MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pantoea vagans C9-1 plasmid pPag2

Total Repeats: 3251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014563	CCA	2	6	126060	126065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308189389
2502	NC_014563	GCT	2	6	126088	126093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189389
2503	NC_014563	AGC	2	6	126121	126126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189389
2504	NC_014563	TGC	2	6	126146	126151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189389
2505	NC_014563	ATTC	2	8	126183	126190	25 %	50 %	0 %	25 %	308189389
2506	NC_014563	TG	3	6	126352	126357	0 %	50 %	50 %	0 %	308189390
2507	NC_014563	CACG	2	8	126359	126366	25 %	0 %	25 %	50 %	308189390
2508	NC_014563	CT	3	6	126419	126424	0 %	50 %	0 %	50 %	308189390
2509	NC_014563	TCA	2	6	126427	126432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189390
2510	NC_014563	CTC	2	6	126437	126442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2511	NC_014563	GCC	2	6	126475	126480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2512	NC_014563	CAG	2	6	126482	126487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_014563	AGCAG	2	10	126498	126507	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2514	NC_014563	CGG	2	6	126565	126570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_014563	GGAG	2	8	126657	126664	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_014563	TTTCTA	2	12	126820	126831	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2517	NC_014563	A	6	6	126884	126889	100 %	0 %	0 %	0 %	308189391
2518	NC_014563	ACT	2	6	126891	126896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189391
2519	NC_014563	TTA	2	6	126931	126936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308189391
2520	NC_014563	CAAA	2	8	126985	126992	75 %	0 %	0 %	25 %	308189391
2521	NC_014563	CAC	2	6	127058	127063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308189391
2522	NC_014563	ATT	2	6	127092	127097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308189391
2523	NC_014563	TCC	2	6	127108	127113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308189391
2524	NC_014563	T	6	6	127179	127184	0 %	100 %	0 %	0 %	308189391
2525	NC_014563	TCT	2	6	127188	127193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308189391
2526	NC_014563	T	7	7	127193	127199	0 %	100 %	0 %	0 %	308189391
2527	NC_014563	TCA	2	6	127218	127223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189391
2528	NC_014563	A	7	7	127223	127229	100 %	0 %	0 %	0 %	308189391
2529	NC_014563	TAG	2	6	127297	127302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_014563	CTT	2	6	127333	127338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2531	NC_014563	ATCA	2	8	127346	127353	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2532	NC_014563	GCATAA	2	12	127410	127421	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2533	NC_014563	T	6	6	127429	127434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_014563	ATTT	2	8	127439	127446	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_014563	TATTT	2	10	127471	127480	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_014563	CT	3	6	127573	127578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2537	NC_014563	CTTTCC	2	12	127696	127707	0 %	50 %	0 %	50 %	308189392
2538	NC_014563	TGC	2	6	127730	127735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189392
2539	NC_014563	GCT	3	9	127762	127770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189392
2540	NC_014563	CTGA	2	8	127798	127805	25 %	25 %	25 %	25 %	308189392
2541	NC_014563	CCT	2	6	127849	127854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308189392
2542	NC_014563	ATG	2	6	127890	127895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189392
2543	NC_014563	TCGT	2	8	127905	127912	0 %	50 %	25 %	25 %	308189392
2544	NC_014563	CT	3	6	128015	128020	0 %	50 %	0 %	50 %	308189392
2545	NC_014563	CCG	2	6	128029	128034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189392
2546	NC_014563	CTG	2	6	128060	128065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189392
2547	NC_014563	TGC	2	6	128118	128123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189392
2548	NC_014563	TGG	2	6	128126	128131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189392
2549	NC_014563	AGT	2	6	128177	128182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189392
2550	NC_014563	CAA	2	6	128188	128193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308189392
2551	NC_014563	CAGC	2	8	128233	128240	25 %	0 %	25 %	50 %	308189392
2552	NC_014563	AGT	2	6	128328	128333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189392
2553	NC_014563	CTG	2	6	128349	128354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189392
2554	NC_014563	ACG	2	6	128364	128369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189392
2555	NC_014563	CTT	2	6	128387	128392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308189392
2556	NC_014563	AAT	2	6	128447	128452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308189392
2557	NC_014563	CTG	2	6	128486	128491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189392
2558	NC_014563	TCA	2	6	128547	128552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189392
2559	NC_014563	CAT	2	6	128597	128602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189392
2560	NC_014563	GC	3	6	128603	128608	0 %	0 %	50 %	50 %	308189392
2561	NC_014563	TGGAA	2	10	128628	128637	40 %	20 %	40 %	0 %	308189392
2562	NC_014563	TGGG	2	8	128694	128701	0 %	25 %	75 %	0 %	308189392
2563	NC_014563	AGGA	2	8	128747	128754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_014563	GGTCAC	2	12	128790	128801	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	308189393
2565	NC_014563	GCA	2	6	128812	128817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189393
2566	NC_014563	GTGC	2	8	128908	128915	0 %	25 %	50 %	25 %	308189393
2567	NC_014563	CG	3	6	128961	128966	0 %	0 %	50 %	50 %	308189393
2568	NC_014563	TTC	2	6	128982	128987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308189393
2569	NC_014563	GCA	2	6	129047	129052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189393
2570	NC_014563	GCC	2	6	129058	129063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189393
2571	NC_014563	GAA	2	6	129115	129120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308189393
2572	NC_014563	ACC	2	6	129189	129194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308189393
2573	NC_014563	GCC	2	6	129300	129305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189393
2574	NC_014563	CAG	2	6	129351	129356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189393
2575	NC_014563	CG	3	6	129401	129406	0 %	0 %	50 %	50 %	308189393
2576	NC_014563	ATA	2	6	129436	129441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308189393
2577	NC_014563	TTC	2	6	129480	129485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308189393
2578	NC_014563	GGC	2	6	129605	129610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189393
2579	NC_014563	CTG	2	6	129628	129633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189393
2580	NC_014563	CG	3	6	129724	129729	0 %	0 %	50 %	50 %	308189393
2581	NC_014563	TGCA	2	8	129781	129788	25 %	25 %	25 %	25 %	308189393
2582	NC_014563	TCT	2	6	129865	129870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2583	NC_014563	ACAA	2	8	129910	129917	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2584	NC_014563	A	7	7	129934	129940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_014563	GA	3	6	129969	129974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_014563	A	6	6	129980	129985	100 %	0 %	0 %	0 %	308189394
2587	NC_014563	GTT	2	6	130011	130016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308189394
2588	NC_014563	GCG	2	6	130025	130030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189394
2589	NC_014563	ATC	2	6	130071	130076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189394
2590	NC_014563	GAA	2	6	130169	130174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308189394
2591	NC_014563	GAA	2	6	130238	130243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308189394
2592	NC_014563	AAAC	2	8	130255	130262	75 %	0 %	0 %	25 %	308189394
2593	NC_014563	GGA	2	6	130287	130292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308189394
2594	NC_014563	GAA	2	6	130328	130333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308189394
2595	NC_014563	CTA	2	6	130639	130644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2596	NC_014563	GCCA	2	8	130649	130656	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2597	NC_014563	CTGGT	2	10	130676	130685	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2598	NC_014563	TGC	2	6	130698	130703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2599	NC_014563	GCA	2	6	130750	130755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189395
2600	NC_014563	AGT	2	6	130764	130769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189395
2601	NC_014563	AGA	2	6	130821	130826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308189395
2602	NC_014563	CTT	2	6	130842	130847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308189395
2603	NC_014563	A	6	6	130953	130958	100 %	0 %	0 %	0 %	308189395
2604	NC_014563	TCT	2	6	130997	131002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308189395
2605	NC_014563	GCC	2	6	131053	131058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2606	NC_014563	GCT	2	6	131085	131090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2607	NC_014563	ATG	2	6	131120	131125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189396
2608	NC_014563	GCAA	2	8	131138	131145	50 %	0 %	25 %	25 %	308189396
2609	NC_014563	GAT	2	6	131161	131166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189396
2610	NC_014563	TAA	2	6	131204	131209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308189396
2611	NC_014563	AG	3	6	131396	131401	50 %	0 %	50 %	0 %	308189397
2612	NC_014563	CGG	2	6	131404	131409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189397
2613	NC_014563	GAG	2	6	131574	131579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308189397
2614	NC_014563	TCC	2	6	131610	131615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308189397
2615	NC_014563	GGT	2	6	131618	131623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189397
2616	NC_014563	GA	3	6	131708	131713	50 %	0 %	50 %	0 %	308189397
2617	NC_014563	ATC	2	6	131792	131797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189397
2618	NC_014563	TGAAA	2	10	131800	131809	60 %	20 %	20 %	0 %	308189397
2619	NC_014563	GCA	2	6	131842	131847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_014563	CTT	2	6	131918	131923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2621	NC_014563	GTG	2	6	131931	131936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_014563	T	6	6	132156	132161	0 %	100 %	0 %	0 %	308189398
2623	NC_014563	TAA	2	6	132175	132180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308189398
2624	NC_014563	GAGCA	2	10	132248	132257	40 %	0 %	40 %	20 %	308189398
2625	NC_014563	GAA	2	6	132261	132266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308189398
2626	NC_014563	CGA	2	6	132274	132279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189398
2627	NC_014563	TCA	2	6	132280	132285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189398
2628	NC_014563	AAT	2	6	132350	132355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308189398
2629	NC_014563	AGT	2	6	132418	132423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189398
2630	NC_014563	GCA	2	6	132483	132488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189398
2631	NC_014563	A	8	8	132530	132537	100 %	0 %	0 %	0 %	308189398
2632	NC_014563	CTG	2	6	132587	132592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189398
2633	NC_014563	GTGCAT	2	12	132602	132613	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	308189398
2634	NC_014563	GTG	2	6	132619	132624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189398
2635	NC_014563	CTG	2	6	132625	132630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189398
2636	NC_014563	TCA	2	6	132631	132636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189398
2637	NC_014563	TCA	2	6	132643	132648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189398
2638	NC_014563	CTGG	2	8	132691	132698	0 %	25 %	50 %	25 %	308189398
2639	NC_014563	GGC	2	6	132834	132839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189398
2640	NC_014563	GGC	2	6	132952	132957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2641	NC_014563	CAC	2	6	132990	132995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2642	NC_014563	GCA	2	6	133004	133009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2643	NC_014563	AAC	2	6	133016	133021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2644	NC_014563	T	6	6	133112	133117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2645	NC_014563	GCC	2	6	133148	133153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2646	NC_014563	AACA	2	8	133162	133169	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2647	NC_014563	AGA	2	6	133239	133244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2648	NC_014563	ATT	2	6	133294	133299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2649	NC_014563	TCTGC	2	10	133302	133311	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2650	NC_014563	GCAG	2	8	133313	133320	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2651	NC_014563	GGCCT	2	10	133382	133391	0 %	20 %	40 %	40 %	308189399
2652	NC_014563	GC	4	8	133480	133487	0 %	0 %	50 %	50 %	308189399
2653	NC_014563	ATC	3	9	133542	133550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189399
2654	NC_014563	CAG	2	6	133586	133591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189399
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2656	NC_014563	CAT	2	6	133681	133686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189399
2657	NC_014563	ATG	2	6	133730	133735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189399
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2666	NC_014563	AT	3	6	134134	134139	50 %	50 %	0 %	0 %	308189399
2667	NC_014563	CTG	2	6	134210	134215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189399
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2670	NC_014563	GCA	2	6	134323	134328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2671	NC_014563	CAA	2	6	134338	134343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2673	NC_014563	CGA	2	6	134412	134417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2674	NC_014563	GA	3	6	134416	134421	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2675	NC_014563	CGA	2	6	134451	134456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2676	NC_014563	TTC	2	6	134523	134528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2678	NC_014563	TGA	2	6	134721	134726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189401
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2685	NC_014563	CCT	2	6	135129	135134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2696	NC_014563	TGGAA	2	10	135624	135633	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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2700	NC_014563	GTTCT	3	15	135775	135789	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2701	NC_014563	AAG	2	6	135794	135799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2703	NC_014563	CTG	2	6	135831	135836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2712	NC_014563	ATG	2	6	136143	136148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2714	NC_014563	A	7	7	136167	136173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2715	NC_014563	CCG	2	6	136177	136182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2726	NC_014563	TCCA	2	8	136440	136447	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2727	NC_014563	AC	3	6	136451	136456	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2737	NC_014563	GCA	2	6	137166	137171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189405
2738	NC_014563	GTC	2	6	137265	137270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189405
2739	NC_014563	GCCTGT	2	12	137372	137383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189405
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2741	NC_014563	TGC	2	6	137426	137431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189405
2742	NC_014563	CGG	2	6	137472	137477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189405
2743	NC_014563	AG	3	6	137535	137540	50 %	0 %	50 %	0 %	308189405
2744	NC_014563	GGGA	2	8	137542	137549	25 %	0 %	75 %	0 %	308189405
2745	NC_014563	ACC	2	6	137586	137591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308189405
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2748	NC_014563	TGG	2	6	137948	137953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189406
2749	NC_014563	GTC	2	6	138016	138021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189406
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2751	NC_014563	GTT	2	6	138192	138197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308189406
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