MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pantoea vagans C9-1 plasmid pPag3

Total Repeats: 10991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014258	GCT	2	6	243960	243965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717341
5002	NC_014258	TGT	3	9	244023	244031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298717341
5003	NC_014258	CAG	2	6	244036	244041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717341
5004	NC_014258	GTG	2	6	244099	244104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717341
5005	NC_014258	CCG	3	9	244160	244168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717341
5006	NC_014258	GAT	2	6	244186	244191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717341
5007	NC_014258	TCG	2	6	244259	244264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717341
5008	NC_014258	CAG	2	6	244270	244275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717341
5009	NC_014258	CCG	2	6	244371	244376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717341
5010	NC_014258	CGC	2	6	244389	244394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717341
5011	NC_014258	AGT	2	6	244422	244427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717341
5012	NC_014258	CAT	2	6	244513	244518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717341
5013	NC_014258	CTT	2	6	244530	244535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717341
5014	NC_014258	GC	3	6	244563	244568	0 %	0 %	50 %	50 %	298717341
5015	NC_014258	TGA	2	6	244602	244607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717341
5016	NC_014258	GCAG	2	8	244686	244693	25 %	0 %	50 %	25 %	298717341
5017	NC_014258	TAA	2	6	244714	244719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717341
5018	NC_014258	CCGGCA	2	12	244853	244864	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	298717341
5019	NC_014258	ATT	2	6	244882	244887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298717341
5020	NC_014258	TCGCAA	2	12	244920	244931	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	298717341
5021	NC_014258	GTTG	2	8	244999	245006	0 %	50 %	50 %	0 %	298717341
5022	NC_014258	TCA	2	6	245052	245057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717341
5023	NC_014258	TC	3	6	245060	245065	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5024	NC_014258	AATC	2	8	245210	245217	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5025	NC_014258	TGG	2	6	245221	245226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_014258	GCAT	2	8	245237	245244	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5027	NC_014258	CGCTA	2	10	245251	245260	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5028	NC_014258	TAA	2	6	245270	245275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_014258	ATA	2	6	245325	245330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_014258	ATA	2	6	245459	245464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_014258	CTTT	2	8	245468	245475	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5032	NC_014258	TAAT	2	8	245482	245489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_014258	AT	3	6	245488	245493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_014258	CAA	2	6	245548	245553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717343
5035	NC_014258	CAT	2	6	245665	245670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717343
5036	NC_014258	TGCC	2	8	245723	245730	0 %	25 %	25 %	50 %	298717343
5037	NC_014258	GCA	2	6	245757	245762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717343
5038	NC_014258	AGC	2	6	245765	245770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717343
5039	NC_014258	GT	3	6	245887	245892	0 %	50 %	50 %	0 %	298717343
5040	NC_014258	GCC	2	6	245934	245939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717343
5041	NC_014258	AGT	2	6	245965	245970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717343
5042	NC_014258	TACC	2	8	245992	245999	25 %	25 %	0 %	50 %	298717343
5043	NC_014258	GGT	2	6	246017	246022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717343
5044	NC_014258	ATT	2	6	246105	246110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298717343
5045	NC_014258	CT	3	6	246111	246116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5046	NC_014258	CAGAAA	2	12	246197	246208	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5047	NC_014258	GCC	3	9	246281	246289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717344
5048	NC_014258	GCT	2	6	246312	246317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717344
5049	NC_014258	TGG	3	9	246320	246328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717344
5050	NC_014258	GCT	2	6	246357	246362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717344
5051	NC_014258	GCG	2	6	246421	246426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717344
5052	NC_014258	GCG	2	6	246459	246464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717344
5053	NC_014258	CGA	2	6	246554	246559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717344
5054	NC_014258	TGC	2	6	246561	246566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717344
5055	NC_014258	TGC	2	6	246662	246667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717344
5056	NC_014258	TTC	2	6	246715	246720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717344
5057	NC_014258	AAC	2	6	246775	246780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717344
5058	NC_014258	CGC	2	6	246819	246824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717344
5059	NC_014258	GGC	2	6	246915	246920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717344
5060	NC_014258	ACT	2	6	246921	246926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717344
5061	NC_014258	GGC	2	6	246961	246966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717344
5062	NC_014258	GAT	2	6	247027	247032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717344
5063	NC_014258	GCT	2	6	247041	247046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717344
5064	NC_014258	CCG	2	6	247136	247141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_014258	CGG	2	6	247149	247154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_014258	TAA	2	6	247208	247213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717345
5067	NC_014258	CG	3	6	247275	247280	0 %	0 %	50 %	50 %	298717345
5068	NC_014258	AAG	2	6	247334	247339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298717345
5069	NC_014258	CAT	2	6	247383	247388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717345
5070	NC_014258	GCTG	2	8	247425	247432	0 %	25 %	50 %	25 %	298717345
5071	NC_014258	CTG	2	6	247486	247491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717345
5072	NC_014258	GACA	2	8	247554	247561	50 %	0 %	25 %	25 %	298717345
5073	NC_014258	CTG	2	6	247616	247621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717345
5074	NC_014258	GAC	3	9	247632	247640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717345
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5076	NC_014258	GA	3	6	247679	247684	50 %	0 %	50 %	0 %	298717345
5077	NC_014258	GCA	2	6	247695	247700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717345
5078	NC_014258	TCG	2	6	247703	247708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717345
5079	NC_014258	TTC	2	6	247762	247767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717345
5080	NC_014258	CGC	2	6	247780	247785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717345
5081	NC_014258	GCGGG	2	10	247824	247833	0 %	0 %	80 %	20 %	298717345
5082	NC_014258	GAA	2	6	247897	247902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298717345
5083	NC_014258	GTC	2	6	247949	247954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717345
5084	NC_014258	CTG	2	6	247957	247962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_014258	TAAA	2	8	247983	247990	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_014258	GCCT	2	8	248032	248039	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5087	NC_014258	TC	3	6	248042	248047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5088	NC_014258	CCG	2	6	248214	248219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717346
5089	NC_014258	TTCAG	2	10	248234	248243	20 %	40 %	20 %	20 %	298717346
5090	NC_014258	A	6	6	248269	248274	100 %	0 %	0 %	0 %	298717346
5091	NC_014258	CGA	2	6	248284	248289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717346
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5094	NC_014258	CTG	2	6	248372	248377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717346
5095	NC_014258	CT	3	6	248392	248397	0 %	50 %	0 %	50 %	298717346
5096	NC_014258	GTG	3	9	248450	248458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717346
5097	NC_014258	GCT	3	9	248506	248514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717346
5098	NC_014258	GCT	2	6	248578	248583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717346
5099	NC_014258	GC	3	6	248588	248593	0 %	0 %	50 %	50 %	298717346
5100	NC_014258	TGG	2	6	248640	248645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717346
5101	NC_014258	CG	3	6	248678	248683	0 %	0 %	50 %	50 %	298717346
5102	NC_014258	TCT	2	6	248800	248805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717346
5103	NC_014258	CCTG	2	8	248808	248815	0 %	25 %	25 %	50 %	298717346
5104	NC_014258	TGC	2	6	248901	248906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717346
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5106	NC_014258	GGC	2	6	248936	248941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717346
5107	NC_014258	TC	3	6	248994	248999	0 %	50 %	0 %	50 %	298717346
5108	NC_014258	TGG	2	6	249021	249026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717346
5109	NC_014258	ATC	2	6	249044	249049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717346
5110	NC_014258	GGTGC	2	10	249080	249089	0 %	20 %	60 %	20 %	298717346
5111	NC_014258	ATT	2	6	249095	249100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298717346
5112	NC_014258	CTG	2	6	249173	249178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717346
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5120	NC_014258	CAGC	2	8	249446	249453	25 %	0 %	25 %	50 %	298717346
5121	NC_014258	GACA	2	8	249480	249487	50 %	0 %	25 %	25 %	298717347
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5123	NC_014258	TGA	2	6	249540	249545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717347
5124	NC_014258	TAAT	2	8	249554	249561	50 %	50 %	0 %	0 %	298717347
5125	NC_014258	ATT	2	6	249579	249584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298717347
5126	NC_014258	ATCA	2	8	249621	249628	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5127	NC_014258	ATTAA	2	10	249656	249665	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_014258	AAT	2	6	249666	249671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_014258	CTT	2	6	249786	249791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_014258	TCC	2	6	249800	249805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5131	NC_014258	GTAA	2	8	249816	249823	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_014258	TAA	2	6	249886	249891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717348
5133	NC_014258	TC	3	6	249942	249947	0 %	50 %	0 %	50 %	298717348
5134	NC_014258	GCA	2	6	249957	249962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717348
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5137	NC_014258	T	6	6	250188	250193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5138	NC_014258	AT	3	6	250212	250217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5139	NC_014258	CG	3	6	250247	250252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5140	NC_014258	CTG	2	6	250300	250305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717349
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5145	NC_014258	GGGCA	2	10	250612	250621	20 %	0 %	60 %	20 %	298717349
5146	NC_014258	GA	3	6	250626	250631	50 %	0 %	50 %	0 %	298717349
5147	NC_014258	A	6	6	250666	250671	100 %	0 %	0 %	0 %	298717349
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5161	NC_014258	GCG	2	6	251424	251429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717350
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5243	NC_014258	GAT	2	6	255142	255147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717353
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5246	NC_014258	ACGCTC	2	12	255268	255279	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	298717353
5247	NC_014258	TGG	2	6	255306	255311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717353
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5363	NC_014258	CAGG	2	8	259997	260004	25 %	0 %	50 %	25 %	298717358
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5365	NC_014258	TCT	2	6	260101	260106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717358
5366	NC_014258	GAA	2	6	260118	260123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298717358
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5396	NC_014258	CAGC	2	8	261856	261863	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5397	NC_014258	ACA	2	6	261870	261875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5483	NC_014258	GCCT	2	8	265524	265531	0 %	25 %	25 %	50 %	298717363
5484	NC_014258	GCG	2	6	265540	265545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717363
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5487	NC_014258	GGC	2	6	265641	265646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717363
5488	NC_014258	CCG	2	6	265700	265705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717363
5489	NC_014258	ACAGCA	2	12	265706	265717	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	298717363
5490	NC_014258	CAG	2	6	265725	265730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717363
5491	NC_014258	GCG	2	6	265731	265736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717363
5492	NC_014258	TGA	2	6	265756	265761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717363
5493	NC_014258	CGG	2	6	265762	265767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717363
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5496	NC_014258	GCGCT	2	10	265911	265920	0 %	20 %	40 %	40 %	298717363
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5499	NC_014258	ATC	2	6	266131	266136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717363
5500	NC_014258	CTGG	2	8	266159	266166	0 %	25 %	50 %	25 %	298717363

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