MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus sp. JDR-2 chromosome

Total Repeats: 142585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012914	AATG	2	8	122781	122788	50 %	25 %	25 %	0 %	251794149
2502	NC_012914	GCT	2	6	122798	122803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794149
2503	NC_012914	AAC	2	6	122817	122822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794149
2504	NC_012914	GAGAA	2	10	122879	122888	60 %	0 %	40 %	0 %	251794149
2505	NC_012914	GGC	2	6	122899	122904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794149
2506	NC_012914	GGA	2	6	122906	122911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794149
2507	NC_012914	CCG	2	6	122981	122986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794149
2508	NC_012914	TAC	2	6	123105	123110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794149
2509	NC_012914	CCG	2	6	123160	123165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794150
2510	NC_012914	TTG	2	6	123170	123175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794150
2511	NC_012914	CAA	2	6	123382	123387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794150
2512	NC_012914	GAA	2	6	123392	123397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794150
2513	NC_012914	ACG	2	6	123505	123510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794150
2514	NC_012914	TCC	2	6	123597	123602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794150
2515	NC_012914	TCA	2	6	123624	123629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794150
2516	NC_012914	TAA	2	6	123658	123663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_012914	TTTC	2	8	123675	123682	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2518	NC_012914	TGT	2	6	123806	123811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794151
2519	NC_012914	GAC	2	6	123861	123866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794151
2520	NC_012914	GAT	2	6	123878	123883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794151
2521	NC_012914	TTC	2	6	123891	123896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794151
2522	NC_012914	TGG	2	6	123904	123909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794151
2523	NC_012914	TTA	2	6	123928	123933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794151
2524	NC_012914	TC	3	6	123965	123970	0 %	50 %	0 %	50 %	251794151
2525	NC_012914	GGCTTT	2	12	124056	124067	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	251794151
2526	NC_012914	GAA	2	6	124346	124351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794151
2527	NC_012914	GGC	2	6	124352	124357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794151
2528	NC_012914	AG	3	6	124408	124413	50 %	0 %	50 %	0 %	251794151
2529	NC_012914	CTG	3	9	124428	124436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794151
2530	NC_012914	TCCT	2	8	124538	124545	0 %	50 %	0 %	50 %	251794151
2531	NC_012914	GAT	2	6	124568	124573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794151
2532	NC_012914	TGTT	2	8	124630	124637	0 %	75 %	25 %	0 %	251794151
2533	NC_012914	CGT	2	6	124655	124660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794151
2534	NC_012914	ATG	2	6	124698	124703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794151
2535	NC_012914	TTC	2	6	124728	124733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794151
2536	NC_012914	GATG	2	8	124858	124865	25 %	25 %	50 %	0 %	251794151
2537	NC_012914	TTGC	2	8	124935	124942	0 %	50 %	25 %	25 %	251794151
2538	NC_012914	AGC	2	6	124963	124968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794151
2539	NC_012914	GGC	2	6	124970	124975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794151
2540	NC_012914	GCT	2	6	125089	125094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2541	NC_012914	TCG	2	6	125107	125112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794152
2542	NC_012914	ATA	2	6	125172	125177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794152
2543	NC_012914	GAA	2	6	125286	125291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794152
2544	NC_012914	TCT	2	6	125327	125332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794152
2545	NC_012914	AAG	2	6	125396	125401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794152
2546	NC_012914	AGT	2	6	125545	125550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794152
2547	NC_012914	CGA	2	6	125591	125596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2548	NC_012914	GGT	2	6	125684	125689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_012914	GTTT	2	8	125720	125727	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_012914	TCC	2	6	125765	125770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2551	NC_012914	TAA	2	6	125787	125792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_012914	TAG	2	6	125845	125850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_012914	GC	3	6	125863	125868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2554	NC_012914	ATTT	2	8	125938	125945	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_012914	A	6	6	125971	125976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_012914	GGGC	2	8	126008	126015	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2557	NC_012914	GAT	2	6	126111	126116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794153
2558	NC_012914	TGG	2	6	126122	126127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794153
2559	NC_012914	AAG	2	6	126130	126135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794153
2560	NC_012914	CGATC	2	10	126190	126199	20 %	20 %	20 %	40 %	251794153
2561	NC_012914	AGA	2	6	126233	126238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794153
2562	NC_012914	GCC	2	6	126271	126276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794153
2563	NC_012914	CAG	2	6	126316	126321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794153
2564	NC_012914	CAGC	2	8	126343	126350	25 %	0 %	25 %	50 %	251794153
2565	NC_012914	CGG	2	6	126357	126362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794153
2566	NC_012914	CTG	2	6	126370	126375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794153
2567	NC_012914	AGG	2	6	126404	126409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794153
2568	NC_012914	GCA	2	6	126426	126431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794153
2569	NC_012914	CCA	2	6	126433	126438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	251794153
2570	NC_012914	CGG	2	6	126500	126505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794153
2571	NC_012914	TCC	2	6	126526	126531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794153
2572	NC_012914	TGC	2	6	126545	126550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794153
2573	NC_012914	GA	3	6	126582	126587	50 %	0 %	50 %	0 %	251794153
2574	NC_012914	GCA	2	6	126588	126593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794153
2575	NC_012914	GCG	2	6	126599	126604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794153
2576	NC_012914	GCC	2	6	126610	126615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794153
2577	NC_012914	AGC	2	6	126617	126622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794153
2578	NC_012914	GCT	2	6	126692	126697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794153
2579	NC_012914	GCA	2	6	126726	126731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794153
2580	NC_012914	GAA	2	6	126766	126771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794153
2581	NC_012914	AGC	2	6	126779	126784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794153
2582	NC_012914	GCC	2	6	126831	126836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794153
2583	NC_012914	TCC	2	6	126868	126873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2584	NC_012914	AAT	2	6	126966	126971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794154
2585	NC_012914	TGC	2	6	127086	127091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794154
2586	NC_012914	AACCGG	2	12	127205	127216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794154
2587	NC_012914	GCC	2	6	127226	127231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794154
2588	NC_012914	AG	3	6	127242	127247	50 %	0 %	50 %	0 %	251794154
2589	NC_012914	GGT	3	9	127403	127411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794154
2590	NC_012914	TCT	2	6	127453	127458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794154
2591	NC_012914	CAT	2	6	127460	127465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794154
2592	NC_012914	GCT	2	6	127564	127569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794154
2593	NC_012914	AGCGG	2	10	127572	127581	20 %	0 %	60 %	20 %	251794154
2594	NC_012914	TCT	2	6	127650	127655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794154
2595	NC_012914	AGG	2	6	127660	127665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794154
2596	NC_012914	TCG	2	6	127674	127679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794154
2597	NC_012914	ACG	2	6	127746	127751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794154
2598	NC_012914	GCG	2	6	127788	127793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794154
2599	NC_012914	ATTCC	2	10	127816	127825	20 %	40 %	0 %	40 %	251794154
2600	NC_012914	CAA	2	6	127855	127860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794154
2601	NC_012914	GGC	2	6	127922	127927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794154
2602	NC_012914	ATA	2	6	128021	128026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794154
2603	NC_012914	TGC	2	6	128135	128140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794154
2604	NC_012914	ACGG	2	8	128168	128175	25 %	0 %	50 %	25 %	251794154
2605	NC_012914	CGT	2	6	128240	128245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794154
2606	NC_012914	CG	3	6	128331	128336	0 %	0 %	50 %	50 %	251794154
2607	NC_012914	TTG	2	6	128442	128447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794154
2608	NC_012914	CGT	2	6	128495	128500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794154
2609	NC_012914	CAG	2	6	128510	128515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794154
2610	NC_012914	GCTT	2	8	128531	128538	0 %	50 %	25 %	25 %	251794154
2611	NC_012914	GCC	2	6	128564	128569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794154
2612	NC_012914	TCT	2	6	128644	128649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794154
2613	NC_012914	GTC	2	6	128699	128704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794154
2614	NC_012914	GGCG	2	8	128789	128796	0 %	0 %	75 %	25 %	251794154
2615	NC_012914	GCT	2	6	128826	128831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794154
2616	NC_012914	GGC	2	6	128834	128839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794154
2617	NC_012914	CTG	2	6	128888	128893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794154
2618	NC_012914	CGG	2	6	128914	128919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794154
2619	NC_012914	CAA	2	6	128933	128938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794154
2620	NC_012914	TCCC	2	8	128971	128978	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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2622	NC_012914	ATT	2	6	129038	129043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2746	NC_012914	CAGC	2	8	134192	134199	25 %	0 %	25 %	50 %	251794162
2747	NC_012914	T	6	6	134210	134215	0 %	100 %	0 %	0 %	251794162
2748	NC_012914	GAA	2	6	134233	134238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794162
2749	NC_012914	GCG	2	6	134317	134322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794162
2750	NC_012914	CCG	2	6	134328	134333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794162
2751	NC_012914	TGA	2	6	134442	134447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794162
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2754	NC_012914	GCC	2	6	134480	134485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794162
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2756	NC_012914	TGC	2	6	134528	134533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794163
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2778	NC_012914	TCCT	2	8	135361	135368	0 %	50 %	0 %	50 %	251794163
2779	NC_012914	CGGT	2	8	135406	135413	0 %	25 %	50 %	25 %	251794163
2780	NC_012914	TCG	2	6	135427	135432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794163
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2798	NC_012914	TGCA	2	8	136196	136203	25 %	25 %	25 %	25 %	251794163
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2801	NC_012914	T	6	6	136355	136360	0 %	100 %	0 %	0 %	251794163
2802	NC_012914	AAGT	2	8	136362	136369	50 %	25 %	25 %	0 %	251794163
2803	NC_012914	CGAT	2	8	136402	136409	25 %	25 %	25 %	25 %	251794163
2804	NC_012914	TGA	2	6	136441	136446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794163
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2806	NC_012914	TCCTT	2	10	136495	136504	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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2824	NC_012914	T	6	6	137601	137606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2834	NC_012914	CTT	2	6	138026	138031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2835	NC_012914	CTA	2	6	138036	138041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2842	NC_012914	CGG	2	6	138455	138460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794166
2843	NC_012914	CCAG	2	8	138485	138492	25 %	0 %	25 %	50 %	251794166
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2851	NC_012914	TTC	2	6	138633	138638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794166
2852	NC_012914	AT	3	6	138654	138659	50 %	50 %	0 %	0 %	251794166
2853	NC_012914	CGC	2	6	138713	138718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794166
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2855	NC_012914	T	6	6	138964	138969	0 %	100 %	0 %	0 %	251794166
2856	NC_012914	TCG	2	6	138976	138981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794166
2857	NC_012914	CCG	2	6	139135	139140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794166
2858	NC_012914	TA	3	6	139152	139157	50 %	50 %	0 %	0 %	251794166
2859	NC_012914	GCC	2	6	139186	139191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794166
2860	NC_012914	TGC	2	6	139192	139197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794166
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2864	NC_012914	GCT	2	6	139298	139303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794166
2865	NC_012914	GCCT	2	8	139365	139372	0 %	25 %	25 %	50 %	251794166
2866	NC_012914	TGCA	2	8	139461	139468	25 %	25 %	25 %	25 %	251794166
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2988	NC_012914	T	6	6	146159	146164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2989	NC_012914	AG	3	6	146227	146232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2990	NC_012914	AGC	2	6	146247	146252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794172
2991	NC_012914	TTG	2	6	146322	146327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794172
2992	NC_012914	TTA	2	6	146345	146350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794172
2993	NC_012914	TGA	2	6	146362	146367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794172
2994	NC_012914	CGGA	2	8	146398	146405	25 %	0 %	50 %	25 %	251794172
2995	NC_012914	TA	3	6	146428	146433	50 %	50 %	0 %	0 %	251794172
2996	NC_012914	GAT	3	9	146565	146573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794172
2997	NC_012914	GAA	2	6	146592	146597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794172
2998	NC_012914	GAT	2	6	146598	146603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794172
2999	NC_012914	GAA	3	9	146673	146681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794172
3000	NC_012914	CGAAGA	2	12	146702	146713	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	251794172

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