MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus polymyxa SC2 chromosome

Total Repeats: 111263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014622	GAA	2	6	25332	25337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639493
502	NC_014622	GCAA	2	8	25344	25351	50 %	0 %	25 %	25 %	310639493
503	NC_014622	TCC	3	9	25361	25369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310639493
504	NC_014622	TCG	2	6	25372	25377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639493
505	NC_014622	AT	3	6	25456	25461	50 %	50 %	0 %	0 %	310639493
506	NC_014622	TCTG	2	8	25507	25514	0 %	50 %	25 %	25 %	310639493
507	NC_014622	AATA	2	8	25524	25531	75 %	25 %	0 %	0 %	310639493
508	NC_014622	T	6	6	25564	25569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_014622	AAG	2	6	25636	25641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639494
510	NC_014622	TGA	2	6	25653	25658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639494
511	NC_014622	TAT	2	6	25680	25685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639494
512	NC_014622	TGA	2	6	25692	25697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639494
513	NC_014622	GATG	2	8	25713	25720	25 %	25 %	50 %	0 %	310639494
514	NC_014622	GTT	2	6	25795	25800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639494
515	NC_014622	GAC	2	6	25812	25817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639494
516	NC_014622	AGA	2	6	25902	25907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639494
517	NC_014622	ATG	2	6	25970	25975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639494
518	NC_014622	TCC	2	6	25989	25994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310639494
519	NC_014622	GAA	2	6	26074	26079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639494
520	NC_014622	GGCT	2	8	26147	26154	0 %	25 %	50 %	25 %	310639494
521	NC_014622	TTG	2	6	26246	26251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639494
522	NC_014622	AAGT	2	8	26354	26361	50 %	25 %	25 %	0 %	310639494
523	NC_014622	AGG	2	6	26363	26368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639494
524	NC_014622	CAG	2	6	26380	26385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639495
525	NC_014622	A	6	6	26392	26397	100 %	0 %	0 %	0 %	310639495
526	NC_014622	GAT	2	6	26463	26468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639495
527	NC_014622	GACA	2	8	26530	26537	50 %	0 %	25 %	25 %	310639495
528	NC_014622	CA	3	6	26549	26554	50 %	0 %	0 %	50 %	310639495
529	NC_014622	ATA	2	6	26596	26601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639495
530	NC_014622	TA	3	6	26631	26636	50 %	50 %	0 %	0 %	310639495
531	NC_014622	A	6	6	26645	26650	100 %	0 %	0 %	0 %	310639495
532	NC_014622	AG	3	6	26801	26806	50 %	0 %	50 %	0 %	310639495
533	NC_014622	CCA	2	6	26826	26831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310639495
534	NC_014622	A	7	7	26836	26842	100 %	0 %	0 %	0 %	310639495
535	NC_014622	T	6	6	26893	26898	0 %	100 %	0 %	0 %	310639495
536	NC_014622	GTG	2	6	26964	26969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639495
537	NC_014622	CCG	2	6	27051	27056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639495
538	NC_014622	GAA	3	9	27099	27107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639495
539	NC_014622	GGCA	2	8	27115	27122	25 %	0 %	50 %	25 %	310639495
540	NC_014622	TGG	2	6	27123	27128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639495
541	NC_014622	A	6	6	27272	27277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_014622	CAA	2	6	27313	27318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_014622	TA	3	6	27323	27328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_014622	TAT	2	6	27364	27369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_014622	AGA	2	6	27471	27476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639496
546	NC_014622	T	6	6	27493	27498	0 %	100 %	0 %	0 %	310639496
547	NC_014622	ATG	2	6	27503	27508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639496
548	NC_014622	TC	3	6	27543	27548	0 %	50 %	0 %	50 %	310639496
549	NC_014622	AAC	2	6	27583	27588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639496
550	NC_014622	TCA	2	6	27630	27635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639496
551	NC_014622	TAA	2	6	27636	27641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639496
552	NC_014622	CTC	2	6	27648	27653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_014622	ATA	2	6	27666	27671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_014622	A	7	7	27746	27752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_014622	GTA	2	6	27753	27758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_014622	TACCT	2	10	27806	27815	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
557	NC_014622	GAT	2	6	27825	27830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_014622	ATT	2	6	27937	27942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_014622	GAA	2	6	27985	27990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639497
560	NC_014622	ACG	2	6	28080	28085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639497
561	NC_014622	ATCTT	2	10	28104	28113	20 %	60 %	0 %	20 %	310639497
562	NC_014622	GGAGC	2	10	28123	28132	20 %	0 %	60 %	20 %	310639497
563	NC_014622	TAT	2	6	28179	28184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639497
564	NC_014622	GAA	2	6	28225	28230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639497
565	NC_014622	TG	3	6	28244	28249	0 %	50 %	50 %	0 %	310639497
566	NC_014622	TTG	2	6	28255	28260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639497
567	NC_014622	GAA	2	6	28297	28302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639497
568	NC_014622	TGA	2	6	28383	28388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639497
569	NC_014622	CGG	2	6	28409	28414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639497
570	NC_014622	TTG	2	6	28442	28447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639497
571	NC_014622	ATT	2	6	28487	28492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639497
572	NC_014622	TGC	2	6	28559	28564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639497
573	NC_014622	ATGC	2	8	28603	28610	25 %	25 %	25 %	25 %	310639497
574	NC_014622	ATTT	2	8	28654	28661	25 %	75 %	0 %	0 %	310639497
575	NC_014622	AG	3	6	28709	28714	50 %	0 %	50 %	0 %	310639497
576	NC_014622	AGC	2	6	28885	28890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639497
577	NC_014622	GGCT	2	8	28980	28987	0 %	25 %	50 %	25 %	310639497
578	NC_014622	ATG	2	6	29036	29041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639497
579	NC_014622	AAAG	2	8	29203	29210	75 %	0 %	25 %	0 %	310639497
580	NC_014622	ATT	2	6	29231	29236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639497
581	NC_014622	AT	3	6	29255	29260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_014622	GTAA	2	8	29267	29274	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
583	NC_014622	GAA	2	6	29350	29355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639498
584	NC_014622	GAT	2	6	29391	29396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639498
585	NC_014622	TCCA	2	8	29424	29431	25 %	25 %	0 %	50 %	310639498
586	NC_014622	GCTG	2	8	29439	29446	0 %	25 %	50 %	25 %	310639498
587	NC_014622	TTTA	2	8	29458	29465	25 %	75 %	0 %	0 %	310639498
588	NC_014622	AGG	2	6	29507	29512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639498
589	NC_014622	GA	3	6	29567	29572	50 %	0 %	50 %	0 %	310639498
590	NC_014622	ATT	3	9	29582	29590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639498
591	NC_014622	GCA	2	6	29613	29618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639498
592	NC_014622	GGCG	2	8	29727	29734	0 %	0 %	75 %	25 %	310639498
593	NC_014622	CGG	2	6	29817	29822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639498
594	NC_014622	AGC	2	6	29846	29851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639498
595	NC_014622	TGG	2	6	29966	29971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639498
596	NC_014622	AGC	2	6	29976	29981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639498
597	NC_014622	GGA	2	6	30006	30011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639498
598	NC_014622	GAA	2	6	30070	30075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_014622	ATCA	2	8	30076	30083	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
600	NC_014622	TTG	2	6	30116	30121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_014622	T	6	6	30145	30150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_014622	ACA	2	6	30189	30194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_014622	ATC	2	6	30211	30216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_014622	TTG	3	9	30228	30236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_014622	CAA	2	6	30248	30253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_014622	ATA	2	6	30344	30349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_014622	TC	3	6	30350	30355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
608	NC_014622	TTTC	2	8	30422	30429	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
609	NC_014622	CT	3	6	30490	30495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
610	NC_014622	AG	3	6	30533	30538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
611	NC_014622	CA	3	6	30572	30577	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
612	NC_014622	CT	3	6	30598	30603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
613	NC_014622	TCTT	2	8	30608	30615	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
614	NC_014622	T	7	7	30620	30626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_014622	TCA	2	6	30649	30654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_014622	GGA	2	6	30672	30677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_014622	CTTGT	2	10	30727	30736	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
618	NC_014622	CGG	2	6	30786	30791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_014622	AGG	2	6	30800	30805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_014622	GGA	2	6	30808	30813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_014622	GCT	2	6	30905	30910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639499
622	NC_014622	A	6	6	30974	30979	100 %	0 %	0 %	0 %	310639499
623	NC_014622	T	6	6	30986	30991	0 %	100 %	0 %	0 %	310639499
624	NC_014622	ACA	2	6	31193	31198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639499
625	NC_014622	ATC	2	6	31243	31248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639499
626	NC_014622	CAG	2	6	31325	31330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639499
627	NC_014622	A	6	6	31340	31345	100 %	0 %	0 %	0 %	310639499
628	NC_014622	TCA	2	6	31362	31367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639499
629	NC_014622	ATG	2	6	31461	31466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639499
630	NC_014622	CAA	2	6	31492	31497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639499
631	NC_014622	GAA	2	6	31543	31548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639499
632	NC_014622	A	6	6	31547	31552	100 %	0 %	0 %	0 %	310639499
633	NC_014622	GCT	2	6	31565	31570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639499
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763	NC_014622	A	6	6	38007	38012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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765	NC_014622	ATCTG	2	10	38072	38081	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
766	NC_014622	AGG	2	6	38125	38130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
767	NC_014622	TTG	2	6	38137	38142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639509
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769	NC_014622	TA	3	6	38198	38203	50 %	50 %	0 %	0 %	310639509
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998	NC_014622	GGA	3	9	50121	50129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639518
999	NC_014622	ATG	2	6	50150	50155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639518
1000	NC_014622	ATG	2	6	50222	50227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639518

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