MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Propionibacterium freudenreichii subsp. shermanii CIRM-BIA1 chromosome

Total Repeats: 64968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014215	GCCT	2	8	118136	118143	0 %	25 %	25 %	50 %	297625294
3002	NC_014215	CGC	2	6	118196	118201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625294
3003	NC_014215	GAC	2	6	118212	118217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625294
3004	NC_014215	TC	3	6	118255	118260	0 %	50 %	0 %	50 %	297625295
3005	NC_014215	ACC	2	6	118365	118370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625295
3006	NC_014215	CGCGA	2	10	118387	118396	20 %	0 %	40 %	40 %	297625295
3007	NC_014215	CGG	2	6	118474	118479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625295
3008	NC_014215	CCA	2	6	118501	118506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625295
3009	NC_014215	CTC	2	6	118538	118543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297625295
3010	NC_014215	ACGG	2	8	118573	118580	25 %	0 %	50 %	25 %	297625295
3011	NC_014215	CCA	2	6	118606	118611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625295
3012	NC_014215	TCG	2	6	118615	118620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625295
3013	NC_014215	AC	4	8	118621	118628	50 %	0 %	0 %	50 %	297625295
3014	NC_014215	CCG	2	6	118658	118663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3015	NC_014215	CATCG	2	10	118725	118734	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3016	NC_014215	CAC	2	6	118800	118805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3017	NC_014215	GCG	2	6	118874	118879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_014215	AGC	2	6	118976	118981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_014215	TTG	2	6	119067	119072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297625296
3020	NC_014215	AGC	2	6	119073	119078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625296
3021	NC_014215	GAT	2	6	119084	119089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297625296
3022	NC_014215	AGC	2	6	119142	119147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625296
3023	NC_014215	ACG	2	6	119170	119175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625296
3024	NC_014215	CGG	2	6	119197	119202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625296
3025	NC_014215	ACGCTC	2	12	119261	119272	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	297625296
3026	NC_014215	TCG	2	6	119406	119411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625296
3027	NC_014215	CAG	2	6	119420	119425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625296
3028	NC_014215	CAG	2	6	119447	119452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625296
3029	NC_014215	CAC	2	6	119546	119551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625296
3030	NC_014215	GCG	2	6	119596	119601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625296
3031	NC_014215	AGC	2	6	119754	119759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625296
3032	NC_014215	ACG	2	6	119769	119774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625296
3033	NC_014215	CAA	2	6	119776	119781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_014215	AAC	2	6	119789	119794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_014215	CAG	2	6	119798	119803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_014215	ACG	2	6	119808	119813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_014215	A	6	6	119830	119835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_014215	TGAT	2	8	119880	119887	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_014215	CAT	2	6	120018	120023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297625297
3040	NC_014215	CGCGTT	2	12	120153	120164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625297
3041	NC_014215	GCG	2	6	120173	120178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625297
3042	NC_014215	TCG	2	6	120188	120193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625297
3043	NC_014215	CAGCA	2	10	120229	120238	40 %	0 %	20 %	40 %	297625297
3044	NC_014215	TCG	2	6	120248	120253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625297
3045	NC_014215	CCA	2	6	120258	120263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625297
3046	NC_014215	CGA	2	6	120282	120287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625297
3047	NC_014215	CCA	2	6	120336	120341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625297
3048	NC_014215	ACCGCC	2	12	120428	120439	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	297625297
3049	NC_014215	CAT	2	6	120514	120519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297625297
3050	NC_014215	GGT	2	6	120523	120528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625297
3051	NC_014215	TTC	2	6	120536	120541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297625297
3052	NC_014215	GAC	2	6	120566	120571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625297
3053	NC_014215	CGA	2	6	120691	120696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625297
3054	NC_014215	CTG	2	6	120697	120702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625297
3055	NC_014215	ACCA	2	8	120742	120749	50 %	0 %	0 %	50 %	297625297
3056	NC_014215	CAC	2	6	120778	120783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625297
3057	NC_014215	CT	3	6	120824	120829	0 %	50 %	0 %	50 %	297625298
3058	NC_014215	TTG	2	6	120876	120881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297625298
3059	NC_014215	GCG	2	6	120928	120933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625298
3060	NC_014215	GCCA	2	8	120999	121006	25 %	0 %	25 %	50 %	297625298
3061	NC_014215	CAG	2	6	121007	121012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625298
3062	NC_014215	TAA	2	6	121113	121118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297625298
3063	NC_014215	GCA	2	6	121159	121164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625298
3064	NC_014215	GTTG	2	8	121196	121203	0 %	50 %	50 %	0 %	297625298
3065	NC_014215	ATG	2	6	121251	121256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297625298
3066	NC_014215	AACGCC	2	12	121278	121289	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	297625298
3067	NC_014215	CAT	2	6	121307	121312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297625298
3068	NC_014215	GTA	2	6	121355	121360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297625298
3069	NC_014215	GGT	2	6	121609	121614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625298
3070	NC_014215	CAC	2	6	121625	121630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625298
3071	NC_014215	ATG	2	6	121662	121667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297625298
3072	NC_014215	TCT	2	6	121681	121686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297625298
3073	NC_014215	CAC	2	6	121691	121696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625298
3074	NC_014215	CAG	2	6	121700	121705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625298
3075	NC_014215	GGT	2	6	121730	121735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625298
3076	NC_014215	AAC	2	6	121769	121774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297625298
3077	NC_014215	TCT	2	6	121891	121896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297625298
3078	NC_014215	CTG	2	6	122006	122011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625298
3079	NC_014215	GGCCAC	2	12	122087	122098	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	297625298
3080	NC_014215	CAG	2	6	122099	122104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625298
3081	NC_014215	CTT	2	6	122126	122131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297625298
3082	NC_014215	GCCG	2	8	122168	122175	0 %	0 %	50 %	50 %	297625298
3083	NC_014215	CGG	2	6	122185	122190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625298
3084	NC_014215	CAG	2	6	122198	122203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625298
3085	NC_014215	GAA	2	6	122267	122272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297625298
3086	NC_014215	GC	3	6	122305	122310	0 %	0 %	50 %	50 %	297625298
3087	NC_014215	CCA	2	6	122311	122316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625298
3088	NC_014215	GAA	2	6	122327	122332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297625298
3089	NC_014215	CAC	2	6	122345	122350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625298
3090	NC_014215	GAA	2	6	122351	122356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297625298
3091	NC_014215	CTGG	2	8	122372	122379	0 %	25 %	50 %	25 %	297625298
3092	NC_014215	TCG	2	6	122394	122399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625298
3093	NC_014215	CTT	2	6	122425	122430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297625298
3094	NC_014215	ATC	2	6	122526	122531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297625298
3095	NC_014215	CGAGTA	2	12	122582	122593	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	297625298
3096	NC_014215	GAA	2	6	122639	122644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297625298
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3098	NC_014215	TTC	2	6	122663	122668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297625298
3099	NC_014215	CATGC	2	10	122693	122702	20 %	20 %	20 %	40 %	297625298
3100	NC_014215	GGT	2	6	122705	122710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625298
3101	NC_014215	GTA	2	6	122732	122737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297625298
3102	NC_014215	CTG	2	6	122765	122770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625298
3103	NC_014215	TCG	2	6	122799	122804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625298
3104	NC_014215	CGG	2	6	122860	122865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625298
3105	NC_014215	GGT	2	6	122888	122893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625298
3106	NC_014215	CGG	2	6	122908	122913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625298
3107	NC_014215	GAT	2	6	123017	123022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297625298
3108	NC_014215	ATG	2	6	123099	123104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297625299
3109	NC_014215	CTTG	2	8	123221	123228	0 %	50 %	25 %	25 %	297625299
3110	NC_014215	GC	3	6	123352	123357	0 %	0 %	50 %	50 %	297625299
3111	NC_014215	GCC	2	6	123472	123477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625299
3112	NC_014215	CGC	2	6	123522	123527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625299
3113	NC_014215	ACC	2	6	123720	123725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625299
3114	NC_014215	CCATG	2	10	123729	123738	20 %	20 %	20 %	40 %	297625299
3115	NC_014215	GC	3	6	123952	123957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3116	NC_014215	ACC	2	6	123978	123983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625301
3117	NC_014215	CGT	2	6	123988	123993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625301
3118	NC_014215	GTG	2	6	124014	124019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625301
3119	NC_014215	GTCTG	2	10	124048	124057	0 %	40 %	40 %	20 %	297625301
3120	NC_014215	GGTGAG	2	12	124064	124075	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	297625301
3121	NC_014215	GCA	2	6	124095	124100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625301
3122	NC_014215	GGT	2	6	124136	124141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625301
3123	NC_014215	GCC	2	6	124163	124168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3124	NC_014215	TGG	2	6	124221	124226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_014215	GGC	2	6	124312	124317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625302
3126	NC_014215	GCTGGG	2	12	124366	124377	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	297625302
3127	NC_014215	GGTG	2	8	124395	124402	0 %	25 %	75 %	0 %	297625302
3128	NC_014215	GAG	2	6	124454	124459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297625302
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3131	NC_014215	AGTG	2	8	124548	124555	25 %	25 %	50 %	0 %	297625302
3132	NC_014215	TAC	2	6	124639	124644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297625303
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3142	NC_014215	GGGT	2	8	124999	125006	0 %	25 %	75 %	0 %	297625303
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3151	NC_014215	GGA	2	6	125343	125348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297625303
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3155	NC_014215	CTTG	2	8	125515	125522	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3156	NC_014215	GGT	2	6	125624	125629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3157	NC_014215	GTT	2	6	125639	125644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3159	NC_014215	CTG	2	6	125838	125843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3163	NC_014215	GGT	2	6	125951	125956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3164	NC_014215	GAG	3	9	125967	125975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3223	NC_014215	CGGC	2	8	128832	128839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3224	NC_014215	CCG	2	6	128842	128847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3229	NC_014215	CCA	2	6	128990	128995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3230	NC_014215	CGG	2	6	128996	129001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3231	NC_014215	CACCCA	2	12	129007	129018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3232	NC_014215	AACCC	2	10	129026	129035	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
3233	NC_014215	GGC	2	6	129059	129064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625309
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3238	NC_014215	GCA	2	6	129139	129144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625309
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3241	NC_014215	GCA	2	6	129365	129370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625309
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3243	NC_014215	GGGC	2	8	129398	129405	0 %	0 %	75 %	25 %	297625309
3244	NC_014215	GCGT	2	8	129471	129478	0 %	25 %	50 %	25 %	297625309
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3349	NC_014215	GACGG	2	10	133495	133504	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3350	NC_014215	GACGG	2	10	133531	133540	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3351	NC_014215	GCC	2	6	133612	133617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3356	NC_014215	TGA	2	6	133732	133737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3361	NC_014215	CGG	2	6	133935	133940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3362	NC_014215	CAC	2	6	133957	133962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625313
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3367	NC_014215	CGG	2	6	134160	134165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625313
3368	NC_014215	CTG	2	6	134173	134178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625313
3369	NC_014215	GGT	2	6	134203	134208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625313
3370	NC_014215	GCC	2	6	134230	134235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625313
3371	NC_014215	GGC	2	6	134264	134269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625313
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3380	NC_014215	CGG	2	6	134530	134535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625313
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3382	NC_014215	CTG	2	6	134605	134610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625313
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3397	NC_014215	GGGC	2	8	135165	135172	0 %	0 %	75 %	25 %	297625313
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3488	NC_014215	CG	4	8	138936	138943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3491	NC_014215	AGG	2	6	139015	139020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3492	NC_014215	CCA	2	6	139099	139104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625316
3493	NC_014215	CTG	2	6	139128	139133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625316
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3495	NC_014215	CGC	2	6	139190	139195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625316
3496	NC_014215	GC	3	6	139276	139281	0 %	0 %	50 %	50 %	297625316
3497	NC_014215	TGG	2	6	139301	139306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625316
3498	NC_014215	GCC	2	6	139323	139328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625316
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3500	NC_014215	GTG	2	6	139356	139361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625316

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