MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pantoea vagans C9-1 plasmid pPag1

Total Repeats: 3547

< Previous12345678Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014561	ATTC	2	8	164587	164594	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3502	NC_014561	TGCTT	2	10	164839	164848	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3503	NC_014561	TAA	2	6	164875	164880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_014561	TTC	2	6	164905	164910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_014561	GCA	2	6	165069	165074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185538
3506	NC_014561	GAA	2	6	165111	165116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185538
3507	NC_014561	AG	3	6	165127	165132	50 %	0 %	50 %	0 %	308185538
3508	NC_014561	CAA	2	6	165179	165184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_014561	G	6	6	165302	165307	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_014561	T	6	6	165313	165318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_014561	AAG	2	6	165423	165428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_014561	AAC	2	6	165454	165459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_014561	ATAA	2	8	165472	165479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_014561	AGTG	2	8	165508	165515	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_014561	AAGAA	2	10	165581	165590	80 %	0 %	20 %	0 %	308185539
3516	NC_014561	GTT	2	6	165648	165653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308185539
3517	NC_014561	TAA	2	6	165671	165676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308185539
3518	NC_014561	TTGT	2	8	165711	165718	0 %	75 %	25 %	0 %	308185539
3519	NC_014561	GC	3	6	165738	165743	0 %	0 %	50 %	50 %	308185539
3520	NC_014561	GATG	2	8	165767	165774	25 %	25 %	50 %	0 %	308185539
3521	NC_014561	ACA	2	6	165823	165828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308185539
3522	NC_014561	TGGATA	2	12	165850	165861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185539
3523	NC_014561	TCGT	2	8	165936	165943	0 %	50 %	25 %	25 %	308185539
3524	NC_014561	GC	3	6	165975	165980	0 %	0 %	50 %	50 %	308185539
3525	NC_014561	GA	3	6	166063	166068	50 %	0 %	50 %	0 %	308185539
3526	NC_014561	CTG	2	6	166179	166184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185539
3527	NC_014561	CG	3	6	166315	166320	0 %	0 %	50 %	50 %	308185539
3528	NC_014561	CGC	2	6	166398	166403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185539
3529	NC_014561	GAT	2	6	166488	166493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185539
3530	NC_014561	TAT	2	6	166532	166537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308185539
3531	NC_014561	GGTG	2	8	166559	166566	0 %	25 %	75 %	0 %	308185539
3532	NC_014561	GA	3	6	166710	166715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_014561	GCCT	2	8	166818	166825	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3534	NC_014561	CT	3	6	166976	166981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3535	NC_014561	TCC	2	6	167021	167026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3536	NC_014561	ACA	2	6	167224	167229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_014561	T	7	7	167248	167254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_014561	AGTG	2	8	167335	167342	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_014561	TC	3	6	167360	167365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3540	NC_014561	ATG	2	6	167371	167376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_014561	A	6	6	167382	167387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_014561	TAGCA	2	10	167389	167398	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3543	NC_014561	CAGGG	2	10	167500	167509	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3544	NC_014561	CCT	2	6	167536	167541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3545	NC_014561	CGTG	2	8	167587	167594	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3546	NC_014561	CTC	2	6	167624	167629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3547	NC_014561	ATC	2	6	167660	167665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185540

< Previous12345678Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.