MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pantoea vagans C9-1 plasmid pPag2

Total Repeats: 3251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014563	TTACG	2	10	52741	52750	20 %	40 %	20 %	20 %	308189279
1002	NC_014563	CGGC	2	8	52760	52767	0 %	0 %	50 %	50 %	308189279
1003	NC_014563	ACC	2	6	52831	52836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308189279
1004	NC_014563	AGA	2	6	52840	52845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308189279
1005	NC_014563	TGGCG	2	10	52849	52858	0 %	20 %	60 %	20 %	308189279
1006	NC_014563	GGC	2	6	52871	52876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189279
1007	NC_014563	CGCTG	2	10	52878	52887	0 %	20 %	40 %	40 %	308189279
1008	NC_014563	GCG	2	6	52903	52908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189279
1009	NC_014563	CCA	2	6	52914	52919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308189279
1010	NC_014563	AAC	2	6	53043	53048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308189279
1011	NC_014563	AGCCTG	2	12	53049	53060	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	308189279
1012	NC_014563	A	7	7	53096	53102	100 %	0 %	0 %	0 %	308189279
1013	NC_014563	ATGGGA	2	12	53141	53152	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	308189279
1014	NC_014563	TTTC	2	8	53167	53174	0 %	75 %	0 %	25 %	308189279
1015	NC_014563	TCC	2	6	53261	53266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308189279
1016	NC_014563	CGC	2	6	53298	53303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189279
1017	NC_014563	CGC	2	6	53445	53450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189279
1018	NC_014563	GCC	2	6	53489	53494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189279
1019	NC_014563	CCGT	2	8	53561	53568	0 %	25 %	25 %	50 %	308189279
1020	NC_014563	CCGT	2	8	53597	53604	0 %	25 %	25 %	50 %	308189279
1021	NC_014563	TCT	2	6	53605	53610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308189279
1022	NC_014563	TCGG	2	8	53689	53696	0 %	25 %	50 %	25 %	308189280
1023	NC_014563	TCA	2	6	53729	53734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189280
1024	NC_014563	TGC	2	6	53931	53936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189280
1025	NC_014563	GCAG	2	8	53968	53975	25 %	0 %	50 %	25 %	308189280
1026	NC_014563	AAT	2	6	54023	54028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308189280
1027	NC_014563	GGT	3	9	54066	54074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189281
1028	NC_014563	GCTG	2	8	54104	54111	0 %	25 %	50 %	25 %	308189281
1029	NC_014563	GAA	2	6	54147	54152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308189281
1030	NC_014563	GAA	2	6	54158	54163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308189281
1031	NC_014563	TCA	2	6	54175	54180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189281
1032	NC_014563	GC	3	6	54202	54207	0 %	0 %	50 %	50 %	308189281
1033	NC_014563	AG	3	6	54236	54241	50 %	0 %	50 %	0 %	308189281
1034	NC_014563	TCA	2	6	54244	54249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189281
1035	NC_014563	CTG	2	6	54291	54296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189281
1036	NC_014563	TGA	2	6	54347	54352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189281
1037	NC_014563	TGG	2	6	54379	54384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189281
1038	NC_014563	TGA	2	6	54418	54423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189281
1039	NC_014563	ATT	2	6	54447	54452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308189281
1040	NC_014563	GGC	2	6	54519	54524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189281
1041	NC_014563	CTG	2	6	54600	54605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189281
1042	NC_014563	GCT	2	6	54626	54631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189281
1043	NC_014563	CTG	2	6	54741	54746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189281
1044	NC_014563	CGG	2	6	54800	54805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189281
1045	NC_014563	CGG	2	6	54831	54836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_014563	GAG	2	6	54856	54861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_014563	GCTG	2	8	54931	54938	0 %	25 %	50 %	25 %	308189282
1048	NC_014563	CGG	2	6	55006	55011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189282
1049	NC_014563	TGT	2	6	55028	55033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308189282
1050	NC_014563	AAAT	2	8	55178	55185	75 %	25 %	0 %	0 %	308189282
1051	NC_014563	ATT	2	6	55248	55253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_014563	GAT	2	6	55282	55287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_014563	TGA	2	6	55317	55322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189283
1054	NC_014563	GCA	2	6	55360	55365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189283
1055	NC_014563	ACC	2	6	55376	55381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308189283
1056	NC_014563	CAG	2	6	55448	55453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189283
1057	NC_014563	CGG	2	6	55477	55482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189283
1058	NC_014563	TGA	2	6	55498	55503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189283
1059	NC_014563	GAAAA	2	10	55544	55553	80 %	0 %	20 %	0 %	308189283
1060	NC_014563	CGC	2	6	55561	55566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189283
1061	NC_014563	GC	4	8	55565	55572	0 %	0 %	50 %	50 %	308189283
1062	NC_014563	TGC	2	6	55626	55631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189283
1063	NC_014563	GC	3	6	55649	55654	0 %	0 %	50 %	50 %	308189283
1064	NC_014563	TAA	2	6	55657	55662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308189283
1065	NC_014563	CTG	2	6	55854	55859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189283
1066	NC_014563	AAC	2	6	55864	55869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308189283
1067	NC_014563	A	6	6	55915	55920	100 %	0 %	0 %	0 %	308189283
1068	NC_014563	GTG	2	6	55970	55975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189283
1069	NC_014563	ACGG	2	8	56006	56013	25 %	0 %	50 %	25 %	308189283
1070	NC_014563	AT	3	6	56016	56021	50 %	50 %	0 %	0 %	308189283
1071	NC_014563	AAT	2	6	56082	56087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308189283
1072	NC_014563	CTGA	2	8	56156	56163	25 %	25 %	25 %	25 %	308189284
1073	NC_014563	CTG	2	6	56316	56321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189284
1074	NC_014563	CGC	2	6	56392	56397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189284
1075	NC_014563	CCG	2	6	56404	56409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189284
1076	NC_014563	TCG	2	6	56445	56450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189284
1077	NC_014563	CAC	2	6	56472	56477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308189284
1078	NC_014563	GCC	2	6	56486	56491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189284
1079	NC_014563	CACC	2	8	56544	56551	25 %	0 %	0 %	75 %	308189284
1080	NC_014563	CAG	2	6	56649	56654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189284
1081	NC_014563	GCT	2	6	56671	56676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189284
1082	NC_014563	ATA	2	6	56792	56797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308189284
1083	NC_014563	GCT	2	6	56851	56856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189284
1084	NC_014563	ATG	2	6	56886	56891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189284
1085	NC_014563	GCT	2	6	56975	56980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189284
1086	NC_014563	CAAT	2	8	57015	57022	50 %	25 %	0 %	25 %	308189284
1087	NC_014563	TAAA	2	8	57054	57061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_014563	GTT	3	9	57111	57119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_014563	CATT	2	8	57147	57154	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1090	NC_014563	CAG	2	6	57255	57260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_014563	ACC	2	6	57375	57380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308189285
1092	NC_014563	CGT	2	6	57459	57464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189285
1093	NC_014563	TGA	2	6	57566	57571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189285
1094	NC_014563	TTG	2	6	57599	57604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308189285
1095	NC_014563	TTC	2	6	57751	57756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308189285
1096	NC_014563	GAGC	2	8	57778	57785	25 %	0 %	50 %	25 %	308189285
1097	NC_014563	TA	3	6	57922	57927	50 %	50 %	0 %	0 %	308189285
1098	NC_014563	GAT	2	6	57966	57971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189285
1099	NC_014563	CT	3	6	57983	57988	0 %	50 %	0 %	50 %	308189285
1100	NC_014563	TGA	2	6	58005	58010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189285
1101	NC_014563	CAC	2	6	58058	58063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308189285
1102	NC_014563	CAC	2	6	58093	58098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308189285
1103	NC_014563	AGT	2	6	58119	58124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189285
1104	NC_014563	CGC	2	6	58125	58130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189285
1105	NC_014563	ACA	2	6	58152	58157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308189285
1106	NC_014563	TGTT	2	8	58181	58188	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_014563	ATGAA	2	10	58248	58257	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_014563	AGA	2	6	58348	58353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_014563	ATG	2	6	58420	58425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189286
1110	NC_014563	GGT	2	6	58427	58432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189286
1111	NC_014563	CAT	2	6	58451	58456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189286
1112	NC_014563	GCA	3	9	58468	58476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189286
1113	NC_014563	CCG	2	6	58534	58539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189286
1114	NC_014563	ACG	2	6	58573	58578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189286
1115	NC_014563	CCA	2	6	58627	58632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308189286
1116	NC_014563	CAC	2	6	58700	58705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308189286
1117	NC_014563	CTG	2	6	58733	58738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189286
1118	NC_014563	AGCC	2	8	58752	58759	25 %	0 %	25 %	50 %	308189286
1119	NC_014563	AG	3	6	58907	58912	50 %	0 %	50 %	0 %	308189286
1120	NC_014563	CGA	2	6	58934	58939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189286
1121	NC_014563	TCA	2	6	58960	58965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189286
1122	NC_014563	CTG	2	6	58967	58972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189286
1123	NC_014563	TG	3	6	58975	58980	0 %	50 %	50 %	0 %	308189286
1124	NC_014563	AGA	2	6	58999	59004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308189286
1125	NC_014563	CT	3	6	59111	59116	0 %	50 %	0 %	50 %	308189286
1126	NC_014563	CGG	2	6	59117	59122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189286
1127	NC_014563	GCT	2	6	59128	59133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189286
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1250	NC_014563	TAG	2	6	65038	65043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1251	NC_014563	CAG	2	6	65180	65185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1252	NC_014563	AGG	2	6	65227	65232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308189298
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1255	NC_014563	CGG	2	6	65289	65294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189298
1256	NC_014563	CAA	2	6	65332	65337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1257	NC_014563	ATC	3	9	65339	65347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1259	NC_014563	T	7	7	65401	65407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1260	NC_014563	CAA	2	6	65575	65580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1261	NC_014563	TAAA	2	8	65621	65628	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1263	NC_014563	ATT	2	6	65646	65651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1264	NC_014563	ATTT	3	12	65659	65670	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1265	NC_014563	GCA	2	6	65728	65733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1281	NC_014563	CGG	2	6	66842	66847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1286	NC_014563	AT	3	6	67028	67033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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