MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus polymyxa SC2 chromosome

Total Repeats: 111263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014622	ATAA	2	8	261300	261307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_014622	GGT	2	6	261318	261323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_014622	TGT	2	6	261364	261369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639692
5004	NC_014622	AGA	2	6	261428	261433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639692
5005	NC_014622	GTGA	2	8	261447	261454	25 %	25 %	50 %	0 %	310639692
5006	NC_014622	GAA	2	6	261482	261487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639692
5007	NC_014622	TTC	2	6	261540	261545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639692
5008	NC_014622	ATA	2	6	261550	261555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639692
5009	NC_014622	AT	3	6	261608	261613	50 %	50 %	0 %	0 %	310639692
5010	NC_014622	AGA	2	6	261665	261670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639692
5011	NC_014622	ATG	2	6	261700	261705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639692
5012	NC_014622	TGA	2	6	261721	261726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639692
5013	NC_014622	GAA	2	6	261753	261758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639692
5014	NC_014622	CGA	2	6	261767	261772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639692
5015	NC_014622	AAC	2	6	261847	261852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639692
5016	NC_014622	AAG	2	6	261867	261872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639692
5017	NC_014622	ACG	2	6	261873	261878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639692
5018	NC_014622	A	7	7	261916	261922	100 %	0 %	0 %	0 %	310639692
5019	NC_014622	ATTT	2	8	261931	261938	25 %	75 %	0 %	0 %	310639692
5020	NC_014622	T	6	6	261936	261941	0 %	100 %	0 %	0 %	310639692
5021	NC_014622	AAGCG	2	10	261950	261959	40 %	0 %	40 %	20 %	310639692
5022	NC_014622	ATTA	2	8	262032	262039	50 %	50 %	0 %	0 %	310639692
5023	NC_014622	CAG	2	6	262071	262076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639692
5024	NC_014622	AGTA	2	8	262095	262102	50 %	25 %	25 %	0 %	310639692
5025	NC_014622	GTA	2	6	262104	262109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639692
5026	NC_014622	T	6	6	262125	262130	0 %	100 %	0 %	0 %	310639692
5027	NC_014622	ATG	2	6	262354	262359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639692
5028	NC_014622	AATTC	2	10	262489	262498	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5029	NC_014622	AAC	2	6	262529	262534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_014622	CATT	2	8	262562	262569	25 %	50 %	0 %	25 %	310639693
5031	NC_014622	GAA	2	6	262650	262655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639693
5032	NC_014622	TGA	2	6	262658	262663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639693
5033	NC_014622	GAT	2	6	262674	262679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639693
5034	NC_014622	TA	3	6	262693	262698	50 %	50 %	0 %	0 %	310639693
5035	NC_014622	ATTA	2	8	262727	262734	50 %	50 %	0 %	0 %	310639693
5036	NC_014622	AATATA	2	12	262818	262829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639693
5037	NC_014622	AGA	2	6	262841	262846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639693
5038	NC_014622	AAC	2	6	262929	262934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639693
5039	NC_014622	GAA	3	9	262959	262967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639693
5040	NC_014622	AGG	2	6	263033	263038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639693
5041	NC_014622	TATT	2	8	263081	263088	25 %	75 %	0 %	0 %	310639693
5042	NC_014622	A	6	6	263115	263120	100 %	0 %	0 %	0 %	310639693
5043	NC_014622	A	8	8	263125	263132	100 %	0 %	0 %	0 %	310639693
5044	NC_014622	ATT	2	6	263147	263152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639693
5045	NC_014622	AG	3	6	263235	263240	50 %	0 %	50 %	0 %	310639693
5046	NC_014622	TAA	2	6	263254	263259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639693
5047	NC_014622	A	6	6	263313	263318	100 %	0 %	0 %	0 %	310639693
5048	NC_014622	T	6	6	263328	263333	0 %	100 %	0 %	0 %	310639693
5049	NC_014622	TAA	2	6	263377	263382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639693
5050	NC_014622	CTA	2	6	263391	263396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639693
5051	NC_014622	AGAT	2	8	263455	263462	50 %	25 %	25 %	0 %	310639693
5052	NC_014622	TGA	2	6	263480	263485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639693
5053	NC_014622	AT	3	6	263556	263561	50 %	50 %	0 %	0 %	310639693
5054	NC_014622	AAG	2	6	263570	263575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639693
5055	NC_014622	ACAA	2	8	263605	263612	75 %	0 %	0 %	25 %	310639693
5056	NC_014622	AT	3	6	263617	263622	50 %	50 %	0 %	0 %	310639693
5057	NC_014622	TATT	2	8	263679	263686	25 %	75 %	0 %	0 %	310639693
5058	NC_014622	A	7	7	263715	263721	100 %	0 %	0 %	0 %	310639693
5059	NC_014622	AGCT	2	8	263737	263744	25 %	25 %	25 %	25 %	310639693
5060	NC_014622	GAT	2	6	263787	263792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639693
5061	NC_014622	TTA	2	6	263817	263822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639693
5062	NC_014622	TTC	2	6	263899	263904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_014622	TTTTG	2	10	263942	263951	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_014622	TGA	2	6	264004	264009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_014622	ATA	3	9	264023	264031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639694
5066	NC_014622	TATTAA	2	12	264165	264176	50 %	50 %	0 %	0 %	310639694
5067	NC_014622	CAT	2	6	264201	264206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639694
5068	NC_014622	TAA	2	6	264243	264248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639694
5069	NC_014622	TAA	2	6	264276	264281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639694
5070	NC_014622	TTG	2	6	264299	264304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639694
5071	NC_014622	AT	3	6	264331	264336	50 %	50 %	0 %	0 %	310639694
5072	NC_014622	A	6	6	264350	264355	100 %	0 %	0 %	0 %	310639694
5073	NC_014622	ATGAGG	2	12	264371	264382	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	310639694
5074	NC_014622	A	6	6	264417	264422	100 %	0 %	0 %	0 %	310639694
5075	NC_014622	GAAAG	2	10	264492	264501	60 %	0 %	40 %	0 %	310639694
5076	NC_014622	GAA	2	6	264651	264656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639695
5077	NC_014622	ACTA	2	8	264666	264673	50 %	25 %	0 %	25 %	310639695
5078	NC_014622	T	6	6	264678	264683	0 %	100 %	0 %	0 %	310639695
5079	NC_014622	TACAG	2	10	264727	264736	40 %	20 %	20 %	20 %	310639695
5080	NC_014622	CGA	2	6	264803	264808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639695
5081	NC_014622	ATG	2	6	264811	264816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639695
5082	NC_014622	AAGAG	2	10	264830	264839	60 %	0 %	40 %	0 %	310639695
5083	NC_014622	AGA	2	6	264857	264862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639695
5084	NC_014622	AAC	2	6	264915	264920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639695
5085	NC_014622	CAT	2	6	264937	264942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639695
5086	NC_014622	CTG	2	6	265009	265014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639695
5087	NC_014622	TTA	2	6	265046	265051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639695
5088	NC_014622	CAC	2	6	265056	265061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310639695
5089	NC_014622	A	6	6	265091	265096	100 %	0 %	0 %	0 %	310639695
5090	NC_014622	AGA	2	6	265103	265108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639695
5091	NC_014622	TAG	2	6	265124	265129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639695
5092	NC_014622	TTA	2	6	265216	265221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639695
5093	NC_014622	GGA	2	6	265255	265260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639695
5094	NC_014622	CAA	2	6	265326	265331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639695
5095	NC_014622	ATT	2	6	265348	265353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639695
5096	NC_014622	TC	3	6	265419	265424	0 %	50 %	0 %	50 %	310639695
5097	NC_014622	CAT	2	6	265442	265447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639695
5098	NC_014622	GT	3	6	265510	265515	0 %	50 %	50 %	0 %	310639695
5099	NC_014622	ATTG	2	8	265535	265542	25 %	50 %	25 %	0 %	310639695
5100	NC_014622	AT	3	6	265627	265632	50 %	50 %	0 %	0 %	310639695
5101	NC_014622	TGG	2	6	265691	265696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639695
5102	NC_014622	TGG	2	6	265759	265764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639695
5103	NC_014622	CAG	2	6	265765	265770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639695
5104	NC_014622	ATG	2	6	265798	265803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639695
5105	NC_014622	TGT	2	6	265828	265833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639695
5106	NC_014622	TTA	2	6	265834	265839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639695
5107	NC_014622	AAT	2	6	265845	265850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639695
5108	NC_014622	AG	3	6	265859	265864	50 %	0 %	50 %	0 %	310639695
5109	NC_014622	T	6	6	265877	265882	0 %	100 %	0 %	0 %	310639695
5110	NC_014622	AGA	2	6	265898	265903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639695
5111	NC_014622	TAT	2	6	265910	265915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639695
5112	NC_014622	TGAT	2	8	265948	265955	25 %	50 %	25 %	0 %	310639695
5113	NC_014622	AAT	2	6	265956	265961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639695
5114	NC_014622	AAG	3	9	265998	266006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639695
5115	NC_014622	TG	3	6	266050	266055	0 %	50 %	50 %	0 %	310639695
5116	NC_014622	ATC	2	6	266115	266120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639695
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5118	NC_014622	TTG	2	6	266346	266351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_014622	T	6	6	266425	266430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_014622	TA	3	6	266443	266448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_014622	ATG	2	6	266457	266462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_014622	GGA	2	6	266565	266570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639696
5123	NC_014622	ATC	2	6	266599	266604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639696
5124	NC_014622	AAG	2	6	266676	266681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_014622	TACT	2	8	266689	266696	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5126	NC_014622	TTAG	2	8	266774	266781	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_014622	TCCC	2	8	266788	266795	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5128	NC_014622	AAT	2	6	266842	266847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_014622	AAC	2	6	266855	266860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_014622	AAG	2	6	266890	266895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639697
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5162	NC_014622	ATA	2	6	268940	268945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5163	NC_014622	ATA	2	6	268950	268955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5164	NC_014622	TA	3	6	268979	268984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5165	NC_014622	ATT	2	6	269007	269012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5242	NC_014622	TA	3	6	272512	272517	50 %	50 %	0 %	0 %	310639704
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5245	NC_014622	A	6	6	272569	272574	100 %	0 %	0 %	0 %	310639704
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5249	NC_014622	ATAAA	2	10	272770	272779	80 %	20 %	0 %	0 %	310639704
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5251	NC_014622	TTC	2	6	272810	272815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639704
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5253	NC_014622	ATT	2	6	272897	272902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639704
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5375	NC_014622	ATCAG	2	10	277958	277967	40 %	20 %	20 %	20 %	310639710
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