MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus polymyxa E681 chromosome

Total Repeats: 104121

< Previous12...197198199200201202203204205206207208209Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
104001	NC_014483	CTG	2	6	5389102	5389107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308071638
104002	NC_014483	TTC	2	6	5389125	5389130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308071638
104003	NC_014483	CAT	2	6	5389168	5389173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308071638
104004	NC_014483	ATAGC	2	10	5389179	5389188	40 %	20 %	20 %	20 %	308071638
104005	NC_014483	CAT	2	6	5389196	5389201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308071638
104006	NC_014483	GCA	2	6	5389231	5389236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308071638
104007	NC_014483	ACC	2	6	5389353	5389358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308071638
104008	NC_014483	TAA	2	6	5389441	5389446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308071638
104009	NC_014483	CAGC	2	8	5389475	5389482	25 %	0 %	25 %	50 %	308071638
104010	NC_014483	ATC	2	6	5389538	5389543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308071638
104011	NC_014483	AATC	2	8	5389570	5389577	50 %	25 %	0 %	25 %	308071638
104012	NC_014483	GGC	2	6	5389596	5389601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308071638
104013	NC_014483	CT	3	6	5389637	5389642	0 %	50 %	0 %	50 %	308071638
104014	NC_014483	CGC	2	6	5389999	5390004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308071638
104015	NC_014483	CAC	2	6	5390024	5390029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308071638
104016	NC_014483	ATC	2	6	5390100	5390105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308071638
104017	NC_014483	TGC	3	9	5390126	5390134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308071638
104018	NC_014483	CCT	2	6	5390190	5390195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308071638
104019	NC_014483	CCT	2	6	5390217	5390222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104020	NC_014483	TA	4	8	5390258	5390265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104021	NC_014483	CAT	2	6	5390346	5390351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308071639
104022	NC_014483	CAG	2	6	5390436	5390441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308071639
104023	NC_014483	GC	3	6	5390467	5390472	0 %	0 %	50 %	50 %	308071639
104024	NC_014483	CTT	2	6	5390473	5390478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308071639
104025	NC_014483	CAA	2	6	5390479	5390484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308071639
104026	NC_014483	GCA	2	6	5390634	5390639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308071639
104027	NC_014483	AGC	2	6	5390768	5390773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308071639
104028	NC_014483	CCG	2	6	5390790	5390795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308071639
104029	NC_014483	CAG	2	6	5390968	5390973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308071639
104030	NC_014483	TGA	2	6	5390974	5390979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308071639
104031	NC_014483	CAA	2	6	5391000	5391005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308071639
104032	NC_014483	CCG	2	6	5391045	5391050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308071639
104033	NC_014483	GCA	2	6	5391054	5391059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308071639
104034	NC_014483	CAT	2	6	5391126	5391131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308071639
104035	NC_014483	CCA	2	6	5391174	5391179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308071639
104036	NC_014483	CGA	2	6	5391194	5391199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308071639
104037	NC_014483	TCCA	2	8	5391217	5391224	25 %	25 %	0 %	50 %	308071639
104038	NC_014483	A	6	6	5391317	5391322	100 %	0 %	0 %	0 %	308071639
104039	NC_014483	GCA	2	6	5391366	5391371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308071639
104040	NC_014483	ACA	2	6	5391428	5391433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308071639
104041	NC_014483	TCT	2	6	5391434	5391439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308071639
104042	NC_014483	TCC	2	6	5391482	5391487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308071639
104043	NC_014483	TAT	2	6	5391511	5391516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308071639
104044	NC_014483	TG	3	6	5391532	5391537	0 %	50 %	50 %	0 %	308071639
104045	NC_014483	TAC	2	6	5391564	5391569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308071639
104046	NC_014483	GCC	2	6	5391628	5391633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308071639
104047	NC_014483	CCT	2	6	5391689	5391694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104048	NC_014483	TCA	2	6	5391722	5391727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104049	NC_014483	A	7	7	5391760	5391766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104050	NC_014483	AG	3	6	5391788	5391793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104051	NC_014483	ATT	2	6	5391806	5391811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308071640
104052	NC_014483	T	6	6	5391810	5391815	0 %	100 %	0 %	0 %	308071640
104053	NC_014483	ATG	2	6	5391820	5391825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308071640
104054	NC_014483	TCC	2	6	5391982	5391987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308071640
104055	NC_014483	T	6	6	5391992	5391997	0 %	100 %	0 %	0 %	308071640
104056	NC_014483	TGTC	2	8	5392098	5392105	0 %	50 %	25 %	25 %	308071640
104057	NC_014483	CTG	3	9	5392205	5392213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308071640
104058	NC_014483	TCT	2	6	5392309	5392314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308071640
104059	NC_014483	GT	3	6	5392371	5392376	0 %	50 %	50 %	0 %	308071640
104060	NC_014483	AG	3	6	5392395	5392400	50 %	0 %	50 %	0 %	308071640
104061	NC_014483	CTT	2	6	5392422	5392427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308071640
104062	NC_014483	T	6	6	5392604	5392609	0 %	100 %	0 %	0 %	308071641
104063	NC_014483	GGA	2	6	5392619	5392624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308071641
104064	NC_014483	TGC	2	6	5392664	5392669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308071641
104065	NC_014483	CTG	2	6	5392820	5392825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308071641
104066	NC_014483	TCA	3	9	5392843	5392851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308071641
104067	NC_014483	CGC	2	6	5392877	5392882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308071641
104068	NC_014483	AAG	2	6	5392932	5392937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308071641
104069	NC_014483	TAA	2	6	5392962	5392967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308071641
104070	NC_014483	TAC	2	6	5393003	5393008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308071641
104071	NC_014483	CAGC	2	8	5393019	5393026	25 %	0 %	25 %	50 %	308071641
104072	NC_014483	AAC	2	6	5393052	5393057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308071641
104073	NC_014483	CTTG	2	8	5393158	5393165	0 %	50 %	25 %	25 %	308071641
104074	NC_014483	AAT	2	6	5393180	5393185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308071641
104075	NC_014483	GGCCA	2	10	5393216	5393225	20 %	0 %	40 %	40 %	308071641
104076	NC_014483	CGT	2	6	5393321	5393326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308071641
104077	NC_014483	ACAGC	2	10	5393359	5393368	40 %	0 %	20 %	40 %	308071641
104078	NC_014483	AGG	2	6	5393391	5393396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308071641
104079	NC_014483	AGC	2	6	5393522	5393527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308071642
104080	NC_014483	GCA	2	6	5393547	5393552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308071642
104081	NC_014483	ACGA	2	8	5393596	5393603	50 %	0 %	25 %	25 %	308071642
104082	NC_014483	CCA	2	6	5393625	5393630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308071642
104083	NC_014483	ATG	2	6	5393641	5393646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308071642
104084	NC_014483	ACT	2	6	5393687	5393692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308071642
104085	NC_014483	TCT	2	6	5393703	5393708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308071642
104086	NC_014483	CT	3	6	5393743	5393748	0 %	50 %	0 %	50 %	308071642
104087	NC_014483	GCG	2	6	5393749	5393754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308071642
104088	NC_014483	T	8	8	5393842	5393849	0 %	100 %	0 %	0 %	308071642
104089	NC_014483	ACCTTT	2	12	5393898	5393909	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104090	NC_014483	TA	3	6	5393910	5393915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104091	NC_014483	AAG	2	6	5393918	5393923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104092	NC_014483	ACA	2	6	5393929	5393934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104093	NC_014483	CTT	2	6	5394017	5394022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104094	NC_014483	T	6	6	5394031	5394036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104095	NC_014483	ACA	2	6	5394037	5394042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104096	NC_014483	AATC	2	8	5394054	5394061	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104097	NC_014483	A	8	8	5394081	5394088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104098	NC_014483	ACC	2	6	5394090	5394095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104099	NC_014483	CGA	2	6	5394148	5394153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308071643
104100	NC_014483	TTC	2	6	5394175	5394180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308071643
104101	NC_014483	T	6	6	5394210	5394215	0 %	100 %	0 %	0 %	308071643
104102	NC_014483	TGC	2	6	5394254	5394259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104103	NC_014483	CCT	2	6	5394261	5394266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104104	NC_014483	A	6	6	5394316	5394321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104105	NC_014483	CCT	2	6	5394403	5394408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104106	NC_014483	C	6	6	5394415	5394420	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
104107	NC_014483	TCAC	2	8	5394423	5394430	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104108	NC_014483	CCTCT	2	10	5394470	5394479	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
104109	NC_014483	ATC	2	6	5394480	5394485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104110	NC_014483	TGT	2	6	5394497	5394502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104111	NC_014483	T	6	6	5394523	5394528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104112	NC_014483	ATTC	2	8	5394535	5394542	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104113	NC_014483	ATCC	2	8	5394553	5394560	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104114	NC_014483	GTTC	2	8	5394584	5394591	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104115	NC_014483	AAT	2	6	5394595	5394600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104116	NC_014483	A	6	6	5394738	5394743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104117	NC_014483	TTGTG	2	10	5394783	5394792	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
104118	NC_014483	ACA	2	6	5394807	5394812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104119	NC_014483	ATAA	2	8	5394827	5394834	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104120	NC_014483	CTT	2	6	5394858	5394863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104121	NC_014483	ATG	2	6	5394869	5394874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...197198199200201202203204205206207208209Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.