MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Pantoea vagans C9-1 plasmid pPag2

Total Repeats: 3251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014563	T	6	6	28504	28509	0 %	100 %	0 %	0 %	308189240
502	NC_014563	T	7	7	28512	28518	0 %	100 %	0 %	0 %	308189240
503	NC_014563	TA	3	6	28543	28548	50 %	50 %	0 %	0 %	308189240
504	NC_014563	CAT	2	6	28618	28623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189240
505	NC_014563	GGTT	2	8	28683	28690	0 %	50 %	50 %	0 %	308189240
506	NC_014563	A	7	7	28718	28724	100 %	0 %	0 %	0 %	308189240
507	NC_014563	CTG	2	6	28750	28755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189240
508	NC_014563	T	7	7	28758	28764	0 %	100 %	0 %	0 %	308189240
509	NC_014563	GA	3	6	28767	28772	50 %	0 %	50 %	0 %	308189240
510	NC_014563	AAT	2	6	28793	28798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308189240
511	NC_014563	TTC	2	6	28831	28836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308189240
512	NC_014563	TTC	2	6	28852	28857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308189240
513	NC_014563	GTC	2	6	28948	28953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189240
514	NC_014563	ACCAT	2	10	28959	28968	40 %	20 %	0 %	40 %	308189240
515	NC_014563	TA	3	6	29014	29019	50 %	50 %	0 %	0 %	308189240
516	NC_014563	AG	3	6	29024	29029	50 %	0 %	50 %	0 %	308189240
517	NC_014563	ATC	2	6	29062	29067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189240
518	NC_014563	GCA	2	6	29081	29086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189240
519	NC_014563	AGG	2	6	29100	29105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308189240
520	NC_014563	T	9	9	29178	29186	0 %	100 %	0 %	0 %	308189240
521	NC_014563	AAACC	2	10	29204	29213	60 %	0 %	0 %	40 %	308189240
522	NC_014563	TCA	2	6	29273	29278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189240
523	NC_014563	TAA	2	6	29286	29291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308189240
524	NC_014563	AAT	2	6	29446	29451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308189240
525	NC_014563	ATATT	2	10	29490	29499	40 %	60 %	0 %	0 %	308189240
526	NC_014563	GAT	2	6	29512	29517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189240
527	NC_014563	ATA	2	6	29623	29628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_014563	TAAA	2	8	29650	29657	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_014563	A	7	7	29655	29661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_014563	TAAT	2	8	29670	29677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_014563	ATTAA	2	10	29694	29703	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_014563	CT	3	6	29846	29851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
533	NC_014563	TTTA	2	8	29996	30003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_014563	TAC	2	6	30012	30017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_014563	T	8	8	30020	30027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_014563	AGCTT	2	10	30031	30040	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
537	NC_014563	TCA	2	6	30041	30046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_014563	ATT	2	6	30100	30105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_014563	TA	3	6	30164	30169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_014563	TA	3	6	30178	30183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_014563	ACC	2	6	30320	30325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308189241
542	NC_014563	TTC	2	6	30333	30338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308189242
543	NC_014563	GGA	2	6	30370	30375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308189242
544	NC_014563	GAT	2	6	30436	30441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189243
545	NC_014563	TGG	2	6	30458	30463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189243
546	NC_014563	CTG	2	6	30511	30516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189243
547	NC_014563	CTG	2	6	30531	30536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189243
548	NC_014563	GGA	2	6	30582	30587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308189243
549	NC_014563	CCGG	2	8	30620	30627	0 %	0 %	50 %	50 %	308189243
550	NC_014563	CCG	2	6	30694	30699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189243
551	NC_014563	GTG	2	6	30715	30720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189243
552	NC_014563	A	8	8	30729	30736	100 %	0 %	0 %	0 %	308189243
553	NC_014563	CAT	2	6	30750	30755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189243
554	NC_014563	GCA	2	6	30825	30830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189243
555	NC_014563	GCA	2	6	30843	30848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189243
556	NC_014563	CTG	2	6	30889	30894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189243
557	NC_014563	TGCGGG	2	12	30917	30928	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	308189243
558	NC_014563	CG	4	8	30935	30942	0 %	0 %	50 %	50 %	308189243
559	NC_014563	GGC	2	6	30997	31002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189243
560	NC_014563	GC	4	8	31019	31026	0 %	0 %	50 %	50 %	308189243
561	NC_014563	CG	3	6	31054	31059	0 %	0 %	50 %	50 %	308189243
562	NC_014563	GCG	2	6	31124	31129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189243
563	NC_014563	GGC	2	6	31184	31189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189243
564	NC_014563	CG	3	6	31207	31212	0 %	0 %	50 %	50 %	308189243
565	NC_014563	GC	4	8	31253	31260	0 %	0 %	50 %	50 %	308189243
566	NC_014563	CTG	2	6	31423	31428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_014563	A	6	6	31439	31444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_014563	AAT	2	6	31503	31508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_014563	TTC	2	6	31545	31550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_014563	CTG	2	6	31645	31650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_014563	GAA	2	6	31779	31784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_014563	CTG	3	9	31790	31798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_014563	T	6	6	31811	31816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_014563	TGA	2	6	31834	31839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189244
575	NC_014563	GTCA	2	8	31872	31879	25 %	25 %	25 %	25 %	308189244
576	NC_014563	CG	3	6	31885	31890	0 %	0 %	50 %	50 %	308189244
577	NC_014563	CAT	2	6	31895	31900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189244
578	NC_014563	CAG	2	6	31995	32000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_014563	CAG	2	6	32013	32018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_014563	ATA	2	6	32061	32066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_014563	GAA	2	6	32079	32084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_014563	TGA	2	6	32256	32261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_014563	GAC	2	6	32298	32303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_014563	TCA	2	6	32350	32355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_014563	ATA	2	6	32437	32442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308189245
586	NC_014563	TCC	2	6	32524	32529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308189245
587	NC_014563	TCGT	2	8	32558	32565	0 %	50 %	25 %	25 %	308189245
588	NC_014563	AGC	2	6	32692	32697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_014563	TCA	2	6	32795	32800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_014563	CAT	2	6	32815	32820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_014563	TTC	2	6	32843	32848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_014563	TC	3	6	32847	32852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
593	NC_014563	ACT	2	6	32882	32887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_014563	TGC	2	6	33034	33039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189246
595	NC_014563	AGCG	2	8	33118	33125	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
596	NC_014563	ACG	2	6	33217	33222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_014563	CAG	2	6	33268	33273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_014563	TTC	2	6	33294	33299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308189247
599	NC_014563	GCT	2	6	33318	33323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189247
600	NC_014563	GAT	2	6	33358	33363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189247
601	NC_014563	CTC	2	6	33410	33415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308189247
602	NC_014563	TCA	2	6	33419	33424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189247
603	NC_014563	CAG	2	6	33451	33456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189247
604	NC_014563	CTG	2	6	33496	33501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189247
605	NC_014563	GCG	2	6	33539	33544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189247
606	NC_014563	TCA	2	6	33665	33670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189247
607	NC_014563	G	7	7	33706	33712	0 %	0 %	100 %	0 %	308189247
608	NC_014563	CAT	2	6	33720	33725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189247
609	NC_014563	ACG	2	6	33778	33783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189247
610	NC_014563	ATT	2	6	33860	33865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308189247
611	NC_014563	ATA	2	6	33932	33937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308189247
612	NC_014563	CTGG	2	8	33993	34000	0 %	25 %	50 %	25 %	308189247
613	NC_014563	A	7	7	34107	34113	100 %	0 %	0 %	0 %	308189247
614	NC_014563	GC	3	6	34130	34135	0 %	0 %	50 %	50 %	308189247
615	NC_014563	TAT	2	6	34213	34218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308189247
616	NC_014563	GAT	2	6	34354	34359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189247
617	NC_014563	GAC	2	6	34366	34371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189247
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619	NC_014563	CG	3	6	34548	34553	0 %	0 %	50 %	50 %	308189247
620	NC_014563	GAC	2	6	34575	34580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189247
621	NC_014563	CCT	2	6	34619	34624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308189247
622	NC_014563	CGG	2	6	34773	34778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189247
623	NC_014563	CTA	2	6	34854	34859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189247
624	NC_014563	TCT	2	6	34864	34869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308189247
625	NC_014563	TGA	2	6	34899	34904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189247
626	NC_014563	A	6	6	34925	34930	100 %	0 %	0 %	0 %	308189247
627	NC_014563	CTG	2	6	35134	35139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189247
628	NC_014563	A	6	6	35158	35163	100 %	0 %	0 %	0 %	308189247
629	NC_014563	CGA	2	6	35166	35171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189247
630	NC_014563	AC	3	6	35195	35200	50 %	0 %	0 %	50 %	308189247
631	NC_014563	TGG	2	6	35201	35206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189247
632	NC_014563	TAA	2	6	35268	35273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308189247
633	NC_014563	A	6	6	35272	35277	100 %	0 %	0 %	0 %	308189247
634	NC_014563	CGGG	2	8	35331	35338	0 %	0 %	75 %	25 %	308189247
635	NC_014563	ATT	3	9	35424	35432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308189248
636	NC_014563	GCT	2	6	35463	35468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189248
637	NC_014563	CGT	2	6	35515	35520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189248
638	NC_014563	CAT	2	6	35568	35573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189248
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640	NC_014563	CAG	2	6	35629	35634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189248
641	NC_014563	A	6	6	35681	35686	100 %	0 %	0 %	0 %	308189248
642	NC_014563	GTG	2	6	35770	35775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189248
643	NC_014563	CTG	2	6	35776	35781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189248
644	NC_014563	A	7	7	35800	35806	100 %	0 %	0 %	0 %	308189248
645	NC_014563	CGA	2	6	35863	35868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189248
646	NC_014563	GCC	2	6	35884	35889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189248
647	NC_014563	CGT	2	6	36059	36064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189248
648	NC_014563	CTG	2	6	36094	36099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189248
649	NC_014563	T	6	6	36112	36117	0 %	100 %	0 %	0 %	308189248
650	NC_014563	CTG	2	6	36121	36126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189248
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652	NC_014563	GC	3	6	36195	36200	0 %	0 %	50 %	50 %	308189248
653	NC_014563	ATG	2	6	36284	36289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189248
654	NC_014563	CTGATG	2	12	36351	36362	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	308189249
655	NC_014563	TGC	2	6	36364	36369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189249
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658	NC_014563	CAT	2	6	36458	36463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189249
659	NC_014563	TGGCAG	2	12	36517	36528	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	308189249
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663	NC_014563	GAC	2	6	36727	36732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189249
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665	NC_014563	CTGG	2	8	36842	36849	0 %	25 %	50 %	25 %	308189249
666	NC_014563	GCT	2	6	36908	36913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189249
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668	NC_014563	TGA	2	6	36965	36970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189249
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671	NC_014563	CGCC	2	8	37103	37110	0 %	0 %	25 %	75 %	308189249
672	NC_014563	ATT	2	6	37166	37171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308189249
673	NC_014563	GGC	2	6	37178	37183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189249
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675	NC_014563	GCGCA	2	10	37275	37284	20 %	0 %	40 %	40 %	308189249
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678	NC_014563	GCA	2	6	37402	37407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189250
679	NC_014563	GC	3	6	37475	37480	0 %	0 %	50 %	50 %	308189250
680	NC_014563	GGGACT	2	12	37542	37553	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	308189250
681	NC_014563	GCG	2	6	37622	37627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189250
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685	NC_014563	GGTTG	2	10	37722	37731	0 %	40 %	60 %	0 %	308189250
686	NC_014563	GAC	2	6	37848	37853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189250
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688	NC_014563	GAC	2	6	37993	37998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189250
689	NC_014563	TGC	2	6	38042	38047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189250
690	NC_014563	CGG	2	6	38073	38078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189250
691	NC_014563	TTG	2	6	38108	38113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308189250
692	NC_014563	GCG	2	6	38186	38191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189250
693	NC_014563	TGG	2	6	38201	38206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189250
694	NC_014563	CGG	2	6	38255	38260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189250
695	NC_014563	TTG	2	6	38267	38272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308189250
696	NC_014563	GC	3	6	38282	38287	0 %	0 %	50 %	50 %	308189250
697	NC_014563	T	6	6	38290	38295	0 %	100 %	0 %	0 %	308189250
698	NC_014563	TGC	2	6	38303	38308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189250
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700	NC_014563	CCTG	2	8	38412	38419	0 %	25 %	25 %	50 %	308189251
701	NC_014563	TG	3	6	38431	38436	0 %	50 %	50 %	0 %	308189251
702	NC_014563	GCT	2	6	38469	38474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189251
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704	NC_014563	CAG	2	6	38544	38549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189251
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722	NC_014563	TCG	2	6	39787	39792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189252
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725	NC_014563	CGG	2	6	39870	39875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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733	NC_014563	T	6	6	40287	40292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
734	NC_014563	AAT	2	6	40312	40317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308189254
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747	NC_014563	T	8	8	40834	40841	0 %	100 %	0 %	0 %	308189255
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751	NC_014563	CGA	2	6	40990	40995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
752	NC_014563	AAC	2	6	41087	41092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
753	NC_014563	TAT	2	6	41118	41123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308189256
754	NC_014563	GA	3	6	41130	41135	50 %	0 %	50 %	0 %	308189256
755	NC_014563	AACTT	2	10	41137	41146	40 %	40 %	0 %	20 %	308189256
756	NC_014563	CTG	2	6	41193	41198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189256
757	NC_014563	TCT	2	6	41280	41285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308189256
758	NC_014563	CTGA	2	8	41320	41327	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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