MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pantoea vagans C9-1 plasmid pPag3

Total Repeats: 10991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_014258	A	6	6	482345	482350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_014258	ATA	2	6	482379	482384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_014258	ATTA	2	8	482396	482403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_014258	A	6	6	482409	482414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_014258	T	7	7	482446	482452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_014258	TGTT	2	8	482509	482516	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_014258	ATCA	2	8	482552	482559	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10008	NC_014258	GA	3	6	482565	482570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_014258	ATG	2	6	482621	482626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_014258	CAC	2	6	482743	482748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717582
10011	NC_014258	TCCC	2	8	482800	482807	0 %	25 %	0 %	75 %	298717582
10012	NC_014258	ACA	2	6	482842	482847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717582
10013	NC_014258	TCG	2	6	482854	482859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717582
10014	NC_014258	GA	3	6	482886	482891	50 %	0 %	50 %	0 %	298717582
10015	NC_014258	CGC	2	6	482896	482901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717582
10016	NC_014258	CCA	2	6	482932	482937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717582
10017	NC_014258	ACG	2	6	482954	482959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717582
10018	NC_014258	AGC	2	6	482964	482969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717582
10019	NC_014258	CAG	2	6	482993	482998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717582
10020	NC_014258	AGC	2	6	483063	483068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717582
10021	NC_014258	GCA	2	6	483076	483081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717582
10022	NC_014258	CGGG	2	8	483084	483091	0 %	0 %	75 %	25 %	298717582
10023	NC_014258	CTG	2	6	483110	483115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717582
10024	NC_014258	GAT	2	6	483170	483175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717582
10025	NC_014258	TGT	2	6	483346	483351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298717582
10026	NC_014258	CAA	2	6	483391	483396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717582
10027	NC_014258	CACC	2	8	483400	483407	25 %	0 %	0 %	75 %	298717582
10028	NC_014258	CAG	2	6	483512	483517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717582
10029	NC_014258	GGC	2	6	483624	483629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717583
10030	NC_014258	ACG	2	6	483631	483636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717583
10031	NC_014258	CAG	2	6	483646	483651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717583
10032	NC_014258	CAG	2	6	483679	483684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717583
10033	NC_014258	CAG	2	6	483688	483693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717583
10034	NC_014258	GAT	2	6	483709	483714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717583
10035	NC_014258	GCC	2	6	483715	483720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717583
10036	NC_014258	GTA	2	6	483736	483741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717583
10037	NC_014258	TGC	2	6	483771	483776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717583
10038	NC_014258	ATC	2	6	483791	483796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717583
10039	NC_014258	AGC	2	6	483797	483802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717583
10040	NC_014258	CAC	2	6	483847	483852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717583
10041	NC_014258	CAGA	2	8	483853	483860	50 %	0 %	25 %	25 %	298717583
10042	NC_014258	GCC	2	6	483890	483895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717583
10043	NC_014258	CAG	2	6	483910	483915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717583
10044	NC_014258	AGA	2	6	483921	483926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298717583
10045	NC_014258	GC	4	8	483959	483966	0 %	0 %	50 %	50 %	298717583
10046	NC_014258	TCA	2	6	483974	483979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717583
10047	NC_014258	AAG	2	6	483980	483985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298717583
10048	NC_014258	CAG	2	6	484012	484017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717583
10049	NC_014258	ATG	2	6	484019	484024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717583
10050	NC_014258	A	7	7	484153	484159	100 %	0 %	0 %	0 %	298717583
10051	NC_014258	TCT	2	6	484187	484192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717583
10052	NC_014258	TGC	2	6	484224	484229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717583
10053	NC_014258	GAAA	2	8	484247	484254	75 %	0 %	25 %	0 %	298717583
10054	NC_014258	GA	3	6	484367	484372	50 %	0 %	50 %	0 %	298717583
10055	NC_014258	CCAC	2	8	484385	484392	25 %	0 %	0 %	75 %	298717583
10056	NC_014258	TCA	2	6	484507	484512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717584
10057	NC_014258	TGA	2	6	484517	484522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717584
10058	NC_014258	CG	3	6	484572	484577	0 %	0 %	50 %	50 %	298717584
10059	NC_014258	GCG	2	6	484588	484593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717584
10060	NC_014258	CAG	2	6	484728	484733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717584
10061	NC_014258	TGA	2	6	484736	484741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717584
10062	NC_014258	AGG	2	6	484786	484791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298717584
10063	NC_014258	CTG	2	6	484803	484808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717584
10064	NC_014258	TCT	2	6	484838	484843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717584
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10066	NC_014258	CTG	2	6	484920	484925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717584
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10070	NC_014258	CCA	2	6	484991	484996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717584
10071	NC_014258	TGC	2	6	485093	485098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717584
10072	NC_014258	GCG	2	6	485173	485178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717584
10073	NC_014258	CAT	2	6	485207	485212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717584
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10079	NC_014258	GGCG	2	8	485428	485435	0 %	0 %	75 %	25 %	298717585
10080	NC_014258	CCG	2	6	485467	485472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717585
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10083	NC_014258	CTG	2	6	485528	485533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717585
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10089	NC_014258	CTG	2	6	486106	486111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717585
10090	NC_014258	GCT	3	9	486116	486124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717585
10091	NC_014258	GTG	2	6	486162	486167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717585
10092	NC_014258	T	6	6	486171	486176	0 %	100 %	0 %	0 %	298717585
10093	NC_014258	T	6	6	486238	486243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_014258	CAG	2	6	486268	486273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_014258	TTC	2	6	486287	486292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10096	NC_014258	TTCAGG	2	12	486297	486308	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10097	NC_014258	ATG	3	9	486362	486370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_014258	CAGG	2	8	486402	486409	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10099	NC_014258	AGG	2	6	486498	486503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_014258	GCA	2	6	486536	486541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_014258	AATT	2	8	486576	486583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_014258	TGA	2	6	486589	486594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_014258	T	7	7	486596	486602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_014258	AGG	2	6	486635	486640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298717586
10105	NC_014258	CGA	2	6	486660	486665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717586
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10108	NC_014258	ACT	2	6	486850	486855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717586
10109	NC_014258	CTG	2	6	486911	486916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717586
10110	NC_014258	TTC	2	6	486925	486930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717586
10111	NC_014258	TAA	2	6	486937	486942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717586
10112	NC_014258	AAT	2	6	486967	486972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_014258	TTG	3	9	486994	487002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_014258	ACT	2	6	487034	487039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10115	NC_014258	A	8	8	487083	487090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_014258	CAG	2	6	487262	487267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717587
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10119	NC_014258	AGA	3	9	487375	487383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298717587
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10122	NC_014258	ACC	2	6	487477	487482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10123	NC_014258	CAA	2	6	487540	487545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10124	NC_014258	GCA	2	6	487573	487578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10125	NC_014258	GCT	2	6	487730	487735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717588
10126	NC_014258	GAC	2	6	487745	487750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717588
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10130	NC_014258	T	7	7	487969	487975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10131	NC_014258	GGCT	2	8	487976	487983	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10132	NC_014258	AGAA	2	8	488053	488060	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10133	NC_014258	TCA	2	6	488078	488083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717589
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10138	NC_014258	CTG	2	6	488411	488416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10139	NC_014258	TAA	2	6	488552	488557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10141	NC_014258	TTAT	2	8	488570	488577	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10142	NC_014258	CAA	2	6	488592	488597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10143	NC_014258	CTGT	2	8	488621	488628	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10144	NC_014258	A	6	6	488647	488652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10145	NC_014258	TAA	2	6	488733	488738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10150	NC_014258	G	6	6	489103	489108	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10151	NC_014258	AAT	2	6	489110	489115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10152	NC_014258	CAT	2	6	489121	489126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10154	NC_014258	GAT	2	6	489302	489307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717590
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10212	NC_014258	AAGCG	2	10	492100	492109	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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10217	NC_014258	TAT	2	6	492385	492390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10218	NC_014258	CTG	2	6	492411	492416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10232	NC_014258	GCA	2	6	493056	493061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717594
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10234	NC_014258	GGT	2	6	493096	493101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717594
10235	NC_014258	CG	3	6	493113	493118	0 %	0 %	50 %	50 %	298717594
10236	NC_014258	CGG	3	9	493182	493190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717594
10237	NC_014258	GC	3	6	493206	493211	0 %	0 %	50 %	50 %	298717594
10238	NC_014258	GC	3	6	493274	493279	0 %	0 %	50 %	50 %	298717594
10239	NC_014258	TGC	2	6	493280	493285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717594
10240	NC_014258	CTG	2	6	493354	493359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717594
10241	NC_014258	CCGC	2	8	493390	493397	0 %	0 %	25 %	75 %	298717594
10242	NC_014258	ATC	2	6	493417	493422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717594
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10244	NC_014258	CAT	2	6	493475	493480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10246	NC_014258	GATC	2	8	493597	493604	25 %	25 %	25 %	25 %	298717595
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10485	NC_014258	ATT	2	6	504819	504824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298717612
10486	NC_014258	CCA	2	6	504859	504864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717612
10487	NC_014258	T	6	6	504875	504880	0 %	100 %	0 %	0 %	298717612
10488	NC_014258	CG	3	6	504989	504994	0 %	0 %	50 %	50 %	298717612
10489	NC_014258	GTC	2	6	505038	505043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717612
10490	NC_014258	CAG	2	6	505140	505145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10491	NC_014258	GTT	2	6	505146	505151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10492	NC_014258	GAAAG	2	10	505354	505363	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10493	NC_014258	AGC	2	6	505383	505388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717613
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10496	NC_014258	CCGG	2	8	505563	505570	0 %	0 %	50 %	50 %	298717613
10497	NC_014258	GAT	2	6	505587	505592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717613
10498	NC_014258	CTG	2	6	505599	505604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717613
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