MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus polymyxa SC2 chromosome

Total Repeats: 111263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_014622	TCA	2	6	959509	959514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310640329
18502	NC_014622	ACA	2	6	959561	959566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310640329
18503	NC_014622	AAT	2	6	959600	959605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310640329
18504	NC_014622	ATG	2	6	959610	959615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640329
18505	NC_014622	AGT	2	6	959659	959664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640329
18506	NC_014622	GGC	2	6	959702	959707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310640329
18507	NC_014622	GCA	2	6	959738	959743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640329
18508	NC_014622	GGC	2	6	959762	959767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310640329
18509	NC_014622	TCG	2	6	959769	959774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640329
18510	NC_014622	ATT	2	6	959786	959791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310640329
18511	NC_014622	AAG	2	6	959859	959864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310640329
18512	NC_014622	GAAAAA	2	12	959881	959892	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	310640329
18513	NC_014622	TCG	2	6	959946	959951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640329
18514	NC_014622	GTT	2	6	959975	959980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310640329
18515	NC_014622	GAG	2	6	960047	960052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310640329
18516	NC_014622	AAC	2	6	960060	960065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310640329
18517	NC_014622	GGC	2	6	960118	960123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310640329
18518	NC_014622	ATA	2	6	960126	960131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310640329
18519	NC_014622	AGC	2	6	960172	960177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640329
18520	NC_014622	GAA	2	6	960323	960328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310640329
18521	NC_014622	GCA	2	6	960416	960421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18522	NC_014622	GGA	2	6	960447	960452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18523	NC_014622	TG	3	6	960506	960511	0 %	50 %	50 %	0 %	310640330
18524	NC_014622	GAA	2	6	960518	960523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310640330
18525	NC_014622	GT	3	6	960587	960592	0 %	50 %	50 %	0 %	310640330
18526	NC_014622	GTGA	2	8	960603	960610	25 %	25 %	50 %	0 %	310640330
18527	NC_014622	A	6	6	960642	960647	100 %	0 %	0 %	0 %	310640330
18528	NC_014622	GAT	2	6	960672	960677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640330
18529	NC_014622	TGC	2	6	960787	960792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640330
18530	NC_014622	GGT	2	6	960878	960883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310640330
18531	NC_014622	GCA	2	6	960903	960908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640330
18532	NC_014622	GGA	2	6	960938	960943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310640330
18533	NC_014622	TGG	2	6	960970	960975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310640330
18534	NC_014622	GAG	2	6	961014	961019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310640330
18535	NC_014622	TTG	2	6	961054	961059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310640330
18536	NC_014622	GCG	2	6	961086	961091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310640330
18537	NC_014622	ATT	2	6	961182	961187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310640330
18538	NC_014622	ATT	2	6	961206	961211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310640330
18539	NC_014622	GTG	2	6	961255	961260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310640330
18540	NC_014622	TGA	2	6	961276	961281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640330
18541	NC_014622	GCT	2	6	961392	961397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640330
18542	NC_014622	GT	4	8	961449	961456	0 %	50 %	50 %	0 %	310640330
18543	NC_014622	AACG	2	8	961583	961590	50 %	0 %	25 %	25 %	310640330
18544	NC_014622	TGGT	2	8	961609	961616	0 %	50 %	50 %	0 %	310640330
18545	NC_014622	GCT	2	6	961662	961667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640330
18546	NC_014622	GCAA	2	8	961684	961691	50 %	0 %	25 %	25 %	310640330
18547	NC_014622	AT	3	6	961733	961738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18548	NC_014622	T	6	6	961769	961774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18549	NC_014622	ACTG	3	12	961819	961830	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18550	NC_014622	GAG	2	6	961840	961845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18551	NC_014622	AGC	2	6	961872	961877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640331
18552	NC_014622	GAA	2	6	961919	961924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310640331
18553	NC_014622	CTT	2	6	961943	961948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310640331
18554	NC_014622	GTG	2	6	962009	962014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310640331
18555	NC_014622	TGTT	2	8	962181	962188	0 %	75 %	25 %	0 %	310640331
18556	NC_014622	TGC	2	6	962232	962237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640331
18557	NC_014622	GTG	2	6	962247	962252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310640331
18558	NC_014622	GAGC	2	8	962324	962331	25 %	0 %	50 %	25 %	310640331
18559	NC_014622	TGCC	2	8	962349	962356	0 %	25 %	25 %	50 %	310640331
18560	NC_014622	GCA	2	6	962378	962383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640331
18561	NC_014622	AGA	2	6	962482	962487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310640331
18562	NC_014622	GCT	2	6	962489	962494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640331
18563	NC_014622	ATGA	2	8	962545	962552	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18564	NC_014622	CAA	2	6	962561	962566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18565	NC_014622	GA	3	6	962617	962622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18566	NC_014622	A	6	6	962642	962647	100 %	0 %	0 %	0 %	310640332
18567	NC_014622	GCAG	2	8	962744	962751	25 %	0 %	50 %	25 %	310640332
18568	NC_014622	GCC	2	6	962765	962770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310640332
18569	NC_014622	AAG	2	6	962789	962794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310640332
18570	NC_014622	ATG	2	6	962816	962821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640332
18571	NC_014622	CCG	2	6	962831	962836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310640332
18572	NC_014622	ACA	2	6	962853	962858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310640332
18573	NC_014622	A	6	6	962972	962977	100 %	0 %	0 %	0 %	310640332
18574	NC_014622	AAG	2	6	963020	963025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310640332
18575	NC_014622	AAT	2	6	963056	963061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310640332
18576	NC_014622	ACG	2	6	963098	963103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640332
18577	NC_014622	ATG	2	6	963150	963155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640332
18578	NC_014622	TGC	2	6	963177	963182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640332
18579	NC_014622	ATG	3	9	963213	963221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640332
18580	NC_014622	GGC	2	6	963355	963360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310640332
18581	NC_014622	GAAG	2	8	963424	963431	50 %	0 %	50 %	0 %	310640332
18582	NC_014622	A	6	6	963455	963460	100 %	0 %	0 %	0 %	310640332
18583	NC_014622	GAG	2	6	963470	963475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310640332
18584	NC_014622	AAG	2	6	963555	963560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18585	NC_014622	T	6	6	963602	963607	0 %	100 %	0 %	0 %	310640333
18586	NC_014622	TTA	2	6	963620	963625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310640333
18587	NC_014622	TA	3	6	963633	963638	50 %	50 %	0 %	0 %	310640333
18588	NC_014622	TTG	2	6	963679	963684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310640333
18589	NC_014622	GC	3	6	963690	963695	0 %	0 %	50 %	50 %	310640333
18590	NC_014622	TGGC	2	8	963720	963727	0 %	25 %	50 %	25 %	310640333
18591	NC_014622	ATGT	2	8	963732	963739	25 %	50 %	25 %	0 %	310640333
18592	NC_014622	ATCA	2	8	963740	963747	50 %	25 %	0 %	25 %	310640333
18593	NC_014622	TAT	2	6	963786	963791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310640333
18594	NC_014622	GAT	2	6	963798	963803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640333
18595	NC_014622	GCT	2	6	963831	963836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640333
18596	NC_014622	TTC	2	6	963973	963978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310640333
18597	NC_014622	ATTGCA	2	12	963993	964004	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	310640333
18598	NC_014622	GGCA	2	8	964081	964088	25 %	0 %	50 %	25 %	310640333
18599	NC_014622	TTA	2	6	964214	964219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310640333
18600	NC_014622	GAT	2	6	964227	964232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18601	NC_014622	GAT	3	9	964234	964242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640334
18602	NC_014622	AAC	2	6	964243	964248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310640334
18603	NC_014622	TCG	2	6	964323	964328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640334
18604	NC_014622	TGC	2	6	964365	964370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640334
18605	NC_014622	CAATT	2	10	964508	964517	40 %	40 %	0 %	20 %	310640334
18606	NC_014622	CTG	2	6	964559	964564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640334
18607	NC_014622	CG	3	6	964581	964586	0 %	0 %	50 %	50 %	310640334
18608	NC_014622	ACA	2	6	964606	964611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310640334
18609	NC_014622	CAG	2	6	964676	964681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640334
18610	NC_014622	CGA	2	6	964735	964740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310640334
18611	NC_014622	TGG	2	6	964767	964772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310640334
18612	NC_014622	GTC	2	6	964823	964828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640334
18613	NC_014622	GGA	2	6	964900	964905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310640334
18614	NC_014622	T	6	6	964922	964927	0 %	100 %	0 %	0 %	310640334
18615	NC_014622	AAG	2	6	965022	965027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18616	NC_014622	CG	3	6	965068	965073	0 %	0 %	50 %	50 %	310640335
18617	NC_014622	GATG	2	8	965109	965116	25 %	25 %	50 %	0 %	310640335
18618	NC_014622	CGG	2	6	965120	965125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310640335
18619	NC_014622	CTG	2	6	965164	965169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640335
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18621	NC_014622	T	6	6	965223	965228	0 %	100 %	0 %	0 %	310640335
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18741	NC_014622	TCA	2	6	970701	970706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310640340
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18982	NC_014622	ACA	2	6	983103	983108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18983	NC_014622	TATAG	2	10	983153	983162	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18984	NC_014622	GA	3	6	983163	983168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18985	NC_014622	A	6	6	983180	983185	100 %	0 %	0 %	0 %	310640355
18986	NC_014622	TTG	2	6	983233	983238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310640355
18987	NC_014622	CATG	2	8	983239	983246	25 %	25 %	25 %	25 %	310640355
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18990	NC_014622	TAG	2	6	983288	983293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310640355
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18997	NC_014622	ACCG	2	8	983588	983595	25 %	0 %	25 %	50 %	310640355
18998	NC_014622	A	7	7	983637	983643	100 %	0 %	0 %	0 %	310640355
18999	NC_014622	GCT	2	6	983646	983651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310640355
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