MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus sp. JDR-2 chromosome

Total Repeats: 142585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012914	GAT	2	6	173429	173434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794193
3502	NC_012914	GGC	2	6	173582	173587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794194
3503	NC_012914	GAA	2	6	173612	173617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794194
3504	NC_012914	GGAA	2	8	173653	173660	50 %	0 %	50 %	0 %	251794194
3505	NC_012914	TGATGG	2	12	173674	173685	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	251794194
3506	NC_012914	TTTC	2	8	173693	173700	0 %	75 %	0 %	25 %	251794194
3507	NC_012914	TAC	2	6	173744	173749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794194
3508	NC_012914	TGA	2	6	173815	173820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794194
3509	NC_012914	GTT	2	6	173889	173894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794194
3510	NC_012914	GGC	2	6	173925	173930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794194
3511	NC_012914	CGGA	2	8	173952	173959	25 %	0 %	50 %	25 %	251794194
3512	NC_012914	TTG	2	6	173994	173999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794194
3513	NC_012914	ATA	2	6	174002	174007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794194
3514	NC_012914	GA	3	6	174057	174062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_012914	ATTTT	2	10	174162	174171	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_012914	ATT	2	6	174356	174361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794195
3517	NC_012914	TAC	2	6	174377	174382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794195
3518	NC_012914	AAT	2	6	174437	174442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794195
3519	NC_012914	ACA	2	6	174449	174454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794195
3520	NC_012914	TGC	2	6	174459	174464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794195
3521	NC_012914	GCT	2	6	174505	174510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794195
3522	NC_012914	TTC	2	6	174596	174601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794195
3523	NC_012914	TTG	2	6	174618	174623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794195
3524	NC_012914	GGC	2	6	174682	174687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794195
3525	NC_012914	GAG	2	6	174746	174751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794195
3526	NC_012914	AGC	2	6	174780	174785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794195
3527	NC_012914	CTG	2	6	174797	174802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794195
3528	NC_012914	GGAA	2	8	174874	174881	50 %	0 %	50 %	0 %	251794195
3529	NC_012914	TTC	2	6	174882	174887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794195
3530	NC_012914	GCG	2	6	174894	174899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794195
3531	NC_012914	GATC	2	8	175021	175028	25 %	25 %	25 %	25 %	251794195
3532	NC_012914	GAT	2	6	175033	175038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794195
3533	NC_012914	CTA	2	6	175051	175056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794195
3534	NC_012914	GCG	2	6	175082	175087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794195
3535	NC_012914	GCG	2	6	175110	175115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794195
3536	NC_012914	CG	3	6	175233	175238	0 %	0 %	50 %	50 %	251794195
3537	NC_012914	AGA	2	6	175336	175341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794195
3538	NC_012914	CGG	2	6	175414	175419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794195
3539	NC_012914	AGG	2	6	175435	175440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794195
3540	NC_012914	AGCGA	2	10	175453	175462	40 %	0 %	40 %	20 %	251794195
3541	NC_012914	A	6	6	175462	175467	100 %	0 %	0 %	0 %	251794196
3542	NC_012914	CGA	2	6	175560	175565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794196
3543	NC_012914	TAT	2	6	175611	175616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794196
3544	NC_012914	GGA	2	6	175695	175700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794196
3545	NC_012914	GCT	2	6	175719	175724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794196
3546	NC_012914	CGA	2	6	175802	175807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794196
3547	NC_012914	CAA	2	6	175849	175854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794196
3548	NC_012914	TCG	2	6	175919	175924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794196
3549	NC_012914	TGG	2	6	175928	175933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794196
3550	NC_012914	GAA	2	6	176031	176036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794196
3551	NC_012914	GACA	2	8	176098	176105	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3552	NC_012914	TCG	2	6	176225	176230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794197
3553	NC_012914	AGG	2	6	176240	176245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794197
3554	NC_012914	GCT	2	6	176259	176264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794197
3555	NC_012914	AGC	2	6	176276	176281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794197
3556	NC_012914	CGT	2	6	176303	176308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794197
3557	NC_012914	GCG	2	6	176338	176343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794197
3558	NC_012914	CGC	2	6	176358	176363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794197
3559	NC_012914	TGGA	2	8	176434	176441	25 %	25 %	50 %	0 %	251794197
3560	NC_012914	CGG	2	6	176511	176516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794197
3561	NC_012914	GGC	2	6	176520	176525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794197
3562	NC_012914	CGT	2	6	176531	176536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794197
3563	NC_012914	TGA	2	6	176543	176548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794197
3564	NC_012914	CGC	2	6	176597	176602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794197
3565	NC_012914	CGG	2	6	176610	176615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794197
3566	NC_012914	AAGG	2	8	176617	176624	50 %	0 %	50 %	0 %	251794197
3567	NC_012914	GCC	2	6	176647	176652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794197
3568	NC_012914	CGG	2	6	176685	176690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794197
3569	NC_012914	ACGGC	2	10	176717	176726	20 %	0 %	40 %	40 %	251794197
3570	NC_012914	CGA	2	6	176853	176858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794197
3571	NC_012914	CTG	2	6	176890	176895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794197
3572	NC_012914	GCC	2	6	176968	176973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794197
3573	NC_012914	CG	3	6	177002	177007	0 %	0 %	50 %	50 %	251794197
3574	NC_012914	CG	3	6	177015	177020	0 %	0 %	50 %	50 %	251794197
3575	NC_012914	TGC	2	6	177047	177052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794197
3576	NC_012914	ATCG	2	8	177060	177067	25 %	25 %	25 %	25 %	251794197
3577	NC_012914	CGT	2	6	177081	177086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794197
3578	NC_012914	CCGAT	2	10	177125	177134	20 %	20 %	20 %	40 %	251794197
3579	NC_012914	ATT	2	6	177206	177211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794197
3580	NC_012914	ATC	2	6	177229	177234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794197
3581	NC_012914	CGA	2	6	177236	177241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794197
3582	NC_012914	GAA	2	6	177288	177293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794197
3583	NC_012914	CTA	2	6	177306	177311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794197
3584	NC_012914	GAA	2	6	177330	177335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794197
3585	NC_012914	GCA	3	9	177338	177346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794197
3586	NC_012914	CAAT	2	8	177420	177427	50 %	25 %	0 %	25 %	251794197
3587	NC_012914	ATA	2	6	177448	177453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_012914	AAG	2	6	177456	177461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_012914	GCG	2	6	177553	177558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794198
3590	NC_012914	GTTCC	2	10	177579	177588	0 %	40 %	20 %	40 %	251794198
3591	NC_012914	GC	3	6	177645	177650	0 %	0 %	50 %	50 %	251794198
3592	NC_012914	ATCGAC	2	12	177657	177668	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	251794198
3593	NC_012914	CAC	2	6	177672	177677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	251794198
3594	NC_012914	GATG	2	8	177773	177780	25 %	25 %	50 %	0 %	251794198
3595	NC_012914	CCGC	2	8	177815	177822	0 %	0 %	25 %	75 %	251794198
3596	NC_012914	CG	3	6	177834	177839	0 %	0 %	50 %	50 %	251794198
3597	NC_012914	CAT	2	6	177960	177965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794198
3598	NC_012914	CG	3	6	177996	178001	0 %	0 %	50 %	50 %	251794198
3599	NC_012914	CGA	2	6	178004	178009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794198
3600	NC_012914	CAA	2	6	178012	178017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794198
3601	NC_012914	CGA	2	6	178048	178053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794198
3602	NC_012914	ATC	2	6	178078	178083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794199
3603	NC_012914	GTA	2	6	178147	178152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794199
3604	NC_012914	CGG	2	6	178178	178183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794199
3605	NC_012914	TCC	2	6	178193	178198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794199
3606	NC_012914	GCA	2	6	178273	178278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794199
3607	NC_012914	GCT	2	6	178290	178295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794199
3608	NC_012914	AGCGAA	2	12	178327	178338	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	251794199
3609	NC_012914	CAA	2	6	178541	178546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794199
3610	NC_012914	CAG	2	6	178558	178563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794199
3611	NC_012914	GCATG	2	10	178593	178602	20 %	20 %	40 %	20 %	251794199
3612	NC_012914	AGC	2	6	178621	178626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794199
3613	NC_012914	GCT	2	6	178641	178646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794199
3614	NC_012914	T	8	8	178701	178708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_012914	TAT	2	6	178755	178760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794200
3616	NC_012914	GGAC	2	8	178779	178786	25 %	0 %	50 %	25 %	251794200
3617	NC_012914	AGG	2	6	178862	178867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794200
3618	NC_012914	CGA	2	6	178872	178877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794200
3619	NC_012914	CG	3	6	178915	178920	0 %	0 %	50 %	50 %	251794200
3620	NC_012914	GA	3	6	178952	178957	50 %	0 %	50 %	0 %	251794200
3621	NC_012914	GGC	2	6	178978	178983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794200
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3623	NC_012914	CGG	2	6	179051	179056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794200
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3717	NC_012914	TA	4	8	184084	184091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3718	NC_012914	AT	3	6	184098	184103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3719	NC_012914	ACC	2	6	184132	184137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3720	NC_012914	GTTG	2	8	184139	184146	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3721	NC_012914	GAC	2	6	184147	184152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3722	NC_012914	CTTT	2	8	184247	184254	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3723	NC_012914	GAA	2	6	184316	184321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3724	NC_012914	ACA	2	6	184330	184335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3725	NC_012914	AGG	2	6	184404	184409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3731	NC_012914	ATA	2	6	184783	184788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794205
3732	NC_012914	CTT	2	6	184826	184831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794205
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3734	NC_012914	CGG	3	9	184859	184867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794205
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3740	NC_012914	CGA	2	6	185168	185173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794205
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3989	NC_012914	ATC	2	6	197114	197119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794217
3990	NC_012914	AAGCT	2	10	197187	197196	40 %	20 %	20 %	20 %	251794217
3991	NC_012914	CGG	2	6	197281	197286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794217
3992	NC_012914	ATG	2	6	197315	197320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794217
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