MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pantoea vagans C9-1 plasmid pPag3

Total Repeats: 10991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_014258	TGC	2	6	312662	312667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717413
6502	NC_014258	CGG	2	6	312687	312692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717413
6503	NC_014258	GC	3	6	312707	312712	0 %	0 %	50 %	50 %	298717413
6504	NC_014258	CGA	2	6	312762	312767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717413
6505	NC_014258	AACG	2	8	312871	312878	50 %	0 %	25 %	25 %	298717413
6506	NC_014258	TGC	2	6	312971	312976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717413
6507	NC_014258	GCT	3	9	313020	313028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717413
6508	NC_014258	GCC	2	6	313077	313082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717413
6509	NC_014258	TCG	2	6	313104	313109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717413
6510	NC_014258	TGGC	2	8	313123	313130	0 %	25 %	50 %	25 %	298717413
6511	NC_014258	CTG	2	6	313147	313152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717413
6512	NC_014258	GCC	2	6	313216	313221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717413
6513	NC_014258	CGG	2	6	313236	313241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717413
6514	NC_014258	TG	3	6	313243	313248	0 %	50 %	50 %	0 %	298717413
6515	NC_014258	CCG	2	6	313283	313288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717413
6516	NC_014258	GCC	3	9	313303	313311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717413
6517	NC_014258	GGT	2	6	313323	313328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717413
6518	NC_014258	CGCTG	2	10	313406	313415	0 %	20 %	40 %	40 %	298717413
6519	NC_014258	AGC	2	6	313444	313449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717413
6520	NC_014258	CAA	2	6	313474	313479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717413
6521	NC_014258	GGTC	2	8	313610	313617	0 %	25 %	50 %	25 %	298717414
6522	NC_014258	CTG	2	6	313641	313646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717414
6523	NC_014258	GCT	2	6	313649	313654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717414
6524	NC_014258	CCG	2	6	313723	313728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717414
6525	NC_014258	GAG	2	6	313830	313835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298717414
6526	NC_014258	TGC	2	6	313885	313890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717414
6527	NC_014258	GACAGC	2	12	313918	313929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717414
6528	NC_014258	CT	3	6	313989	313994	0 %	50 %	0 %	50 %	298717414
6529	NC_014258	GC	3	6	314024	314029	0 %	0 %	50 %	50 %	298717414
6530	NC_014258	TCG	2	6	314119	314124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717414
6531	NC_014258	TGA	2	6	314125	314130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717414
6532	NC_014258	GCA	2	6	314147	314152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717414
6533	NC_014258	CCGG	2	8	314177	314184	0 %	0 %	50 %	50 %	298717414
6534	NC_014258	CCG	2	6	314217	314222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717414
6535	NC_014258	CTG	2	6	314229	314234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717414
6536	NC_014258	CTG	2	6	314273	314278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717414
6537	NC_014258	CAC	2	6	314313	314318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717414
6538	NC_014258	GCA	3	9	314324	314332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717414
6539	NC_014258	CGG	3	9	314398	314406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717414
6540	NC_014258	TGCCG	2	10	314498	314507	0 %	20 %	40 %	40 %	298717414
6541	NC_014258	GGC	2	6	314508	314513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717414
6542	NC_014258	CAG	2	6	314561	314566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717414
6543	NC_014258	A	7	7	314593	314599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_014258	CGC	2	6	314602	314607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6545	NC_014258	GCT	2	6	314697	314702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717415
6546	NC_014258	GGC	2	6	314725	314730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717415
6547	NC_014258	CTG	2	6	314740	314745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717415
6548	NC_014258	GCA	2	6	314753	314758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717415
6549	NC_014258	CTG	2	6	314761	314766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717415
6550	NC_014258	CCAT	2	8	314774	314781	25 %	25 %	0 %	50 %	298717415
6551	NC_014258	CG	3	6	314814	314819	0 %	0 %	50 %	50 %	298717415
6552	NC_014258	CAT	2	6	314881	314886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717415
6553	NC_014258	CGC	2	6	314925	314930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717415
6554	NC_014258	CTGCG	2	10	314990	314999	0 %	20 %	40 %	40 %	298717415
6555	NC_014258	ACC	2	6	315023	315028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717415
6556	NC_014258	TGC	2	6	315058	315063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717415
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6558	NC_014258	TGG	2	6	315120	315125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717415
6559	NC_014258	CAC	2	6	315175	315180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717415
6560	NC_014258	CCA	2	6	315186	315191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717415
6561	NC_014258	TCAG	2	8	315227	315234	25 %	25 %	25 %	25 %	298717415
6562	NC_014258	CTG	2	6	315244	315249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717415
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6564	NC_014258	GCG	2	6	315317	315322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717415
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6572	NC_014258	CAG	2	6	315637	315642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717415
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6574	NC_014258	CTGA	2	8	315679	315686	25 %	25 %	25 %	25 %	298717415
6575	NC_014258	CGA	2	6	315693	315698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717415
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6582	NC_014258	GC	3	6	316289	316294	0 %	0 %	50 %	50 %	298717415
6583	NC_014258	CTG	2	6	316408	316413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717415
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6585	NC_014258	ACC	2	6	316537	316542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717415
6586	NC_014258	TTCTT	2	10	316572	316581	0 %	80 %	0 %	20 %	298717415
6587	NC_014258	ACTG	2	8	316590	316597	25 %	25 %	25 %	25 %	298717415
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6590	NC_014258	ATC	2	6	316662	316667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6591	NC_014258	CGG	2	6	316671	316676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6592	NC_014258	T	7	7	316679	316685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_014258	T	7	7	316785	316791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_014258	CAA	2	6	316798	316803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6595	NC_014258	CTG	2	6	316806	316811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6596	NC_014258	GA	4	8	316866	316873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6597	NC_014258	CTGG	2	8	316915	316922	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6598	NC_014258	ACT	2	6	316944	316949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6600	NC_014258	TAT	2	6	317054	317059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_014258	GCA	2	6	317145	317150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717416
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6603	NC_014258	TGC	2	6	317228	317233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717416
6604	NC_014258	AGCC	2	8	317241	317248	25 %	0 %	25 %	50 %	298717416
6605	NC_014258	CTG	2	6	317284	317289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717416
6606	NC_014258	CAGT	2	8	317338	317345	25 %	25 %	25 %	25 %	298717416
6607	NC_014258	GC	3	6	317359	317364	0 %	0 %	50 %	50 %	298717416
6608	NC_014258	GAA	2	6	317380	317385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298717416
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6612	NC_014258	CAGC	2	8	317454	317461	25 %	0 %	25 %	50 %	298717416
6613	NC_014258	ATT	2	6	317478	317483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298717416
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6992	NC_014258	GCT	2	6	335375	335380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717434
6993	NC_014258	CTG	2	6	335432	335437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717434
6994	NC_014258	CAT	2	6	335539	335544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717434
6995	NC_014258	TAC	2	6	335688	335693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6996	NC_014258	CAT	2	6	335797	335802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6997	NC_014258	TAA	2	6	335916	335921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6998	NC_014258	GGAG	2	8	335980	335987	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6999	NC_014258	A	8	8	335993	336000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7000	NC_014258	GAG	3	9	336026	336034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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