MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus polymyxa SC2 chromosome

Total Repeats: 111263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_014622	CTG	2	6	1220515	1220520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640536
23502	NC_014622	TTA	2	6	1220522	1220527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310640536
23503	NC_014622	GAA	2	6	1220608	1220613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310640536
23504	NC_014622	GGA	2	6	1220631	1220636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310640536
23505	NC_014622	TTC	2	6	1220660	1220665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310640536
23506	NC_014622	GCG	3	9	1220670	1220678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310640536
23507	NC_014622	TGA	2	6	1220776	1220781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640537
23508	NC_014622	AATT	2	8	1220844	1220851	50 %	50 %	0 %	0 %	310640537
23509	NC_014622	TGC	2	6	1220883	1220888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640537
23510	NC_014622	AG	3	6	1220945	1220950	50 %	0 %	50 %	0 %	310640537
23511	NC_014622	GTCC	2	8	1221100	1221107	0 %	25 %	25 %	50 %	310640537
23512	NC_014622	TTTACT	2	12	1221122	1221133	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	310640537
23513	NC_014622	TG	3	6	1221149	1221154	0 %	50 %	50 %	0 %	310640537
23514	NC_014622	GTA	2	6	1221176	1221181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640537
23515	NC_014622	TGC	2	6	1221192	1221197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640537
23516	NC_014622	ATG	2	6	1221218	1221223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640537
23517	NC_014622	GTT	2	6	1221278	1221283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310640537
23518	NC_014622	AT	3	6	1221286	1221291	50 %	50 %	0 %	0 %	310640537
23519	NC_014622	GCA	2	6	1221309	1221314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640537
23520	NC_014622	ATA	2	6	1221315	1221320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310640537
23521	NC_014622	GC	3	6	1221373	1221378	0 %	0 %	50 %	50 %	310640537
23522	NC_014622	TC	3	6	1221414	1221419	0 %	50 %	0 %	50 %	310640537
23523	NC_014622	ATT	2	6	1221555	1221560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310640537
23524	NC_014622	TAA	2	6	1221562	1221567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310640537
23525	NC_014622	TA	3	6	1221729	1221734	50 %	50 %	0 %	0 %	310640537
23526	NC_014622	GGTT	2	8	1221746	1221753	0 %	50 %	50 %	0 %	310640537
23527	NC_014622	GAG	2	6	1221812	1221817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310640537
23528	NC_014622	TTA	2	6	1221847	1221852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310640537
23529	NC_014622	TGT	2	6	1221933	1221938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310640537
23530	NC_014622	GAT	2	6	1221983	1221988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640537
23531	NC_014622	GAT	2	6	1222139	1222144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640537
23532	NC_014622	AGA	2	6	1222207	1222212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310640537
23533	NC_014622	T	6	6	1222422	1222427	0 %	100 %	0 %	0 %	310640537
23534	NC_014622	TAT	2	6	1222444	1222449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310640537
23535	NC_014622	CAATC	2	10	1222472	1222481	40 %	20 %	0 %	40 %	310640537
23536	NC_014622	GTTCA	2	10	1222628	1222637	20 %	40 %	20 %	20 %	310640537
23537	NC_014622	TTTA	2	8	1222648	1222655	25 %	75 %	0 %	0 %	310640537
23538	NC_014622	GCTATT	2	12	1222674	1222685	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	310640537
23539	NC_014622	AAC	2	6	1222823	1222828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23540	NC_014622	CTC	2	6	1222847	1222852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23541	NC_014622	GGA	2	6	1222903	1222908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23542	NC_014622	A	6	6	1222911	1222916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23543	NC_014622	AGA	2	6	1222929	1222934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310640538
23544	NC_014622	GTT	2	6	1222950	1222955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310640538
23545	NC_014622	CAT	2	6	1222960	1222965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310640538
23546	NC_014622	TCAT	2	8	1222993	1223000	25 %	50 %	0 %	25 %	310640538
23547	NC_014622	GCGA	2	8	1223020	1223027	25 %	0 %	50 %	25 %	310640538
23548	NC_014622	CCA	2	6	1223075	1223080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310640538
23549	NC_014622	ATG	2	6	1223234	1223239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640538
23550	NC_014622	CGCT	2	8	1223388	1223395	0 %	25 %	25 %	50 %	310640538
23551	NC_014622	AGC	2	6	1223480	1223485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640538
23552	NC_014622	CCAG	2	8	1223571	1223578	25 %	0 %	25 %	50 %	310640538
23553	NC_014622	AT	3	6	1223583	1223588	50 %	50 %	0 %	0 %	310640538
23554	NC_014622	AGC	2	6	1223645	1223650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640538
23555	NC_014622	T	6	6	1223655	1223660	0 %	100 %	0 %	0 %	310640538
23556	NC_014622	AGA	2	6	1223683	1223688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23557	NC_014622	GAA	2	6	1223780	1223785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23558	NC_014622	TCATT	2	10	1223802	1223811	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23559	NC_014622	ATT	2	6	1223954	1223959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310640539
23560	NC_014622	TAT	2	6	1224141	1224146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310640539
23561	NC_014622	ATT	2	6	1224148	1224153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310640539
23562	NC_014622	GGC	2	6	1224194	1224199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310640539
23563	NC_014622	GGA	2	6	1224218	1224223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310640539
23564	NC_014622	T	6	6	1224234	1224239	0 %	100 %	0 %	0 %	310640539
23565	NC_014622	TA	3	6	1224285	1224290	50 %	50 %	0 %	0 %	310640539
23566	NC_014622	CTG	2	6	1224314	1224319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640539
23567	NC_014622	CTG	2	6	1224326	1224331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640539
23568	NC_014622	CTG	2	6	1224438	1224443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640539
23569	NC_014622	TCA	2	6	1224447	1224452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310640539
23570	NC_014622	GTA	2	6	1224515	1224520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640539
23571	NC_014622	CCATT	2	10	1224537	1224546	20 %	40 %	0 %	40 %	310640539
23572	NC_014622	TGC	2	6	1224558	1224563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640539
23573	NC_014622	CAACA	2	10	1224613	1224622	60 %	0 %	0 %	40 %	310640539
23574	NC_014622	GAA	2	6	1224649	1224654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310640539
23575	NC_014622	TGG	2	6	1224669	1224674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310640539
23576	NC_014622	TGGG	2	8	1224742	1224749	0 %	25 %	75 %	0 %	310640539
23577	NC_014622	TTC	2	6	1224796	1224801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310640539
23578	NC_014622	GCA	2	6	1224813	1224818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640539
23579	NC_014622	GGA	2	6	1224889	1224894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310640539
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23581	NC_014622	TGA	2	6	1224930	1224935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640539
23582	NC_014622	ACC	2	6	1224955	1224960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310640539
23583	NC_014622	TAT	2	6	1225049	1225054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310640539
23584	NC_014622	TGGAG	2	10	1225105	1225114	20 %	20 %	60 %	0 %	310640539
23585	NC_014622	TTCG	2	8	1225131	1225138	0 %	50 %	25 %	25 %	310640539
23586	NC_014622	GGC	2	6	1225262	1225267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310640539
23587	NC_014622	CAGT	2	8	1225321	1225328	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23588	NC_014622	CAG	2	6	1225361	1225366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23589	NC_014622	GCA	2	6	1225409	1225414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23590	NC_014622	CAA	2	6	1225422	1225427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23591	NC_014622	GAA	2	6	1225448	1225453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310640540
23592	NC_014622	A	7	7	1225452	1225458	100 %	0 %	0 %	0 %	310640540
23593	NC_014622	TAG	2	6	1225492	1225497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640540
23594	NC_014622	CAG	2	6	1225608	1225613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640540
23595	NC_014622	ACT	2	6	1225614	1225619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310640540
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23597	NC_014622	GCAA	2	8	1225679	1225686	50 %	0 %	25 %	25 %	310640540
23598	NC_014622	CGG	2	6	1225766	1225771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310640540
23599	NC_014622	ATGG	2	8	1225774	1225781	25 %	25 %	50 %	0 %	310640540
23600	NC_014622	CAG	2	6	1225884	1225889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640540
23601	NC_014622	CTG	2	6	1225920	1225925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640540
23602	NC_014622	GGC	2	6	1225938	1225943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310640540
23603	NC_014622	ATC	2	6	1226006	1226011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310640540
23604	NC_014622	AAGG	2	8	1226013	1226020	50 %	0 %	50 %	0 %	310640540
23605	NC_014622	CAAT	2	8	1226030	1226037	50 %	25 %	0 %	25 %	310640540
23606	NC_014622	TGG	2	6	1226048	1226053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310640540
23607	NC_014622	TAG	2	6	1226089	1226094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640540
23608	NC_014622	AC	3	6	1226168	1226173	50 %	0 %	0 %	50 %	310640540
23609	NC_014622	TGTCA	2	10	1226201	1226210	20 %	40 %	20 %	20 %	310640540
23610	NC_014622	TTCG	2	8	1226245	1226252	0 %	50 %	25 %	25 %	310640540
23611	NC_014622	CGT	2	6	1226308	1226313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640540
23612	NC_014622	TGG	2	6	1226378	1226383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310640540
23613	NC_014622	CAG	2	6	1226468	1226473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640540
23614	NC_014622	TTGG	2	8	1226524	1226531	0 %	50 %	50 %	0 %	310640540
23615	NC_014622	GCAA	2	8	1226563	1226570	50 %	0 %	25 %	25 %	310640540
23616	NC_014622	AAGG	2	8	1226616	1226623	50 %	0 %	50 %	0 %	310640540
23617	NC_014622	TA	3	6	1226662	1226667	50 %	50 %	0 %	0 %	310640540
23618	NC_014622	G	6	6	1226739	1226744	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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23856	NC_014622	ATG	2	6	1238778	1238783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640551
23857	NC_014622	GATG	2	8	1238867	1238874	25 %	25 %	50 %	0 %	310640551
23858	NC_014622	CAG	2	6	1238910	1238915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640551
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23870	NC_014622	GTG	2	6	1239592	1239597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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23874	NC_014622	CAAG	2	8	1239865	1239872	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23875	NC_014622	A	6	6	1239922	1239927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23876	NC_014622	GTAA	2	8	1240105	1240112	50 %	25 %	25 %	0 %	310640553
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23887	NC_014622	CCGA	2	8	1240440	1240447	25 %	0 %	25 %	50 %	310640553
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23943	NC_014622	CAT	2	6	1243337	1243342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23944	NC_014622	TA	4	8	1243347	1243354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23945	NC_014622	TGGGAT	2	12	1243407	1243418	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	310640558
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23956	NC_014622	CTG	2	6	1243899	1243904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640558
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23958	NC_014622	TTG	2	6	1244016	1244021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310640558
23959	NC_014622	CTG	2	6	1244025	1244030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640558
23960	NC_014622	GAC	2	6	1244075	1244080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640558
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23962	NC_014622	TA	3	6	1244177	1244182	50 %	50 %	0 %	0 %	310640559
23963	NC_014622	TAC	2	6	1244187	1244192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310640559
23964	NC_014622	CAG	2	6	1244203	1244208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640559
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23967	NC_014622	T	6	6	1244346	1244351	0 %	100 %	0 %	0 %	310640560
23968	NC_014622	A	6	6	1244490	1244495	100 %	0 %	0 %	0 %	310640560
23969	NC_014622	CCG	2	6	1244519	1244524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310640560
23970	NC_014622	ATA	2	6	1244537	1244542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310640560
23971	NC_014622	GCC	2	6	1244613	1244618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310640560
23972	NC_014622	CAC	2	6	1244639	1244644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310640560
23973	NC_014622	ATG	2	6	1244917	1244922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640560
23974	NC_014622	CAG	2	6	1244925	1244930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640560
23975	NC_014622	TCC	2	6	1244976	1244981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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23977	NC_014622	CTG	2	6	1245113	1245118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640561
23978	NC_014622	ATG	2	6	1245145	1245150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640561
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23985	NC_014622	TCT	2	6	1245409	1245414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310640563
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23988	NC_014622	TCCAT	2	10	1245567	1245576	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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23990	NC_014622	GTT	2	6	1245600	1245605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23991	NC_014622	TAA	2	6	1245654	1245659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23992	NC_014622	GCA	2	6	1245684	1245689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640564
23993	NC_014622	GCA	2	6	1245744	1245749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640564
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23995	NC_014622	AGCG	2	8	1245859	1245866	25 %	0 %	50 %	25 %	310640564
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24000	NC_014622	A	6	6	1246077	1246082	100 %	0 %	0 %	0 %	310640564

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