MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus polymyxa SC2 chromosome

Total Repeats: 111263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6502	NC_014622	GATGCC	2	12	335313	335324	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310639758
6503	NC_014622	TCG	2	6	335404	335409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639758
6504	NC_014622	ATC	2	6	335430	335435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639758
6505	NC_014622	AT	3	6	335450	335455	50 %	50 %	0 %	0 %	310639758
6506	NC_014622	TTC	2	6	335470	335475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639758
6507	NC_014622	ATG	2	6	335518	335523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639758
6508	NC_014622	TAA	2	6	335603	335608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639758
6509	NC_014622	GCA	2	6	335681	335686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639758
6510	NC_014622	CGG	3	9	335711	335719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639758
6511	NC_014622	GCA	2	6	335803	335808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639758
6512	NC_014622	TCG	2	6	335960	335965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639758
6513	NC_014622	TAC	2	6	336063	336068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639758
6514	NC_014622	AAT	2	6	336081	336086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639758
6515	NC_014622	CCG	2	6	336095	336100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639758
6516	NC_014622	TCA	2	6	336176	336181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639758
6517	NC_014622	TGG	2	6	336221	336226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639758
6518	NC_014622	CAG	2	6	336234	336239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639758
6519	NC_014622	ATA	2	6	336304	336309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639758
6520	NC_014622	CAT	2	6	336314	336319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639758
6521	NC_014622	ATA	2	6	336433	336438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639758
6522	NC_014622	TGA	2	6	336475	336480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639758
6523	NC_014622	AAC	2	6	336481	336486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639758
6524	NC_014622	CAT	2	6	336635	336640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639758
6525	NC_014622	GCC	2	6	336723	336728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639758
6526	NC_014622	GAA	2	6	336948	336953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639758
6527	NC_014622	AT	3	6	336979	336984	50 %	50 %	0 %	0 %	310639758
6528	NC_014622	CTG	2	6	337007	337012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_014622	CT	3	6	337028	337033	0 %	50 %	0 %	50 %	310639759
6530	NC_014622	CGG	2	6	337048	337053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639759
6531	NC_014622	CTGG	2	8	337056	337063	0 %	25 %	50 %	25 %	310639759
6532	NC_014622	T	6	6	337080	337085	0 %	100 %	0 %	0 %	310639759
6533	NC_014622	TAC	2	6	337127	337132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639759
6534	NC_014622	CAG	2	6	337172	337177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639759
6535	NC_014622	GTC	2	6	337285	337290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639759
6536	NC_014622	ATG	2	6	337308	337313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639759
6537	NC_014622	CAG	2	6	337329	337334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639759
6538	NC_014622	T	6	6	337335	337340	0 %	100 %	0 %	0 %	310639759
6539	NC_014622	ACT	2	6	337350	337355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639759
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6541	NC_014622	A	6	6	337399	337404	100 %	0 %	0 %	0 %	310639759
6542	NC_014622	GAG	2	6	337436	337441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639759
6543	NC_014622	CAT	2	6	337442	337447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639759
6544	NC_014622	CGC	2	6	337473	337478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639759
6545	NC_014622	TCATA	2	10	337490	337499	40 %	40 %	0 %	20 %	310639759
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6548	NC_014622	ATC	2	6	337803	337808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639759
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6550	NC_014622	A	7	7	337921	337927	100 %	0 %	0 %	0 %	310639759
6551	NC_014622	GTA	3	9	338026	338034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639759
6552	NC_014622	TGCT	2	8	338100	338107	0 %	50 %	25 %	25 %	310639759
6553	NC_014622	CAG	2	6	338109	338114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639759
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6555	NC_014622	ATGG	2	8	338209	338216	25 %	25 %	50 %	0 %	310639759
6556	NC_014622	AGC	2	6	338248	338253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639759
6557	NC_014622	CGTA	2	8	338314	338321	25 %	25 %	25 %	25 %	310639759
6558	NC_014622	GCT	2	6	338337	338342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639759
6559	NC_014622	TCTG	2	8	338372	338379	0 %	50 %	25 %	25 %	310639759
6560	NC_014622	CTC	2	6	338394	338399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310639759
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6562	NC_014622	ATG	2	6	338529	338534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639759
6563	NC_014622	TCA	2	6	338560	338565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639759
6564	NC_014622	TCAT	2	8	338590	338597	25 %	50 %	0 %	25 %	310639759
6565	NC_014622	A	6	6	338627	338632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_014622	A	6	6	338784	338789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_014622	AAC	2	6	338817	338822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6568	NC_014622	CAG	2	6	338887	338892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639760
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6570	NC_014622	AGGA	2	8	338923	338930	50 %	0 %	50 %	0 %	310639760
6571	NC_014622	CGT	2	6	338986	338991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639760
6572	NC_014622	ATGG	2	8	339013	339020	25 %	25 %	50 %	0 %	310639760
6573	NC_014622	GAA	2	6	339045	339050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639760
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6581	NC_014622	T	7	7	339535	339541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_014622	TTC	2	6	339563	339568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639761
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6585	NC_014622	CAGC	2	8	339732	339739	25 %	0 %	25 %	50 %	310639761
6586	NC_014622	AG	3	6	339764	339769	50 %	0 %	50 %	0 %	310639761
6587	NC_014622	ATG	2	6	339842	339847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639761
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6591	NC_014622	TCG	2	6	339971	339976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639761
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6594	NC_014622	ACTC	2	8	340096	340103	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6595	NC_014622	AAAAAT	2	12	340148	340159	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6601	NC_014622	ATA	2	6	340462	340467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639762
6602	NC_014622	TTG	2	6	340577	340582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639762
6603	NC_014622	GCTGCG	2	12	340604	340615	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310639762
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6605	NC_014622	TAT	2	6	340680	340685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639762
6606	NC_014622	ATT	2	6	340738	340743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639762
6607	NC_014622	ATGTG	2	10	340860	340869	20 %	40 %	40 %	0 %	310639762
6608	NC_014622	TGT	3	9	340910	340918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639762
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6610	NC_014622	T	6	6	341071	341076	0 %	100 %	0 %	0 %	310639762
6611	NC_014622	CTT	2	6	341109	341114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639762
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6613	NC_014622	CTT	2	6	341187	341192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6614	NC_014622	GT	3	6	341240	341245	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_014622	TTATG	2	10	341253	341262	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_014622	A	6	6	341269	341274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6617	NC_014622	TTA	2	6	341278	341283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_014622	CAA	2	6	341310	341315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639763
6619	NC_014622	CAA	2	6	341356	341361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639763
6620	NC_014622	TAAAT	2	10	341369	341378	60 %	40 %	0 %	0 %	310639763
6621	NC_014622	CTG	2	6	341389	341394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639763
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6747	NC_014622	AGG	2	6	348378	348383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639770
6748	NC_014622	AAC	2	6	348450	348455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639770
6749	NC_014622	GGA	2	6	348467	348472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639770
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6751	NC_014622	ACAT	2	8	348543	348550	50 %	25 %	0 %	25 %	310639770
6752	NC_014622	CTC	3	9	348599	348607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310639770
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6763	NC_014622	TTGC	2	8	349110	349117	0 %	50 %	25 %	25 %	310639770
6764	NC_014622	GTT	2	6	349140	349145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639770
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6775	NC_014622	GAG	2	6	349732	349737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6776	NC_014622	T	6	6	349762	349767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6777	NC_014622	AAG	2	6	349796	349801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6778	NC_014622	CTG	2	6	349813	349818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6780	NC_014622	TAT	2	6	349844	349849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6781	NC_014622	ATA	2	6	349903	349908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6782	NC_014622	GCTG	2	8	349954	349961	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6783	NC_014622	ATA	2	6	349982	349987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6785	NC_014622	ACG	2	6	350091	350096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6786	NC_014622	CTT	2	6	350116	350121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6787	NC_014622	TGGG	2	8	350216	350223	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6788	NC_014622	TCA	2	6	350224	350229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6789	NC_014622	CAA	2	6	350369	350374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6791	NC_014622	A	7	7	350401	350407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6794	NC_014622	CAT	2	6	350532	350537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6796	NC_014622	AG	3	6	350548	350553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6797	NC_014622	ATC	2	6	350557	350562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6799	NC_014622	ATCG	2	8	350925	350932	25 %	25 %	25 %	25 %	310639771
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6804	NC_014622	GATT	2	8	351259	351266	25 %	50 %	25 %	0 %	310639771
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6823	NC_014622	CAT	2	6	352069	352074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639772
6824	NC_014622	TTG	2	6	352120	352125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639772
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6839	NC_014622	A	8	8	353146	353153	100 %	0 %	0 %	0 %	310639772
6840	NC_014622	CAT	2	6	353154	353159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639772
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6844	NC_014622	ATCG	2	8	353239	353246	25 %	25 %	25 %	25 %	310639772
6845	NC_014622	CTG	2	6	353257	353262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639772
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6853	NC_014622	T	6	6	353671	353676	0 %	100 %	0 %	0 %	310639773
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6860	NC_014622	CTTG	2	8	354123	354130	0 %	50 %	25 %	25 %	310639773
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6872	NC_014622	GCTT	2	8	354866	354873	0 %	50 %	25 %	25 %	310639774
6873	NC_014622	TCA	2	6	355007	355012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639774
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6892	NC_014622	GTA	2	6	356210	356215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639774
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6899	NC_014622	GT	4	8	356588	356595	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6994	NC_014622	G	7	7	361169	361175	0 %	0 %	100 %	0 %	310639779
6995	NC_014622	TGCTGT	2	12	361177	361188	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	310639779
6996	NC_014622	CTG	2	6	361342	361347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639779
6997	NC_014622	AT	3	6	361351	361356	50 %	50 %	0 %	0 %	310639779
6998	NC_014622	CCA	2	6	361433	361438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310639779
6999	NC_014622	GAA	2	6	361445	361450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639779
7000	NC_014622	ATG	2	6	361468	361473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639779

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