MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Propionibacterium freudenreichii subsp. shermanii CIRM-BIA1 chromosome

Total Repeats: 64968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014215	GT	3	6	28	33	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014215	C	6	6	88	93	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NC_014215	GGT	2	6	152	157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014215	CCG	2	6	213	218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_014215	ACAG	2	8	253	260	50 %	0 %	25 %	25 %	297625199
6	NC_014215	CT	3	6	304	309	0 %	50 %	0 %	50 %	297625199
7	NC_014215	TGA	2	6	377	382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297625199
8	NC_014215	CG	3	6	404	409	0 %	0 %	50 %	50 %	297625199
9	NC_014215	ATCGA	2	10	415	424	40 %	20 %	20 %	20 %	297625199
10	NC_014215	ACC	2	6	464	469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625199
11	NC_014215	CGAGC	2	10	495	504	20 %	0 %	40 %	40 %	297625199
12	NC_014215	C	6	6	523	528	0 %	0 %	0 %	100 %	297625199
13	NC_014215	CGA	2	6	534	539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625199
14	NC_014215	TGCG	2	8	605	612	0 %	25 %	50 %	25 %	297625199
15	NC_014215	CCG	2	6	644	649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625199
16	NC_014215	TCG	2	6	715	720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625199
17	NC_014215	TGC	2	6	735	740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625199
18	NC_014215	GTGGCC	2	12	745	756	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	297625199
19	NC_014215	TGA	2	6	785	790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297625199
20	NC_014215	CTG	2	6	823	828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625199
21	NC_014215	ACT	3	9	854	862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297625199
22	NC_014215	GAG	2	6	892	897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297625199
23	NC_014215	TCA	2	6	911	916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297625199
24	NC_014215	CCG	2	6	948	953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625199
25	NC_014215	CGA	2	6	963	968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625199
26	NC_014215	CGA	2	6	987	992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625199
27	NC_014215	AGACCC	2	12	1013	1024	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	297625199
28	NC_014215	AGG	2	6	1025	1030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297625199
29	NC_014215	TTC	2	6	1033	1038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297625199
30	NC_014215	GCC	2	6	1170	1175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625199
31	NC_014215	GCC	2	6	1213	1218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625199
32	NC_014215	GGAG	2	8	1293	1300	25 %	0 %	75 %	0 %	297625199
33	NC_014215	GAG	2	6	1339	1344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297625199
34	NC_014215	TGGCCG	2	12	1352	1363	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	297625199
35	NC_014215	TGC	2	6	1370	1375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625199
36	NC_014215	CGA	2	6	1418	1423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625199
37	NC_014215	ACT	2	6	1442	1447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297625199
38	NC_014215	CGA	2	6	1461	1466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625199
39	NC_014215	ACCAC	2	10	1586	1595	40 %	0 %	0 %	60 %	297625199
40	NC_014215	TGA	2	6	1628	1633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297625199
41	NC_014215	CG	3	6	1695	1700	0 %	0 %	50 %	50 %	297625199
42	NC_014215	CAC	2	6	1742	1747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625200
43	NC_014215	GCA	2	6	1777	1782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625200
44	NC_014215	CGA	2	6	1789	1794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625200
45	NC_014215	GCC	2	6	1935	1940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625200
46	NC_014215	CGA	2	6	1981	1986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625200
47	NC_014215	ACA	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297625200
48	NC_014215	CAG	2	6	2045	2050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625200
49	NC_014215	CAG	2	6	2219	2224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625200
50	NC_014215	AAG	2	6	2256	2261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297625200
51	NC_014215	GGC	2	6	2264	2269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625200
52	NC_014215	GGC	2	6	2273	2278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625200
53	NC_014215	CG	4	8	2325	2332	0 %	0 %	50 %	50 %	297625200
54	NC_014215	GAC	2	6	2354	2359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625200
55	NC_014215	CG	3	6	2511	2516	0 %	0 %	50 %	50 %	297625200
56	NC_014215	GCG	3	9	2514	2522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625200
57	NC_014215	CCA	2	6	2557	2562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625200
58	NC_014215	AGA	2	6	2584	2589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297625200
59	NC_014215	CGA	2	6	2626	2631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625200
60	NC_014215	CGG	2	6	2699	2704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625200
61	NC_014215	CGC	3	9	2744	2752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625200
62	NC_014215	CGC	2	6	2774	2779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625200
63	NC_014215	CAA	2	6	2897	2902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297625200
64	NC_014215	TCA	2	6	2998	3003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297625200
65	NC_014215	GTC	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625200
66	NC_014215	TCA	2	6	3022	3027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297625200
67	NC_014215	GCG	3	9	3039	3047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625200
68	NC_014215	GC	3	6	3075	3080	0 %	0 %	50 %	50 %	297625200
69	NC_014215	GC	3	6	3092	3097	0 %	0 %	50 %	50 %	297625200
70	NC_014215	GTC	2	6	3144	3149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625200
71	NC_014215	TCTA	2	8	3179	3186	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014215	CGA	2	6	3246	3251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014215	AAC	2	6	3317	3322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014215	AAC	2	6	3332	3337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014215	GAC	2	6	3362	3367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014215	GCG	2	6	3417	3422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625201
77	NC_014215	TAC	2	6	3447	3452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297625201
78	NC_014215	GCT	2	6	3464	3469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625201
79	NC_014215	C	6	6	3471	3476	0 %	0 %	0 %	100 %	297625201
80	NC_014215	GAG	2	6	3513	3518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297625201
81	NC_014215	GTG	2	6	3537	3542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625201
82	NC_014215	CGA	2	6	3646	3651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625201
83	NC_014215	CGA	2	6	3695	3700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625201
84	NC_014215	GC	3	6	3716	3721	0 %	0 %	50 %	50 %	297625201
85	NC_014215	CAT	2	6	3737	3742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297625201
86	NC_014215	GGCC	2	8	3755	3762	0 %	0 %	50 %	50 %	297625201
87	NC_014215	GGC	2	6	3785	3790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625201
88	NC_014215	CTC	2	6	3819	3824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297625201
89	NC_014215	GTG	2	6	3927	3932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625201
90	NC_014215	GAG	2	6	3972	3977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297625201
91	NC_014215	GGA	2	6	3992	3997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297625201
92	NC_014215	CGA	2	6	3998	4003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625201
93	NC_014215	GC	3	6	4041	4046	0 %	0 %	50 %	50 %	297625202
94	NC_014215	CCA	2	6	4084	4089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625202
95	NC_014215	CTCGGC	2	12	4121	4132	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	297625202
96	NC_014215	GCC	2	6	4137	4142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625202
97	NC_014215	CG	3	6	4167	4172	0 %	0 %	50 %	50 %	297625202
98	NC_014215	CGT	3	9	4174	4182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625202
99	NC_014215	CAG	2	6	4187	4192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625202
100	NC_014215	CGT	2	6	4255	4260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625202
101	NC_014215	GCCC	2	8	4276	4283	0 %	0 %	25 %	75 %	297625202
102	NC_014215	GCCGCG	2	12	4284	4295	0 %	0 %	50 %	50 %	297625202
103	NC_014215	CCA	2	6	4330	4335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625202
104	NC_014215	GGT	2	6	4349	4354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625202
105	NC_014215	GGC	2	6	4388	4393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625202
106	NC_014215	CGGGC	2	10	4467	4476	0 %	0 %	60 %	40 %	297625202
107	NC_014215	CCA	2	6	4483	4488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625202
108	NC_014215	GC	3	6	4507	4512	0 %	0 %	50 %	50 %	297625202
109	NC_014215	CCA	2	6	4531	4536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625202
110	NC_014215	GCC	2	6	4564	4569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625202
111	NC_014215	CAG	2	6	4580	4585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625202
112	NC_014215	GC	3	6	4617	4622	0 %	0 %	50 %	50 %	297625202
113	NC_014215	GCCC	2	8	4635	4642	0 %	0 %	25 %	75 %	297625202
114	NC_014215	CGC	2	6	4696	4701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625202
115	NC_014215	TCG	2	6	4723	4728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625202
116	NC_014215	CGC	2	6	4791	4796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625202
117	NC_014215	CGC	2	6	4895	4900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625202
118	NC_014215	CAC	2	6	4925	4930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625202
119	NC_014215	TGGC	2	8	5049	5056	0 %	25 %	50 %	25 %	297625202
120	NC_014215	GCT	2	6	5107	5112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625202
121	NC_014215	ACC	2	6	5136	5141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625202
122	NC_014215	TCGG	2	8	5230	5237	0 %	25 %	50 %	25 %	297625203
123	NC_014215	GCC	2	6	5241	5246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625203
124	NC_014215	GGC	2	6	5349	5354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625203
125	NC_014215	AGC	2	6	5374	5379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625203
126	NC_014215	GTG	2	6	5392	5397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625203
127	NC_014215	CGG	2	6	5426	5431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625203
128	NC_014215	GTTC	2	8	5441	5448	0 %	50 %	25 %	25 %	297625203
129	NC_014215	TCG	2	6	5449	5454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625203
130	NC_014215	CCA	2	6	5483	5488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625203
131	NC_014215	CCA	2	6	5507	5512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625203
132	NC_014215	CGC	2	6	5573	5578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625203
133	NC_014215	TGGATG	2	12	5626	5637	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	297625203
134	NC_014215	CCG	2	6	5653	5658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625203
135	NC_014215	CGT	2	6	5732	5737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625203
136	NC_014215	GAT	2	6	5796	5801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297625203
137	NC_014215	CGT	2	6	5831	5836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625203
138	NC_014215	GTA	2	6	5844	5849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297625203
139	NC_014215	TGG	2	6	5903	5908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625203
140	NC_014215	CGG	2	6	5987	5992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625203
141	NC_014215	GCCGTA	2	12	5994	6005	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297625203
142	NC_014215	CGA	2	6	6053	6058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625203
143	NC_014215	GCACA	2	10	6063	6072	40 %	0 %	20 %	40 %	297625203
144	NC_014215	GTT	3	9	6090	6098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297625203
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147	NC_014215	GCA	2	6	6274	6279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625203
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150	NC_014215	CGA	2	6	6359	6364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625203
151	NC_014215	G	6	6	6483	6488	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014215	CAC	2	6	6514	6519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_014215	CGGC	2	8	6556	6563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_014215	ACGG	2	8	6573	6580	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
155	NC_014215	CCG	2	6	6689	6694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_014215	GTC	2	6	6726	6731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_014215	AGA	2	6	6831	6836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014215	CTG	2	6	6847	6852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_014215	CGT	2	6	6926	6931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625204
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247	NC_014215	CCCG	2	8	10372	10379	0 %	0 %	25 %	75 %	297625205
248	NC_014215	CCA	2	6	10385	10390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625205
249	NC_014215	TGC	2	6	10442	10447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
250	NC_014215	ATT	2	6	10481	10486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_014215	GCCC	2	8	10498	10505	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
252	NC_014215	CG	3	6	10558	10563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
253	NC_014215	CGG	2	6	10565	10570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_014215	CCCG	2	8	10583	10590	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
255	NC_014215	GTG	2	6	10591	10596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
256	NC_014215	ATGGC	2	10	10638	10647	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
257	NC_014215	TCG	2	6	10707	10712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_014215	CGT	2	6	10733	10738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_014215	ACG	2	6	10764	10769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_014215	CGG	2	6	10840	10845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_014215	GGT	2	6	10873	10878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
262	NC_014215	TGG	2	6	10896	10901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
263	NC_014215	CGG	2	6	10937	10942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_014215	CCG	2	6	11013	11018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
265	NC_014215	GC	4	8	11047	11054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
266	NC_014215	CGGT	2	8	11253	11260	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
267	NC_014215	AG	3	6	11297	11302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
268	NC_014215	TGG	2	6	11327	11332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
269	NC_014215	GCG	2	6	11368	11373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_014215	GCACA	2	10	11461	11470	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
271	NC_014215	ACG	2	6	11532	11537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_014215	GGTC	2	8	11557	11564	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
273	NC_014215	C	6	6	11583	11588	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
274	NC_014215	GCCGT	2	10	11602	11611	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
275	NC_014215	CGC	2	6	11628	11633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
276	NC_014215	CGC	2	6	11654	11659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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280	NC_014215	CGGG	2	8	11842	11849	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
281	NC_014215	AAC	2	6	11885	11890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_014215	TTC	2	6	12013	12018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_014215	CG	3	6	12033	12038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
284	NC_014215	CGC	2	6	12045	12050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
285	NC_014215	CGC	2	6	12075	12080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
286	NC_014215	CGC	2	6	12119	12124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
287	NC_014215	GCCG	2	8	12129	12136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
288	NC_014215	ATG	2	6	12231	12236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_014215	GGC	2	6	12251	12256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_014215	GAG	2	6	12487	12492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297625206
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378	NC_014215	CAC	2	6	15720	15725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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380	NC_014215	GCCG	2	8	15890	15897	0 %	0 %	50 %	50 %	297625209
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386	NC_014215	ACA	2	6	16090	16095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297625209
387	NC_014215	CAG	2	6	16117	16122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625209
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394	NC_014215	CAA	2	6	16442	16447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297625209
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402	NC_014215	ATT	2	6	16660	16665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297625209
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492	NC_014215	GCA	2	6	20453	20458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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497	NC_014215	CCCTCA	2	12	20707	20718	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	297625214
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500	NC_014215	TCG	2	6	20863	20868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625214

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