MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pantoea vagans C9-1 plasmid pPag3

Total Repeats: 10991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014258	T	6	6	177408	177413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_014258	GAC	2	6	177431	177436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_014258	TCA	2	6	177507	177512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_014258	GC	3	6	177530	177535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3505	NC_014258	AAT	2	6	177668	177673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717280
3506	NC_014258	ATC	2	6	177753	177758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717280
3507	NC_014258	ATC	2	6	177792	177797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717280
3508	NC_014258	GC	3	6	177845	177850	0 %	0 %	50 %	50 %	298717280
3509	NC_014258	CAT	2	6	177913	177918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717280
3510	NC_014258	TCA	2	6	177940	177945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717280
3511	NC_014258	GCT	2	6	178021	178026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717280
3512	NC_014258	GGCGC	2	10	178060	178069	0 %	0 %	60 %	40 %	298717280
3513	NC_014258	AAG	2	6	178085	178090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298717280
3514	NC_014258	TAA	2	6	178117	178122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717280
3515	NC_014258	TCCAGC	2	12	178146	178157	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	298717280
3516	NC_014258	TGGC	2	8	178175	178182	0 %	25 %	50 %	25 %	298717280
3517	NC_014258	ACCC	2	8	178196	178203	25 %	0 %	0 %	75 %	298717280
3518	NC_014258	GTC	2	6	178220	178225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717280
3519	NC_014258	CGCC	2	8	178297	178304	0 %	0 %	25 %	75 %	298717280
3520	NC_014258	CCT	2	6	178429	178434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298717280
3521	NC_014258	GCA	2	6	178435	178440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717280
3522	NC_014258	ATT	2	6	178445	178450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298717280
3523	NC_014258	TGC	2	6	178575	178580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717281
3524	NC_014258	CAG	2	6	178611	178616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717281
3525	NC_014258	A	6	6	178671	178676	100 %	0 %	0 %	0 %	298717281
3526	NC_014258	GC	3	6	178756	178761	0 %	0 %	50 %	50 %	298717281
3527	NC_014258	AGC	2	6	178849	178854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717281
3528	NC_014258	AATG	2	8	178890	178897	50 %	25 %	25 %	0 %	298717281
3529	NC_014258	CAG	2	6	178980	178985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717281
3530	NC_014258	CCAG	2	8	178986	178993	25 %	0 %	25 %	50 %	298717281
3531	NC_014258	GCCA	2	8	179093	179100	25 %	0 %	25 %	50 %	298717281
3532	NC_014258	CA	3	6	179113	179118	50 %	0 %	0 %	50 %	298717281
3533	NC_014258	TGA	2	6	179119	179124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717281
3534	NC_014258	AGC	2	6	179191	179196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717281
3535	NC_014258	CCG	2	6	179243	179248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717281
3536	NC_014258	TGG	3	9	179306	179314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717281
3537	NC_014258	GCA	2	6	179372	179377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717281
3538	NC_014258	CAG	3	9	179406	179414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717281
3539	NC_014258	TGC	2	6	179430	179435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717281
3540	NC_014258	CAGC	2	8	179445	179452	25 %	0 %	25 %	50 %	298717281
3541	NC_014258	CCCGA	2	10	179508	179517	20 %	0 %	20 %	60 %	298717281
3542	NC_014258	GGC	2	6	179529	179534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717281
3543	NC_014258	G	7	7	179536	179542	0 %	0 %	100 %	0 %	298717281
3544	NC_014258	GCA	2	6	179627	179632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717281
3545	NC_014258	CGG	2	6	179642	179647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717281
3546	NC_014258	AGC	2	6	179677	179682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717281
3547	NC_014258	A	9	9	179692	179700	100 %	0 %	0 %	0 %	298717281
3548	NC_014258	TGT	2	6	179738	179743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_014258	CAT	2	6	179749	179754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_014258	ATC	2	6	179762	179767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_014258	GCA	2	6	179772	179777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_014258	TGC	2	6	179779	179784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_014258	G	6	6	179785	179790	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_014258	GTTG	2	8	179792	179799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_014258	TGA	2	6	179879	179884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_014258	CTGG	2	8	179969	179976	0 %	25 %	50 %	25 %	298717282
3557	NC_014258	CTG	2	6	179999	180004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717282
3558	NC_014258	GAGAA	2	10	180062	180071	60 %	0 %	40 %	0 %	298717282
3559	NC_014258	ATC	2	6	180078	180083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717282
3560	NC_014258	TTA	2	6	180110	180115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_014258	CGG	2	6	180145	180150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_014258	CACC	2	8	180255	180262	25 %	0 %	0 %	75 %	298717283
3563	NC_014258	CAG	2	6	180274	180279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717283
3564	NC_014258	CAA	2	6	180336	180341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717283
3565	NC_014258	ATG	2	6	180416	180421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_014258	CT	3	6	180497	180502	0 %	50 %	0 %	50 %	298717284
3567	NC_014258	CTGA	2	8	180614	180621	25 %	25 %	25 %	25 %	298717284
3568	NC_014258	A	6	6	180637	180642	100 %	0 %	0 %	0 %	298717284
3569	NC_014258	TGG	2	6	180651	180656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717284
3570	NC_014258	GCGT	2	8	180741	180748	0 %	25 %	50 %	25 %	298717285
3571	NC_014258	GCC	2	6	180754	180759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717285
3572	NC_014258	GCC	2	6	180779	180784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717285
3573	NC_014258	AACG	2	8	180830	180837	50 %	0 %	25 %	25 %	298717285
3574	NC_014258	CAGCGT	2	12	180901	180912	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	298717285
3575	NC_014258	GCA	2	6	180996	181001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717285
3576	NC_014258	GCA	2	6	181200	181205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717285
3577	NC_014258	GTCA	2	8	181207	181214	25 %	25 %	25 %	25 %	298717285
3578	NC_014258	CG	3	6	181227	181232	0 %	0 %	50 %	50 %	298717285
3579	NC_014258	CAT	2	6	181306	181311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717285
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3581	NC_014258	CGA	2	6	181370	181375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717285
3582	NC_014258	TCG	2	6	181382	181387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717285
3583	NC_014258	TGCC	2	8	181422	181429	0 %	25 %	25 %	50 %	298717285
3584	NC_014258	GAT	2	6	181444	181449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717285
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3587	NC_014258	ATA	2	6	181520	181525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717285
3588	NC_014258	CCG	2	6	181562	181567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717285
3589	NC_014258	CTG	2	6	181615	181620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717285
3590	NC_014258	CAC	2	6	181621	181626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717285
3591	NC_014258	TCA	2	6	181652	181657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717285
3592	NC_014258	CAG	2	6	181687	181692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717285
3593	NC_014258	GC	3	6	181710	181715	0 %	0 %	50 %	50 %	298717285
3594	NC_014258	CTG	2	6	181716	181721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717285
3595	NC_014258	TTCA	2	8	181822	181829	25 %	50 %	0 %	25 %	298717285
3596	NC_014258	TCA	2	6	181845	181850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717285
3597	NC_014258	GC	3	6	181973	181978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3598	NC_014258	TTCA	2	8	181981	181988	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3599	NC_014258	TG	3	6	182049	182054	0 %	50 %	50 %	0 %	298717286
3600	NC_014258	CTT	2	6	182060	182065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717286
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3602	NC_014258	GAT	2	6	182128	182133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717286
3603	NC_014258	TCG	2	6	182135	182140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717286
3604	NC_014258	A	6	6	182239	182244	100 %	0 %	0 %	0 %	298717286
3605	NC_014258	CAG	2	6	182245	182250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717286
3606	NC_014258	CGG	2	6	182324	182329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717286
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3609	NC_014258	CGAC	2	8	182439	182446	25 %	0 %	25 %	50 %	298717286
3610	NC_014258	GGC	2	6	182460	182465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717286
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3612	NC_014258	TGA	2	6	182514	182519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717286
3613	NC_014258	GGC	2	6	182616	182621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717286
3614	NC_014258	GCC	2	6	182641	182646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717286
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3617	NC_014258	GCA	2	6	182808	182813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717286
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3619	NC_014258	GC	3	6	182852	182857	0 %	0 %	50 %	50 %	298717286
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3621	NC_014258	TGA	2	6	182972	182977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717286
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3623	NC_014258	GCG	2	6	183037	183042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717286
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3988	NC_014258	CGG	2	6	199211	199216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717302
3989	NC_014258	CTG	2	6	199411	199416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717302
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3991	NC_014258	CTG	2	6	199462	199467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717302
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