MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Propionibacterium freudenreichii subsp. shermanii CIRM-BIA1 chromosome

Total Repeats: 64968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014215	TGG	2	6	139372	139377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625316
3502	NC_014215	CCA	2	6	139378	139383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625316
3503	NC_014215	GAC	2	6	139467	139472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625316
3504	NC_014215	TGG	2	6	139474	139479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625316
3505	NC_014215	AGC	2	6	139546	139551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625316
3506	NC_014215	TGG	2	6	139579	139584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625316
3507	NC_014215	GGC	2	6	139593	139598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625316
3508	NC_014215	ATG	2	6	139614	139619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297625316
3509	NC_014215	TGG	2	6	139636	139641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625316
3510	NC_014215	GCG	3	9	139642	139650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625316
3511	NC_014215	CGC	2	6	139719	139724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625316
3512	NC_014215	CGA	2	6	139757	139762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625316
3513	NC_014215	GAG	2	6	139815	139820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297625316
3514	NC_014215	GAC	2	6	139821	139826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625316
3515	NC_014215	GC	3	6	139831	139836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3516	NC_014215	CGA	2	6	139966	139971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625317
3517	NC_014215	GAT	2	6	139994	139999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297625317
3518	NC_014215	GCC	2	6	140015	140020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625317
3519	NC_014215	CGATGC	2	12	140026	140037	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297625317
3520	NC_014215	AAC	2	6	140091	140096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297625317
3521	NC_014215	AGT	2	6	140098	140103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297625317
3522	NC_014215	CGG	2	6	140109	140114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625317
3523	NC_014215	CG	3	6	140118	140123	0 %	0 %	50 %	50 %	297625317
3524	NC_014215	GTGC	2	8	140124	140131	0 %	25 %	50 %	25 %	297625317
3525	NC_014215	AGC	2	6	140136	140141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625317
3526	NC_014215	GGC	2	6	140171	140176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625317
3527	NC_014215	TGC	2	6	140244	140249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625317
3528	NC_014215	CGA	2	6	140279	140284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625317
3529	NC_014215	CAT	2	6	140294	140299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297625317
3530	NC_014215	CGGC	2	8	140305	140312	0 %	0 %	50 %	50 %	297625317
3531	NC_014215	CGC	2	6	140330	140335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625317
3532	NC_014215	GCGG	2	8	140342	140349	0 %	0 %	75 %	25 %	297625317
3533	NC_014215	TCG	2	6	140394	140399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625317
3534	NC_014215	GC	3	6	140422	140427	0 %	0 %	50 %	50 %	297625317
3535	NC_014215	CCA	2	6	140434	140439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625317
3536	NC_014215	TGC	3	9	140442	140450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625317
3537	NC_014215	CGA	2	6	140485	140490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625317
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3539	NC_014215	CCAG	2	8	140524	140531	25 %	0 %	25 %	50 %	297625317
3540	NC_014215	GTC	2	6	140570	140575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625317
3541	NC_014215	GGC	2	6	140600	140605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625317
3542	NC_014215	CAG	2	6	140606	140611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625317
3543	NC_014215	GCC	2	6	140624	140629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625317
3544	NC_014215	GCC	3	9	140646	140654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625317
3545	NC_014215	GTC	2	6	140675	140680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625317
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3548	NC_014215	CCG	2	6	140773	140778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625317
3549	NC_014215	GCG	2	6	140833	140838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_014215	CGC	2	6	140843	140848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3551	NC_014215	CCGGTT	2	12	140874	140885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_014215	TCT	2	6	140917	140922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_014215	G	6	6	140926	140931	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_014215	CCA	2	6	140939	140944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3555	NC_014215	GCGTCG	2	12	141000	141011	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	297625318
3556	NC_014215	CCG	2	6	141025	141030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625318
3557	NC_014215	GGC	2	6	141063	141068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625318
3558	NC_014215	TGCT	2	8	141136	141143	0 %	50 %	25 %	25 %	297625318
3559	NC_014215	CCG	2	6	141146	141151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625318
3560	NC_014215	TGG	2	6	141161	141166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625318
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3562	NC_014215	CGGCA	2	10	141197	141206	20 %	0 %	40 %	40 %	297625318
3563	NC_014215	CCG	2	6	141215	141220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625318
3564	NC_014215	GGCC	2	8	141260	141267	0 %	0 %	50 %	50 %	297625318
3565	NC_014215	GGT	2	6	141309	141314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625318
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3569	NC_014215	CCT	2	6	141386	141391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297625318
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3572	NC_014215	TCG	2	6	141484	141489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625318
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3576	NC_014215	CGGAC	2	10	141735	141744	20 %	0 %	40 %	40 %	297625318
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3588	NC_014215	TCT	2	6	142238	142243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297625318
3589	NC_014215	CGT	2	6	142262	142267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625318
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3591	NC_014215	GC	3	6	142289	142294	0 %	0 %	50 %	50 %	297625318
3592	NC_014215	CGT	2	6	142454	142459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625318
3593	NC_014215	CGA	3	9	142476	142484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625318
3594	NC_014215	ACC	2	6	142539	142544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3595	NC_014215	CGAC	2	8	142548	142555	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3596	NC_014215	GC	3	6	142569	142574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3597	NC_014215	CATC	2	8	142598	142605	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3598	NC_014215	GC	3	6	142606	142611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3599	NC_014215	CGG	3	9	142619	142627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625319
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3601	NC_014215	CCG	2	6	142664	142669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625319
3602	NC_014215	TCG	2	6	142708	142713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625319
3603	NC_014215	TCG	2	6	142726	142731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625319
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3605	NC_014215	TCG	2	6	142756	142761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625319
3606	NC_014215	GTC	2	6	142779	142784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625319
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3608	NC_014215	CGGT	2	8	142930	142937	0 %	25 %	50 %	25 %	297625319
3609	NC_014215	TGA	2	6	142991	142996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297625319
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3612	NC_014215	GCCG	2	8	143130	143137	0 %	0 %	50 %	50 %	297625319
3613	NC_014215	CGC	2	6	143139	143144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625319
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3616	NC_014215	GC	3	6	143220	143225	0 %	0 %	50 %	50 %	297625319
3617	NC_014215	CTC	2	6	143229	143234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297625319
3618	NC_014215	TCG	2	6	143311	143316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625319
3619	NC_014215	GCG	2	6	143361	143366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625319
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3621	NC_014215	GGC	2	6	143418	143423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625319
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3744	NC_014215	GC	3	6	147771	147776	0 %	0 %	50 %	50 %	297625323
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3755	NC_014215	ACC	2	6	148415	148420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3756	NC_014215	CAAG	2	8	148522	148529	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3757	NC_014215	AACCA	2	10	148533	148542	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
3758	NC_014215	ACC	2	6	148581	148586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625324
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3985	NC_014215	CGATAG	2	12	158144	158155	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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3992	NC_014215	G	6	6	158586	158591	0 %	0 %	100 %	0 %	297625331
3993	NC_014215	ATC	2	6	158613	158618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297625331
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3996	NC_014215	ATA	3	9	158690	158698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3997	NC_014215	ACGC	2	8	158743	158750	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3998	NC_014215	TGA	2	6	158751	158756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3999	NC_014215	TCC	2	6	158798	158803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4000	NC_014215	ATT	2	6	158814	158819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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