MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus polymyxa SC2 chromosome

Total Repeats: 111263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014622	CGG	2	6	50288	50293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639518
1002	NC_014622	CTGC	2	8	50332	50339	0 %	25 %	25 %	50 %	310639518
1003	NC_014622	AGA	2	6	50363	50368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639518
1004	NC_014622	GAA	2	6	50428	50433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639518
1005	NC_014622	GAAG	2	8	50445	50452	50 %	0 %	50 %	0 %	310639518
1006	NC_014622	TTG	2	6	50510	50515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639518
1007	NC_014622	GGA	2	6	50550	50555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639518
1008	NC_014622	CGT	2	6	50629	50634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639518
1009	NC_014622	CAG	2	6	50643	50648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639518
1010	NC_014622	CTT	2	6	50689	50694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639518
1011	NC_014622	GATT	2	8	50701	50708	25 %	50 %	25 %	0 %	310639518
1012	NC_014622	GTA	2	6	50809	50814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_014622	A	6	6	50841	50846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_014622	GTA	2	6	50890	50895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_014622	TGA	2	6	51003	51008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_014622	T	6	6	51012	51017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_014622	AGG	2	6	51025	51030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_014622	CAA	2	6	51061	51066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639519
1019	NC_014622	GTG	2	6	51153	51158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639519
1020	NC_014622	TAA	2	6	51286	51291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639519
1021	NC_014622	AAG	2	6	51297	51302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639519
1022	NC_014622	CGT	2	6	51355	51360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_014622	GTG	2	6	51397	51402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639520
1024	NC_014622	AAGCC	2	10	51413	51422	40 %	0 %	20 %	40 %	310639520
1025	NC_014622	T	9	9	51658	51666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_014622	GAG	2	6	51671	51676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_014622	AT	3	6	51695	51700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_014622	AGG	2	6	51761	51766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_014622	AGC	2	6	51829	51834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639521
1030	NC_014622	ACA	2	6	51923	51928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639521
1031	NC_014622	AC	3	6	52068	52073	50 %	0 %	0 %	50 %	310639522
1032	NC_014622	TTG	2	6	52184	52189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639522
1033	NC_014622	ACT	2	6	52282	52287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639522
1034	NC_014622	TTC	2	6	52410	52415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639522
1035	NC_014622	AGGA	2	8	52483	52490	50 %	0 %	50 %	0 %	310639522
1036	NC_014622	TCCG	2	8	52539	52546	0 %	25 %	25 %	50 %	310639522
1037	NC_014622	GTA	2	6	52633	52638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639522
1038	NC_014622	GTCCAA	2	12	52679	52690	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	310639523
1039	NC_014622	GCGG	2	8	52692	52699	0 %	0 %	75 %	25 %	310639523
1040	NC_014622	GCC	2	6	52734	52739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639523
1041	NC_014622	T	7	7	52764	52770	0 %	100 %	0 %	0 %	310639523
1042	NC_014622	AAGC	2	8	52827	52834	50 %	0 %	25 %	25 %	310639523
1043	NC_014622	AAC	2	6	52849	52854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639523
1044	NC_014622	GA	3	6	52900	52905	50 %	0 %	50 %	0 %	310639523
1045	NC_014622	ATC	2	6	52950	52955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639523
1046	NC_014622	AATCA	2	10	53021	53030	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1047	NC_014622	T	7	7	53042	53048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_014622	A	7	7	53051	53057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_014622	GGA	2	6	53076	53081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_014622	ACC	2	6	53236	53241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310639524
1051	NC_014622	ATG	2	6	53251	53256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639524
1052	NC_014622	AGG	2	6	53378	53383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639524
1053	NC_014622	GGA	2	6	53391	53396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639524
1054	NC_014622	GGC	2	6	53406	53411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639524
1055	NC_014622	GGT	3	9	53439	53447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639524
1056	NC_014622	TCG	2	6	53550	53555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639524
1057	NC_014622	GGA	2	6	53583	53588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639524
1058	NC_014622	T	7	7	53671	53677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_014622	TAG	2	6	53760	53765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_014622	GAA	2	6	53772	53777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_014622	GAA	2	6	53780	53785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_014622	T	8	8	53808	53815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_014622	TCT	2	6	53863	53868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_014622	TGAC	2	8	53897	53904	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1065	NC_014622	AG	3	6	53907	53912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_014622	AG	4	8	53927	53934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_014622	CG	3	6	53996	54001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_014622	T	7	7	54007	54013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_014622	TGA	2	6	54093	54098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_014622	ATG	2	6	54115	54120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639525
1071	NC_014622	TCCAAA	2	12	54166	54177	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	310639525
1072	NC_014622	AGT	2	6	54231	54236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639525
1073	NC_014622	GATG	2	8	54257	54264	25 %	25 %	50 %	0 %	310639525
1074	NC_014622	TGC	2	6	54377	54382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639525
1075	NC_014622	TGG	2	6	54444	54449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639525
1076	NC_014622	TCT	2	6	54530	54535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639525
1077	NC_014622	ATTT	2	8	54554	54561	25 %	75 %	0 %	0 %	310639525
1078	NC_014622	AAG	2	6	54682	54687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639525
1079	NC_014622	GAA	2	6	54706	54711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639525
1080	NC_014622	TTA	2	6	54722	54727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639525
1081	NC_014622	TGA	2	6	54743	54748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639525
1082	NC_014622	TTCA	2	8	54770	54777	25 %	50 %	0 %	25 %	310639525
1083	NC_014622	CTGT	2	8	54778	54785	0 %	50 %	25 %	25 %	310639525
1084	NC_014622	CTTGGT	2	12	54807	54818	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	310639525
1085	NC_014622	TGG	2	6	54827	54832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639525
1086	NC_014622	TCGG	2	8	54853	54860	0 %	25 %	50 %	25 %	310639525
1087	NC_014622	TGC	2	6	54950	54955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639525
1088	NC_014622	TGC	2	6	54989	54994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639525
1089	NC_014622	ATCT	2	8	55015	55022	25 %	50 %	0 %	25 %	310639525
1090	NC_014622	TAT	2	6	55076	55081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639525
1091	NC_014622	CCG	2	6	55190	55195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639525
1092	NC_014622	CAGC	2	8	55224	55231	25 %	0 %	25 %	50 %	310639525
1093	NC_014622	CGGA	2	8	55277	55284	25 %	0 %	50 %	25 %	310639525
1094	NC_014622	GGAA	2	8	55314	55321	50 %	0 %	50 %	0 %	310639525
1095	NC_014622	ATG	2	6	55396	55401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639525
1096	NC_014622	GCC	2	6	55443	55448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639525
1097	NC_014622	CAG	2	6	55501	55506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639525
1098	NC_014622	ATA	2	6	55523	55528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639525
1099	NC_014622	GTC	2	6	55556	55561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639525
1100	NC_014622	TTG	2	6	55565	55570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639525
1101	NC_014622	GGA	2	6	55602	55607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639525
1102	NC_014622	TCCA	2	8	55693	55700	25 %	25 %	0 %	50 %	310639525
1103	NC_014622	ATT	2	6	55711	55716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639525
1104	NC_014622	TGA	2	6	55773	55778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639525
1105	NC_014622	ATT	2	6	55789	55794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639525
1106	NC_014622	CTG	2	6	55801	55806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639525
1107	NC_014622	CGG	2	6	55847	55852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639525
1108	NC_014622	CGC	2	6	55858	55863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639525
1109	NC_014622	GCC	2	6	55930	55935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639525
1110	NC_014622	AGG	2	6	55938	55943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639525
1111	NC_014622	TCT	2	6	55949	55954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639525
1112	NC_014622	ATG	2	6	55972	55977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639525
1113	NC_014622	GCA	2	6	56040	56045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639525
1114	NC_014622	AG	3	6	56046	56051	50 %	0 %	50 %	0 %	310639525
1115	NC_014622	GCA	2	6	56056	56061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639525
1116	NC_014622	GAA	2	6	56074	56079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639525
1117	NC_014622	TGC	2	6	56138	56143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639525
1118	NC_014622	TGAT	2	8	56183	56190	25 %	50 %	25 %	0 %	310639525
1119	NC_014622	TTA	2	6	56240	56245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639525
1120	NC_014622	GAG	2	6	56254	56259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639525
1121	NC_014622	TA	3	6	56373	56378	50 %	50 %	0 %	0 %	310639525
1122	NC_014622	CAA	2	6	56497	56502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639525
1123	NC_014622	ATG	2	6	56513	56518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639525
1124	NC_014622	GTT	2	6	56530	56535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639525
1125	NC_014622	GGT	2	6	56591	56596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639525
1126	NC_014622	ACGG	2	8	56607	56614	25 %	0 %	50 %	25 %	310639525
1127	NC_014622	GATG	2	8	56773	56780	25 %	25 %	50 %	0 %	310639526
1128	NC_014622	GGC	2	6	56808	56813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639526
1129	NC_014622	GGGA	2	8	56828	56835	25 %	0 %	75 %	0 %	310639526
1130	NC_014622	TCG	2	6	56939	56944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639526
1131	NC_014622	GAT	2	6	56973	56978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639526
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1134	NC_014622	TGCAAG	2	12	57159	57170	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	310639526
1135	NC_014622	CTG	2	6	57188	57193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639526
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1137	NC_014622	ATTTC	2	10	57261	57270	20 %	60 %	0 %	20 %	310639526
1138	NC_014622	TGAT	2	8	57401	57408	25 %	50 %	25 %	0 %	310639526
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1148	NC_014622	TTGA	2	8	57977	57984	25 %	50 %	25 %	0 %	310639527
1149	NC_014622	AT	3	6	58119	58124	50 %	50 %	0 %	0 %	310639527
1150	NC_014622	AG	3	6	58126	58131	50 %	0 %	50 %	0 %	310639527
1151	NC_014622	ATT	2	6	58196	58201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639527
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1155	NC_014622	TGC	2	6	58383	58388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639527
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1160	NC_014622	TCA	2	6	58675	58680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639528
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1234	NC_014622	T	6	6	62731	62736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1235	NC_014622	ATT	2	6	62748	62753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1236	NC_014622	GACA	2	8	62767	62774	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1238	NC_014622	TTC	2	6	62915	62920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1239	NC_014622	TA	3	6	63031	63036	50 %	50 %	0 %	0 %	310639531
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1256	NC_014622	GAC	2	6	63950	63955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639531
1257	NC_014622	CTG	2	6	63976	63981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639531
1258	NC_014622	ATG	2	6	63990	63995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639531
1259	NC_014622	GGT	2	6	63996	64001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639531
1260	NC_014622	CAG	2	6	64130	64135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639531
1261	NC_014622	CATT	2	8	64152	64159	25 %	50 %	0 %	25 %	310639531
1262	NC_014622	TCG	2	6	64280	64285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639531
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1291	NC_014622	CATA	2	8	65565	65572	50 %	25 %	0 %	25 %	310639533
1292	NC_014622	GCG	2	6	65588	65593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639533
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1295	NC_014622	TCG	2	6	65699	65704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639533
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1346	NC_014622	GGA	2	6	68510	68515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1370	NC_014622	G	7	7	69515	69521	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1371	NC_014622	AAGGG	2	10	69567	69576	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1372	NC_014622	CA	4	8	69581	69588	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1373	NC_014622	AAGG	2	8	69638	69645	50 %	0 %	50 %	0 %	310639537
1374	NC_014622	TCG	2	6	69728	69733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639537
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1376	NC_014622	CTT	2	6	69906	69911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639537
1377	NC_014622	T	6	6	69940	69945	0 %	100 %	0 %	0 %	310639537
1378	NC_014622	GCTC	2	8	69983	69990	0 %	25 %	25 %	50 %	310639537
1379	NC_014622	GAC	2	6	70019	70024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639537
1380	NC_014622	TG	3	6	70042	70047	0 %	50 %	50 %	0 %	310639537
1381	NC_014622	CAT	2	6	70086	70091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639537
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1383	NC_014622	CAT	2	6	70258	70263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639537
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1497	NC_014622	ACT	2	6	76791	76796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639546
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1500	NC_014622	ATAC	2	8	76904	76911	50 %	25 %	0 %	25 %	310639546

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