MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pantoea vagans C9-1 plasmid pPag3

Total Repeats: 10991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014258	TCG	2	6	152968	152973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717255
3002	NC_014258	CG	3	6	152985	152990	0 %	0 %	50 %	50 %	298717255
3003	NC_014258	GGC	2	6	153102	153107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717255
3004	NC_014258	GTT	2	6	153141	153146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298717255
3005	NC_014258	CCGCG	2	10	153272	153281	0 %	0 %	40 %	60 %	298717255
3006	NC_014258	TC	3	6	153311	153316	0 %	50 %	0 %	50 %	298717255
3007	NC_014258	ATA	2	6	153337	153342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717255
3008	NC_014258	AG	3	6	153356	153361	50 %	0 %	50 %	0 %	298717255
3009	NC_014258	ATC	2	6	153399	153404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717255
3010	NC_014258	CGG	2	6	153421	153426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717255
3011	NC_014258	CCG	2	6	153541	153546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717255
3012	NC_014258	GGC	2	6	153564	153569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717255
3013	NC_014258	GGC	2	6	153622	153627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_014258	ACCCG	2	10	153662	153671	20 %	0 %	20 %	60 %	298717256
3015	NC_014258	TAT	2	6	153871	153876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298717256
3016	NC_014258	CGC	2	6	153877	153882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717256
3017	NC_014258	GTG	2	6	153913	153918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717256
3018	NC_014258	CACG	2	8	154048	154055	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3019	NC_014258	AG	3	6	154113	154118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_014258	GC	3	6	154222	154227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3021	NC_014258	CT	3	6	154316	154321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3022	NC_014258	GCG	2	6	154365	154370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717257
3023	NC_014258	TG	3	6	154380	154385	0 %	50 %	50 %	0 %	298717257
3024	NC_014258	CTG	2	6	154397	154402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717257
3025	NC_014258	GCC	2	6	154448	154453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717257
3026	NC_014258	G	6	6	154465	154470	0 %	0 %	100 %	0 %	298717257
3027	NC_014258	GC	3	6	154500	154505	0 %	0 %	50 %	50 %	298717257
3028	NC_014258	TGG	2	6	154544	154549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717257
3029	NC_014258	AGC	2	6	154572	154577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717257
3030	NC_014258	TGG	2	6	154587	154592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717257
3031	NC_014258	GCC	2	6	154597	154602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717257
3032	NC_014258	GCA	3	9	154642	154650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717257
3033	NC_014258	GCA	2	6	154753	154758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717257
3034	NC_014258	CGG	2	6	154810	154815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717257
3035	NC_014258	ATC	2	6	154820	154825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717257
3036	NC_014258	CAG	2	6	154853	154858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717257
3037	NC_014258	GC	3	6	154867	154872	0 %	0 %	50 %	50 %	298717257
3038	NC_014258	GTCCG	2	10	154923	154932	0 %	20 %	40 %	40 %	298717257
3039	NC_014258	TGC	2	6	154935	154940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717257
3040	NC_014258	CCA	2	6	154998	155003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717257
3041	NC_014258	CAG	2	6	155020	155025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717257
3042	NC_014258	GAT	2	6	155044	155049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717257
3043	NC_014258	GCT	2	6	155053	155058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717257
3044	NC_014258	GCTG	2	8	155086	155093	0 %	25 %	50 %	25 %	298717257
3045	NC_014258	AG	3	6	155107	155112	50 %	0 %	50 %	0 %	298717257
3046	NC_014258	TGC	2	6	155241	155246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717257
3047	NC_014258	ACTC	2	8	155248	155255	25 %	25 %	0 %	50 %	298717257
3048	NC_014258	CAA	2	6	155308	155313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717258
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3050	NC_014258	CAGC	2	8	155405	155412	25 %	0 %	25 %	50 %	298717258
3051	NC_014258	CAGC	2	8	155426	155433	25 %	0 %	25 %	50 %	298717258
3052	NC_014258	CCG	2	6	155511	155516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717259
3053	NC_014258	ATT	2	6	155570	155575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298717259
3054	NC_014258	CGT	2	6	155588	155593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717259
3055	NC_014258	GGC	2	6	155606	155611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717259
3056	NC_014258	GCA	2	6	155629	155634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717259
3057	NC_014258	CAA	2	6	155638	155643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717259
3058	NC_014258	GAC	2	6	155692	155697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717259
3059	NC_014258	ACC	2	6	155843	155848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717259
3060	NC_014258	GCT	2	6	155872	155877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717259
3061	NC_014258	GC	3	6	155910	155915	0 %	0 %	50 %	50 %	298717259
3062	NC_014258	GC	3	6	155956	155961	0 %	0 %	50 %	50 %	298717259
3063	NC_014258	TGCG	2	8	155964	155971	0 %	25 %	50 %	25 %	298717259
3064	NC_014258	GCCAG	2	10	156016	156025	20 %	0 %	40 %	40 %	298717259
3065	NC_014258	GCG	2	6	156026	156031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717259
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3069	NC_014258	TGC	2	6	156118	156123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717259
3070	NC_014258	CGG	2	6	156133	156138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717259
3071	NC_014258	AGC	2	6	156168	156173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717259
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3073	NC_014258	TGG	3	9	156312	156320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717260
3074	NC_014258	GCGG	2	8	156323	156330	0 %	0 %	75 %	25 %	298717260
3075	NC_014258	CTG	2	6	156344	156349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717260
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3077	NC_014258	GC	4	8	156481	156488	0 %	0 %	50 %	50 %	298717260
3078	NC_014258	GCCA	2	8	156542	156549	25 %	0 %	25 %	50 %	298717260
3079	NC_014258	GATC	2	8	156571	156578	25 %	25 %	25 %	25 %	298717260
3080	NC_014258	TGG	3	9	156579	156587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717260
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3092	NC_014258	GCA	2	6	157136	157141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717260
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3101	NC_014258	GTT	2	6	157603	157608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298717261
3102	NC_014258	AATAA	2	10	157637	157646	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_014258	GAT	2	6	157687	157692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_014258	GCA	2	6	157696	157701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_014258	TGC	2	6	157709	157714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_014258	TGCG	3	12	157781	157792	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3107	NC_014258	GA	3	6	157804	157809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_014258	TAAC	2	8	157845	157852	50 %	25 %	0 %	25 %	298717262
3109	NC_014258	GTC	2	6	157881	157886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717262
3110	NC_014258	GCT	2	6	157890	157895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717262
3111	NC_014258	GGTG	2	8	157929	157936	0 %	25 %	75 %	0 %	298717262
3112	NC_014258	GCG	2	6	158011	158016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717262
3113	NC_014258	CGC	2	6	158027	158032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717262
3114	NC_014258	GC	3	6	158046	158051	0 %	0 %	50 %	50 %	298717262
3115	NC_014258	AAACTC	2	12	158103	158114	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	298717262
3116	NC_014258	GAT	2	6	158120	158125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717262
3117	NC_014258	CGC	2	6	158151	158156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717262
3118	NC_014258	GGC	3	9	158172	158180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717262
3119	NC_014258	TCT	2	6	158252	158257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717262
3120	NC_014258	CG	3	6	158298	158303	0 %	0 %	50 %	50 %	298717262
3121	NC_014258	AACGG	2	10	158410	158419	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3122	NC_014258	CATCA	2	10	158446	158455	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3123	NC_014258	A	6	6	158485	158490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_014258	AGC	2	6	158599	158604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3491	NC_014258	TGC	2	6	176568	176573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717279
3492	NC_014258	AT	3	6	176678	176683	50 %	50 %	0 %	0 %	298717279
3493	NC_014258	TCA	2	6	176706	176711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717279
3494	NC_014258	CGA	2	6	176873	176878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717279
3495	NC_014258	ACG	2	6	176931	176936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717279
3496	NC_014258	GCA	2	6	176965	176970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717279
3497	NC_014258	GGC	2	6	176972	176977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717279
3498	NC_014258	GGCG	2	8	177107	177114	0 %	0 %	75 %	25 %	298717279
3499	NC_014258	AAGG	2	8	177283	177290	50 %	0 %	50 %	0 %	298717279
3500	NC_014258	AGA	3	9	177374	177382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298717279

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