MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus polymyxa SC2 chromosome

Total Repeats: 111263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
108001	NC_014622	CAA	2	6	5563849	5563854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310644696
108002	NC_014622	CCGTT	2	10	5563863	5563872	0 %	40 %	20 %	40 %	310644696
108003	NC_014622	GAAGG	2	10	5563897	5563906	40 %	0 %	60 %	0 %	310644696
108004	NC_014622	GCT	2	6	5563921	5563926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644696
108005	NC_014622	GC	3	6	5563970	5563975	0 %	0 %	50 %	50 %	310644696
108006	NC_014622	CCA	2	6	5563989	5563994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310644696
108007	NC_014622	TGT	2	6	5564034	5564039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310644696
108008	NC_014622	T	6	6	5564096	5564101	0 %	100 %	0 %	0 %	310644696
108009	NC_014622	CCGT	2	8	5564180	5564187	0 %	25 %	25 %	50 %	310644696
108010	NC_014622	TTG	2	6	5564352	5564357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310644696
108011	NC_014622	GGTT	2	8	5564393	5564400	0 %	50 %	50 %	0 %	310644696
108012	NC_014622	GCA	2	6	5564490	5564495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644696
108013	NC_014622	CAT	2	6	5564532	5564537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644696
108014	NC_014622	AGCCA	2	10	5564606	5564615	40 %	0 %	20 %	40 %	310644696
108015	NC_014622	TTCA	2	8	5564629	5564636	25 %	50 %	0 %	25 %	310644696
108016	NC_014622	CACCGG	2	12	5564652	5564663	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310644696
108017	NC_014622	CTG	2	6	5564745	5564750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644696
108018	NC_014622	TGT	2	6	5564756	5564761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310644696
108019	NC_014622	TCC	2	6	5564792	5564797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310644696
108020	NC_014622	CAG	3	9	5564842	5564850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644696
108021	NC_014622	ATC	2	6	5564894	5564899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644696
108022	NC_014622	TCC	2	6	5564907	5564912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108023	NC_014622	A	6	6	5564954	5564959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108024	NC_014622	CAG	2	6	5564979	5564984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108025	NC_014622	GCA	2	6	5565078	5565083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644697
108026	NC_014622	ACC	2	6	5565090	5565095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310644697
108027	NC_014622	CAGG	2	8	5565133	5565140	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108028	NC_014622	CAG	2	6	5565212	5565217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108029	NC_014622	CTG	2	6	5565222	5565227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108030	NC_014622	CAA	2	6	5565293	5565298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108031	NC_014622	CAA	2	6	5565314	5565319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108032	NC_014622	TA	3	6	5565327	5565332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108033	NC_014622	TTC	2	6	5565356	5565361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108034	NC_014622	TTA	2	6	5565374	5565379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108035	NC_014622	TTG	2	6	5565400	5565405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310644698
108036	NC_014622	CAA	2	6	5565418	5565423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310644698
108037	NC_014622	TGCA	2	8	5565484	5565491	25 %	25 %	25 %	25 %	310644698
108038	NC_014622	CCGTAT	2	12	5565530	5565541	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	310644698
108039	NC_014622	CGC	2	6	5565557	5565562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108040	NC_014622	CAC	2	6	5565603	5565608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108041	NC_014622	GC	3	6	5565610	5565615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108042	NC_014622	CCTAA	2	10	5565646	5565655	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
108043	NC_014622	CAGC	2	8	5565695	5565702	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108044	NC_014622	GTAAC	2	10	5565736	5565745	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
108045	NC_014622	CCA	2	6	5565833	5565838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108046	NC_014622	TCA	2	6	5565924	5565929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644699
108047	NC_014622	GCA	3	9	5566043	5566051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644699
108048	NC_014622	TGC	2	6	5566125	5566130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644699
108049	NC_014622	CAG	2	6	5566134	5566139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644699
108050	NC_014622	TTCC	2	8	5566146	5566153	0 %	50 %	0 %	50 %	310644699
108051	NC_014622	GCA	2	6	5566189	5566194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644699
108052	NC_014622	GTC	2	6	5566249	5566254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644699
108053	NC_014622	CAGC	2	8	5566259	5566266	25 %	0 %	25 %	50 %	310644699
108054	NC_014622	GCA	2	6	5566271	5566276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644699
108055	NC_014622	ATG	2	6	5566291	5566296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310644699
108056	NC_014622	CCGC	2	8	5566297	5566304	0 %	0 %	25 %	75 %	310644699
108057	NC_014622	CGAA	2	8	5566422	5566429	50 %	0 %	25 %	25 %	310644699
108058	NC_014622	ATC	2	6	5566531	5566536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644699
108059	NC_014622	AGT	2	6	5566735	5566740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310644699
108060	NC_014622	CAG	2	6	5566752	5566757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644699
108061	NC_014622	ACC	2	6	5566794	5566799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310644699
108062	NC_014622	CAC	2	6	5566914	5566919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310644699
108063	NC_014622	ATG	2	6	5566936	5566941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310644699
108064	NC_014622	A	6	6	5567040	5567045	100 %	0 %	0 %	0 %	310644699
108065	NC_014622	TAA	2	6	5567064	5567069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310644699
108066	NC_014622	CAG	2	6	5567096	5567101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644699
108067	NC_014622	AAT	2	6	5567212	5567217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310644699
108068	NC_014622	GGA	2	6	5567253	5567258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310644700
108069	NC_014622	CAA	2	6	5567351	5567356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310644700
108070	NC_014622	CTTC	2	8	5567419	5567426	0 %	50 %	0 %	50 %	310644700
108071	NC_014622	ATC	2	6	5567471	5567476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644700
108072	NC_014622	TGAA	3	12	5567548	5567559	50 %	25 %	25 %	0 %	310644700
108073	NC_014622	TTCA	2	8	5567579	5567586	25 %	50 %	0 %	25 %	310644700
108074	NC_014622	CTT	4	12	5567597	5567608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310644700
108075	NC_014622	TGA	2	6	5567760	5567765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310644700
108076	NC_014622	TTC	2	6	5567828	5567833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310644700
108077	NC_014622	CTC	2	6	5567859	5567864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310644700
108078	NC_014622	A	6	6	5567898	5567903	100 %	0 %	0 %	0 %	310644700
108079	NC_014622	TAC	2	6	5568110	5568115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644701
108080	NC_014622	GCA	2	6	5568193	5568198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644701
108081	NC_014622	AC	3	6	5568199	5568204	50 %	0 %	0 %	50 %	310644701
108082	NC_014622	TA	5	10	5568221	5568230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108083	NC_014622	A	6	6	5568247	5568252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108084	NC_014622	CA	3	6	5568261	5568266	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108085	NC_014622	ACA	2	6	5568269	5568274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108086	NC_014622	ATTTT	2	10	5568279	5568288	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108087	NC_014622	AGT	2	6	5568356	5568361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108088	NC_014622	AAC	2	6	5568435	5568440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310644702
108089	NC_014622	CAA	2	6	5568533	5568538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310644702
108090	NC_014622	ATTT	2	8	5568583	5568590	25 %	75 %	0 %	0 %	310644702
108091	NC_014622	AAGG	2	8	5568690	5568697	50 %	0 %	50 %	0 %	310644702
108092	NC_014622	GCAC	2	8	5568732	5568739	25 %	0 %	25 %	50 %	310644702
108093	NC_014622	TCA	2	6	5568769	5568774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644702
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108095	NC_014622	AATGA	2	10	5568930	5568939	60 %	20 %	20 %	0 %	310644702
108096	NC_014622	TGA	2	6	5568986	5568991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310644702
108097	NC_014622	GCTG	2	8	5569037	5569044	0 %	25 %	50 %	25 %	310644702
108098	NC_014622	T	6	6	5569304	5569309	0 %	100 %	0 %	0 %	310644702
108099	NC_014622	GAT	2	6	5569331	5569336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310644702
108100	NC_014622	AGG	2	6	5569339	5569344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310644702
108101	NC_014622	AGA	2	6	5569347	5569352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310644702
108102	NC_014622	GAGG	2	8	5569353	5569360	25 %	0 %	75 %	0 %	310644702
108103	NC_014622	CAG	2	6	5569399	5569404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644702
108104	NC_014622	GAA	2	6	5569491	5569496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310644702
108105	NC_014622	CA	3	6	5569515	5569520	50 %	0 %	0 %	50 %	310644702
108106	NC_014622	GC	3	6	5569525	5569530	0 %	0 %	50 %	50 %	310644702
108107	NC_014622	CGG	2	6	5569631	5569636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310644702
108108	NC_014622	AAC	2	6	5569644	5569649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310644702
108109	NC_014622	CAGG	2	8	5569695	5569702	25 %	0 %	50 %	25 %	310644702
108110	NC_014622	GCT	2	6	5569776	5569781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644702
108111	NC_014622	TAC	2	6	5570225	5570230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644703
108112	NC_014622	GGA	2	6	5570348	5570353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310644703
108113	NC_014622	CA	3	6	5570402	5570407	50 %	0 %	0 %	50 %	310644703
108114	NC_014622	A	6	6	5570412	5570417	100 %	0 %	0 %	0 %	310644703
108115	NC_014622	ACA	2	6	5570584	5570589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310644703
108116	NC_014622	GTC	2	6	5570637	5570642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644703
108117	NC_014622	ATCT	2	8	5570687	5570694	25 %	50 %	0 %	25 %	310644703
108118	NC_014622	ATT	2	6	5570771	5570776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310644703
108119	NC_014622	CAG	2	6	5570786	5570791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644703
108120	NC_014622	GAC	2	6	5570829	5570834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644703
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108122	NC_014622	GCT	2	6	5570931	5570936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644703
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108125	NC_014622	CTG	2	6	5571168	5571173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644703
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108127	NC_014622	ATC	2	6	5571211	5571216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108128	NC_014622	GA	3	6	5571223	5571228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108129	NC_014622	ACT	2	6	5571238	5571243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644704
108130	NC_014622	GA	3	6	5571296	5571301	50 %	0 %	50 %	0 %	310644704
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108142	NC_014622	TA	3	6	5572296	5572301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108143	NC_014622	CCA	2	6	5572327	5572332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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108163	NC_014622	TAA	2	6	5573347	5573352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108164	NC_014622	TGC	2	6	5573387	5573392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644706
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108206	NC_014622	ATTT	2	8	5575681	5575688	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108207	NC_014622	CTTTTT	2	12	5575749	5575760	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108208	NC_014622	GGA	2	6	5575768	5575773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108209	NC_014622	TC	4	8	5575817	5575824	0 %	50 %	0 %	50 %	310644707
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108212	NC_014622	TCC	2	6	5575975	5575980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310644707
108213	NC_014622	ACC	3	9	5575996	5576004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310644707
108214	NC_014622	GAAT	2	8	5576045	5576052	50 %	25 %	25 %	0 %	310644707
108215	NC_014622	TGCTCA	2	12	5576089	5576100	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	310644707
108216	NC_014622	GCG	2	6	5576119	5576124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310644707
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108218	NC_014622	CCA	2	6	5576228	5576233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310644707
108219	NC_014622	GCT	2	6	5576315	5576320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644707
108220	NC_014622	TGC	2	6	5576416	5576421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644707
108221	NC_014622	CCT	2	6	5576766	5576771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108222	NC_014622	T	6	6	5576814	5576819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108223	NC_014622	ATGT	2	8	5576830	5576837	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108224	NC_014622	TGA	2	6	5576838	5576843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108225	NC_014622	TTACAT	2	12	5576849	5576860	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108226	NC_014622	T	6	6	5576879	5576884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108227	NC_014622	ATTA	2	8	5576905	5576912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108228	NC_014622	T	7	7	5576923	5576929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108229	NC_014622	T	7	7	5576937	5576943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108230	NC_014622	CAAAC	2	10	5576956	5576965	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
108231	NC_014622	A	6	6	5577023	5577028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108232	NC_014622	AG	3	6	5577035	5577040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108233	NC_014622	TAT	2	6	5577125	5577130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310644708
108234	NC_014622	CTT	2	6	5577140	5577145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310644708
108235	NC_014622	AAG	2	6	5577153	5577158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310644708
108236	NC_014622	GTT	2	6	5577198	5577203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310644708
108237	NC_014622	TTC	2	6	5577339	5577344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310644708
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108239	NC_014622	CTA	2	6	5577400	5577405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644708
108240	NC_014622	T	6	6	5577407	5577412	0 %	100 %	0 %	0 %	310644708
108241	NC_014622	TTGT	2	8	5577597	5577604	0 %	75 %	25 %	0 %	310644708
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108246	NC_014622	AGACA	2	10	5577806	5577815	60 %	0 %	20 %	20 %	310644708
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108315	NC_014622	ATA	2	6	5581766	5581771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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108320	NC_014622	TAAAA	2	10	5582007	5582016	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108321	NC_014622	AGA	2	6	5582036	5582041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108322	NC_014622	CTG	2	6	5582131	5582136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644713
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108333	NC_014622	A	6	6	5582777	5582782	100 %	0 %	0 %	0 %	310644713
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108340	NC_014622	AT	3	6	5583147	5583152	50 %	50 %	0 %	0 %	310644714
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108344	NC_014622	TGC	2	6	5583287	5583292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644714
108345	NC_014622	CTG	2	6	5583323	5583328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644714
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108347	NC_014622	CAA	2	6	5583514	5583519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310644714
108348	NC_014622	CT	3	6	5583540	5583545	0 %	50 %	0 %	50 %	310644714
108349	NC_014622	GCA	2	6	5583577	5583582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644714
108350	NC_014622	GCA	2	6	5583604	5583609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644714
108351	NC_014622	TCA	2	6	5583652	5583657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644714
108352	NC_014622	CACT	2	8	5583721	5583728	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
108353	NC_014622	AGC	2	6	5583739	5583744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108354	NC_014622	AG	3	6	5583824	5583829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108355	NC_014622	GCT	2	6	5583874	5583879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644715
108356	NC_014622	TGCT	2	8	5583899	5583906	0 %	50 %	25 %	25 %	310644715
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108358	NC_014622	CAT	2	6	5583987	5583992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644715
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108371	NC_014622	TCAA	2	8	5584667	5584674	50 %	25 %	0 %	25 %	310644715
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108377	NC_014622	TA	4	8	5584979	5584986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108378	NC_014622	CAT	2	6	5585023	5585028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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108412	NC_014622	CA	3	6	5587112	5587117	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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108426	NC_014622	GCC	2	6	5587919	5587924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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108448	NC_014622	ATG	3	9	5588652	5588660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310644722
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108450	NC_014622	ATC	2	6	5588692	5588697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644722
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108453	NC_014622	GAT	2	6	5588853	5588858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310644722
108454	NC_014622	TCC	2	6	5588937	5588942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310644722
108455	NC_014622	ACG	2	6	5589096	5589101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644722
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108457	NC_014622	TCC	2	6	5589188	5589193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310644722
108458	NC_014622	CG	3	6	5589204	5589209	0 %	0 %	50 %	50 %	310644722
108459	NC_014622	ATG	2	6	5589211	5589216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310644722
108460	NC_014622	TGA	2	6	5589245	5589250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310644722
108461	NC_014622	TGT	2	6	5589337	5589342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310644722
108462	NC_014622	ATC	2	6	5589361	5589366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644722
108463	NC_014622	CA	3	6	5589410	5589415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108464	NC_014622	AAG	2	6	5589476	5589481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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108466	NC_014622	AGAT	2	8	5589524	5589531	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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