MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus sp. JDR-2 chromosome

Total Repeats: 142585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_012914	CTGAA	2	10	832731	832740	40 %	20 %	20 %	20 %	251794746
17002	NC_012914	GCAG	2	8	832767	832774	25 %	0 %	50 %	25 %	251794746
17003	NC_012914	GGA	2	6	832804	832809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794746
17004	NC_012914	AGCTT	2	10	833021	833030	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17005	NC_012914	ACAA	2	8	833074	833081	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17006	NC_012914	AGG	2	6	833096	833101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17007	NC_012914	GCG	2	6	833107	833112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17008	NC_012914	ATGA	2	8	833116	833123	50 %	25 %	25 %	0 %	251794747
17009	NC_012914	TAC	3	9	833161	833169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794747
17010	NC_012914	ATCTG	2	10	833219	833228	20 %	40 %	20 %	20 %	251794747
17011	NC_012914	GAT	2	6	833232	833237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794747
17012	NC_012914	AGG	2	6	833438	833443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794747
17013	NC_012914	CTG	2	6	833514	833519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794748
17014	NC_012914	TTG	2	6	833542	833547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794748
17015	NC_012914	GCA	2	6	833564	833569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794748
17016	NC_012914	GCT	2	6	833684	833689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794748
17017	NC_012914	GCT	2	6	833708	833713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794748
17018	NC_012914	CGG	2	6	833719	833724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794748
17019	NC_012914	TTG	2	6	833794	833799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794748
17020	NC_012914	CAA	2	6	833829	833834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794748
17021	NC_012914	GCAG	2	8	833843	833850	25 %	0 %	50 %	25 %	251794748
17022	NC_012914	CGT	2	6	833897	833902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794748
17023	NC_012914	CTT	2	6	833928	833933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794748
17024	NC_012914	GCT	2	6	833948	833953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794748
17025	NC_012914	CATT	2	8	833965	833972	25 %	50 %	0 %	25 %	251794748
17026	NC_012914	TAT	2	6	833980	833985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794748
17027	NC_012914	ACAT	2	8	834010	834017	50 %	25 %	0 %	25 %	251794748
17028	NC_012914	AAAGA	2	10	834063	834072	80 %	0 %	20 %	0 %	251794749
17029	NC_012914	TGG	2	6	834135	834140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794749
17030	NC_012914	AGGA	2	8	834184	834191	50 %	0 %	50 %	0 %	251794749
17031	NC_012914	GCG	2	6	834216	834221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794749
17032	NC_012914	CTG	2	6	834222	834227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794749
17033	NC_012914	ATG	2	6	834229	834234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794749
17034	NC_012914	GAAG	2	8	834260	834267	50 %	0 %	50 %	0 %	251794749
17035	NC_012914	CTGG	2	8	834290	834297	0 %	25 %	50 %	25 %	251794749
17036	NC_012914	GGA	2	6	834311	834316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794749
17037	NC_012914	CGG	2	6	834365	834370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794749
17038	NC_012914	GGAAG	2	10	834395	834404	40 %	0 %	60 %	0 %	251794749
17039	NC_012914	CCG	2	6	834529	834534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794749
17040	NC_012914	ATCA	2	8	834564	834571	50 %	25 %	0 %	25 %	251794749
17041	NC_012914	GCA	2	6	834738	834743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17042	NC_012914	TCG	2	6	834747	834752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17043	NC_012914	TA	3	6	834763	834768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17044	NC_012914	TTA	2	6	834794	834799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17045	NC_012914	CAG	2	6	834923	834928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17046	NC_012914	A	6	6	834942	834947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17047	NC_012914	T	8	8	834968	834975	0 %	100 %	0 %	0 %	251794750
17048	NC_012914	TAAG	2	8	834998	835005	50 %	25 %	25 %	0 %	251794750
17049	NC_012914	GCCAT	2	10	835039	835048	20 %	20 %	20 %	40 %	251794750
17050	NC_012914	GGA	2	6	835125	835130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794750
17051	NC_012914	CTT	2	6	835132	835137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794750
17052	NC_012914	T	6	6	835136	835141	0 %	100 %	0 %	0 %	251794750
17053	NC_012914	AGC	2	6	835197	835202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794750
17054	NC_012914	TCA	2	6	835203	835208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794750
17055	NC_012914	AATC	2	8	835414	835421	50 %	25 %	0 %	25 %	251794750
17056	NC_012914	TA	3	6	835551	835556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17057	NC_012914	AAC	2	6	835565	835570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17058	NC_012914	ACAGC	2	10	835582	835591	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
17059	NC_012914	A	6	6	835670	835675	100 %	0 %	0 %	0 %	251794751
17060	NC_012914	GCT	2	6	835723	835728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794751
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17062	NC_012914	AGC	2	6	835782	835787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794751
17063	NC_012914	GCT	2	6	835807	835812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794751
17064	NC_012914	TGC	2	6	835860	835865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794751
17065	NC_012914	TAC	2	6	835925	835930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794751
17066	NC_012914	GCT	2	6	835954	835959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794751
17067	NC_012914	CGG	2	6	836011	836016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794751
17068	NC_012914	ACA	2	6	836017	836022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794751
17069	NC_012914	GCG	2	6	836045	836050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794751
17070	NC_012914	ATT	2	6	836066	836071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794751
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17073	NC_012914	ATCA	2	8	836222	836229	50 %	25 %	0 %	25 %	251794751
17074	NC_012914	AAC	2	6	836275	836280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794751
17075	NC_012914	AACG	2	8	836317	836324	50 %	0 %	25 %	25 %	251794751
17076	NC_012914	TGGAA	2	10	836358	836367	40 %	20 %	40 %	0 %	251794751
17077	NC_012914	ACCG	2	8	836399	836406	25 %	0 %	25 %	50 %	251794751
17078	NC_012914	GGC	2	6	836465	836470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794751
17079	NC_012914	TCCAC	2	10	836496	836505	20 %	20 %	0 %	60 %	251794751
17080	NC_012914	AT	3	6	836518	836523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17081	NC_012914	GCT	2	6	836577	836582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794752
17082	NC_012914	CCGT	2	8	836588	836595	0 %	25 %	25 %	50 %	251794752
17083	NC_012914	CCG	2	6	836598	836603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794752
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17085	NC_012914	GTT	2	6	836632	836637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794752
17086	NC_012914	TAT	2	6	836704	836709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794752
17087	NC_012914	CCT	2	6	836753	836758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794752
17088	NC_012914	GA	3	6	836775	836780	50 %	0 %	50 %	0 %	251794752
17089	NC_012914	TTA	2	6	836867	836872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794752
17090	NC_012914	TAT	2	6	836880	836885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794752
17091	NC_012914	GTT	2	6	836899	836904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794752
17092	NC_012914	TTGC	2	8	836948	836955	0 %	50 %	25 %	25 %	251794752
17093	NC_012914	TTTATC	2	12	836962	836973	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	251794752
17094	NC_012914	GATC	2	8	837011	837018	25 %	25 %	25 %	25 %	251794752
17095	NC_012914	GGT	2	6	837079	837084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794752
17096	NC_012914	CCGA	2	8	837094	837101	25 %	0 %	25 %	50 %	251794752
17097	NC_012914	GTG	3	9	837229	837237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794752
17098	NC_012914	A	6	6	837265	837270	100 %	0 %	0 %	0 %	251794752
17099	NC_012914	C	6	6	837330	837335	0 %	0 %	0 %	100 %	251794753
17100	NC_012914	AGG	2	6	837338	837343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794753
17101	NC_012914	GCC	2	6	837344	837349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794753
17102	NC_012914	GAG	2	6	837420	837425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794753
17103	NC_012914	TTGTT	2	10	837448	837457	0 %	80 %	20 %	0 %	251794753
17104	NC_012914	TTA	2	6	837511	837516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794753
17105	NC_012914	ATG	2	6	837553	837558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794753
17106	NC_012914	T	6	6	837579	837584	0 %	100 %	0 %	0 %	251794753
17107	NC_012914	TGC	2	6	837604	837609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794753
17108	NC_012914	TGT	2	6	837652	837657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794753
17109	NC_012914	GAA	2	6	837681	837686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794753
17110	NC_012914	CTG	2	6	837738	837743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794753
17111	NC_012914	GAC	2	6	837766	837771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794753
17112	NC_012914	AGCTTG	2	12	837793	837804	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	251794753
17113	NC_012914	ATG	2	6	837808	837813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794753
17114	NC_012914	AGG	2	6	837835	837840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794753
17115	NC_012914	GAT	2	6	837893	837898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794753
17116	NC_012914	CAT	2	6	837936	837941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794753
17117	NC_012914	GCG	2	6	837990	837995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794753
17118	NC_012914	GGC	2	6	838076	838081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794753
17119	NC_012914	ATA	2	6	838144	838149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794753
17120	NC_012914	GTTG	2	8	838272	838279	0 %	50 %	50 %	0 %	251794753
17121	NC_012914	TGG	2	6	838342	838347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794753
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