MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus polymyxa SC2 chromosome

Total Repeats: 111263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_014622	A	6	6	598253	598258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_014622	CTTT	2	8	598277	598284	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11503	NC_014622	GT	3	6	598285	598290	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_014622	TCA	2	6	598376	598381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639971
11505	NC_014622	AGA	2	6	598387	598392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639971
11506	NC_014622	TGC	2	6	598433	598438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639971
11507	NC_014622	TCA	2	6	598452	598457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639971
11508	NC_014622	CATA	2	8	598606	598613	50 %	25 %	0 %	25 %	310639971
11509	NC_014622	TTG	2	6	598620	598625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639971
11510	NC_014622	TCA	2	6	598671	598676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639971
11511	NC_014622	TG	3	6	598754	598759	0 %	50 %	50 %	0 %	310639971
11512	NC_014622	TCA	2	6	598794	598799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639971
11513	NC_014622	CAG	2	6	598912	598917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639971
11514	NC_014622	GGC	2	6	599050	599055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639971
11515	NC_014622	CCT	2	6	599061	599066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310639971
11516	NC_014622	TGC	3	9	599093	599101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639971
11517	NC_014622	TGT	2	6	599109	599114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639971
11518	NC_014622	TTC	2	6	599185	599190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639971
11519	NC_014622	GCT	2	6	599196	599201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639971
11520	NC_014622	CAG	2	6	599263	599268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639971
11521	NC_014622	AT	3	6	599291	599296	50 %	50 %	0 %	0 %	310639971
11522	NC_014622	CCT	2	6	599337	599342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11523	NC_014622	TTCT	2	8	599350	599357	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11524	NC_014622	CA	3	6	599374	599379	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11525	NC_014622	T	6	6	599426	599431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_014622	CAG	2	6	599451	599456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11527	NC_014622	CAT	2	6	599502	599507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639972
11528	NC_014622	GCT	2	6	599531	599536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639972
11529	NC_014622	AGG	2	6	599587	599592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639972
11530	NC_014622	GAA	2	6	599613	599618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639972
11531	NC_014622	GT	3	6	599713	599718	0 %	50 %	50 %	0 %	310639972
11532	NC_014622	T	6	6	599718	599723	0 %	100 %	0 %	0 %	310639972
11533	NC_014622	CGG	2	6	599821	599826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639972
11534	NC_014622	AGCC	2	8	599854	599861	25 %	0 %	25 %	50 %	310639972
11535	NC_014622	ATAA	2	8	599985	599992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_014622	GAA	2	6	600014	600019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_014622	ATT	2	6	600040	600045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639973
11538	NC_014622	CGG	2	6	600113	600118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639973
11539	NC_014622	GGT	2	6	600165	600170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639973
11540	NC_014622	GAG	2	6	600262	600267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639973
11541	NC_014622	GGAA	2	8	600297	600304	50 %	0 %	50 %	0 %	310639973
11542	NC_014622	GGC	3	9	600420	600428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639973
11543	NC_014622	TGC	2	6	600456	600461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639973
11544	NC_014622	ATT	2	6	600496	600501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639973
11545	NC_014622	TGG	3	9	600548	600556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639973
11546	NC_014622	TGAT	2	8	600605	600612	25 %	50 %	25 %	0 %	310639973
11547	NC_014622	TAG	2	6	600617	600622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639973
11548	NC_014622	CCG	2	6	600710	600715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639974
11549	NC_014622	GA	3	6	600829	600834	50 %	0 %	50 %	0 %	310639974
11550	NC_014622	AC	4	8	600865	600872	50 %	0 %	0 %	50 %	310639974
11551	NC_014622	ACGG	2	8	600909	600916	25 %	0 %	50 %	25 %	310639974
11552	NC_014622	ATG	2	6	600938	600943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639974
11553	NC_014622	CAA	2	6	600984	600989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639974
11554	NC_014622	CGG	2	6	600990	600995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639974
11555	NC_014622	TGG	2	6	601004	601009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639974
11556	NC_014622	GCC	2	6	601062	601067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639974
11557	NC_014622	CAT	2	6	601104	601109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639974
11558	NC_014622	TCG	2	6	601178	601183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639974
11559	NC_014622	CTG	2	6	601189	601194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639974
11560	NC_014622	GGCACG	2	12	601195	601206	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310639974
11561	NC_014622	GCG	2	6	601259	601264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639974
11562	NC_014622	TGCAC	2	10	601314	601323	20 %	20 %	20 %	40 %	310639974
11563	NC_014622	TGG	2	6	601415	601420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639974
11564	NC_014622	GCTAC	2	10	601489	601498	20 %	20 %	20 %	40 %	310639974
11565	NC_014622	GCA	2	6	601576	601581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639974
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11568	NC_014622	GCA	2	6	601723	601728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639974
11569	NC_014622	GCT	2	6	601770	601775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639974
11570	NC_014622	GC	3	6	601789	601794	0 %	0 %	50 %	50 %	310639974
11571	NC_014622	CTGG	2	8	601841	601848	0 %	25 %	50 %	25 %	310639974
11572	NC_014622	GCC	2	6	601853	601858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639974
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11574	NC_014622	CGG	2	6	601919	601924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639974
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11576	NC_014622	GCG	2	6	601951	601956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639974
11577	NC_014622	CGC	2	6	601967	601972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639974
11578	NC_014622	CTG	2	6	601993	601998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639974
11579	NC_014622	CAG	2	6	602009	602014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639974
11580	NC_014622	GCAC	2	8	602089	602096	25 %	0 %	25 %	50 %	310639974
11581	NC_014622	CAT	2	6	602187	602192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639974
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11583	NC_014622	GCAG	2	8	602226	602233	25 %	0 %	50 %	25 %	310639974
11584	NC_014622	CG	3	6	602277	602282	0 %	0 %	50 %	50 %	310639974
11585	NC_014622	ATT	2	6	602320	602325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639974
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11587	NC_014622	AGG	2	6	602355	602360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639975
11588	NC_014622	ATA	2	6	602414	602419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639975
11589	NC_014622	CAG	2	6	602473	602478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639975
11590	NC_014622	GCC	2	6	602595	602600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639975
11591	NC_014622	TCC	2	6	602726	602731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310639975
11592	NC_014622	AAC	2	6	602755	602760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639975
11593	NC_014622	CTCC	2	8	602823	602830	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11594	NC_014622	ATTT	2	8	602865	602872	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_014622	GGA	2	6	603034	603039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639976
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11597	NC_014622	CGC	2	6	603322	603327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639976
11598	NC_014622	TCAG	2	8	603330	603337	25 %	25 %	25 %	25 %	310639976
11599	NC_014622	GAT	2	6	603459	603464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639976
11600	NC_014622	CAG	2	6	603527	603532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639976
11601	NC_014622	AAG	2	6	603542	603547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639976
11602	NC_014622	GT	3	6	603575	603580	0 %	50 %	50 %	0 %	310639976
11603	NC_014622	GAC	2	6	603634	603639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639976
11604	NC_014622	ACG	2	6	603654	603659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639976
11605	NC_014622	TA	3	6	603669	603674	50 %	50 %	0 %	0 %	310639976
11606	NC_014622	TGA	2	6	603704	603709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639976
11607	NC_014622	TGAAAT	2	12	603741	603752	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	310639976
11608	NC_014622	CTT	2	6	603776	603781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639976
11609	NC_014622	TA	3	6	603868	603873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_014622	ATCT	2	8	603881	603888	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11611	NC_014622	ATT	2	6	604049	604054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639977
11612	NC_014622	TGC	2	6	604204	604209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639977
11613	NC_014622	GCTG	2	8	604215	604222	0 %	25 %	50 %	25 %	310639977
11614	NC_014622	TG	3	6	604221	604226	0 %	50 %	50 %	0 %	310639977
11615	NC_014622	GTC	2	6	604270	604275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639977
11616	NC_014622	GCA	2	6	604291	604296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639977
11617	NC_014622	GCT	2	6	604434	604439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639977
11618	NC_014622	TTG	2	6	604476	604481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639977
11619	NC_014622	CTG	2	6	604602	604607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639977
11620	NC_014622	GCT	2	6	604618	604623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639977
11621	NC_014622	TGTTCA	2	12	604708	604719	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	310639977
11622	NC_014622	GC	3	6	604752	604757	0 %	0 %	50 %	50 %	310639977
11623	NC_014622	TGT	2	6	604923	604928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639977
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11645	NC_014622	A	6	6	605926	605931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11744	NC_014622	TA	3	6	610812	610817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11745	NC_014622	GCT	2	6	610905	610910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11985	NC_014622	GTT	2	6	623470	623475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11986	NC_014622	TAC	2	6	623496	623501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11987	NC_014622	TA	3	6	623504	623509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11988	NC_014622	GAT	2	6	623523	623528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11990	NC_014622	GGCCT	2	10	623617	623626	0 %	20 %	40 %	40 %	310639995
11991	NC_014622	GAT	2	6	623715	623720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639995
11992	NC_014622	GCG	2	6	623770	623775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639995
11993	NC_014622	TGA	2	6	623795	623800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639995
11994	NC_014622	ACA	2	6	623801	623806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639995
11995	NC_014622	GTAT	2	8	623827	623834	25 %	50 %	25 %	0 %	310639995
11996	NC_014622	ACT	2	6	623968	623973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639995
11997	NC_014622	TTC	2	6	624001	624006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639995
11998	NC_014622	AAC	2	6	624043	624048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639995
11999	NC_014622	GAAG	2	8	624078	624085	50 %	0 %	50 %	0 %	310639995
12000	NC_014622	ATG	2	6	624181	624186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639995

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