_014837	ACA	2	6	12935	12940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317046248
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287	NC_014837	GGC	2	6	13076	13081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317046248
288	NC_014837	CGG	2	6	13120	13125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317046249
289	NC_014837	GATT	2	8	13190	13197	25 %	50 %	25 %	0 %	317046249
290	NC_014837	TCG	2	6	13203	13208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046249
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296	NC_014837	GGT	2	6	13394	13399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046249
297	NC_014837	GCA	2	6	13406	13411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046249
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299	NC_014837	TCA	2	6	13450	13455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317046249
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301	NC_014837	CTGG	2	8	13484	13491	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
302	NC_014837	GT	3	6	13493	13498	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
303	NC_014837	AAT	2	6	13545	13550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_014837	TCA	2	6	13570	13575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
305	NC_014837	A	8	8	13615	13622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
306	NC_014837	GCT	2	6	13648	13653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
307	NC_014837	TC	4	8	13752	13759	0 %	50 %	0 %	50 %	317046250
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314	NC_014837	GC	3	6	13958	13963	0 %	0 %	50 %	50 %	317046250
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352	NC_014837	CTTC	2	8	15148	15155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
353	NC_014837	GCAT	2	8	15203	15210	25 %	25 %	25 %	25 %	317046252
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381	NC_014837	GTG	2	6	16617	16622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046254
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389	NC_014837	CAT	2	6	17111	17116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317046254
390	NC_014837	TGG	2	6	17250	17255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046255
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393	NC_014837	GCAG	2	8	17367	17374	25 %	0 %	50 %	25 %	317046255
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