MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pantoea vagans C9-1 plasmid pPag1

Total Repeats: 3547

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014561	CTG	2	6	23218	23223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185401
502	NC_014561	GAT	2	6	23227	23232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185401
503	NC_014561	GTG	3	9	23239	23247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185401
504	NC_014561	TGG	2	6	23333	23338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185401
505	NC_014561	GCC	2	6	23434	23439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185401
506	NC_014561	TGG	3	9	23453	23461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185401
507	NC_014561	TGC	3	9	23492	23500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185401
508	NC_014561	CTT	2	6	23526	23531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308185401
509	NC_014561	TGC	2	6	23553	23558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185401
510	NC_014561	GTG	2	6	23584	23589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185401
511	NC_014561	CGT	2	6	23599	23604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185401
512	NC_014561	TCA	2	6	23609	23614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185401
513	NC_014561	CGC	2	6	23628	23633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185401
514	NC_014561	GCA	2	6	23702	23707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185401
515	NC_014561	CGG	2	6	23729	23734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185401
516	NC_014561	GGA	2	6	23793	23798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308185401
517	NC_014561	GCG	2	6	23846	23851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185401
518	NC_014561	CTG	2	6	23921	23926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185401
519	NC_014561	CGC	2	6	23993	23998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185401
520	NC_014561	AAT	2	6	24022	24027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308185401
521	NC_014561	GCT	2	6	24042	24047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185401
522	NC_014561	GTG	2	6	24053	24058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185401
523	NC_014561	AGC	2	6	24071	24076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185401
524	NC_014561	CGC	2	6	24108	24113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185401
525	NC_014561	GAT	2	6	24220	24225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185401
526	NC_014561	ATCG	2	8	24277	24284	25 %	25 %	25 %	25 %	308185401
527	NC_014561	CCT	2	6	24458	24463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308185401
528	NC_014561	GGCA	2	8	24546	24553	25 %	0 %	50 %	25 %	308185401
529	NC_014561	CGG	2	6	24597	24602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185401
530	NC_014561	TGG	2	6	24635	24640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185401
531	NC_014561	GGC	2	6	24654	24659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185401
532	NC_014561	TGC	2	6	24870	24875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185401
533	NC_014561	GGC	2	6	24885	24890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185401
534	NC_014561	ATG	2	6	24913	24918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185401
535	NC_014561	CCGGTG	2	12	24965	24976	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	308185401
536	NC_014561	GGC	2	6	25012	25017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185401
537	NC_014561	CGG	2	6	25139	25144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_014561	AG	4	8	25249	25256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
539	NC_014561	TCG	2	6	25271	25276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_014561	ATTC	2	8	25280	25287	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
541	NC_014561	AGA	2	6	25288	25293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_014561	CCT	2	6	25368	25373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_014561	CCT	2	6	25434	25439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_014561	CAC	2	6	25489	25494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_014561	TGT	2	6	25506	25511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_014561	CTAG	2	8	25556	25563	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
547	NC_014561	CGC	2	6	25656	25661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_014561	GCGAC	2	10	25722	25731	20 %	0 %	40 %	40 %	308185402
549	NC_014561	AGCAGA	2	12	25764	25775	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	308185402
550	NC_014561	GAT	2	6	25793	25798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185402
551	NC_014561	CAG	2	6	25832	25837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185402
552	NC_014561	TGGC	2	8	25843	25850	0 %	25 %	50 %	25 %	308185402
553	NC_014561	GGA	2	6	25858	25863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308185402
554	NC_014561	A	6	6	25863	25868	100 %	0 %	0 %	0 %	308185402
555	NC_014561	CGC	2	6	25876	25881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185402
556	NC_014561	CAG	2	6	25892	25897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185402
557	NC_014561	GCT	2	6	26022	26027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185403
558	NC_014561	T	6	6	26030	26035	0 %	100 %	0 %	0 %	308185403
559	NC_014561	TGA	2	6	26051	26056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185403
560	NC_014561	AG	3	6	26057	26062	50 %	0 %	50 %	0 %	308185403
561	NC_014561	GGC	2	6	26072	26077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185403
562	NC_014561	ATC	2	6	26170	26175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_014561	CTA	2	6	26233	26238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_014561	AAC	2	6	26245	26250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_014561	TTCA	2	8	26251	26258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
566	NC_014561	GCA	2	6	26270	26275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_014561	TGG	2	6	26296	26301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
568	NC_014561	GC	3	6	26322	26327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
569	NC_014561	ATG	2	6	26334	26339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_014561	CGA	2	6	26354	26359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_014561	CCT	2	6	26390	26395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_014561	AC	3	6	26399	26404	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
573	NC_014561	ATA	3	9	26450	26458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308185404
574	NC_014561	GCCT	2	8	26486	26493	0 %	25 %	25 %	50 %	308185404
575	NC_014561	AGC	2	6	26512	26517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185404
576	NC_014561	CAGC	3	12	26514	26525	25 %	0 %	25 %	50 %	308185404
577	NC_014561	CTC	2	6	26565	26570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308185404
578	NC_014561	CG	4	8	26585	26592	0 %	0 %	50 %	50 %	308185404
579	NC_014561	GGC	2	6	26593	26598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185404
580	NC_014561	TGA	2	6	26603	26608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185404
581	NC_014561	TCC	2	6	26695	26700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308185404
582	NC_014561	AGC	3	9	26713	26721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185404
583	NC_014561	GGAA	2	8	26757	26764	50 %	0 %	50 %	0 %	308185404
584	NC_014561	GCCA	2	8	26794	26801	25 %	0 %	25 %	50 %	308185404
585	NC_014561	CAG	2	6	26869	26874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185404
586	NC_014561	GAT	2	6	26928	26933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185404
587	NC_014561	TGC	2	6	27077	27082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185404
588	NC_014561	GCA	2	6	27115	27120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185404
589	NC_014561	CACGC	2	10	27156	27165	20 %	0 %	20 %	60 %	308185404
590	NC_014561	GCTG	2	8	27173	27180	0 %	25 %	50 %	25 %	308185404
591	NC_014561	CCGAT	2	10	27191	27200	20 %	20 %	20 %	40 %	308185404
592	NC_014561	GCA	3	9	27237	27245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185404
593	NC_014561	TG	3	6	27263	27268	0 %	50 %	50 %	0 %	308185404
594	NC_014561	ACTG	2	8	27294	27301	25 %	25 %	25 %	25 %	308185404
595	NC_014561	CGG	2	6	27336	27341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185404
596	NC_014561	GAA	2	6	27433	27438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185404
597	NC_014561	CAG	2	6	27460	27465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185404
598	NC_014561	CGGCA	2	10	27487	27496	20 %	0 %	40 %	40 %	308185404
599	NC_014561	TGA	2	6	27512	27517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185404
600	NC_014561	CGT	2	6	27532	27537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185404
601	NC_014561	TTC	2	6	27571	27576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308185404
602	NC_014561	GCC	3	9	27586	27594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185404
603	NC_014561	T	7	7	27656	27662	0 %	100 %	0 %	0 %	308185404
604	NC_014561	GC	3	6	27732	27737	0 %	0 %	50 %	50 %	308185404
605	NC_014561	CGC	2	6	27742	27747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185404
606	NC_014561	CAG	2	6	27802	27807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185404
607	NC_014561	CGC	2	6	27815	27820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185404
608	NC_014561	CAG	2	6	27928	27933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185404
609	NC_014561	A	6	6	27971	27976	100 %	0 %	0 %	0 %	308185404
610	NC_014561	GCC	2	6	28051	28056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185404
611	NC_014561	AGC	2	6	28062	28067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185404
612	NC_014561	GGCC	2	8	28080	28087	0 %	0 %	50 %	50 %	308185404
613	NC_014561	TCG	2	6	28116	28121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185404
614	NC_014561	TCG	2	6	28132	28137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185404
615	NC_014561	CAC	2	6	28182	28187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185404
616	NC_014561	TGG	2	6	28205	28210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185404
617	NC_014561	GGC	2	6	28275	28280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185404
618	NC_014561	CAG	2	6	28288	28293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185404
619	NC_014561	GC	3	6	28305	28310	0 %	0 %	50 %	50 %	308185404
620	NC_014561	GATGC	2	10	28360	28369	20 %	20 %	40 %	20 %	308185404
621	NC_014561	A	6	6	28450	28455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_014561	AGGCA	2	10	28478	28487	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
623	NC_014561	GTT	2	6	28496	28501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_014561	GCC	2	6	28599	28604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185405
625	NC_014561	GAA	2	6	28617	28622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185405
626	NC_014561	GAT	2	6	28670	28675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185405
627	NC_014561	TC	3	6	28693	28698	0 %	50 %	0 %	50 %	308185405
628	NC_014561	TC	3	6	28772	28777	0 %	50 %	0 %	50 %	308185405
629	NC_014561	CAG	2	6	28863	28868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185405
630	NC_014561	GCA	2	6	28870	28875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185405
631	NC_014561	CAT	2	6	28883	28888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185405
632	NC_014561	GGT	2	6	28896	28901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185405
633	NC_014561	GC	3	6	28916	28921	0 %	0 %	50 %	50 %	308185405
634	NC_014561	GCT	2	6	28979	28984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185405
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641	NC_014561	CTGGA	2	10	29259	29268	20 %	20 %	40 %	20 %	308185405
642	NC_014561	CGC	2	6	29279	29284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185405
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644	NC_014561	TGATC	2	10	29351	29360	20 %	40 %	20 %	20 %	308185405
645	NC_014561	TCA	2	6	29385	29390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185405
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649	NC_014561	T	7	7	29592	29598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
650	NC_014561	TGT	2	6	29606	29611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
651	NC_014561	CTGG	2	8	29788	29795	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
652	NC_014561	CTG	3	9	29855	29863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185406
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655	NC_014561	CTG	2	6	29993	29998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185406
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659	NC_014561	TGC	2	6	30147	30152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185406
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748	NC_014561	ATC	3	9	34388	34396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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751	NC_014561	CAGG	2	8	34554	34561	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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757	NC_014561	GCA	2	6	34976	34981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185412
758	NC_014561	ATT	2	6	35020	35025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308185412
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762	NC_014561	T	7	7	35124	35130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
763	NC_014561	GAA	2	6	35146	35151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
764	NC_014561	ATA	2	6	35154	35159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
765	NC_014561	GA	3	6	35200	35205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
766	NC_014561	T	7	7	35257	35263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
767	NC_014561	TCACT	2	10	35266	35275	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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770	NC_014561	ATG	2	6	35451	35456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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773	NC_014561	CAT	2	6	35530	35535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
774	NC_014561	ATA	2	6	35551	35556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
775	NC_014561	ATTT	2	8	35562	35569	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
776	NC_014561	T	8	8	35581	35588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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784	NC_014561	TAA	2	6	35772	35777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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786	NC_014561	ATTT	2	8	35855	35862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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