MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pantoea vagans C9-1 plasmid pPag3

Total Repeats: 10991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_014258	CGG	2	6	505723	505728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717613
10502	NC_014258	GCT	2	6	505748	505753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717613
10503	NC_014258	AAT	2	6	505770	505775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717613
10504	NC_014258	TGC	2	6	505792	505797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717613
10505	NC_014258	TTTC	2	8	505817	505824	0 %	75 %	0 %	25 %	298717613
10506	NC_014258	GAT	2	6	506053	506058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10507	NC_014258	TTA	2	6	506157	506162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298717614
10508	NC_014258	CGT	2	6	506197	506202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717614
10509	NC_014258	ATTTT	2	10	506223	506232	20 %	80 %	0 %	0 %	298717614
10510	NC_014258	CAGG	2	8	506242	506249	25 %	0 %	50 %	25 %	298717614
10511	NC_014258	TGA	2	6	506347	506352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717614
10512	NC_014258	GCCC	2	8	506359	506366	0 %	0 %	25 %	75 %	298717614
10513	NC_014258	TCG	2	6	506391	506396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717614
10514	NC_014258	CTGC	2	8	506431	506438	0 %	25 %	25 %	50 %	298717614
10515	NC_014258	TCT	2	6	506445	506450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717614
10516	NC_014258	TGA	2	6	506501	506506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_014258	ATAA	2	8	506540	506547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10518	NC_014258	CTGCA	2	10	506630	506639	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10519	NC_014258	TTA	2	6	506728	506733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10520	NC_014258	ACCCT	2	10	506769	506778	20 %	20 %	0 %	60 %	298717615
10521	NC_014258	GGC	2	6	506788	506793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717615
10522	NC_014258	CAC	2	6	506800	506805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717615
10523	NC_014258	GCG	2	6	506825	506830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717615
10524	NC_014258	CCA	2	6	506841	506846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717615
10525	NC_014258	GC	3	6	506850	506855	0 %	0 %	50 %	50 %	298717615
10526	NC_014258	CGC	2	6	506859	506864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717615
10527	NC_014258	GCT	2	6	506953	506958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717615
10528	NC_014258	GCC	2	6	506988	506993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717615
10529	NC_014258	TGC	2	6	507003	507008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717615
10530	NC_014258	TGG	2	6	507048	507053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717615
10531	NC_014258	GCC	2	6	507077	507082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717615
10532	NC_014258	CTG	2	6	507167	507172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717615
10533	NC_014258	GCT	2	6	507268	507273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717615
10534	NC_014258	TGA	2	6	507282	507287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717615
10535	NC_014258	CCGCG	2	10	507377	507386	0 %	0 %	40 %	60 %	298717615
10536	NC_014258	TGG	2	6	507471	507476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717615
10537	NC_014258	CGG	2	6	507508	507513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717615
10538	NC_014258	TCGT	2	8	507565	507572	0 %	50 %	25 %	25 %	298717615
10539	NC_014258	GCC	2	6	507574	507579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717615
10540	NC_014258	CG	3	6	507580	507585	0 %	0 %	50 %	50 %	298717615
10541	NC_014258	GCTGAT	2	12	507604	507615	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	298717615
10542	NC_014258	TGCCC	2	10	507808	507817	0 %	20 %	20 %	60 %	298717615
10543	NC_014258	GCC	2	6	507836	507841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717615
10544	NC_014258	C	6	6	507840	507845	0 %	0 %	0 %	100 %	298717615
10545	NC_014258	CG	3	6	507929	507934	0 %	0 %	50 %	50 %	298717615
10546	NC_014258	ATG	2	6	508065	508070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717616
10547	NC_014258	TGC	2	6	508142	508147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717616
10548	NC_014258	GGC	2	6	508238	508243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717616
10549	NC_014258	GTT	2	6	508265	508270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298717616
10550	NC_014258	ACC	2	6	508311	508316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717616
10551	NC_014258	GCA	2	6	508350	508355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717616
10552	NC_014258	TGAA	2	8	508414	508421	50 %	25 %	25 %	0 %	298717616
10553	NC_014258	GC	3	6	508475	508480	0 %	0 %	50 %	50 %	298717616
10554	NC_014258	CGCC	2	8	508494	508501	0 %	0 %	25 %	75 %	298717616
10555	NC_014258	TAC	2	6	508514	508519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717616
10556	NC_014258	GCAC	2	8	508554	508561	25 %	0 %	25 %	50 %	298717616
10557	NC_014258	CAC	2	6	508577	508582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717616
10558	NC_014258	GCCC	2	8	508676	508683	0 %	0 %	25 %	75 %	298717616
10559	NC_014258	CGG	2	6	508739	508744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717616
10560	NC_014258	GGT	2	6	508760	508765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717616
10561	NC_014258	GCC	2	6	508773	508778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717616
10562	NC_014258	GATC	2	8	508876	508883	25 %	25 %	25 %	25 %	298717616
10563	NC_014258	GCA	2	6	508910	508915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717616
10564	NC_014258	GCA	2	6	509006	509011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717616
10565	NC_014258	CTG	2	6	509017	509022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717616
10566	NC_014258	GC	3	6	509039	509044	0 %	0 %	50 %	50 %	298717616
10567	NC_014258	CGA	2	6	509045	509050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717616
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10569	NC_014258	CTGCG	2	10	509130	509139	0 %	20 %	40 %	40 %	298717616
10570	NC_014258	TGG	2	6	509140	509145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717616
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10572	NC_014258	CTG	2	6	509310	509315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717616
10573	NC_014258	GCGG	2	8	509342	509349	0 %	0 %	75 %	25 %	298717616
10574	NC_014258	GCA	2	6	509399	509404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717616
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10578	NC_014258	GAT	2	6	509544	509549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717616
10579	NC_014258	CTG	2	6	509595	509600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717616
10580	NC_014258	GCG	2	6	509638	509643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717616
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10585	NC_014258	CACG	2	8	509804	509811	25 %	0 %	25 %	50 %	298717616
10586	NC_014258	TGG	2	6	509821	509826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717616
10587	NC_014258	GAT	2	6	509946	509951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717616
10588	NC_014258	CAA	2	6	509955	509960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717616
10589	NC_014258	CTG	2	6	510003	510008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717616
10590	NC_014258	TAC	2	6	510043	510048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717616
10591	NC_014258	CAGC	2	8	510205	510212	25 %	0 %	25 %	50 %	298717616
10592	NC_014258	CTCA	2	8	510294	510301	25 %	25 %	0 %	50 %	298717616
10593	NC_014258	CGC	2	6	510338	510343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717616
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10599	NC_014258	ATG	2	6	510463	510468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717616
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10602	NC_014258	TGT	2	6	510619	510624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298717616
10603	NC_014258	CTG	2	6	510687	510692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717616
10604	NC_014258	CTG	2	6	510708	510713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717616
10605	NC_014258	CAT	2	6	510830	510835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717616
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10612	NC_014258	CCGG	2	8	511316	511323	0 %	0 %	50 %	50 %	298717616
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10619	NC_014258	CGG	2	6	511676	511681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717616
10620	NC_014258	AGC	2	6	511717	511722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717616
10621	NC_014258	GCT	2	6	511814	511819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717616
10622	NC_014258	GCAC	2	8	511851	511858	25 %	0 %	25 %	50 %	298717616
10623	NC_014258	TGCC	2	8	511969	511976	0 %	25 %	25 %	50 %	298717616
10624	NC_014258	GCAGT	2	10	512035	512044	20 %	20 %	40 %	20 %	298717616
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10981	NC_014258	GGTAAT	2	12	529069	529080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717634
10982	NC_014258	TTC	2	6	529115	529120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717634
10983	NC_014258	TCG	2	6	529128	529133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717634
10984	NC_014258	GAAC	2	8	529188	529195	50 %	0 %	25 %	25 %	298717634
10985	NC_014258	TAT	2	6	529230	529235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298717634
10986	NC_014258	TTG	2	6	529238	529243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298717634
10987	NC_014258	CAC	2	6	529263	529268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717634
10988	NC_014258	CGA	2	6	529509	529514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10989	NC_014258	TC	3	6	529532	529537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10990	NC_014258	T	6	6	529557	529562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10991	NC_014258	CAT	3	9	529639	529647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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