MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus polymyxa SC2 chromosome

Total Repeats: 111263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_014622	GCG	2	6	1272126	1272131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310640592
24502	NC_014622	TGAT	2	8	1272135	1272142	25 %	50 %	25 %	0 %	310640592
24503	NC_014622	CTG	2	6	1272173	1272178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640592
24504	NC_014622	GCAA	2	8	1272234	1272241	50 %	0 %	25 %	25 %	310640592
24505	NC_014622	CT	3	6	1272266	1272271	0 %	50 %	0 %	50 %	310640592
24506	NC_014622	GCT	2	6	1272283	1272288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640592
24507	NC_014622	GAT	2	6	1272323	1272328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640592
24508	NC_014622	A	6	6	1272362	1272367	100 %	0 %	0 %	0 %	310640592
24509	NC_014622	GGATC	2	10	1272496	1272505	20 %	20 %	40 %	20 %	310640592
24510	NC_014622	CAT	2	6	1272611	1272616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310640592
24511	NC_014622	GGAC	2	8	1272698	1272705	25 %	0 %	50 %	25 %	310640592
24512	NC_014622	AAC	2	6	1272788	1272793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310640592
24513	NC_014622	AAC	2	6	1272812	1272817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310640592
24514	NC_014622	GGA	2	6	1272835	1272840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310640592
24515	NC_014622	GAT	2	6	1272869	1272874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640592
24516	NC_014622	AGG	2	6	1272939	1272944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310640592
24517	NC_014622	GTC	2	6	1272947	1272952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640592
24518	NC_014622	A	7	7	1272968	1272974	100 %	0 %	0 %	0 %	310640592
24519	NC_014622	CAG	2	6	1273034	1273039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640592
24520	NC_014622	GTA	2	6	1273043	1273048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640592
24521	NC_014622	CCGGA	2	10	1273068	1273077	20 %	0 %	40 %	40 %	310640592
24522	NC_014622	CG	3	6	1273101	1273106	0 %	0 %	50 %	50 %	310640592
24523	NC_014622	TCAT	2	8	1273143	1273150	25 %	50 %	0 %	25 %	310640592
24524	NC_014622	TG	3	6	1273215	1273220	0 %	50 %	50 %	0 %	310640592
24525	NC_014622	TGA	2	6	1273293	1273298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640592
24526	NC_014622	AT	3	6	1273300	1273305	50 %	50 %	0 %	0 %	310640592
24527	NC_014622	AGG	2	6	1273315	1273320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310640592
24528	NC_014622	AACTA	2	10	1273340	1273349	60 %	20 %	0 %	20 %	310640592
24529	NC_014622	ATG	2	6	1273377	1273382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640593
24530	NC_014622	GTC	2	6	1273392	1273397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640593
24531	NC_014622	GGC	2	6	1273425	1273430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310640593
24532	NC_014622	ATC	2	6	1273515	1273520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310640593
24533	NC_014622	GCC	2	6	1273575	1273580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310640593
24534	NC_014622	ATG	2	6	1273584	1273589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640593
24535	NC_014622	TGC	2	6	1273720	1273725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640593
24536	NC_014622	TC	3	6	1273768	1273773	0 %	50 %	0 %	50 %	310640593
24537	NC_014622	GGA	2	6	1273782	1273787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310640593
24538	NC_014622	CAT	2	6	1273850	1273855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310640593
24539	NC_014622	TGAA	2	8	1273888	1273895	50 %	25 %	25 %	0 %	310640593
24540	NC_014622	CCA	2	6	1273938	1273943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310640593
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24542	NC_014622	CTG	2	6	1274043	1274048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640593
24543	NC_014622	GTC	2	6	1274098	1274103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640593
24544	NC_014622	A	6	6	1274160	1274165	100 %	0 %	0 %	0 %	310640593
24545	NC_014622	TGC	2	6	1274225	1274230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640593
24546	NC_014622	GCTT	2	8	1274289	1274296	0 %	50 %	25 %	25 %	310640593
24547	NC_014622	TGG	2	6	1274300	1274305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310640593
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24549	NC_014622	GCA	2	6	1274414	1274419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640593
24550	NC_014622	CTG	3	9	1274439	1274447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640593
24551	NC_014622	ACA	2	6	1274467	1274472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310640593
24552	NC_014622	GCT	2	6	1274547	1274552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24553	NC_014622	GTC	2	6	1274601	1274606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640594
24554	NC_014622	CCG	2	6	1274616	1274621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310640594
24555	NC_014622	CAT	2	6	1274656	1274661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310640594
24556	NC_014622	CAG	2	6	1274669	1274674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640594
24557	NC_014622	GCCCG	2	10	1274704	1274713	0 %	0 %	40 %	60 %	310640594
24558	NC_014622	TGC	2	6	1274728	1274733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640594
24559	NC_014622	TG	3	6	1274760	1274765	0 %	50 %	50 %	0 %	310640594
24560	NC_014622	ATT	2	6	1274834	1274839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310640594
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24563	NC_014622	GCT	2	6	1275025	1275030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640594
24564	NC_014622	ATT	2	6	1275077	1275082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310640594
24565	NC_014622	T	6	6	1275118	1275123	0 %	100 %	0 %	0 %	310640594
24566	NC_014622	AAC	2	6	1275125	1275130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310640594
24567	NC_014622	CAG	2	6	1275135	1275140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640594
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24569	NC_014622	AACA	2	8	1275171	1275178	75 %	0 %	0 %	25 %	310640594
24570	NC_014622	TCCT	2	8	1275260	1275267	0 %	50 %	0 %	50 %	310640594
24571	NC_014622	CG	3	6	1275287	1275292	0 %	0 %	50 %	50 %	310640594
24572	NC_014622	CGC	2	6	1275310	1275315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310640594
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24577	NC_014622	ATA	2	6	1275473	1275478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310640594
24578	NC_014622	GATATT	2	12	1275481	1275492	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	310640594
24579	NC_014622	TAA	2	6	1275504	1275509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24580	NC_014622	CTT	2	6	1275513	1275518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24581	NC_014622	AT	3	6	1275538	1275543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24582	NC_014622	TG	3	6	1275715	1275720	0 %	50 %	50 %	0 %	310640595
24583	NC_014622	ATA	2	6	1275763	1275768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310640595
24584	NC_014622	CACC	2	8	1275776	1275783	25 %	0 %	0 %	75 %	310640595
24585	NC_014622	CTC	2	6	1275794	1275799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310640595
24586	NC_014622	GAC	2	6	1275885	1275890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640595
24587	NC_014622	AGCC	2	8	1276001	1276008	25 %	0 %	25 %	50 %	310640595
24588	NC_014622	TTC	2	6	1276053	1276058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310640595
24589	NC_014622	AGA	2	6	1276073	1276078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310640595
24590	NC_014622	TTTG	2	8	1276085	1276092	0 %	75 %	25 %	0 %	310640595
24591	NC_014622	CCAG	2	8	1276094	1276101	25 %	0 %	25 %	50 %	310640595
24592	NC_014622	GCC	2	6	1276108	1276113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310640595
24593	NC_014622	TGG	2	6	1276182	1276187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310640595
24594	NC_014622	TGG	2	6	1276233	1276238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310640595
24595	NC_014622	ATCA	2	8	1276266	1276273	50 %	25 %	0 %	25 %	310640595
24596	NC_014622	GTTGC	2	10	1276306	1276315	0 %	40 %	40 %	20 %	310640595
24597	NC_014622	AT	3	6	1276333	1276338	50 %	50 %	0 %	0 %	310640595
24598	NC_014622	T	6	6	1276362	1276367	0 %	100 %	0 %	0 %	310640596
24599	NC_014622	AAG	2	6	1276421	1276426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310640596
24600	NC_014622	CTG	2	6	1276441	1276446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640596
24601	NC_014622	TCA	2	6	1276470	1276475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310640596
24602	NC_014622	TGA	2	6	1276510	1276515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640596
24603	NC_014622	TTC	2	6	1276530	1276535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310640597
24604	NC_014622	TAT	2	6	1276642	1276647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310640597
24605	NC_014622	TTA	2	6	1276704	1276709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310640597
24606	NC_014622	TCA	2	6	1276832	1276837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310640597
24607	NC_014622	AGC	2	6	1277156	1277161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640598
24608	NC_014622	GAC	2	6	1277308	1277313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640598
24609	NC_014622	CAT	2	6	1277415	1277420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310640598
24610	NC_014622	ATT	2	6	1277449	1277454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310640598
24611	NC_014622	CAT	2	6	1277455	1277460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310640598
24612	NC_014622	A	7	7	1277508	1277514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24613	NC_014622	CTTA	2	8	1277530	1277537	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24614	NC_014622	TAT	2	6	1277540	1277545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24615	NC_014622	CATA	2	8	1277547	1277554	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24616	NC_014622	AGC	2	6	1277592	1277597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640599
24617	NC_014622	T	7	7	1277679	1277685	0 %	100 %	0 %	0 %	310640599
24618	NC_014622	A	6	6	1277691	1277696	100 %	0 %	0 %	0 %	310640599
24619	NC_014622	TGC	2	6	1277715	1277720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640599
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24732	NC_014622	CCA	2	6	1282721	1282726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310640602
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24734	NC_014622	T	6	6	1282930	1282935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24736	NC_014622	GTA	2	6	1283009	1283014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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24847	NC_014622	TTAT	2	8	1288766	1288773	25 %	75 %	0 %	0 %	310640606
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24974	NC_014622	A	8	8	1295501	1295508	100 %	0 %	0 %	0 %	310640615
24975	NC_014622	ATC	2	6	1295546	1295551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310640615
24976	NC_014622	CGGCT	2	10	1295552	1295561	0 %	20 %	40 %	40 %	310640615
24977	NC_014622	GCA	2	6	1295623	1295628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640615
24978	NC_014622	CGG	2	6	1295714	1295719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310640615
24979	NC_014622	A	7	7	1295814	1295820	100 %	0 %	0 %	0 %	310640615
24980	NC_014622	GAAATG	2	12	1295828	1295839	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	310640615
24981	NC_014622	T	6	6	1295840	1295845	0 %	100 %	0 %	0 %	310640615
24982	NC_014622	AGA	2	6	1295929	1295934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310640615
24983	NC_014622	TCA	2	6	1295943	1295948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310640615
24984	NC_014622	TGT	2	6	1295982	1295987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310640615
24985	NC_014622	TGC	2	6	1296096	1296101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640615
24986	NC_014622	G	6	6	1296108	1296113	0 %	0 %	100 %	0 %	310640615
24987	NC_014622	AAG	2	6	1296128	1296133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310640615
24988	NC_014622	G	6	6	1296154	1296159	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24989	NC_014622	TTC	3	9	1296248	1296256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310640616
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24991	NC_014622	GCA	2	6	1296303	1296308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640616
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24994	NC_014622	ATG	2	6	1296524	1296529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640616
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24997	NC_014622	GGA	2	6	1296806	1296811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310640616
24998	NC_014622	ATAA	2	8	1296848	1296855	75 %	25 %	0 %	0 %	310640616
24999	NC_014622	CA	4	8	1296881	1296888	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25000	NC_014622	CAT	2	6	1296944	1296949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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