MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus polymyxa SC2 chromosome

Total Repeats: 111263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014622	TAC	2	6	76930	76935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639546
1502	NC_014622	GAA	2	6	76962	76967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639546
1503	NC_014622	GAA	2	6	76971	76976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639546
1504	NC_014622	TAGCA	2	10	76991	77000	40 %	20 %	20 %	20 %	310639546
1505	NC_014622	CGGA	2	8	77063	77070	25 %	0 %	50 %	25 %	310639546
1506	NC_014622	TTG	2	6	77146	77151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639546
1507	NC_014622	ACG	2	6	77190	77195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639546
1508	NC_014622	TAT	2	6	77351	77356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639546
1509	NC_014622	CGT	2	6	77367	77372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639546
1510	NC_014622	GGCGG	2	10	77430	77439	0 %	0 %	80 %	20 %	310639546
1511	NC_014622	TTG	2	6	77527	77532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639546
1512	NC_014622	TTGA	2	8	77613	77620	25 %	50 %	25 %	0 %	310639546
1513	NC_014622	CA	3	6	77705	77710	50 %	0 %	0 %	50 %	310639546
1514	NC_014622	CGC	2	6	77746	77751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639546
1515	NC_014622	AAG	2	6	77785	77790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639546
1516	NC_014622	GAA	2	6	77826	77831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639546
1517	NC_014622	TTA	2	6	77947	77952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639546
1518	NC_014622	TCGC	2	8	78037	78044	0 %	25 %	25 %	50 %	310639546
1519	NC_014622	ATG	2	6	78133	78138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639546
1520	NC_014622	TCA	2	6	78143	78148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639546
1521	NC_014622	GAT	2	6	78153	78158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639546
1522	NC_014622	GCC	2	6	78188	78193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639546
1523	NC_014622	GCATCG	2	12	78208	78219	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310639546
1524	NC_014622	TGC	2	6	78265	78270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639546
1525	NC_014622	ACCGT	2	10	78289	78298	20 %	20 %	20 %	40 %	310639546
1526	NC_014622	ATAAC	2	10	78302	78311	60 %	20 %	0 %	20 %	310639546
1527	NC_014622	TGA	2	6	78391	78396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639547
1528	NC_014622	CCT	2	6	78429	78434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310639547
1529	NC_014622	ATT	2	6	78462	78467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639547
1530	NC_014622	CTG	2	6	78483	78488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639547
1531	NC_014622	TGG	2	6	78509	78514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639547
1532	NC_014622	GATT	2	8	78530	78537	25 %	50 %	25 %	0 %	310639547
1533	NC_014622	CGTC	2	8	78547	78554	0 %	25 %	25 %	50 %	310639547
1534	NC_014622	CTG	2	6	78556	78561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639547
1535	NC_014622	GTT	2	6	78582	78587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639547
1536	NC_014622	GAC	3	9	78697	78705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639547
1537	NC_014622	GCT	3	9	78722	78730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639547
1538	NC_014622	AGG	2	6	78733	78738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639547
1539	NC_014622	ATT	2	6	78774	78779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639547
1540	NC_014622	TCTTT	2	10	78793	78802	0 %	80 %	0 %	20 %	310639547
1541	NC_014622	GTC	2	6	78825	78830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639547
1542	NC_014622	GA	3	6	78850	78855	50 %	0 %	50 %	0 %	310639547
1543	NC_014622	AT	3	6	78873	78878	50 %	50 %	0 %	0 %	310639547
1544	NC_014622	TAA	2	6	78908	78913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639547
1545	NC_014622	GGA	2	6	79002	79007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639547
1546	NC_014622	TCG	2	6	79043	79048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639547
1547	NC_014622	GACT	2	8	79057	79064	25 %	25 %	25 %	25 %	310639547
1548	NC_014622	TCATTG	2	12	79102	79113	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	310639547
1549	NC_014622	TATT	2	8	79126	79133	25 %	75 %	0 %	0 %	310639547
1550	NC_014622	TGAAC	2	10	79163	79172	40 %	20 %	20 %	20 %	310639547
1551	NC_014622	ATC	2	6	79220	79225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639547
1552	NC_014622	AGGC	2	8	79257	79264	25 %	0 %	50 %	25 %	310639547
1553	NC_014622	T	6	6	79272	79277	0 %	100 %	0 %	0 %	310639547
1554	NC_014622	TGC	2	6	79282	79287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639547
1555	NC_014622	TGA	2	6	79288	79293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639547
1556	NC_014622	GGA	3	9	79320	79328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639547
1557	NC_014622	AAC	2	6	79334	79339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639547
1558	NC_014622	ATG	2	6	79431	79436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639547
1559	NC_014622	CAT	2	6	79448	79453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639547
1560	NC_014622	TC	4	8	79520	79527	0 %	50 %	0 %	50 %	310639547
1561	NC_014622	GGC	2	6	79538	79543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639547
1562	NC_014622	ATT	2	6	79611	79616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639547
1563	NC_014622	TG	3	6	79617	79622	0 %	50 %	50 %	0 %	310639547
1564	NC_014622	CGT	2	6	79698	79703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639547
1565	NC_014622	TA	3	6	79737	79742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_014622	TGA	2	6	79759	79764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_014622	T	7	7	79777	79783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_014622	GCA	2	6	79810	79815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_014622	TAT	2	6	79816	79821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_014622	A	7	7	79880	79886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_014622	G	8	8	79968	79975	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_014622	TATT	3	12	80023	80034	25 %	75 %	0 %	0 %	310639548
1573	NC_014622	GTTTT	2	10	80047	80056	0 %	80 %	20 %	0 %	310639548
1574	NC_014622	TGT	2	6	80064	80069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639548
1575	NC_014622	GAA	2	6	80103	80108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639548
1576	NC_014622	CTT	2	6	80119	80124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639548
1577	NC_014622	ATT	2	6	80140	80145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639548
1578	NC_014622	TCA	2	6	80171	80176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639548
1579	NC_014622	CTGGC	2	10	80210	80219	0 %	20 %	40 %	40 %	310639548
1580	NC_014622	TTAA	2	8	80260	80267	50 %	50 %	0 %	0 %	310639548
1581	NC_014622	TC	3	6	80285	80290	0 %	50 %	0 %	50 %	310639548
1582	NC_014622	TTGGT	2	10	80292	80301	0 %	60 %	40 %	0 %	310639548
1583	NC_014622	TGC	2	6	80331	80336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639548
1584	NC_014622	GCT	2	6	80364	80369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639548
1585	NC_014622	TGGGC	2	10	80378	80387	0 %	20 %	60 %	20 %	310639548
1586	NC_014622	TTG	2	6	80401	80406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639548
1587	NC_014622	CAT	2	6	80412	80417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639548
1588	NC_014622	CGG	2	6	80444	80449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639548
1589	NC_014622	TGT	2	6	80499	80504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639548
1590	NC_014622	A	6	6	80530	80535	100 %	0 %	0 %	0 %	310639548
1591	NC_014622	GAA	3	9	80555	80563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_014622	TGGAA	2	10	80677	80686	40 %	20 %	40 %	0 %	310639549
1593	NC_014622	TTG	2	6	80741	80746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_014622	CT	3	6	80748	80753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1595	NC_014622	T	6	6	80756	80761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_014622	TA	3	6	80856	80861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_014622	ATA	2	6	80880	80885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_014622	TA	3	6	80899	80904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_014622	TA	3	6	80909	80914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_014622	GTT	2	6	80934	80939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_014622	A	6	6	80957	80962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_014622	GGT	2	6	80967	80972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_014622	TAC	2	6	80984	80989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639550
1604	NC_014622	A	6	6	80997	81002	100 %	0 %	0 %	0 %	310639550
1605	NC_014622	TAA	2	6	81024	81029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639550
1606	NC_014622	TTAC	2	8	81089	81096	25 %	50 %	0 %	25 %	310639550
1607	NC_014622	TGTC	2	8	81156	81163	0 %	50 %	25 %	25 %	310639550
1608	NC_014622	GAA	2	6	81184	81189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639550
1609	NC_014622	TCG	2	6	81290	81295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639550
1610	NC_014622	TGA	2	6	81377	81382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639550
1611	NC_014622	ACA	2	6	81443	81448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639550
1612	NC_014622	GCC	2	6	81562	81567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639550
1613	NC_014622	GAA	2	6	81607	81612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639550
1614	NC_014622	AGG	2	6	81747	81752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639550
1615	NC_014622	TTA	2	6	81764	81769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639551
1616	NC_014622	TAT	2	6	81786	81791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639551
1617	NC_014622	TCT	2	6	81842	81847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639551
1618	NC_014622	TGT	2	6	81921	81926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639551
1619	NC_014622	TGG	2	6	81968	81973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639551
1620	NC_014622	TGA	2	6	81990	81995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639551
1621	NC_014622	ATG	2	6	82010	82015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639551
1622	NC_014622	AAG	3	9	82097	82105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639551
1623	NC_014622	TGGG	2	8	82120	82127	0 %	25 %	75 %	0 %	310639551
1624	NC_014622	GTG	2	6	82161	82166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639551
1625	NC_014622	GA	3	6	82168	82173	50 %	0 %	50 %	0 %	310639551
1626	NC_014622	TTC	2	6	82194	82199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639551
1627	NC_014622	ACG	2	6	82204	82209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639551
1628	NC_014622	GTG	2	6	82312	82317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639551
1629	NC_014622	TC	3	6	82322	82327	0 %	50 %	0 %	50 %	310639551
1630	NC_014622	TCT	2	6	82349	82354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639551
1631	NC_014622	TGG	2	6	82357	82362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639551
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1633	NC_014622	ATC	2	6	82381	82386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639551
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1658	NC_014622	ATT	2	6	84162	84167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639552
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1661	NC_014622	CTGA	2	8	84291	84298	25 %	25 %	25 %	25 %	310639552
1662	NC_014622	CA	3	6	84315	84320	50 %	0 %	0 %	50 %	310639552
1663	NC_014622	TGG	2	6	84371	84376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639552
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1677	NC_014622	TTA	2	6	85290	85295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639553
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1680	NC_014622	GGA	2	6	85384	85389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639553
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1688	NC_014622	CAGGA	2	10	85932	85941	40 %	0 %	40 %	20 %	310639553
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1692	NC_014622	AATT	2	8	86180	86187	50 %	50 %	0 %	0 %	310639553
1693	NC_014622	GACAG	2	10	86229	86238	40 %	0 %	40 %	20 %	310639554
1694	NC_014622	GGAA	2	8	86292	86299	50 %	0 %	50 %	0 %	310639554
1695	NC_014622	CAA	2	6	86345	86350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639554
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1700	NC_014622	CTATTG	2	12	86648	86659	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	310639554
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1702	NC_014622	GTA	2	6	86761	86766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639554
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1711	NC_014622	GGC	2	6	87076	87081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639554
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1725	NC_014622	GGA	2	6	87921	87926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1726	NC_014622	TCATAT	2	12	88074	88085	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	310639556
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1729	NC_014622	AG	3	6	88194	88199	50 %	0 %	50 %	0 %	310639556
1730	NC_014622	CTTG	2	8	88254	88261	0 %	50 %	25 %	25 %	310639556
1731	NC_014622	AGC	2	6	88262	88267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639556
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1738	NC_014622	CTGG	2	8	88542	88549	0 %	25 %	50 %	25 %	310639556
1739	NC_014622	TC	3	6	88693	88698	0 %	50 %	0 %	50 %	310639556
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1742	NC_014622	AAGA	2	8	88795	88802	75 %	0 %	25 %	0 %	310639556
1743	NC_014622	CAA	2	6	88974	88979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639556
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1747	NC_014622	AGA	2	6	89277	89282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639556
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1750	NC_014622	GAA	2	6	89593	89598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639556
1751	NC_014622	ATTT	2	8	89858	89865	25 %	75 %	0 %	0 %	310639556
1752	NC_014622	CTT	2	6	89944	89949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639556
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1754	NC_014622	ATT	2	6	90121	90126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639556
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1880	NC_014622	GAA	2	6	97885	97890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639556
1881	NC_014622	GT	3	6	97934	97939	0 %	50 %	50 %	0 %	310639556
1882	NC_014622	TGC	2	6	97964	97969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639556
1883	NC_014622	GTAT	2	8	98087	98094	25 %	50 %	25 %	0 %	310639556
1884	NC_014622	CA	3	6	98207	98212	50 %	0 %	0 %	50 %	310639556
1885	NC_014622	CCGT	2	8	98224	98231	0 %	25 %	25 %	50 %	310639556
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1906	NC_014622	CTTCA	2	10	99407	99416	20 %	40 %	0 %	40 %	310639556
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1914	NC_014622	CTG	2	6	100384	100389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639556
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1985	NC_014622	GCAA	2	8	104535	104542	50 %	0 %	25 %	25 %	310639556
1986	NC_014622	AAC	2	6	104565	104570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639556
1987	NC_014622	GAA	2	6	104650	104655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639556
1988	NC_014622	AGT	2	6	104784	104789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639556
1989	NC_014622	GATC	2	8	104803	104810	25 %	25 %	25 %	25 %	310639556
1990	NC_014622	CTG	2	6	104818	104823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639556
1991	NC_014622	GCGG	2	8	104848	104855	0 %	0 %	75 %	25 %	310639556
1992	NC_014622	CA	3	6	104937	104942	50 %	0 %	0 %	50 %	310639556
1993	NC_014622	AAT	2	6	105022	105027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639556
1994	NC_014622	ACA	2	6	105082	105087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639556
1995	NC_014622	TGG	2	6	105139	105144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639556
1996	NC_014622	CAAC	2	8	105169	105176	50 %	0 %	0 %	50 %	310639556
1997	NC_014622	TTGAC	2	10	105206	105215	20 %	40 %	20 %	20 %	310639556
1998	NC_014622	TAA	2	6	105239	105244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639556
1999	NC_014622	GGA	2	6	105247	105252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639556
2000	NC_014622	ATG	2	6	105266	105271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639556

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