MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus sp. JDR-2 chromosome

Total Repeats: 142585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_012914	GCT	2	6	881364	881369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794792
18003	NC_012914	GTT	2	6	881382	881387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794792
18004	NC_012914	TTC	2	6	881446	881451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794792
18005	NC_012914	TGTA	2	8	881456	881463	25 %	50 %	25 %	0 %	251794792
18006	NC_012914	GAT	2	6	881544	881549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794792
18007	NC_012914	TTC	2	6	881558	881563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794792
18008	NC_012914	CGG	2	6	881564	881569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794792
18009	NC_012914	TGC	2	6	881582	881587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794792
18010	NC_012914	GGT	2	6	881706	881711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794792
18011	NC_012914	TGC	2	6	881733	881738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794792
18012	NC_012914	GCG	2	6	881778	881783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794792
18013	NC_012914	TGC	2	6	881833	881838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794793
18014	NC_012914	CGG	2	6	881853	881858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794793
18015	NC_012914	GGC	2	6	881865	881870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794793
18016	NC_012914	TGCT	2	8	881941	881948	0 %	50 %	25 %	25 %	251794793
18017	NC_012914	GC	3	6	881992	881997	0 %	0 %	50 %	50 %	251794793
18018	NC_012914	GCG	2	6	882015	882020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794793
18019	NC_012914	CGT	2	6	882191	882196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794793
18020	NC_012914	CAG	2	6	882228	882233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794793
18021	NC_012914	CGC	2	6	882314	882319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794793
18022	NC_012914	TAA	2	6	882362	882367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794793
18023	NC_012914	TAA	2	6	882437	882442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794793
18024	NC_012914	GAA	2	6	882481	882486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794793
18025	NC_012914	A	6	6	882485	882490	100 %	0 %	0 %	0 %	251794793
18026	NC_012914	CTG	2	6	882498	882503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794793
18027	NC_012914	TA	3	6	882597	882602	50 %	50 %	0 %	0 %	251794793
18028	NC_012914	TCA	2	6	882735	882740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794794
18029	NC_012914	CAG	3	9	882746	882754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794794
18030	NC_012914	CGG	3	9	882783	882791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794794
18031	NC_012914	GCG	2	6	882810	882815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794794
18032	NC_012914	T	6	6	882880	882885	0 %	100 %	0 %	0 %	251794794
18033	NC_012914	CGG	2	6	882964	882969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794794
18034	NC_012914	GTG	2	6	883049	883054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794794
18035	NC_012914	GCAGGC	2	12	883057	883068	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	251794794
18036	NC_012914	ATCA	2	8	883103	883110	50 %	25 %	0 %	25 %	251794794
18037	NC_012914	ATA	2	6	883145	883150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794794
18038	NC_012914	CAGA	2	8	883160	883167	50 %	0 %	25 %	25 %	251794794
18039	NC_012914	GCT	3	9	883207	883215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794794
18040	NC_012914	TTG	2	6	883299	883304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794794
18041	NC_012914	AAT	2	6	883330	883335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18042	NC_012914	A	6	6	883339	883344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18043	NC_012914	A	6	6	883357	883362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18044	NC_012914	GAA	2	6	883433	883438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18045	NC_012914	GAC	2	6	883446	883451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18046	NC_012914	T	6	6	883510	883515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18047	NC_012914	GCG	2	6	883648	883653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794795
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18049	NC_012914	GCT	2	6	883853	883858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794795
18050	NC_012914	TCCT	2	8	883890	883897	0 %	50 %	0 %	50 %	251794795
18051	NC_012914	ATT	2	6	883986	883991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794795
18052	NC_012914	GGA	2	6	884144	884149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794795
18053	NC_012914	ACG	2	6	884208	884213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794795
18054	NC_012914	CGA	2	6	884236	884241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794795
18055	NC_012914	GATT	2	8	884357	884364	25 %	50 %	25 %	0 %	251794795
18056	NC_012914	ACG	2	6	884380	884385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794795
18057	NC_012914	GTA	2	6	884430	884435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794795
18058	NC_012914	CAAG	2	8	884477	884484	50 %	0 %	25 %	25 %	251794795
18059	NC_012914	CAG	2	6	884499	884504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794795
18060	NC_012914	CGG	2	6	884509	884514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794795
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18064	NC_012914	GCT	2	6	884854	884859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794796
18065	NC_012914	TCT	2	6	884874	884879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794796
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18078	NC_012914	GCT	2	6	885379	885384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794796
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18084	NC_012914	TA	3	6	885561	885566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18085	NC_012914	GTT	2	6	885733	885738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794797
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18090	NC_012914	ATT	2	6	885908	885913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794797
18091	NC_012914	AAG	2	6	885924	885929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794797
18092	NC_012914	AAC	2	6	885934	885939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18093	NC_012914	GCT	2	6	885968	885973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18094	NC_012914	TTGC	2	8	885989	885996	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18095	NC_012914	TAA	2	6	886007	886012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794798
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18097	NC_012914	ATTC	2	8	886237	886244	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18098	NC_012914	TAT	2	6	886269	886274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18099	NC_012914	T	7	7	886307	886313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18100	NC_012914	GAA	2	6	886414	886419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794799
18101	NC_012914	GC	3	6	886468	886473	0 %	0 %	50 %	50 %	251794799
18102	NC_012914	GGA	2	6	886483	886488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794799
18103	NC_012914	GC	3	6	886502	886507	0 %	0 %	50 %	50 %	251794799
18104	NC_012914	CGC	2	6	886675	886680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794799
18105	NC_012914	GTA	2	6	886703	886708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794799
18106	NC_012914	GC	3	6	886800	886805	0 %	0 %	50 %	50 %	251794799
18107	NC_012914	CAT	2	6	886861	886866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794799
18108	NC_012914	GCCGTA	2	12	886958	886969	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	251794799
18109	NC_012914	AAGC	2	8	887034	887041	50 %	0 %	25 %	25 %	251794799
18110	NC_012914	CGC	2	6	887062	887067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794799
18111	NC_012914	GCT	2	6	887113	887118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18112	NC_012914	AGT	2	6	887219	887224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18113	NC_012914	AGG	2	6	887246	887251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18114	NC_012914	TGC	2	6	887308	887313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794800
18115	NC_012914	GCG	2	6	887367	887372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794800
18116	NC_012914	CAT	2	6	887407	887412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794800
18117	NC_012914	GCA	2	6	887423	887428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794800
18118	NC_012914	CTGG	2	8	887501	887508	0 %	25 %	50 %	25 %	251794800
18119	NC_012914	TTG	2	6	887532	887537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794800
18120	NC_012914	TGAACG	2	12	887571	887582	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	251794800
18121	NC_012914	TTGC	2	8	887609	887616	0 %	50 %	25 %	25 %	251794800
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18124	NC_012914	TTG	2	6	887769	887774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794800
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18144	NC_012914	T	7	7	888683	888689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18150	NC_012914	GCTAA	2	10	888993	889002	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18151	NC_012914	GCT	2	6	889028	889033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18152	NC_012914	GCAT	2	8	889062	889069	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18153	NC_012914	CAG	2	6	889089	889094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18237	NC_012914	TTTG	2	8	893045	893052	0 %	75 %	25 %	0 %	251794803
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18240	NC_012914	CCGG	2	8	893262	893269	0 %	0 %	50 %	50 %	251794803
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18500	NC_012914	AGG	2	6	905558	905563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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