MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus polymyxa SC2 chromosome

Total Repeats: 111263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
105001	NC_014622	ACA	2	6	5409120	5409125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310644550
105002	NC_014622	GCA	2	6	5409130	5409135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644550
105003	NC_014622	T	6	6	5409157	5409162	0 %	100 %	0 %	0 %	310644550
105004	NC_014622	CCA	2	6	5409163	5409168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310644550
105005	NC_014622	T	6	6	5409178	5409183	0 %	100 %	0 %	0 %	310644550
105006	NC_014622	CAG	2	6	5409200	5409205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644550
105007	NC_014622	T	8	8	5409234	5409241	0 %	100 %	0 %	0 %	310644550
105008	NC_014622	TTC	2	6	5409327	5409332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310644550
105009	NC_014622	TCC	2	6	5409462	5409467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310644550
105010	NC_014622	TAT	2	6	5409567	5409572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105011	NC_014622	CGA	2	6	5409582	5409587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105012	NC_014622	TTAT	2	8	5409603	5409610	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105013	NC_014622	ACT	2	6	5409647	5409652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105014	NC_014622	T	7	7	5409701	5409707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105015	NC_014622	ATC	2	6	5409718	5409723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105016	NC_014622	AT	3	6	5409725	5409730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105017	NC_014622	A	6	6	5409744	5409749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105018	NC_014622	AG	3	6	5409886	5409891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105019	NC_014622	CAAAC	2	10	5409946	5409955	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
105020	NC_014622	TGG	2	6	5409990	5409995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105021	NC_014622	GGT	2	6	5409996	5410001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105022	NC_014622	AG	3	6	5410023	5410028	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105023	NC_014622	AC	3	6	5410120	5410125	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105024	NC_014622	TAG	2	6	5410174	5410179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105025	NC_014622	A	7	7	5410182	5410188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105026	NC_014622	AAG	2	6	5410313	5410318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105027	NC_014622	CTT	2	6	5410344	5410349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105028	NC_014622	ATT	2	6	5410428	5410433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310644551
105029	NC_014622	ATG	2	6	5410488	5410493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310644551
105030	NC_014622	GC	3	6	5410502	5410507	0 %	0 %	50 %	50 %	310644551
105031	NC_014622	TCA	2	6	5410560	5410565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644551
105032	NC_014622	TAA	2	6	5410588	5410593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310644551
105033	NC_014622	GCTC	2	8	5410659	5410666	0 %	25 %	25 %	50 %	310644551
105034	NC_014622	CGTC	2	8	5410768	5410775	0 %	25 %	25 %	50 %	310644551
105035	NC_014622	CTG	2	6	5410793	5410798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644551
105036	NC_014622	CAG	2	6	5410829	5410834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644551
105037	NC_014622	ACC	2	6	5410856	5410861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310644551
105038	NC_014622	AT	3	6	5411091	5411096	50 %	50 %	0 %	0 %	310644551
105039	NC_014622	TGT	2	6	5411124	5411129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310644551
105040	NC_014622	TCACC	2	10	5411149	5411158	20 %	20 %	0 %	60 %	310644551
105041	NC_014622	TCC	2	6	5411184	5411189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310644551
105042	NC_014622	CTG	2	6	5411209	5411214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644551
105043	NC_014622	T	6	6	5411330	5411335	0 %	100 %	0 %	0 %	310644551
105044	NC_014622	ATC	2	6	5411412	5411417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105045	NC_014622	CT	3	6	5411436	5411441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105046	NC_014622	GGA	2	6	5411450	5411455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105047	NC_014622	AGA	2	6	5411472	5411477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105048	NC_014622	CAT	2	6	5411537	5411542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105049	NC_014622	AAAT	2	8	5411561	5411568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105050	NC_014622	T	6	6	5411580	5411585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105051	NC_014622	AGG	2	6	5411586	5411591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105052	NC_014622	CTATT	2	10	5411592	5411601	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
105053	NC_014622	AAG	2	6	5411654	5411659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310644552
105054	NC_014622	CGTG	2	8	5411691	5411698	0 %	25 %	50 %	25 %	310644552
105055	NC_014622	TGC	2	6	5411724	5411729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644552
105056	NC_014622	GTA	2	6	5411731	5411736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310644552
105057	NC_014622	GAT	2	6	5411764	5411769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310644552
105058	NC_014622	CGT	2	6	5411784	5411789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644552
105059	NC_014622	TTG	2	6	5411891	5411896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310644552
105060	NC_014622	GGT	2	6	5411899	5411904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310644552
105061	NC_014622	GCAG	2	8	5411905	5411912	25 %	0 %	50 %	25 %	310644552
105062	NC_014622	CTG	2	6	5412115	5412120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644552
105063	NC_014622	GTA	2	6	5412172	5412177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310644552
105064	NC_014622	AGTC	2	8	5412334	5412341	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105065	NC_014622	CGT	2	6	5412418	5412423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644553
105066	NC_014622	CTG	2	6	5412457	5412462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644553
105067	NC_014622	CAG	2	6	5412466	5412471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644553
105068	NC_014622	ATA	2	6	5412497	5412502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310644553
105069	NC_014622	CG	3	6	5412575	5412580	0 %	0 %	50 %	50 %	310644553
105070	NC_014622	CCT	2	6	5412587	5412592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310644553
105071	NC_014622	ACA	3	9	5412629	5412637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310644553
105072	NC_014622	GCT	2	6	5412645	5412650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644553
105073	NC_014622	A	6	6	5412691	5412696	100 %	0 %	0 %	0 %	310644553
105074	NC_014622	TCT	2	6	5412737	5412742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310644553
105075	NC_014622	GCA	2	6	5412782	5412787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644553
105076	NC_014622	ATA	2	6	5412797	5412802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310644553
105077	NC_014622	AGC	2	6	5412856	5412861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644553
105078	NC_014622	G	6	6	5412888	5412893	0 %	0 %	100 %	0 %	310644553
105079	NC_014622	AAC	2	6	5412916	5412921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310644553
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105082	NC_014622	CAA	2	6	5412969	5412974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310644553
105083	NC_014622	CCCA	2	8	5412994	5413001	25 %	0 %	0 %	75 %	310644553
105084	NC_014622	TCA	2	6	5413014	5413019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644553
105085	NC_014622	AGC	2	6	5413028	5413033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644553
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105087	NC_014622	C	6	6	5413237	5413242	0 %	0 %	0 %	100 %	310644553
105088	NC_014622	ACA	2	6	5413473	5413478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310644553
105089	NC_014622	AGA	2	6	5413487	5413492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310644553
105090	NC_014622	TAA	2	6	5413514	5413519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105091	NC_014622	CCT	2	6	5413520	5413525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105092	NC_014622	TTTA	2	8	5413526	5413533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105093	NC_014622	CAT	2	6	5413553	5413558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105094	NC_014622	ACA	2	6	5413561	5413566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105095	NC_014622	CAA	2	6	5413635	5413640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310644554
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105097	NC_014622	AT	3	6	5413731	5413736	50 %	50 %	0 %	0 %	310644554
105098	NC_014622	TGT	2	6	5413745	5413750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310644554
105099	NC_014622	AACT	2	8	5413770	5413777	50 %	25 %	0 %	25 %	310644554
105100	NC_014622	TGC	2	6	5413866	5413871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644555
105101	NC_014622	TCA	2	6	5413879	5413884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644555
105102	NC_014622	AATCG	2	10	5413886	5413895	40 %	20 %	20 %	20 %	310644555
105103	NC_014622	AGC	2	6	5413963	5413968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644555
105104	NC_014622	ATC	2	6	5414171	5414176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644555
105105	NC_014622	AGC	2	6	5414196	5414201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644555
105106	NC_014622	TG	3	6	5414268	5414273	0 %	50 %	50 %	0 %	310644555
105107	NC_014622	TAT	2	6	5414308	5414313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310644555
105108	NC_014622	TCC	2	6	5414328	5414333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310644555
105109	NC_014622	AGT	2	6	5414370	5414375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310644555
105110	NC_014622	GAA	2	6	5414397	5414402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310644555
105111	NC_014622	TC	3	6	5414419	5414424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105112	NC_014622	GA	3	6	5414510	5414515	50 %	0 %	50 %	0 %	310644556
105113	NC_014622	AGT	2	6	5414541	5414546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310644556
105114	NC_014622	GCG	2	6	5414635	5414640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310644556
105115	NC_014622	CCA	2	6	5414692	5414697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310644556
105116	NC_014622	CAG	2	6	5414701	5414706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644556
105117	NC_014622	CCCAA	2	10	5414815	5414824	40 %	0 %	0 %	60 %	310644556
105118	NC_014622	AGC	2	6	5414955	5414960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644556
105119	NC_014622	GAGC	2	8	5414974	5414981	25 %	0 %	50 %	25 %	310644556
105120	NC_014622	GCA	2	6	5414986	5414991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644556
105121	NC_014622	A	6	6	5415111	5415116	100 %	0 %	0 %	0 %	310644556
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105123	NC_014622	CAT	2	6	5415151	5415156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644556
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105125	NC_014622	AGC	2	6	5415267	5415272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644556
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105129	NC_014622	ACAGC	2	10	5415325	5415334	40 %	0 %	20 %	40 %	310644556
105130	NC_014622	ACT	2	6	5415429	5415434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644556
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105132	NC_014622	GC	3	6	5415483	5415488	0 %	0 %	50 %	50 %	310644556
105133	NC_014622	GAT	2	6	5415569	5415574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310644556
105134	NC_014622	CAA	2	6	5415700	5415705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310644556
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105138	NC_014622	A	7	7	5415917	5415923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105139	NC_014622	CCAG	2	8	5415948	5415955	25 %	0 %	25 %	50 %	310644557
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105147	NC_014622	TA	3	6	5416539	5416544	50 %	50 %	0 %	0 %	310644557
105148	NC_014622	GCA	3	9	5416545	5416553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644557
105149	NC_014622	TCC	2	6	5416583	5416588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310644557
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105231	NC_014622	GCTC	2	8	5420103	5420110	0 %	25 %	25 %	50 %	310644562
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105233	NC_014622	TCA	2	6	5420228	5420233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644562
105234	NC_014622	TTCG	2	8	5420257	5420264	0 %	50 %	25 %	25 %	310644562
105235	NC_014622	CA	3	6	5420363	5420368	50 %	0 %	0 %	50 %	310644562
105236	NC_014622	TCA	2	6	5420423	5420428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644562
105237	NC_014622	TCG	3	9	5420511	5420519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644562
105238	NC_014622	GCC	2	6	5420677	5420682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310644562
105239	NC_014622	TTTGA	2	10	5420728	5420737	20 %	60 %	20 %	0 %	310644562
105240	NC_014622	TCC	2	6	5420934	5420939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105241	NC_014622	T	6	6	5420953	5420958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105242	NC_014622	CTT	2	6	5420996	5421001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105243	NC_014622	TAA	2	6	5421013	5421018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105244	NC_014622	ATT	2	6	5421049	5421054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105245	NC_014622	T	7	7	5421121	5421127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105246	NC_014622	AT	3	6	5421157	5421162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105247	NC_014622	GTG	2	6	5421215	5421220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105248	NC_014622	AGG	2	6	5421253	5421258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105249	NC_014622	CT	3	6	5421334	5421339	0 %	50 %	0 %	50 %	310644563
105250	NC_014622	TTCA	2	8	5421352	5421359	25 %	50 %	0 %	25 %	310644563
105251	NC_014622	CGGAG	2	10	5421373	5421382	20 %	0 %	60 %	20 %	310644563
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105254	NC_014622	CCG	2	6	5421600	5421605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310644563
105255	NC_014622	AGGC	2	8	5421741	5421748	25 %	0 %	50 %	25 %	310644563
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105261	NC_014622	GCTG	2	8	5422135	5422142	0 %	25 %	50 %	25 %	310644563
105262	NC_014622	T	6	6	5422195	5422200	0 %	100 %	0 %	0 %	310644563
105263	NC_014622	CAA	2	6	5422269	5422274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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105266	NC_014622	AAT	2	6	5422454	5422459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310644564
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105271	NC_014622	CGG	2	6	5422691	5422696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310644564
105272	NC_014622	CTG	2	6	5422727	5422732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644564
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105286	NC_014622	TCTT	2	8	5423466	5423473	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105287	NC_014622	AT	3	6	5423515	5423520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105288	NC_014622	CT	3	6	5423598	5423603	0 %	50 %	0 %	50 %	310644565
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105324	NC_014622	TCAT	2	8	5425430	5425437	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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105347	NC_014622	ACG	2	6	5426245	5426250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644567
105348	NC_014622	TGC	2	6	5426252	5426257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644567
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105350	NC_014622	TCT	2	6	5426300	5426305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310644567
105351	NC_014622	GC	3	6	5426414	5426419	0 %	0 %	50 %	50 %	310644567
105352	NC_014622	GGCT	2	8	5426465	5426472	0 %	25 %	50 %	25 %	310644567
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105357	NC_014622	GTT	2	6	5426694	5426699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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105499	NC_014622	TAAAA	2	10	5434626	5434635	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105500	NC_014622	A	6	6	5434640	5434645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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