MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pantoea vagans C9-1 plasmid pPag3

Total Repeats: 10991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014258	GCA	2	6	221335	221340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717319
4502	NC_014258	TTCA	2	8	221345	221352	25 %	50 %	0 %	25 %	298717319
4503	NC_014258	CGC	2	6	221428	221433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717319
4504	NC_014258	TCG	2	6	221439	221444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717319
4505	NC_014258	CCG	2	6	221454	221459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717319
4506	NC_014258	GCTG	2	8	221497	221504	0 %	25 %	50 %	25 %	298717319
4507	NC_014258	A	6	6	221513	221518	100 %	0 %	0 %	0 %	298717319
4508	NC_014258	GTC	2	6	221634	221639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_014258	T	6	6	221653	221658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_014258	TTCA	2	8	221661	221668	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4511	NC_014258	TTG	2	6	221686	221691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298717320
4512	NC_014258	CTT	2	6	221734	221739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717320
4513	NC_014258	CCG	2	6	221779	221784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717320
4514	NC_014258	GCG	2	6	221794	221799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717320
4515	NC_014258	AAG	2	6	221806	221811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298717320
4516	NC_014258	TAA	2	6	221835	221840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717320
4517	NC_014258	GCC	2	6	221895	221900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717320
4518	NC_014258	CAG	3	9	221940	221948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717320
4519	NC_014258	CTG	2	6	221973	221978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717320
4520	NC_014258	CAG	2	6	221991	221996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717320
4521	NC_014258	CAGC	2	8	222060	222067	25 %	0 %	25 %	50 %	298717320
4522	NC_014258	GCA	2	6	222090	222095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717320
4523	NC_014258	TGG	2	6	222200	222205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717320
4524	NC_014258	CGG	3	9	222233	222241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717320
4525	NC_014258	TGG	2	6	222248	222253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717320
4526	NC_014258	ATG	2	6	222265	222270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717320
4527	NC_014258	GCT	2	6	222287	222292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717320
4528	NC_014258	CAG	2	6	222315	222320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717320
4529	NC_014258	TCA	2	6	222329	222334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717320
4530	NC_014258	GGC	2	6	222359	222364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717320
4531	NC_014258	TTC	2	6	222396	222401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717320
4532	NC_014258	GCG	2	6	222433	222438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717320
4533	NC_014258	T	6	6	222443	222448	0 %	100 %	0 %	0 %	298717320
4534	NC_014258	TCA	2	6	222482	222487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717320
4535	NC_014258	CAGAG	2	10	222529	222538	40 %	0 %	40 %	20 %	298717320
4536	NC_014258	CGG	2	6	222539	222544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717320
4537	NC_014258	CGC	2	6	222584	222589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717320
4538	NC_014258	CAG	2	6	222627	222632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717320
4539	NC_014258	ATC	2	6	222646	222651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717320
4540	NC_014258	ATC	2	6	222769	222774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717320
4541	NC_014258	CAGCGC	2	12	222825	222836	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	298717320
4542	NC_014258	ATG	3	9	222838	222846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717320
4543	NC_014258	GCC	2	6	222880	222885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717320
4544	NC_014258	GC	3	6	222887	222892	0 %	0 %	50 %	50 %	298717320
4545	NC_014258	GGC	2	6	222897	222902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717320
4546	NC_014258	CAG	2	6	222909	222914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717320
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4548	NC_014258	CGC	2	6	222959	222964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717320
4549	NC_014258	GC	3	6	222977	222982	0 %	0 %	50 %	50 %	298717320
4550	NC_014258	AAT	2	6	223041	223046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717320
4551	NC_014258	CGA	2	6	223098	223103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717320
4552	NC_014258	TAA	2	6	223137	223142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_014258	CAA	2	6	223143	223148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_014258	GAA	2	6	223168	223173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_014258	ATCAA	2	10	223279	223288	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4556	NC_014258	AAT	2	6	223477	223482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717322
4557	NC_014258	GCG	2	6	223509	223514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717322
4558	NC_014258	CAC	2	6	223521	223526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717322
4559	NC_014258	ATA	2	6	223561	223566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717322
4560	NC_014258	CGG	2	6	223580	223585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717322
4561	NC_014258	GC	3	6	223591	223596	0 %	0 %	50 %	50 %	298717322
4562	NC_014258	AGG	2	6	223607	223612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298717322
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4564	NC_014258	CAG	2	6	223782	223787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717322
4565	NC_014258	GCT	2	6	223789	223794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717322
4566	NC_014258	CCAGC	2	10	223872	223881	20 %	0 %	20 %	60 %	298717322
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4569	NC_014258	GGT	2	6	224040	224045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717322
4570	NC_014258	CAGACG	2	12	224055	224066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717322
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4573	NC_014258	TAG	2	6	224146	224151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717322
4574	NC_014258	GTG	2	6	224185	224190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717322
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4579	NC_014258	GAT	2	6	224336	224341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717322
4580	NC_014258	GAG	2	6	224436	224441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_014258	GCG	2	6	224480	224485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717323
4582	NC_014258	CAG	2	6	224515	224520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717323
4583	NC_014258	GTG	2	6	224555	224560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717323
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4586	NC_014258	GTGCC	2	10	224822	224831	0 %	20 %	40 %	40 %	298717323
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4591	NC_014258	CGC	2	6	225147	225152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717323
4592	NC_014258	ACT	2	6	225221	225226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717323
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4594	NC_014258	GCGA	2	8	225303	225310	25 %	0 %	50 %	25 %	298717323
4595	NC_014258	TGG	2	6	225361	225366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717323
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4598	NC_014258	GTTTC	2	10	225544	225553	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4599	NC_014258	GGA	2	6	225591	225596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_014258	GCG	2	6	225630	225635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717324
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4603	NC_014258	TGA	2	6	225796	225801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717324
4604	NC_014258	ACG	2	6	225808	225813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717324
4605	NC_014258	GCGG	2	8	225834	225841	0 %	0 %	75 %	25 %	298717324
4606	NC_014258	GCTG	2	8	225887	225894	0 %	25 %	50 %	25 %	298717324
4607	NC_014258	CGC	3	9	225896	225904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717324
4608	NC_014258	CGGGT	2	10	226090	226099	0 %	20 %	60 %	20 %	298717324
4609	NC_014258	CG	3	6	226135	226140	0 %	0 %	50 %	50 %	298717324
4610	NC_014258	GGC	2	6	226148	226153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717324
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4613	NC_014258	GCG	2	6	226275	226280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_014258	TTCA	2	8	226283	226290	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4615	NC_014258	AATG	2	8	226300	226307	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_014258	CT	3	6	226328	226333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4617	NC_014258	CTC	2	6	226495	226500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298717325
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4620	NC_014258	GAG	2	6	226701	226706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298717325
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4744	NC_014258	ACC	2	6	232582	232587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717330
4745	NC_014258	A	6	6	232603	232608	100 %	0 %	0 %	0 %	298717330
4746	NC_014258	ACC	2	6	232627	232632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717330
4747	NC_014258	GGT	2	6	232660	232665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717330
4748	NC_014258	TGG	2	6	232694	232699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717330
4749	NC_014258	GCG	2	6	232709	232714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717330
4750	NC_014258	GGC	2	6	232725	232730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717330
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4756	NC_014258	GAG	2	6	232888	232893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298717330
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4772	NC_014258	GC	3	6	233633	233638	0 %	0 %	50 %	50 %	298717330
4773	NC_014258	TGAG	2	8	233672	233679	25 %	25 %	50 %	0 %	298717330
4774	NC_014258	ACA	2	6	233711	233716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717330
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4781	NC_014258	CGG	2	6	233946	233951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717330
4782	NC_014258	ATC	3	9	233968	233976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717330
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4784	NC_014258	GCC	2	6	234004	234009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717330
4785	NC_014258	GCATCC	2	12	234037	234048	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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4788	NC_014258	GGT	2	6	234282	234287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717331
4789	NC_014258	GTCA	2	8	234289	234296	25 %	25 %	25 %	25 %	298717331
4790	NC_014258	TTTGA	2	10	234304	234313	20 %	60 %	20 %	0 %	298717331
4791	NC_014258	GC	3	6	234439	234444	0 %	0 %	50 %	50 %	298717331
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4852	NC_014258	TG	3	6	237537	237542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4853	NC_014258	AATTA	2	10	237577	237586	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4854	NC_014258	ATAA	2	8	237634	237641	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4855	NC_014258	ATT	2	6	237643	237648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4856	NC_014258	T	7	7	237664	237670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4857	NC_014258	ATG	2	6	237700	237705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717334
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4859	NC_014258	TTC	2	6	237753	237758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717334
4860	NC_014258	GGC	3	9	237808	237816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717334
4861	NC_014258	CTGG	2	8	237860	237867	0 %	25 %	50 %	25 %	298717334
4862	NC_014258	TGGCG	2	10	237894	237903	0 %	20 %	60 %	20 %	298717334
4863	NC_014258	TCGA	2	8	237991	237998	25 %	25 %	25 %	25 %	298717334
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4988	NC_014258	CCG	2	6	243358	243363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717340
4989	NC_014258	TGA	2	6	243370	243375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717340
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4991	NC_014258	GTT	2	6	243553	243558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298717340
4992	NC_014258	ACG	2	6	243570	243575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717340
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