MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus polymyxa E681 chromosome

Total Repeats: 104121

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014483	CAG	3	9	161163	161171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308066960
3002	NC_014483	TTGTT	2	10	161212	161221	0 %	80 %	20 %	0 %	308066960
3003	NC_014483	CGA	2	6	161222	161227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308066960
3004	NC_014483	GAG	2	6	161259	161264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308066960
3005	NC_014483	CCATGT	2	12	161341	161352	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	308066960
3006	NC_014483	TGA	2	6	161354	161359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308066960
3007	NC_014483	AGT	2	6	161360	161365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308066960
3008	NC_014483	GAT	2	6	161408	161413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308066960
3009	NC_014483	CTGG	2	8	161465	161472	0 %	25 %	50 %	25 %	308066960
3010	NC_014483	CAA	2	6	161655	161660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308066960
3011	NC_014483	CCA	2	6	161690	161695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308066960
3012	NC_014483	TA	3	6	161719	161724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_014483	GAT	2	6	161726	161731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308066961
3014	NC_014483	T	6	6	161743	161748	0 %	100 %	0 %	0 %	308066961
3015	NC_014483	A	6	6	161760	161765	100 %	0 %	0 %	0 %	308066961
3016	NC_014483	GGC	2	6	161876	161881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308066961
3017	NC_014483	TGG	2	6	161899	161904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308066961
3018	NC_014483	GTT	2	6	161981	161986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308066961
3019	NC_014483	AGGA	2	8	162094	162101	50 %	0 %	50 %	0 %	308066961
3020	NC_014483	AGG	2	6	162163	162168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308066961
3021	NC_014483	ACT	2	6	162172	162177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308066961
3022	NC_014483	ACC	2	6	162233	162238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308066961
3023	NC_014483	ATCC	2	8	162295	162302	25 %	25 %	0 %	50 %	308066961
3024	NC_014483	GTT	2	6	162368	162373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308066961
3025	NC_014483	GTC	2	6	162459	162464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308066961
3026	NC_014483	GCTAAA	2	12	162492	162503	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	308066961
3027	NC_014483	GCA	2	6	162561	162566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308066961
3028	NC_014483	GCA	2	6	162581	162586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308066961
3029	NC_014483	CATT	2	8	162604	162611	25 %	50 %	0 %	25 %	308066961
3030	NC_014483	TGT	2	6	162619	162624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308066961
3031	NC_014483	GAA	2	6	162627	162632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308066961
3032	NC_014483	TAG	2	6	162643	162648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308066961
3033	NC_014483	CCT	2	6	162655	162660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308066961
3034	NC_014483	GTG	2	6	162834	162839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_014483	CTT	2	6	162862	162867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_014483	TGC	2	6	162887	162892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308066962
3037	NC_014483	GT	3	6	162908	162913	0 %	50 %	50 %	0 %	308066962
3038	NC_014483	TGA	2	6	162918	162923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308066962
3039	NC_014483	GCT	2	6	162958	162963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308066962
3040	NC_014483	TG	3	6	163009	163014	0 %	50 %	50 %	0 %	308066962
3041	NC_014483	ACG	2	6	163024	163029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308066962
3042	NC_014483	TGC	2	6	163100	163105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308066962
3043	NC_014483	A	7	7	163163	163169	100 %	0 %	0 %	0 %	308066962
3044	NC_014483	AGC	2	6	163181	163186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308066962
3045	NC_014483	CTT	2	6	163218	163223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308066962
3046	NC_014483	TGG	2	6	163230	163235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308066962
3047	NC_014483	TGA	2	6	163241	163246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308066962
3048	NC_014483	CTG	3	9	163279	163287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308066962
3049	NC_014483	GCG	2	6	163343	163348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308066962
3050	NC_014483	GCT	3	9	163383	163391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308066962
3051	NC_014483	AT	3	6	163509	163514	50 %	50 %	0 %	0 %	308066962
3052	NC_014483	GCCT	2	8	163573	163580	0 %	25 %	25 %	50 %	308066962
3053	NC_014483	GGT	2	6	163636	163641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308066962
3054	NC_014483	CGTC	2	8	163651	163658	0 %	25 %	25 %	50 %	308066962
3055	NC_014483	CTGG	2	8	163673	163680	0 %	25 %	50 %	25 %	308066962
3056	NC_014483	CATT	2	8	163700	163707	25 %	50 %	0 %	25 %	308066962
3057	NC_014483	TTG	2	6	163711	163716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308066962
3058	NC_014483	CGA	2	6	163763	163768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308066962
3059	NC_014483	CTG	2	6	163828	163833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308066962
3060	NC_014483	AG	3	6	163845	163850	50 %	0 %	50 %	0 %	308066962
3061	NC_014483	TC	3	6	163878	163883	0 %	50 %	0 %	50 %	308066962
3062	NC_014483	GGC	2	6	163939	163944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308066962
3063	NC_014483	ACGG	2	8	163962	163969	25 %	0 %	50 %	25 %	308066962
3064	NC_014483	GCTT	2	8	163982	163989	0 %	50 %	25 %	25 %	308066962
3065	NC_014483	TGG	2	6	164015	164020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308066962
3066	NC_014483	TGG	2	6	164035	164040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308066962
3067	NC_014483	TTGT	2	8	164107	164114	0 %	75 %	25 %	0 %	308066962
3068	NC_014483	GGCG	2	8	164191	164198	0 %	0 %	75 %	25 %	308066962
3069	NC_014483	CGT	2	6	164201	164206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308066962
3070	NC_014483	CCG	2	6	164214	164219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308066962
3071	NC_014483	TGC	2	6	164225	164230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308066962
3072	NC_014483	GAT	2	6	164262	164267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308066962
3073	NC_014483	GCC	2	6	164316	164321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308066962
3074	NC_014483	GATGGC	2	12	164385	164396	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	308066962
3075	NC_014483	TCGG	2	8	164404	164411	0 %	25 %	50 %	25 %	308066962
3076	NC_014483	CTG	3	9	164422	164430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308066962
3077	NC_014483	AAAG	2	8	164456	164463	75 %	0 %	25 %	0 %	308066962
3078	NC_014483	GAG	2	6	164497	164502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308066963
3079	NC_014483	GCA	2	6	164543	164548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308066963
3080	NC_014483	AGGA	2	8	164578	164585	50 %	0 %	50 %	0 %	308066963
3081	NC_014483	CCG	2	6	164607	164612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308066963
3082	NC_014483	GAC	2	6	164717	164722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308066963
3083	NC_014483	GAG	2	6	164785	164790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308066963
3084	NC_014483	ACG	2	6	164803	164808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308066963
3085	NC_014483	ATCCA	2	10	164817	164826	40 %	20 %	0 %	40 %	308066963
3086	NC_014483	AGA	2	6	164843	164848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308066963
3087	NC_014483	CAG	2	6	164857	164862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308066963
3088	NC_014483	GGAAG	2	10	164951	164960	40 %	0 %	60 %	0 %	308066963
3089	NC_014483	GTT	2	6	164963	164968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308066963
3090	NC_014483	T	7	7	164967	164973	0 %	100 %	0 %	0 %	308066963
3091	NC_014483	CTT	2	6	165000	165005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308066963
3092	NC_014483	GAG	2	6	165036	165041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308066963
3093	NC_014483	CCTG	2	8	165050	165057	0 %	25 %	25 %	50 %	308066963
3094	NC_014483	TGG	2	6	165182	165187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308066963
3095	NC_014483	TGT	2	6	165193	165198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308066963
3096	NC_014483	TGCC	2	8	165205	165212	0 %	25 %	25 %	50 %	308066963
3097	NC_014483	AGGAC	2	10	165221	165230	40 %	0 %	40 %	20 %	308066963
3098	NC_014483	TGC	2	6	165398	165403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308066963
3099	NC_014483	CTG	2	6	165417	165422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308066963
3100	NC_014483	TAT	2	6	165440	165445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308066963
3101	NC_014483	ATG	2	6	165462	165467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308066963
3102	NC_014483	GC	3	6	165480	165485	0 %	0 %	50 %	50 %	308066963
3103	NC_014483	TATC	2	8	165498	165505	25 %	50 %	0 %	25 %	308066963
3104	NC_014483	GGGGA	2	10	165522	165531	20 %	0 %	80 %	0 %	308066963
3105	NC_014483	CAT	2	6	165858	165863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_014483	CCT	2	6	165875	165880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308066964
3107	NC_014483	TGG	2	6	165914	165919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308066964
3108	NC_014483	AGC	2	6	165976	165981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308066964
3109	NC_014483	AGG	3	9	166100	166108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308066964
3110	NC_014483	TGC	2	6	166319	166324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308066964
3111	NC_014483	TGA	2	6	166349	166354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308066964
3112	NC_014483	AC	3	6	166372	166377	50 %	0 %	0 %	50 %	308066964
3113	NC_014483	GGC	2	6	166410	166415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308066964
3114	NC_014483	GTG	2	6	166457	166462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308066964
3115	NC_014483	CCA	2	6	166469	166474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308066964
3116	NC_014483	TCA	2	6	166480	166485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308066964
3117	NC_014483	CGC	2	6	166494	166499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308066964
3118	NC_014483	GA	3	6	166581	166586	50 %	0 %	50 %	0 %	308066964
3119	NC_014483	CATGG	2	10	166699	166708	20 %	20 %	40 %	20 %	308066964
3120	NC_014483	TTC	2	6	166714	166719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308066964
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3122	NC_014483	TGA	2	6	166943	166948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308066964
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3241	NC_014483	CGAAA	2	10	173190	173199	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3242	NC_014483	AAT	2	6	173284	173289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3243	NC_014483	CAGG	2	8	173301	173308	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3244	NC_014483	TTTA	2	8	173321	173328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3245	NC_014483	TGG	2	6	173350	173355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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