MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Pantoea vagans C9-1 plasmid pPag2

Total Repeats: 3251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_014563	GCATG	2	10	100197	100206	20 %	20 %	40 %	20 %	308189362
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2003	NC_014563	CGC	2	6	100287	100292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189362
2004	NC_014563	TCAT	2	8	100346	100353	25 %	50 %	0 %	25 %	308189362
2005	NC_014563	G	6	6	100482	100487	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_014563	CGCGC	2	10	100571	100580	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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2008	NC_014563	CGC	2	6	100654	100659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2009	NC_014563	A	9	9	100738	100746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_014563	ACC	2	6	100768	100773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2011	NC_014563	GAT	2	6	100844	100849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_014563	GAAC	2	8	100908	100915	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2013	NC_014563	ATG	2	6	100923	100928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2014	NC_014563	TGT	2	6	100996	101001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2015	NC_014563	ATG	2	6	101016	101021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_014563	AATC	2	8	101061	101068	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2017	NC_014563	CT	3	6	101095	101100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2019	NC_014563	GTTAC	2	10	101174	101183	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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2123	NC_014563	ATG	2	6	106937	106942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189368
2124	NC_014563	ACT	2	6	106956	106961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189368
2125	NC_014563	CTG	2	6	107081	107086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189368
2126	NC_014563	ACG	2	6	107088	107093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189368
2127	NC_014563	TAA	2	6	107094	107099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308189368
2128	NC_014563	GCTC	2	8	107118	107125	0 %	25 %	25 %	50 %	308189368
2129	NC_014563	ATCA	2	8	107143	107150	50 %	25 %	0 %	25 %	308189368
2130	NC_014563	GCTG	2	8	107154	107161	0 %	25 %	50 %	25 %	308189368
2131	NC_014563	TGGC	2	8	107185	107192	0 %	25 %	50 %	25 %	308189368
2132	NC_014563	CGCT	2	8	107199	107206	0 %	25 %	25 %	50 %	308189368
2133	NC_014563	GGT	2	6	107211	107216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189368
2134	NC_014563	T	7	7	107316	107322	0 %	100 %	0 %	0 %	308189368
2135	NC_014563	T	6	6	107410	107415	0 %	100 %	0 %	0 %	308189368
2136	NC_014563	A	6	6	107434	107439	100 %	0 %	0 %	0 %	308189368
2137	NC_014563	ATG	2	6	107492	107497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189368
2138	NC_014563	TAA	2	6	107553	107558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308189368
2139	NC_014563	ATG	2	6	107581	107586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189368
2140	NC_014563	G	6	6	107592	107597	0 %	0 %	100 %	0 %	308189368
2141	NC_014563	TTGA	2	8	107604	107611	25 %	50 %	25 %	0 %	308189368
2142	NC_014563	GGC	2	6	107631	107636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189369
2143	NC_014563	TAT	2	6	107648	107653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308189369
2144	NC_014563	GCA	2	6	107738	107743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189369
2145	NC_014563	CGC	2	6	107765	107770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189369
2146	NC_014563	TCA	2	6	107830	107835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189369
2147	NC_014563	GCAG	2	8	108108	108115	25 %	0 %	50 %	25 %	308189370
2148	NC_014563	GCC	2	6	108122	108127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189370
2149	NC_014563	TTA	2	6	108143	108148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308189370
2150	NC_014563	CTG	2	6	108157	108162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189370
2151	NC_014563	GCA	2	6	108165	108170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189370
2152	NC_014563	TAC	2	6	108172	108177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189370
2153	NC_014563	AAGCGT	2	12	108241	108252	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	308189370
2154	NC_014563	TATT	2	8	108279	108286	25 %	75 %	0 %	0 %	308189370
2155	NC_014563	CAA	2	6	108289	108294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308189370
2156	NC_014563	ATC	2	6	108304	108309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189370
2157	NC_014563	T	8	8	108482	108489	0 %	100 %	0 %	0 %	308189370
2158	NC_014563	GAT	2	6	108498	108503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189370
2159	NC_014563	ATC	2	6	108553	108558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189370
2160	NC_014563	ACT	2	6	108605	108610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189370
2161	NC_014563	TGG	2	6	108765	108770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189370
2162	NC_014563	TGG	2	6	108873	108878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189370
2163	NC_014563	A	6	6	108941	108946	100 %	0 %	0 %	0 %	308189370
2164	NC_014563	GGC	2	6	109021	109026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189370
2165	NC_014563	CCGA	2	8	109057	109064	25 %	0 %	25 %	50 %	308189370
2166	NC_014563	TTC	2	6	109125	109130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308189370
2167	NC_014563	GT	3	6	109158	109163	0 %	50 %	50 %	0 %	308189370
2168	NC_014563	CGC	2	6	109198	109203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189370
2169	NC_014563	AT	3	6	109228	109233	50 %	50 %	0 %	0 %	308189371
2170	NC_014563	TCA	2	6	109251	109256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189371
2171	NC_014563	TCG	2	6	109261	109266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189371
2172	NC_014563	AAG	2	6	109332	109337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308189371
2173	NC_014563	ATC	2	6	109344	109349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189371
2174	NC_014563	GCG	2	6	109372	109377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189371
2175	NC_014563	ATC	2	6	109385	109390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189371
2176	NC_014563	CGA	2	6	109621	109626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189371
2177	NC_014563	ATG	2	6	109683	109688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189371
2178	NC_014563	CTTCT	2	10	109699	109708	0 %	60 %	0 %	40 %	308189371
2179	NC_014563	GAACT	2	10	109709	109718	40 %	20 %	20 %	20 %	308189371
2180	NC_014563	ATT	2	6	109770	109775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308189371
2181	NC_014563	GGAAA	2	10	109865	109874	60 %	0 %	40 %	0 %	308189371
2182	NC_014563	ATT	2	6	109884	109889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308189371
2183	NC_014563	CCAG	2	8	109903	109910	25 %	0 %	25 %	50 %	308189371
2184	NC_014563	GCG	2	6	110019	110024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189371
2185	NC_014563	CAT	2	6	110165	110170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189371
2186	NC_014563	TCA	2	6	110175	110180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189371
2187	NC_014563	CTT	2	6	110250	110255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308189371
2188	NC_014563	GTA	2	6	110303	110308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189371
2189	NC_014563	CGG	2	6	110311	110316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189371
2190	NC_014563	ATT	2	6	110332	110337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308189371
2191	NC_014563	TGG	2	6	110338	110343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189371
2192	NC_014563	AGG	2	6	110485	110490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308189371
2193	NC_014563	CAA	2	6	110501	110506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308189371
2194	NC_014563	ATG	2	6	110585	110590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189371
2195	NC_014563	CTG	2	6	110607	110612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189371
2196	NC_014563	TTG	2	6	110724	110729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308189371
2197	NC_014563	CCT	2	6	110785	110790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308189371
2198	NC_014563	TTG	2	6	110826	110831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308189371
2199	NC_014563	A	7	7	110836	110842	100 %	0 %	0 %	0 %	308189371
2200	NC_014563	TCG	2	6	110879	110884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189371
2201	NC_014563	TCA	2	6	110895	110900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189371
2202	NC_014563	T	6	6	111041	111046	0 %	100 %	0 %	0 %	308189371
2203	NC_014563	ATGA	2	8	111061	111068	50 %	25 %	25 %	0 %	308189372
2204	NC_014563	GT	3	6	111093	111098	0 %	50 %	50 %	0 %	308189372
2205	NC_014563	T	7	7	111174	111180	0 %	100 %	0 %	0 %	308189372
2206	NC_014563	TGG	2	6	111285	111290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189372
2207	NC_014563	CT	3	6	111413	111418	0 %	50 %	0 %	50 %	308189372
2208	NC_014563	TG	3	6	111486	111491	0 %	50 %	50 %	0 %	308189372
2209	NC_014563	AAT	2	6	111553	111558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308189372
2210	NC_014563	GCA	2	6	111573	111578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189372
2211	NC_014563	GTT	2	6	111596	111601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308189372
2212	NC_014563	ATT	2	6	111664	111669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308189372
2213	NC_014563	AGT	2	6	111709	111714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189372
2214	NC_014563	CAG	2	6	111721	111726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189372
2215	NC_014563	ATTT	2	8	111776	111783	25 %	75 %	0 %	0 %	308189372
2216	NC_014563	CGC	2	6	111843	111848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189372
2217	NC_014563	TATT	2	8	111855	111862	25 %	75 %	0 %	0 %	308189372
2218	NC_014563	GCG	2	6	111973	111978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189372
2219	NC_014563	TC	3	6	111996	112001	0 %	50 %	0 %	50 %	308189372
2220	NC_014563	CCA	2	6	112039	112044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2221	NC_014563	GCA	2	6	112149	112154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189373
2222	NC_014563	CTG	2	6	112166	112171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189373
2223	NC_014563	CCG	2	6	112231	112236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189373
2224	NC_014563	AAT	2	6	112244	112249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308189373
2225	NC_014563	TCC	2	6	112326	112331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308189373
2226	NC_014563	TCT	2	6	112377	112382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308189373
2227	NC_014563	GCGG	2	8	112508	112515	0 %	0 %	75 %	25 %	308189373
2228	NC_014563	CAT	2	6	112589	112594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189373
2229	NC_014563	CCG	2	6	112648	112653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189373
2230	NC_014563	CAG	2	6	112685	112690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189373
2231	NC_014563	GT	3	6	112694	112699	0 %	50 %	50 %	0 %	308189373
2232	NC_014563	CTG	3	9	112724	112732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189373
2233	NC_014563	CTG	2	6	112739	112744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189373
2234	NC_014563	CCG	2	6	112804	112809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189373
2235	NC_014563	CTG	2	6	112829	112834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189373
2236	NC_014563	GCA	2	6	112860	112865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189373
2237	NC_014563	CTGTA	2	10	112871	112880	20 %	40 %	20 %	20 %	308189373
2238	NC_014563	AGGC	2	8	112959	112966	25 %	0 %	50 %	25 %	308189374
2239	NC_014563	TTCT	2	8	113014	113021	0 %	75 %	0 %	25 %	308189374
2240	NC_014563	CTG	2	6	113104	113109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189375
2241	NC_014563	CG	4	8	113118	113125	0 %	0 %	50 %	50 %	308189375
2242	NC_014563	TTC	2	6	113194	113199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308189375
2243	NC_014563	ACA	2	6	113213	113218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308189375
2244	NC_014563	GC	3	6	113229	113234	0 %	0 %	50 %	50 %	308189375
2245	NC_014563	CCT	2	6	113243	113248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308189375
2246	NC_014563	GCCT	2	8	113255	113262	0 %	25 %	25 %	50 %	308189375
2247	NC_014563	GC	3	6	113306	113311	0 %	0 %	50 %	50 %	308189375
2248	NC_014563	GCA	2	6	113315	113320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189375
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2250	NC_014563	CCGG	2	8	113385	113392	0 %	0 %	50 %	50 %	308189375
2251	NC_014563	ATCC	2	8	113473	113480	25 %	25 %	0 %	50 %	308189375
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2254	NC_014563	ACTG	2	8	113536	113543	25 %	25 %	25 %	25 %	308189375
2255	NC_014563	CGCAG	2	10	113558	113567	20 %	0 %	40 %	40 %	308189375
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2260	NC_014563	GCA	2	6	113823	113828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189375
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2299	NC_014563	ACC	2	6	115781	115786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2300	NC_014563	GCAG	2	8	115809	115816	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2301	NC_014563	CGC	2	6	115839	115844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2302	NC_014563	CGG	2	6	115870	115875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2303	NC_014563	T	6	6	115952	115957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2304	NC_014563	GGC	2	6	115983	115988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2326	NC_014563	CA	3	6	116966	116971	50 %	0 %	0 %	50 %	308189376
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2329	NC_014563	GTT	2	6	117189	117194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2330	NC_014563	CAC	2	6	117234	117239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2331	NC_014563	CAGC	2	8	117360	117367	25 %	0 %	25 %	50 %	308189377
2332	NC_014563	TCA	2	6	117429	117434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189377
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2342	NC_014563	TGG	2	6	117805	117810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189378
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2350	NC_014563	GCAG	2	8	118182	118189	25 %	0 %	50 %	25 %	308189378
2351	NC_014563	CGA	2	6	118206	118211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189378
2352	NC_014563	CTG	2	6	118273	118278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189378
2353	NC_014563	CT	3	6	118308	118313	0 %	50 %	0 %	50 %	308189378
2354	NC_014563	CACCC	2	10	118342	118351	20 %	0 %	0 %	80 %	308189378
2355	NC_014563	ACC	2	6	118366	118371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308189378
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2357	NC_014563	AAC	2	6	118518	118523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2358	NC_014563	GC	3	6	118563	118568	0 %	0 %	50 %	50 %	308189379
2359	NC_014563	GCT	2	6	118657	118662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189379
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2361	NC_014563	GCAT	2	8	118672	118679	25 %	25 %	25 %	25 %	308189379
2362	NC_014563	CG	3	6	118698	118703	0 %	0 %	50 %	50 %	308189379
2363	NC_014563	A	7	7	118705	118711	100 %	0 %	0 %	0 %	308189379
2364	NC_014563	TGC	2	6	118749	118754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189379
2365	NC_014563	TCT	2	6	118756	118761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308189379
2366	NC_014563	GGC	3	9	118832	118840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189379
2367	NC_014563	GCT	2	6	118844	118849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189379
2368	NC_014563	CAGC	2	8	118860	118867	25 %	0 %	25 %	50 %	308189379
2369	NC_014563	GTG	2	6	119069	119074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189379
2370	NC_014563	TCA	2	6	119120	119125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189379
2371	NC_014563	AT	3	6	119170	119175	50 %	50 %	0 %	0 %	308189379
2372	NC_014563	ACC	2	6	119270	119275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308189379
2373	NC_014563	CG	3	6	119310	119315	0 %	0 %	50 %	50 %	308189379
2374	NC_014563	GAA	2	6	119366	119371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308189379
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2377	NC_014563	GCTG	2	8	119429	119436	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2378	NC_014563	CGCC	2	8	119563	119570	0 %	0 %	25 %	75 %	308189380
2379	NC_014563	AG	3	6	119590	119595	50 %	0 %	50 %	0 %	308189380
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2403	NC_014563	GAT	2	6	120859	120864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189380
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2411	NC_014563	ACT	2	6	121167	121172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189381
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2443	NC_014563	AGA	2	6	122837	122842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2478	NC_014563	ATG	2	6	124602	124607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189387
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2481	NC_014563	GCC	2	6	124878	124883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189387
2482	NC_014563	AGT	2	6	124917	124922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189387
2483	NC_014563	TCG	2	6	124974	124979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189387
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2485	NC_014563	CGA	2	6	125086	125091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189387
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2487	NC_014563	CGG	2	6	125156	125161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189387
2488	NC_014563	TGC	2	6	125359	125364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189387
2489	NC_014563	GTT	2	6	125546	125551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2490	NC_014563	A	7	7	125565	125571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2491	NC_014563	TGC	2	6	125572	125577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2492	NC_014563	CAG	2	6	125609	125614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2493	NC_014563	GCA	3	9	125624	125632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2494	NC_014563	GGCAC	2	10	125722	125731	20 %	0 %	40 %	40 %	308189388
2495	NC_014563	TCCG	2	8	125748	125755	0 %	25 %	25 %	50 %	308189388
2496	NC_014563	AAG	2	6	125774	125779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308189388
2497	NC_014563	AGCGA	2	10	125783	125792	40 %	0 %	40 %	20 %	308189388
2498	NC_014563	GCC	2	6	125818	125823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189388
2499	NC_014563	GGCC	2	8	125945	125952	0 %	0 %	50 %	50 %	308189389
2500	NC_014563	AGC	2	6	126026	126031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189389

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