MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus polymyxa SC2 chromosome

Total Repeats: 111263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014622	GGA	2	6	183870	183875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_014622	CGA	2	6	183894	183899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_014622	AAC	2	6	183911	183916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_014622	AAGC	2	8	183938	183945	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3505	NC_014622	ACT	2	6	183998	184003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_014622	GTGA	2	8	184018	184025	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_014622	GCG	2	6	184096	184101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_014622	AGT	2	6	184266	184271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_014622	AAG	2	6	184422	184427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_014622	AGA	2	6	184741	184746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_014622	AGTG	2	8	184844	184851	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_014622	GT	4	8	184906	184913	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_014622	AGC	2	6	184965	184970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_014622	AC	3	6	185039	185044	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3515	NC_014622	CCG	2	6	185185	185190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3516	NC_014622	ACA	2	6	185273	185278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_014622	ACC	2	6	185294	185299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3518	NC_014622	GATG	2	8	185350	185357	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_014622	GGCTG	2	10	185407	185416	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3520	NC_014622	GAGAA	2	10	185522	185531	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_014622	GC	3	6	185539	185544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3522	NC_014622	GAA	2	6	185546	185551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_014622	CGG	2	6	185785	185790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_014622	GA	3	6	185883	185888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_014622	ACC	2	6	186056	186061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3526	NC_014622	CCT	2	6	186143	186148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_014622	GGT	2	6	186279	186284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_014622	CGT	2	6	186474	186479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_014622	GAG	2	6	186523	186528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_014622	GTT	2	6	186577	186582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_014622	C	6	6	186650	186655	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3532	NC_014622	GAC	2	6	186693	186698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_014622	TAAGA	2	10	186773	186782	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_014622	GA	3	6	186907	186912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_014622	GTG	2	6	186963	186968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_014622	CT	4	8	186984	186991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3537	NC_014622	TTATG	2	10	187017	187026	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_014622	CCG	2	6	187091	187096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3539	NC_014622	CATA	2	8	187101	187108	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3540	NC_014622	AGG	2	6	187112	187117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_014622	CCA	2	6	187183	187188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3542	NC_014622	T	8	8	187269	187276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_014622	TGCC	2	8	187313	187320	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3544	NC_014622	T	7	7	187424	187430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_014622	CGG	2	6	187489	187494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_014622	GGA	2	6	187524	187529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_014622	GGT	2	6	187582	187587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_014622	CAT	2	6	187595	187600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_014622	CCA	2	6	187604	187609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3550	NC_014622	TCA	2	6	187687	187692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_014622	TCA	2	6	187697	187702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_014622	T	7	7	187719	187725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_014622	GTT	2	6	187728	187733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_014622	TA	3	6	187748	187753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_014622	TAA	2	6	187783	187788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_014622	A	7	7	187824	187830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_014622	GTG	2	6	187836	187841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_014622	ATG	2	6	187931	187936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639627
3559	NC_014622	AAAT	2	8	187990	187997	75 %	25 %	0 %	0 %	310639627
3560	NC_014622	GCT	2	6	188033	188038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639627
3561	NC_014622	CAG	2	6	188198	188203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639627
3562	NC_014622	AGA	2	6	188224	188229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639627
3563	NC_014622	CTG	2	6	188235	188240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639627
3564	NC_014622	TGC	2	6	188370	188375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639627
3565	NC_014622	TTA	2	6	188426	188431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639627
3566	NC_014622	CGA	2	6	188437	188442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639627
3567	NC_014622	GGA	2	6	188494	188499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639627
3568	NC_014622	GAAT	2	8	188542	188549	50 %	25 %	25 %	0 %	310639627
3569	NC_014622	TAT	2	6	188622	188627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639627
3570	NC_014622	CAT	2	6	188690	188695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639627
3571	NC_014622	GA	3	6	188699	188704	50 %	0 %	50 %	0 %	310639627
3572	NC_014622	AGC	2	6	188727	188732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639627
3573	NC_014622	T	6	6	188810	188815	0 %	100 %	0 %	0 %	310639627
3574	NC_014622	ATG	2	6	188931	188936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639627
3575	NC_014622	CTA	2	6	188957	188962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639627
3576	NC_014622	TGGC	2	8	189094	189101	0 %	25 %	50 %	25 %	310639628
3577	NC_014622	GTT	2	6	189153	189158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639628
3578	NC_014622	TTGG	2	8	189198	189205	0 %	50 %	50 %	0 %	310639628
3579	NC_014622	CTA	2	6	189226	189231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639628
3580	NC_014622	GGA	2	6	189254	189259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639628
3581	NC_014622	GAA	2	6	189420	189425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639628
3582	NC_014622	CTG	2	6	189474	189479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639628
3583	NC_014622	GTCAGC	2	12	189508	189519	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310639628
3584	NC_014622	TCT	2	6	189559	189564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639628
3585	NC_014622	GATG	2	8	189566	189573	25 %	25 %	50 %	0 %	310639628
3586	NC_014622	TGCG	2	8	189613	189620	0 %	25 %	50 %	25 %	310639628
3587	NC_014622	CAA	2	6	189735	189740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639628
3588	NC_014622	GCT	2	6	189741	189746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639628
3589	NC_014622	AAG	2	6	189844	189849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639628
3590	NC_014622	GCA	2	6	189864	189869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639628
3591	NC_014622	AAG	2	6	189937	189942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639628
3592	NC_014622	TGT	2	6	190060	190065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639628
3593	NC_014622	GTG	2	6	190072	190077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639628
3594	NC_014622	ACGAT	2	10	190084	190093	40 %	20 %	20 %	20 %	310639628
3595	NC_014622	GACG	2	8	190107	190114	25 %	0 %	50 %	25 %	310639628
3596	NC_014622	AG	3	6	190232	190237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_014622	GCATT	2	10	190301	190310	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3598	NC_014622	TGG	2	6	190391	190396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_014622	GGGATA	2	12	190417	190428	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_014622	TCAAG	2	10	190450	190459	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3601	NC_014622	TG	3	6	190482	190487	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_014622	AAT	2	6	190506	190511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_014622	GA	3	6	190559	190564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_014622	CAG	2	6	190603	190608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639629
3605	NC_014622	TGC	2	6	190766	190771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639629
3606	NC_014622	GAG	2	6	190777	190782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639629
3607	NC_014622	TAT	3	9	190827	190835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639629
3608	NC_014622	CGA	3	9	190916	190924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639629
3609	NC_014622	GAAA	2	8	190954	190961	75 %	0 %	25 %	0 %	310639629
3610	NC_014622	TG	3	6	190994	190999	0 %	50 %	50 %	0 %	310639629
3611	NC_014622	AGT	2	6	191032	191037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639629
3612	NC_014622	GAT	2	6	191098	191103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639629
3613	NC_014622	CGTGG	2	10	191182	191191	0 %	20 %	60 %	20 %	310639629
3614	NC_014622	ATT	2	6	191194	191199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639629
3615	NC_014622	TGA	2	6	191204	191209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639629
3616	NC_014622	TGGTGC	2	12	191217	191228	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	310639629
3617	NC_014622	TAA	3	9	191235	191243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639629
3618	NC_014622	GTCTCG	2	12	191300	191311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639629
3619	NC_014622	GAA	2	6	191314	191319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639629
3620	NC_014622	ATT	2	6	191329	191334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639629
3621	NC_014622	TTA	2	6	191390	191395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639629
3622	NC_014622	ACAA	2	8	191458	191465	75 %	0 %	0 %	25 %	310639629
3623	NC_014622	CGA	2	6	191474	191479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639629
3624	NC_014622	GTTC	2	8	191510	191517	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3625	NC_014622	GAA	2	6	191527	191532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_014622	GA	3	6	191541	191546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_014622	CTG	2	6	191570	191575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639630
3628	NC_014622	GGC	2	6	191638	191643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639630
3629	NC_014622	TGC	2	6	191715	191720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639630
3630	NC_014622	ATT	2	6	191741	191746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639630
3631	NC_014622	TATT	2	8	191755	191762	25 %	75 %	0 %	0 %	310639630
3632	NC_014622	CGG	2	6	191824	191829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639630
3633	NC_014622	AT	3	6	191837	191842	50 %	50 %	0 %	0 %	310639630
3634	NC_014622	TTAT	2	8	191874	191881	25 %	75 %	0 %	0 %	310639630
3635	NC_014622	TCAA	2	8	191976	191983	50 %	25 %	0 %	25 %	310639630
3636	NC_014622	T	6	6	192013	192018	0 %	100 %	0 %	0 %	310639630
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3640	NC_014622	TATGG	2	10	192301	192310	20 %	40 %	40 %	0 %	310639630
3641	NC_014622	TTGC	2	8	192368	192375	0 %	50 %	25 %	25 %	310639630
3642	NC_014622	TCA	2	6	192381	192386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639630
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3659	NC_014622	TAA	2	6	193813	193818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3660	NC_014622	ATA	2	6	193854	193859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3661	NC_014622	A	6	6	193901	193906	100 %	0 %	0 %	0 %	310639633
3662	NC_014622	ATTG	2	8	193984	193991	25 %	50 %	25 %	0 %	310639633
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3666	NC_014622	GTTTT	2	10	194079	194088	0 %	80 %	20 %	0 %	310639633
3667	NC_014622	T	6	6	194138	194143	0 %	100 %	0 %	0 %	310639633
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3682	NC_014622	TCT	2	6	194895	194900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639633
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3685	NC_014622	T	7	7	195085	195091	0 %	100 %	0 %	0 %	310639634
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3688	NC_014622	TAC	2	6	195418	195423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639635
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3729	NC_014622	GAC	2	6	197895	197900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639637
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3735	NC_014622	CAT	2	6	198269	198274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639637
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3738	NC_014622	TGA	2	6	198317	198322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639637
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3740	NC_014622	CTG	2	6	198366	198371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639637
3741	NC_014622	GA	3	6	198379	198384	50 %	0 %	50 %	0 %	310639637
3742	NC_014622	CACG	2	8	198423	198430	25 %	0 %	25 %	50 %	310639637
3743	NC_014622	GAA	2	6	198458	198463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639637
3744	NC_014622	ACGA	2	8	198529	198536	50 %	0 %	25 %	25 %	310639638
3745	NC_014622	ATC	2	6	198689	198694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639638
3746	NC_014622	TCTG	2	8	198716	198723	0 %	50 %	25 %	25 %	310639638
3747	NC_014622	A	6	6	198754	198759	100 %	0 %	0 %	0 %	310639638
3748	NC_014622	GATG	2	8	198792	198799	25 %	25 %	50 %	0 %	310639638
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3994	NC_014622	GCA	2	6	212040	212045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639652
3995	NC_014622	AAG	2	6	212086	212091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639652
3996	NC_014622	ACA	2	6	212116	212121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639652
3997	NC_014622	TCC	2	6	212139	212144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310639652
3998	NC_014622	GCA	2	6	212182	212187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639652
3999	NC_014622	CTG	2	6	212232	212237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639652
4000	NC_014622	CAGC	2	8	212396	212403	25 %	0 %	25 %	50 %	310639652

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