MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus polymyxa SC2 chromosome

Total Repeats: 111263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
106001	NC_014622	TGCC	2	8	5462046	5462053	0 %	25 %	25 %	50 %	310644601
106002	NC_014622	TCA	2	6	5462073	5462078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644601
106003	NC_014622	TCC	2	6	5462176	5462181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310644601
106004	NC_014622	GTT	2	6	5462193	5462198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310644601
106005	NC_014622	TCA	2	6	5462234	5462239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644601
106006	NC_014622	TA	3	6	5462308	5462313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106007	NC_014622	A	7	7	5462355	5462361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106008	NC_014622	CAG	2	6	5462423	5462428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644602
106009	NC_014622	AGC	2	6	5462478	5462483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644602
106010	NC_014622	CAG	2	6	5462487	5462492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644602
106011	NC_014622	CCG	2	6	5462522	5462527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310644602
106012	NC_014622	ATT	2	6	5462595	5462600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310644602
106013	NC_014622	TAC	2	6	5462618	5462623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644602
106014	NC_014622	A	6	6	5462640	5462645	100 %	0 %	0 %	0 %	310644602
106015	NC_014622	CAG	2	6	5462660	5462665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644602
106016	NC_014622	AACGT	2	10	5462754	5462763	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106017	NC_014622	TAA	2	6	5462776	5462781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106018	NC_014622	TC	3	6	5462812	5462817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106019	NC_014622	ACAA	2	8	5462828	5462835	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106020	NC_014622	T	7	7	5462861	5462867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106021	NC_014622	AGG	2	6	5462920	5462925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106022	NC_014622	CGA	2	6	5462990	5462995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644603
106023	NC_014622	AGC	2	6	5462997	5463002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644603
106024	NC_014622	CA	3	6	5463003	5463008	50 %	0 %	0 %	50 %	310644603
106025	NC_014622	CAC	2	6	5463014	5463019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310644603
106026	NC_014622	CCT	2	6	5463044	5463049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310644603
106027	NC_014622	TGA	2	6	5463092	5463097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310644603
106028	NC_014622	AAG	2	6	5463139	5463144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310644603
106029	NC_014622	AACT	2	8	5463187	5463194	50 %	25 %	0 %	25 %	310644603
106030	NC_014622	ATG	2	6	5463229	5463234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310644603
106031	NC_014622	CAC	2	6	5463338	5463343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310644603
106032	NC_014622	ACA	2	6	5463358	5463363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310644603
106033	NC_014622	TGAT	2	8	5463403	5463410	25 %	50 %	25 %	0 %	310644603
106034	NC_014622	CGG	2	6	5463530	5463535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310644603
106035	NC_014622	CGC	2	6	5463569	5463574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310644603
106036	NC_014622	GCT	2	6	5463576	5463581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644603
106037	NC_014622	TGAA	2	8	5463682	5463689	50 %	25 %	25 %	0 %	310644603
106038	NC_014622	ATC	2	6	5463724	5463729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644603
106039	NC_014622	CAG	2	6	5463748	5463753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644603
106040	NC_014622	ACTAT	2	10	5463764	5463773	40 %	40 %	0 %	20 %	310644603
106041	NC_014622	GA	3	6	5463884	5463889	50 %	0 %	50 %	0 %	310644603
106042	NC_014622	ACA	2	6	5463898	5463903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310644603
106043	NC_014622	TCG	2	6	5463934	5463939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644603
106044	NC_014622	AGC	2	6	5464153	5464158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644603
106045	NC_014622	TAT	2	6	5464225	5464230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106046	NC_014622	T	7	7	5464244	5464250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106047	NC_014622	AT	3	6	5464310	5464315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106048	NC_014622	A	6	6	5464324	5464329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106049	NC_014622	AAAG	2	8	5464340	5464347	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106050	NC_014622	TACA	2	8	5464397	5464404	50 %	25 %	0 %	25 %	310644604
106051	NC_014622	TGA	2	6	5464627	5464632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310644604
106052	NC_014622	AGC	2	6	5464728	5464733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644604
106053	NC_014622	GCA	2	6	5464747	5464752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644604
106054	NC_014622	ACCAA	2	10	5464875	5464884	60 %	0 %	0 %	40 %	310644604
106055	NC_014622	AGCAGG	2	12	5464930	5464941	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	310644604
106056	NC_014622	AAG	2	6	5464959	5464964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310644604
106057	NC_014622	A	6	6	5464988	5464993	100 %	0 %	0 %	0 %	310644604
106058	NC_014622	TTG	2	6	5465070	5465075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310644604
106059	NC_014622	CTT	2	6	5465076	5465081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310644604
106060	NC_014622	GCGA	2	8	5465141	5465148	25 %	0 %	50 %	25 %	310644604
106061	NC_014622	TAAT	2	8	5465195	5465202	50 %	50 %	0 %	0 %	310644604
106062	NC_014622	A	6	6	5465325	5465330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106063	NC_014622	TAA	2	6	5465456	5465461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310644605
106064	NC_014622	TGC	2	6	5465481	5465486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644605
106065	NC_014622	ATA	2	6	5465657	5465662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310644605
106066	NC_014622	ATC	2	6	5465705	5465710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644605
106067	NC_014622	CAG	2	6	5465723	5465728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644605
106068	NC_014622	GTC	2	6	5465729	5465734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644605
106069	NC_014622	GCT	2	6	5465757	5465762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644605
106070	NC_014622	ACCA	2	8	5465771	5465778	50 %	0 %	0 %	50 %	310644605
106071	NC_014622	CTC	2	6	5465792	5465797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310644605
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106074	NC_014622	TA	3	6	5465866	5465871	50 %	50 %	0 %	0 %	310644605
106075	NC_014622	TC	3	6	5465897	5465902	0 %	50 %	0 %	50 %	310644605
106076	NC_014622	CTT	2	6	5465905	5465910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310644605
106077	NC_014622	AACC	2	8	5465937	5465944	50 %	0 %	0 %	50 %	310644605
106078	NC_014622	ATA	2	6	5465961	5465966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310644605
106079	NC_014622	ATA	2	6	5466002	5466007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310644605
106080	NC_014622	ATA	2	6	5466035	5466040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310644605
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106083	NC_014622	ACA	2	6	5466229	5466234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310644605
106084	NC_014622	AATA	2	8	5466235	5466242	75 %	25 %	0 %	0 %	310644605
106085	NC_014622	CCTAG	2	10	5466309	5466318	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
106086	NC_014622	TTC	2	6	5466325	5466330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106087	NC_014622	T	7	7	5466356	5466362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106088	NC_014622	TCAAT	2	10	5466406	5466415	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106089	NC_014622	GAT	2	6	5466478	5466483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106090	NC_014622	AAT	2	6	5466496	5466501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106091	NC_014622	AGA	2	6	5466507	5466512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106092	NC_014622	GGT	2	6	5466534	5466539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106093	NC_014622	CAA	2	6	5466657	5466662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106094	NC_014622	TAA	2	6	5466710	5466715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106095	NC_014622	AAG	2	6	5466775	5466780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310644606
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106099	NC_014622	GGC	2	6	5467023	5467028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310644606
106100	NC_014622	A	7	7	5467029	5467035	100 %	0 %	0 %	0 %	310644606
106101	NC_014622	TGG	2	6	5467039	5467044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310644606
106102	NC_014622	TG	3	6	5467113	5467118	0 %	50 %	50 %	0 %	310644606
106103	NC_014622	A	6	6	5467179	5467184	100 %	0 %	0 %	0 %	310644606
106104	NC_014622	A	6	6	5467190	5467195	100 %	0 %	0 %	0 %	310644606
106105	NC_014622	GGC	2	6	5467215	5467220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310644606
106106	NC_014622	GGC	2	6	5467278	5467283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310644606
106107	NC_014622	GAC	2	6	5467299	5467304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644606
106108	NC_014622	GCA	2	6	5467328	5467333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644606
106109	NC_014622	TCA	2	6	5467336	5467341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644606
106110	NC_014622	TCA	2	6	5467385	5467390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644607
106111	NC_014622	GCT	2	6	5467456	5467461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644607
106112	NC_014622	TCGC	2	8	5467509	5467516	0 %	25 %	25 %	50 %	310644607
106113	NC_014622	CTG	2	6	5467597	5467602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644607
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106115	NC_014622	ATC	2	6	5467729	5467734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644607
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106117	NC_014622	CTG	3	9	5467819	5467827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644607
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106332	NC_014622	TA	3	6	5478817	5478822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106333	NC_014622	T	6	6	5478836	5478841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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106335	NC_014622	T	6	6	5478864	5478869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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106350	NC_014622	CA	3	6	5479755	5479760	50 %	0 %	0 %	50 %	310644616
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106352	NC_014622	CGTT	2	8	5479975	5479982	0 %	50 %	25 %	25 %	310644616
106353	NC_014622	GAC	2	6	5480035	5480040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644616
106354	NC_014622	T	6	6	5480063	5480068	0 %	100 %	0 %	0 %	310644616
106355	NC_014622	AGT	2	6	5480090	5480095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310644616
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106357	NC_014622	TCG	2	6	5480131	5480136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644616
106358	NC_014622	GTC	2	6	5480142	5480147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644616
106359	NC_014622	CAG	2	6	5480250	5480255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644616
106360	NC_014622	ACG	2	6	5480328	5480333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644616
106361	NC_014622	CAG	2	6	5480363	5480368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644616
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106372	NC_014622	AT	3	6	5481018	5481023	50 %	50 %	0 %	0 %	310644617
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106383	NC_014622	TGC	2	6	5481634	5481639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644617
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106398	NC_014622	ACT	2	6	5482321	5482326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644618
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106402	NC_014622	CTT	2	6	5482638	5482643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106403	NC_014622	TA	3	6	5482659	5482664	50 %	50 %	0 %	0 %	310644619
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106411	NC_014622	TA	3	6	5483036	5483041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106412	NC_014622	ATT	2	6	5483057	5483062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106413	NC_014622	ATC	2	6	5483140	5483145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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106416	NC_014622	AGG	2	6	5483201	5483206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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106433	NC_014622	A	7	7	5484001	5484007	100 %	0 %	0 %	0 %	310644620
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106439	NC_014622	GCTG	2	8	5484213	5484220	0 %	25 %	50 %	25 %	310644620
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106441	NC_014622	A	7	7	5484394	5484400	100 %	0 %	0 %	0 %	310644620
106442	NC_014622	CTG	2	6	5484430	5484435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644620
106443	NC_014622	GA	3	6	5484475	5484480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106444	NC_014622	ATC	2	6	5484508	5484513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644621
106445	NC_014622	ATG	2	6	5484560	5484565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310644621
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106452	NC_014622	AT	4	8	5485295	5485302	50 %	50 %	0 %	0 %	310644621
106453	NC_014622	A	6	6	5485686	5485691	100 %	0 %	0 %	0 %	310644622
106454	NC_014622	TATG	2	8	5485692	5485699	25 %	50 %	25 %	0 %	310644622
106455	NC_014622	TGA	2	6	5485742	5485747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310644622
106456	NC_014622	GAT	2	6	5485839	5485844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310644622
106457	NC_014622	TGA	2	6	5485885	5485890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106458	NC_014622	TGAA	2	8	5485897	5485904	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106459	NC_014622	CCTGCC	2	12	5485919	5485930	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
106460	NC_014622	ATT	2	6	5486083	5486088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310644623
106461	NC_014622	GCT	2	6	5486106	5486111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644623
106462	NC_014622	T	7	7	5486166	5486172	0 %	100 %	0 %	0 %	310644623
106463	NC_014622	AT	3	6	5486183	5486188	50 %	50 %	0 %	0 %	310644623
106464	NC_014622	TAA	2	6	5486190	5486195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310644623
106465	NC_014622	CGA	2	6	5486196	5486201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644623
106466	NC_014622	GAT	2	6	5486260	5486265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310644623
106467	NC_014622	CAA	2	6	5486283	5486288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310644623
106468	NC_014622	GCT	2	6	5486307	5486312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644623
106469	NC_014622	AAAT	2	8	5486450	5486457	75 %	25 %	0 %	0 %	310644623
106470	NC_014622	ATT	2	6	5486548	5486553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310644623
106471	NC_014622	AT	3	6	5486607	5486612	50 %	50 %	0 %	0 %	310644623
106472	NC_014622	CTT	2	6	5486665	5486670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106473	NC_014622	TGT	2	6	5486709	5486714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106474	NC_014622	ACA	2	6	5486767	5486772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106475	NC_014622	GTA	2	6	5486798	5486803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106476	NC_014622	GGA	2	6	5486878	5486883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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106488	NC_014622	TG	3	6	5487621	5487626	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106489	NC_014622	TGG	2	6	5487668	5487673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310644625
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106493	NC_014622	ATA	2	6	5487778	5487783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310644625
106494	NC_014622	CGC	3	9	5487912	5487920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310644625
106495	NC_014622	CATG	2	8	5487938	5487945	25 %	25 %	25 %	25 %	310644625
106496	NC_014622	GCT	3	9	5487988	5487996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644625
106497	NC_014622	CCA	2	6	5488029	5488034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310644625
106498	NC_014622	ATC	2	6	5488063	5488068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644625
106499	NC_014622	GAACAG	2	12	5488086	5488097	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	310644625
106500	NC_014622	CCA	2	6	5488123	5488128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310644625

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