MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Photorhabdus asymbiotica

Total Repeats: 106444

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012962	CCG	2	6	59	64	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_012962	GCA	2	6	81	86	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012962	GTTT	2	8	198	205	0 %	75 %	25 %	0 %	253987484
4	NC_012962	AT	3	6	225	230	50 %	50 %	0 %	0 %	253987484
5	NC_012962	CAA	2	6	231	236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253987484
6	NC_012962	TTG	2	6	247	252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253987484
7	NC_012962	TTA	2	6	280	285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253987484
8	NC_012962	GTT	2	6	340	345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253987484
9	NC_012962	CAC	2	6	368	373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253987484
10	NC_012962	ATA	2	6	401	406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253987484
11	NC_012962	TTG	2	6	470	475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253987484
12	NC_012962	TGG	2	6	561	566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253987484
13	NC_012962	AGA	2	6	705	710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253987484
14	NC_012962	GAT	2	6	751	756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253987484
15	NC_012962	AAG	2	6	788	793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253987484
16	NC_012962	ATT	2	6	838	843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253987484
17	NC_012962	AGA	2	6	882	887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253987484
18	NC_012962	ACC	2	6	933	938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253987484
19	NC_012962	A	6	6	970	975	100 %	0 %	0 %	0 %	253987484
20	NC_012962	CGA	2	6	978	983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253987484
21	NC_012962	T	7	7	1014	1020	0 %	100 %	0 %	0 %	253987484
22	NC_012962	GCCAAT	2	12	1081	1092	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	253987484
23	NC_012962	ATA	2	6	1178	1183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253987484
24	NC_012962	AATGGC	2	12	1272	1283	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	253987484
25	NC_012962	TGG	2	6	1335	1340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253987484
26	NC_012962	TGC	2	6	1358	1363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253987484
27	NC_012962	AAC	2	6	1382	1387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253987484
28	NC_012962	GAA	2	6	1393	1398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253987484
29	NC_012962	TGGG	2	8	1518	1525	0 %	25 %	75 %	0 %	253987485
30	NC_012962	TAC	2	6	1557	1562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253987485
31	NC_012962	TAT	2	6	1581	1586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253987485
32	NC_012962	GAAATG	2	12	1604	1615	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	253987485
33	NC_012962	GAA	2	6	1646	1651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253987485
34	NC_012962	TGA	2	6	1813	1818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253987485
35	NC_012962	TGT	2	6	1929	1934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253987485
36	NC_012962	GAA	2	6	1949	1954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253987485
37	NC_012962	CGG	2	6	2080	2085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253987485
38	NC_012962	ATTTT	2	10	2142	2151	20 %	80 %	0 %	0 %	253987485
39	NC_012962	TGG	2	6	2163	2168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253987485
40	NC_012962	CGC	2	6	2189	2194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253987485
41	NC_012962	GAA	2	6	2203	2208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253987485
42	NC_012962	TC	3	6	2272	2277	0 %	50 %	0 %	50 %	253987485
43	NC_012962	AAG	3	9	2352	2360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253987485
44	NC_012962	GTTA	2	8	2378	2385	25 %	50 %	25 %	0 %	253987485
45	NC_012962	CTG	2	6	2471	2476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253987485
46	NC_012962	AGA	2	6	2503	2508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253987485
47	NC_012962	TTTA	2	8	2593	2600	25 %	75 %	0 %	0 %	253987486
48	NC_012962	TCAG	2	8	2743	2750	25 %	25 %	25 %	25 %	253987486
49	NC_012962	TGA	2	6	2773	2778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253987486
50	NC_012962	GAC	2	6	2793	2798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253987486
51	NC_012962	AAC	2	6	2802	2807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253987486
52	NC_012962	TGG	2	6	2887	2892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253987486
53	NC_012962	ATTG	2	8	2990	2997	25 %	50 %	25 %	0 %	253987486
54	NC_012962	GTT	2	6	3000	3005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253987486
55	NC_012962	T	7	7	3023	3029	0 %	100 %	0 %	0 %	253987486
56	NC_012962	AAC	2	6	3060	3065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253987486
57	NC_012962	GCA	2	6	3071	3076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253987486
58	NC_012962	CAC	2	6	3129	3134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253987486
59	NC_012962	CAT	2	6	3178	3183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253987486
60	NC_012962	AG	3	6	3262	3267	50 %	0 %	50 %	0 %	253987486
61	NC_012962	AGA	2	6	3379	3384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253987486
62	NC_012962	TTG	2	6	3410	3415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253987486
63	NC_012962	ACA	2	6	3466	3471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253987486
64	NC_012962	TGA	2	6	3487	3492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253987486
65	NC_012962	GCCG	2	8	3512	3519	0 %	0 %	50 %	50 %	253987486
66	NC_012962	CTC	2	6	3707	3712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253987487
67	NC_012962	CGA	2	6	3833	3838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253987487
68	NC_012962	CTCTGT	2	12	3890	3901	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	253987487
69	NC_012962	GAT	2	6	3906	3911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253987487
70	NC_012962	GAA	3	9	3939	3947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253987487
71	NC_012962	CAG	2	6	3955	3960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253987487
72	NC_012962	TTA	2	6	3967	3972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253987487
73	NC_012962	TGC	2	6	3979	3984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253987487
74	NC_012962	G	6	6	3989	3994	0 %	0 %	100 %	0 %	253987487
75	NC_012962	GAT	2	6	4002	4007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253987487
76	NC_012962	CGG	2	6	4025	4030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253987487
77	NC_012962	TGT	2	6	4052	4057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253987487
78	NC_012962	CCG	2	6	4091	4096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253987487
79	NC_012962	ACAG	2	8	4172	4179	50 %	0 %	25 %	25 %	253987487
80	NC_012962	CAA	2	6	4220	4225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253987487
81	NC_012962	TCCT	2	8	4272	4279	0 %	50 %	0 %	50 %	253987487
82	NC_012962	TTG	2	6	4363	4368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253987487
83	NC_012962	TAAA	2	8	4375	4382	75 %	25 %	0 %	0 %	253987487
84	NC_012962	ATCC	2	8	4395	4402	25 %	25 %	0 %	50 %	253987487
85	NC_012962	CAATG	2	10	4453	4462	40 %	20 %	20 %	20 %	253987487
86	NC_012962	ACA	2	6	4594	4599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253987487
87	NC_012962	TGA	2	6	4625	4630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253987487
88	NC_012962	TTCTC	2	10	4683	4692	0 %	60 %	0 %	40 %	253987487
89	NC_012962	TTC	2	6	4712	4717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253987487
90	NC_012962	CTG	2	6	4729	4734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253987487
91	NC_012962	TGA	2	6	4744	4749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253987487
92	NC_012962	TGG	2	6	4759	4764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253987487
93	NC_012962	CTG	2	6	4770	4775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253987487
94	NC_012962	ATG	2	6	4786	4791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253987487
95	NC_012962	GTC	2	6	4800	4805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253987487
96	NC_012962	TGC	2	6	4820	4825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253987487
97	NC_012962	GCC	2	6	4839	4844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253987487
98	NC_012962	TCT	2	6	5076	5081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253987487
99	NC_012962	TAT	3	9	5165	5173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253987487
100	NC_012962	CGGATG	2	12	5179	5190	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	253987487
101	NC_012962	CTT	2	6	5225	5230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253987487
102	NC_012962	A	6	6	5301	5306	100 %	0 %	0 %	0 %	253987487
103	NC_012962	CT	3	6	5358	5363	0 %	50 %	0 %	50 %	253987487
104	NC_012962	CA	3	6	5400	5405	50 %	0 %	0 %	50 %	253987487
105	NC_012962	GAA	2	6	5459	5464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253987487
106	NC_012962	ATC	2	6	5466	5471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253987487
107	NC_012962	ATC	2	6	5521	5526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253987487
108	NC_012962	CTGA	2	8	5532	5539	25 %	25 %	25 %	25 %	253987487
109	NC_012962	CGA	2	6	5552	5557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253987487
110	NC_012962	GCA	2	6	5620	5625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253987487
111	NC_012962	CGG	2	6	5738	5743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253987487
112	NC_012962	ACC	2	6	5749	5754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253987487
113	NC_012962	GTG	2	6	5815	5820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253987487
114	NC_012962	CGT	2	6	5880	5885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253987487
115	NC_012962	GTCT	2	8	5887	5894	0 %	50 %	25 %	25 %	253987487
116	NC_012962	ATG	2	6	5973	5978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253987487
117	NC_012962	ATT	2	6	6014	6019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253987487
118	NC_012962	GAA	2	6	6066	6071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253987487
119	NC_012962	AGC	2	6	6083	6088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253987487
120	NC_012962	ATT	2	6	6110	6115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012962	T	7	7	6157	6163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012962	TTAT	2	8	6169	6176	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012962	ATTT	2	8	6192	6199	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012962	ATA	2	6	6239	6244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012962	A	6	6	6276	6281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012962	TTC	2	6	6305	6310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_012962	TAA	2	6	6326	6331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012962	TTTAG	2	10	6348	6357	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012962	CAT	2	6	6399	6404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012962	AG	3	6	6529	6534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012962	TTATT	2	10	6560	6569	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012962	T	6	6	6577	6582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012962	AAT	2	6	6698	6703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012962	ATT	2	6	6722	6727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012962	A	7	7	6735	6741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012962	T	6	6	6761	6766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012962	T	6	6	6777	6782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012962	A	6	6	6800	6805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012962	TATAAA	7	42	6822	6863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012962	CCA	2	6	6868	6873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_012962	CAT	2	6	6909	6914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_012962	TCA	2	6	6990	6995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_012962	TA	3	6	7016	7021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012962	TAACA	2	10	7052	7061	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_012962	AAGA	2	8	7077	7084	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012962	TA	3	6	7097	7102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012962	CAG	2	6	7194	7199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253987488
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159	NC_012962	GCTG	2	8	8135	8142	0 %	25 %	50 %	25 %	253987488
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163	NC_012962	TTA	2	6	8351	8356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_012962	CATA	2	8	8415	8422	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
165	NC_012962	A	6	6	8422	8427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_012962	TTGAA	2	10	8951	8960	40 %	40 %	20 %	0 %	253987490
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181	NC_012962	AATA	2	8	9278	9285	75 %	25 %	0 %	0 %	253987490
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268	NC_012962	GT	3	6	13994	13999	0 %	50 %	50 %	0 %	253987495
269	NC_012962	TCG	2	6	14056	14061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253987495
270	NC_012962	ATG	2	6	14080	14085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253987495
271	NC_012962	TCC	2	6	14088	14093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253987495
272	NC_012962	AAT	2	6	14130	14135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253987495
273	NC_012962	CTG	2	6	14372	14377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253987495
274	NC_012962	TCA	2	6	14437	14442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253987495
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276	NC_012962	CAACAG	2	12	14654	14665	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	253987495
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281	NC_012962	CAA	2	6	14993	14998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253987495
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283	NC_012962	TTA	2	6	15129	15134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_012962	TG	3	6	15152	15157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
285	NC_012962	GTTA	2	8	15176	15183	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
286	NC_012962	TAT	2	6	15187	15192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_012962	T	6	6	15192	15197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_012962	ATT	2	6	15201	15206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_012962	AATC	2	8	15251	15258	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
290	NC_012962	TGTT	2	8	15290	15297	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
291	NC_012962	T	6	6	15303	15308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_012962	AGT	2	6	15328	15333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
293	NC_012962	TTG	2	6	15386	15391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
294	NC_012962	AT	3	6	15418	15423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_012962	TTGGT	2	10	15492	15501	0 %	60 %	40 %	0 %	253987496
296	NC_012962	TAT	2	6	15508	15513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253987496
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299	NC_012962	TAC	2	6	15586	15591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253987496
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303	NC_012962	AT	3	6	15735	15740	50 %	50 %	0 %	0 %	253987496
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311	NC_012962	ATT	2	6	16089	16094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NC_012962	ATA	2	6	16115	16120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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381	NC_012962	AT	3	6	20041	20046	50 %	50 %	0 %	0 %	253987502
382	NC_012962	T	7	7	20064	20070	0 %	100 %	0 %	0 %	253987502
383	NC_012962	GGC	2	6	20171	20176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253987502
384	NC_012962	AATT	2	8	20216	20223	50 %	50 %	0 %	0 %	253987502
385	NC_012962	CAT	2	6	20357	20362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253987502
386	NC_012962	CCT	2	6	20372	20377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253987503
387	NC_012962	AATTT	2	10	20477	20486	40 %	60 %	0 %	0 %	253987503
388	NC_012962	TTG	2	6	20511	20516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253987503
389	NC_012962	T	6	6	20554	20559	0 %	100 %	0 %	0 %	253987503
390	NC_012962	CAATT	2	10	20662	20671	40 %	40 %	0 %	20 %	253987503
391	NC_012962	GAA	2	6	20852	20857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253987503
392	NC_012962	AATA	2	8	20883	20890	75 %	25 %	0 %	0 %	253987503
393	NC_012962	CCA	2	6	20921	20926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253987503
394	NC_012962	TAA	2	6	20935	20940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253987503
395	NC_012962	CCA	2	6	20965	20970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253987503
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397	NC_012962	AAC	2	6	21073	21078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253987503
398	NC_012962	TAA	2	6	21100	21105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253987503
399	NC_012962	GTAG	2	8	21153	21160	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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401	NC_012962	AGG	2	6	21248	21253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
402	NC_012962	AAC	2	6	21262	21267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
403	NC_012962	AG	3	6	21291	21296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
404	NC_012962	TAA	2	6	21307	21312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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430	NC_012962	T	6	6	22493	22498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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