MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pantoea vagans C9-1 plasmid pPag2

Total Repeats: 3251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014563	TG	3	6	151671	151676	0 %	50 %	50 %	0 %	308189417
3002	NC_014563	ATC	2	6	151722	151727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189417
3003	NC_014563	TTG	2	6	151752	151757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308189417
3004	NC_014563	GGGA	2	8	151794	151801	25 %	0 %	75 %	0 %	308189417
3005	NC_014563	ATC	2	6	151822	151827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189417
3006	NC_014563	TTTC	2	8	151833	151840	0 %	75 %	0 %	25 %	308189417
3007	NC_014563	GCC	2	6	151845	151850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189417
3008	NC_014563	CTA	2	6	151862	151867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189417
3009	NC_014563	ATC	2	6	151926	151931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189417
3010	NC_014563	AATTC	2	10	151933	151942	40 %	40 %	0 %	20 %	308189417
3011	NC_014563	TATTGA	2	12	151991	152002	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	308189417
3012	NC_014563	GTTT	2	8	152028	152035	0 %	75 %	25 %	0 %	308189417
3013	NC_014563	TGC	2	6	152091	152096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189417
3014	NC_014563	ATA	2	6	152135	152140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308189417
3015	NC_014563	TCG	2	6	152251	152256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189418
3016	NC_014563	TTG	2	6	152408	152413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308189418
3017	NC_014563	TGCC	2	8	152473	152480	0 %	25 %	25 %	50 %	308189418
3018	NC_014563	GTT	2	6	152520	152525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308189418
3019	NC_014563	AGG	2	6	152573	152578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308189418
3020	NC_014563	TAA	2	6	152678	152683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308189418
3021	NC_014563	GAAC	2	8	152709	152716	50 %	0 %	25 %	25 %	308189418
3022	NC_014563	T	6	6	152790	152795	0 %	100 %	0 %	0 %	308189418
3023	NC_014563	TCAT	2	8	152850	152857	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3024	NC_014563	TGT	2	6	152876	152881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_014563	AAT	2	6	152936	152941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_014563	GTTTTG	2	12	153099	153110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308189419
3027	NC_014563	CTT	2	6	153116	153121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308189419
3028	NC_014563	A	7	7	153155	153161	100 %	0 %	0 %	0 %	308189419
3029	NC_014563	GCT	2	6	153178	153183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189419
3030	NC_014563	CAG	2	6	153196	153201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189419
3031	NC_014563	ACC	2	6	153251	153256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308189419
3032	NC_014563	CAG	2	6	153320	153325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189419
3033	NC_014563	AC	3	6	153335	153340	50 %	0 %	0 %	50 %	308189419
3034	NC_014563	CTG	2	6	153341	153346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189419
3035	NC_014563	AAC	2	6	153413	153418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308189419
3036	NC_014563	TGT	2	6	153439	153444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308189419
3037	NC_014563	GGC	2	6	153473	153478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189419
3038	NC_014563	TCA	2	6	153554	153559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189419
3039	NC_014563	CCG	2	6	153596	153601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189419
3040	NC_014563	TGC	2	6	153624	153629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189419
3041	NC_014563	CAG	2	6	153765	153770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189419
3042	NC_014563	GTGC	2	8	153793	153800	0 %	25 %	50 %	25 %	308189419
3043	NC_014563	GAA	2	6	153803	153808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308189419
3044	NC_014563	CAG	2	6	153905	153910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189419
3045	NC_014563	GGA	2	6	154048	154053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308189419
3046	NC_014563	A	6	6	154072	154077	100 %	0 %	0 %	0 %	308189419
3047	NC_014563	ATT	2	6	154097	154102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308189419
3048	NC_014563	TGT	2	6	154143	154148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308189419
3049	NC_014563	GCA	2	6	154175	154180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189419
3050	NC_014563	GGT	2	6	154288	154293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189419
3051	NC_014563	CGG	2	6	154302	154307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189419
3052	NC_014563	CGC	2	6	154394	154399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189419
3053	NC_014563	GAT	2	6	154412	154417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189419
3054	NC_014563	CTG	2	6	154476	154481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189419
3055	NC_014563	TC	3	6	154602	154607	0 %	50 %	0 %	50 %	308189419
3056	NC_014563	A	6	6	154744	154749	100 %	0 %	0 %	0 %	308189419
3057	NC_014563	CAC	2	6	154783	154788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308189419
3058	NC_014563	CT	3	6	154857	154862	0 %	50 %	0 %	50 %	308189420
3059	NC_014563	GCC	2	6	154906	154911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189420
3060	NC_014563	TCA	3	9	154978	154986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189420
3061	NC_014563	GCAGG	2	10	155026	155035	20 %	0 %	60 %	20 %	308189420
3062	NC_014563	AT	3	6	155081	155086	50 %	50 %	0 %	0 %	308189420
3063	NC_014563	AAG	2	6	155290	155295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308189420
3064	NC_014563	TGC	2	6	155396	155401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189420
3065	NC_014563	A	6	6	155452	155457	100 %	0 %	0 %	0 %	308189420
3066	NC_014563	GA	3	6	155499	155504	50 %	0 %	50 %	0 %	308189420
3067	NC_014563	CGG	2	6	155566	155571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189420
3068	NC_014563	GA	3	6	155642	155647	50 %	0 %	50 %	0 %	308189420
3069	NC_014563	CTG	2	6	155698	155703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189420
3070	NC_014563	CGG	2	6	155705	155710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189420
3071	NC_014563	CTG	2	6	155791	155796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189420
3072	NC_014563	TCG	2	6	155886	155891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189420
3073	NC_014563	A	6	6	155920	155925	100 %	0 %	0 %	0 %	308189420
3074	NC_014563	AAT	2	6	155940	155945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_014563	T	7	7	156036	156042	0 %	100 %	0 %	0 %	308189421
3076	NC_014563	TCAG	2	8	156058	156065	25 %	25 %	25 %	25 %	308189421
3077	NC_014563	GCA	2	6	156112	156117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189422
3078	NC_014563	TATT	2	8	156139	156146	25 %	75 %	0 %	0 %	308189422
3079	NC_014563	CTTCTG	2	12	156234	156245	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	308189422
3080	NC_014563	TTA	2	6	156247	156252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308189422
3081	NC_014563	ATG	2	6	156327	156332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189422
3082	NC_014563	GCT	2	6	156371	156376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189422
3083	NC_014563	TGGC	2	8	156425	156432	0 %	25 %	50 %	25 %	308189422
3084	NC_014563	A	6	6	156519	156524	100 %	0 %	0 %	0 %	308189422
3085	NC_014563	A	7	7	156638	156644	100 %	0 %	0 %	0 %	308189422
3086	NC_014563	CAA	2	6	156679	156684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308189423
3087	NC_014563	GTC	2	6	156890	156895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_014563	TA	3	6	157016	157021	50 %	50 %	0 %	0 %	308189424
3089	NC_014563	CGG	2	6	157027	157032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189424
3090	NC_014563	TTA	2	6	157034	157039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308189424
3091	NC_014563	AGG	2	6	157088	157093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308189424
3092	NC_014563	A	7	7	157109	157115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_014563	CCAT	2	8	157157	157164	25 %	25 %	0 %	50 %	308189425
3094	NC_014563	CAC	2	6	157201	157206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308189425
3095	NC_014563	CAT	2	6	157214	157219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189425
3096	NC_014563	GATC	2	8	157227	157234	25 %	25 %	25 %	25 %	308189425
3097	NC_014563	GGC	2	6	157250	157255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189425
3098	NC_014563	TTC	2	6	157263	157268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308189425
3099	NC_014563	TGC	2	6	157356	157361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189425
3100	NC_014563	AGAA	2	8	157374	157381	75 %	0 %	25 %	0 %	308189425
3101	NC_014563	GA	3	6	157409	157414	50 %	0 %	50 %	0 %	308189425
3102	NC_014563	CA	3	6	157448	157453	50 %	0 %	0 %	50 %	308189425
3103	NC_014563	CTG	2	6	157474	157479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189425
3104	NC_014563	ATC	2	6	157500	157505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189425
3105	NC_014563	TCG	2	6	157594	157599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189425
3106	NC_014563	AGA	2	6	157651	157656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308189425
3107	NC_014563	TCT	2	6	157667	157672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308189425
3108	NC_014563	AGT	2	6	157733	157738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189425
3109	NC_014563	CGG	2	6	157780	157785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189425
3110	NC_014563	TC	3	6	157835	157840	0 %	50 %	0 %	50 %	308189425
3111	NC_014563	GAA	2	6	157890	157895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308189425
3112	NC_014563	A	6	6	157894	157899	100 %	0 %	0 %	0 %	308189425
3113	NC_014563	TCTG	2	8	157969	157976	0 %	50 %	25 %	25 %	308189425
3114	NC_014563	GGT	2	6	158050	158055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189425
3115	NC_014563	GAA	2	6	158069	158074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308189425
3116	NC_014563	T	6	6	158101	158106	0 %	100 %	0 %	0 %	308189425
3117	NC_014563	ATC	2	6	158128	158133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189425
3118	NC_014563	AGG	2	6	158183	158188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308189425
3119	NC_014563	AC	4	8	158394	158401	50 %	0 %	0 %	50 %	308189425
3120	NC_014563	ACC	2	6	158424	158429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308189425
3121	NC_014563	AG	3	6	158450	158455	50 %	0 %	50 %	0 %	308189425
3122	NC_014563	CAGC	2	8	158459	158466	25 %	0 %	25 %	50 %	308189425
3123	NC_014563	C	6	6	158466	158471	0 %	0 %	0 %	100 %	308189425
3124	NC_014563	TCA	2	6	158482	158487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189425
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3232	NC_014563	TAT	2	6	164380	164385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308189435
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3239	NC_014563	TGC	2	6	165122	165127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189435
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3243	NC_014563	GCA	2	6	165357	165362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189435
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3247	NC_014563	CCA	2	6	165471	165476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308189435
3248	NC_014563	GCA	2	6	165494	165499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189435
3249	NC_014563	ATG	2	6	165603	165608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189435
3250	NC_014563	CAG	2	6	165623	165628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189435
3251	NC_014563	CCAGC	2	10	165638	165647	20 %	0 %	20 %	60 %	308189435

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