MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pedobacter heparinus DSM 2366 chromosome

Total Repeats: 98962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013061	CCA	2	6	136536	136541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	255530030
2502	NC_013061	T	6	6	136606	136611	0 %	100 %	0 %	0 %	255530030
2503	NC_013061	AGC	2	6	136666	136671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530030
2504	NC_013061	GAT	2	6	136738	136743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530030
2505	NC_013061	CTG	2	6	136848	136853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530030
2506	NC_013061	ACT	2	6	136874	136879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530030
2507	NC_013061	ATGCC	2	10	136893	136902	20 %	20 %	20 %	40 %	255530030
2508	NC_013061	ACC	2	6	136947	136952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	255530030
2509	NC_013061	GTA	2	6	137003	137008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530030
2510	NC_013061	ATCAGC	2	12	137085	137096	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	255530030
2511	NC_013061	CAG	2	6	137118	137123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530030
2512	NC_013061	TGA	2	6	137254	137259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530030
2513	NC_013061	GCA	2	6	137280	137285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530030
2514	NC_013061	CTG	4	12	137294	137305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530030
2515	NC_013061	TTAA	2	8	137364	137371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_013061	CTA	2	6	137413	137418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530031
2517	NC_013061	GTA	2	6	137473	137478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530031
2518	NC_013061	TGG	3	9	137541	137549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	255530031
2519	NC_013061	GTT	2	6	137767	137772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530031
2520	NC_013061	GTA	2	6	137854	137859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530031
2521	NC_013061	TGGA	2	8	137876	137883	25 %	25 %	50 %	0 %	255530031
2522	NC_013061	CGG	2	6	137891	137896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	255530031
2523	NC_013061	AAG	2	6	137945	137950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255530031
2524	NC_013061	TG	3	6	137996	138001	0 %	50 %	50 %	0 %	255530031
2525	NC_013061	AAC	2	6	138007	138012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255530031
2526	NC_013061	TAAA	2	8	138106	138113	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_013061	TAA	2	6	138135	138140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_013061	ATGA	2	8	138143	138150	50 %	25 %	25 %	0 %	255530032
2529	NC_013061	CAT	2	6	138268	138273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530032
2530	NC_013061	ATT	2	6	138279	138284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	255530032
2531	NC_013061	TGG	2	6	138450	138455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	255530032
2532	NC_013061	AGA	2	6	138469	138474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255530032
2533	NC_013061	A	6	6	138494	138499	100 %	0 %	0 %	0 %	255530032
2534	NC_013061	GAAG	2	8	138502	138509	50 %	0 %	50 %	0 %	255530032
2535	NC_013061	A	6	6	138569	138574	100 %	0 %	0 %	0 %	255530032
2536	NC_013061	TGA	3	9	138595	138603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530032
2537	NC_013061	AGA	2	6	138630	138635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255530032
2538	NC_013061	ATC	2	6	138650	138655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530032
2539	NC_013061	AAAAGA	2	12	138679	138690	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	255530032
2540	NC_013061	CTTT	2	8	138758	138765	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2541	NC_013061	T	6	6	138780	138785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_013061	AAT	2	6	138786	138791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_013061	AT	3	6	138805	138810	50 %	50 %	0 %	0 %	255530033
2544	NC_013061	A	6	6	138832	138837	100 %	0 %	0 %	0 %	255530033
2545	NC_013061	GGC	2	6	138871	138876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	255530033
2546	NC_013061	TTTTC	2	10	138890	138899	0 %	80 %	0 %	20 %	255530033
2547	NC_013061	ATT	2	6	138923	138928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	255530033
2548	NC_013061	TAC	2	6	138958	138963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530033
2549	NC_013061	ATT	2	6	139050	139055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	255530033
2550	NC_013061	ATGTAA	2	12	139056	139067	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	255530033
2551	NC_013061	CATT	2	8	139112	139119	25 %	50 %	0 %	25 %	255530033
2552	NC_013061	TAC	2	6	139173	139178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530033
2553	NC_013061	ATC	2	6	139241	139246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530033
2554	NC_013061	T	6	6	139330	139335	0 %	100 %	0 %	0 %	255530033
2555	NC_013061	A	6	6	139520	139525	100 %	0 %	0 %	0 %	255530033
2556	NC_013061	CTG	2	6	139574	139579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530033
2557	NC_013061	ATG	2	6	139601	139606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530033
2558	NC_013061	CTT	2	6	139666	139671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	255530033
2559	NC_013061	CAT	2	6	139702	139707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530033
2560	NC_013061	CAA	2	6	139870	139875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255530033
2561	NC_013061	TTG	2	6	139914	139919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530033
2562	NC_013061	AAC	2	6	139939	139944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255530033
2563	NC_013061	ACT	2	6	139954	139959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530033
2564	NC_013061	A	6	6	140014	140019	100 %	0 %	0 %	0 %	255530033
2565	NC_013061	A	6	6	140043	140048	100 %	0 %	0 %	0 %	255530033
2566	NC_013061	CGA	2	6	140128	140133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530033
2567	NC_013061	CTGC	2	8	140160	140167	0 %	25 %	25 %	50 %	255530033
2568	NC_013061	CTG	2	6	140174	140179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530033
2569	NC_013061	AGC	2	6	140247	140252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530033
2570	NC_013061	TTG	2	6	140273	140278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530033
2571	NC_013061	TGA	2	6	140302	140307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530033
2572	NC_013061	TCA	2	6	140315	140320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530033
2573	NC_013061	GAA	2	6	140336	140341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255530033
2574	NC_013061	TAT	2	6	140510	140515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	255530033
2575	NC_013061	CAG	2	6	140528	140533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530033
2576	NC_013061	T	6	6	140627	140632	0 %	100 %	0 %	0 %	255530034
2577	NC_013061	TAAG	3	12	140638	140649	50 %	25 %	25 %	0 %	255530034
2578	NC_013061	TGC	2	6	140670	140675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530034
2579	NC_013061	AGA	2	6	140749	140754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255530034
2580	NC_013061	ATG	2	6	140819	140824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530034
2581	NC_013061	TAAGG	2	10	140881	140890	40 %	20 %	40 %	0 %	255530034
2582	NC_013061	ATG	2	6	140918	140923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530034
2583	NC_013061	GCA	2	6	141026	141031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530034
2584	NC_013061	GCA	2	6	141090	141095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530034
2585	NC_013061	A	8	8	141112	141119	100 %	0 %	0 %	0 %	255530034
2586	NC_013061	A	6	6	141123	141128	100 %	0 %	0 %	0 %	255530034
2587	NC_013061	CAT	2	6	141151	141156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530034
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2589	NC_013061	AAAG	2	8	141310	141317	75 %	0 %	25 %	0 %	255530034
2590	NC_013061	AGC	2	6	141436	141441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530034
2591	NC_013061	ATC	2	6	141479	141484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530034
2592	NC_013061	CAC	2	6	141499	141504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	255530034
2593	NC_013061	CAT	2	6	141550	141555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530034
2594	NC_013061	GAT	2	6	141730	141735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530034
2595	NC_013061	AGA	2	6	141765	141770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255530034
2596	NC_013061	ATA	2	6	141784	141789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	255530034
2597	NC_013061	A	7	7	141882	141888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_013061	GA	3	6	141915	141920	50 %	0 %	50 %	0 %	255530035
2599	NC_013061	ATC	2	6	141935	141940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530035
2600	NC_013061	GCA	2	6	141954	141959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530035
2601	NC_013061	TCA	2	6	141988	141993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530035
2602	NC_013061	CAG	2	6	142061	142066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530035
2603	NC_013061	TGC	2	6	142236	142241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530035
2604	NC_013061	CAG	2	6	142258	142263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530035
2605	NC_013061	GTC	2	6	142346	142351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530035
2606	NC_013061	TAA	2	6	142492	142497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	255530035
2607	NC_013061	CTT	2	6	142517	142522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	255530035
2608	NC_013061	T	6	6	142650	142655	0 %	100 %	0 %	0 %	255530036
2609	NC_013061	TTG	2	6	142666	142671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530036
2610	NC_013061	GATATT	2	12	142683	142694	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	255530036
2611	NC_013061	T	6	6	142693	142698	0 %	100 %	0 %	0 %	255530036
2612	NC_013061	TTAAA	2	10	142706	142715	60 %	40 %	0 %	0 %	255530036
2613	NC_013061	TTTGC	2	10	142806	142815	0 %	60 %	20 %	20 %	255530036
2614	NC_013061	CAT	2	6	142940	142945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530036
2615	NC_013061	GCATTG	2	12	142996	143007	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	255530036
2616	NC_013061	TCC	2	6	143094	143099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	255530036
2617	NC_013061	ATT	2	6	143205	143210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	255530036
2618	NC_013061	GTC	2	6	143259	143264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530036
2619	NC_013061	TTG	2	6	143313	143318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530036
2620	NC_013061	A	6	6	143353	143358	100 %	0 %	0 %	0 %	255530036
2621	NC_013061	TATT	2	8	143362	143369	25 %	75 %	0 %	0 %	255530036
2622	NC_013061	AGCTG	2	10	143450	143459	20 %	20 %	40 %	20 %	255530036
2623	NC_013061	AAT	2	6	143471	143476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	255530036
2624	NC_013061	ATC	2	6	143499	143504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530036
2625	NC_013061	CAT	2	6	143519	143524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530036
2626	NC_013061	GCA	2	6	143542	143547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530036
2627	NC_013061	GAT	2	6	143568	143573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530036
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2630	NC_013061	CGA	2	6	143695	143700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530036
2631	NC_013061	GGTT	2	8	143705	143712	0 %	50 %	50 %	0 %	255530036
2632	NC_013061	ACC	2	6	143727	143732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	255530036
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2637	NC_013061	T	6	6	144108	144113	0 %	100 %	0 %	0 %	255530036
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2655	NC_013061	GTT	2	6	144822	144827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530036
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2660	NC_013061	T	6	6	145123	145128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2661	NC_013061	TGA	2	6	145150	145155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2662	NC_013061	CAG	2	6	145196	145201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530037
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2664	NC_013061	GCAGG	2	10	145380	145389	20 %	0 %	60 %	20 %	255530037
2665	NC_013061	GTA	2	6	145456	145461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530037
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2686	NC_013061	ATC	2	6	146370	146375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2691	NC_013061	TTTA	2	8	146771	146778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2692	NC_013061	T	7	7	146785	146791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2693	NC_013061	AC	3	6	146810	146815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2694	NC_013061	AGA	2	6	146840	146845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2695	NC_013061	T	7	7	146905	146911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2696	NC_013061	ATA	2	6	146916	146921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2697	NC_013061	ATCGG	2	10	146979	146988	20 %	20 %	40 %	20 %	255530040
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2736	NC_013061	CAA	2	6	149621	149626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255530040
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2739	NC_013061	C	6	6	149811	149816	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2740	NC_013061	A	6	6	149823	149828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2741	NC_013061	ATC	2	6	149857	149862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2743	NC_013061	TTTG	2	8	149939	149946	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2744	NC_013061	ACA	2	6	149984	149989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2746	NC_013061	TAAA	2	8	150015	150022	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2996	NC_013061	GT	3	6	162326	162331	0 %	50 %	50 %	0 %	255530052
2997	NC_013061	CAA	2	6	162455	162460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255530052
2998	NC_013061	CTAC	2	8	162537	162544	25 %	25 %	0 %	50 %	255530052
2999	NC_013061	TTG	2	6	162600	162605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530052
3000	NC_013061	ATG	2	6	162690	162695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530052

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