MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus sp. JDR-2 chromosome

Total Repeats: 142585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012914	CGG	2	6	49413	49418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794081
1002	NC_012914	GAT	2	6	49430	49435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794081
1003	NC_012914	CGA	2	6	49450	49455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794081
1004	NC_012914	CTGC	2	8	49481	49488	0 %	25 %	25 %	50 %	251794081
1005	NC_012914	TGG	2	6	49513	49518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_012914	TTC	2	6	49539	49544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_012914	TGT	2	6	49552	49557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_012914	AGTA	2	8	49629	49636	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_012914	CTAT	2	8	49650	49657	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_012914	ATCGC	2	10	49660	49669	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1011	NC_012914	CA	3	6	49682	49687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_012914	GCC	2	6	49713	49718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_012914	GGC	2	6	49730	49735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_012914	T	7	7	49740	49746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_012914	TGG	2	6	49758	49763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_012914	GCC	2	6	49770	49775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_012914	AAT	2	6	49781	49786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_012914	GGAGG	2	10	49838	49847	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_012914	GGAGC	2	10	49864	49873	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1020	NC_012914	GGA	2	6	50028	50033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794082
1021	NC_012914	TCA	2	6	50159	50164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794082
1022	NC_012914	CAT	2	6	50182	50187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794082
1023	NC_012914	ACGTT	2	10	50220	50229	20 %	40 %	20 %	20 %	251794082
1024	NC_012914	CTT	3	9	50248	50256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794082
1025	NC_012914	CTT	2	6	50274	50279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794082
1026	NC_012914	CTT	2	6	50367	50372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794082
1027	NC_012914	CGTAAT	2	12	50409	50420	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	251794082
1028	NC_012914	T	6	6	50440	50445	0 %	100 %	0 %	0 %	251794082
1029	NC_012914	GCA	2	6	50448	50453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794082
1030	NC_012914	TTGCCT	2	12	50519	50530	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	251794082
1031	NC_012914	ATTTC	2	10	50622	50631	20 %	60 %	0 %	20 %	251794082
1032	NC_012914	ATG	2	6	50762	50767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794083
1033	NC_012914	GCT	2	6	50776	50781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794083
1034	NC_012914	CTT	2	6	50854	50859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794083
1035	NC_012914	CTC	2	6	50956	50961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794083
1036	NC_012914	GAA	2	6	51013	51018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794083
1037	NC_012914	GCC	2	6	51040	51045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794083
1038	NC_012914	CTTCG	2	10	51088	51097	0 %	40 %	20 %	40 %	251794083
1039	NC_012914	AGA	2	6	51235	51240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794083
1040	NC_012914	TCG	2	6	51276	51281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794083
1041	NC_012914	CCG	2	6	51302	51307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794083
1042	NC_012914	CTG	2	6	51325	51330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794083
1043	NC_012914	CAG	2	6	51334	51339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794083
1044	NC_012914	GCA	2	6	51357	51362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794083
1045	NC_012914	CCG	2	6	51371	51376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794083
1046	NC_012914	TGG	2	6	51381	51386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794083
1047	NC_012914	GCC	2	6	51391	51396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794083
1048	NC_012914	CCG	2	6	51412	51417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794083
1049	NC_012914	GTC	2	6	51467	51472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794083
1050	NC_012914	GCT	2	6	51486	51491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794083
1051	NC_012914	CAA	2	6	51531	51536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794083
1052	NC_012914	ATT	2	6	51551	51556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794083
1053	NC_012914	AAG	2	6	51561	51566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794083
1054	NC_012914	CAC	2	6	51615	51620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	251794083
1055	NC_012914	GCG	2	6	51626	51631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794083
1056	NC_012914	GCAC	2	8	51696	51703	25 %	0 %	25 %	50 %	251794083
1057	NC_012914	GCA	2	6	51737	51742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794083
1058	NC_012914	ATT	2	6	51892	51897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_012914	TAC	2	6	51920	51925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_012914	GAG	2	6	51949	51954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_012914	AGG	2	6	52044	52049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794084
1062	NC_012914	CGGA	2	8	52067	52074	25 %	0 %	50 %	25 %	251794084
1063	NC_012914	GCA	2	6	52075	52080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794084
1064	NC_012914	CTG	2	6	52094	52099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794084
1065	NC_012914	AGG	2	6	52206	52211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794084
1066	NC_012914	TGCCG	2	10	52231	52240	0 %	20 %	40 %	40 %	251794084
1067	NC_012914	GCT	2	6	52273	52278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794084
1068	NC_012914	ATT	2	6	52316	52321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794084
1069	NC_012914	GCT	2	6	52387	52392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794084
1070	NC_012914	GGC	2	6	52411	52416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794084
1071	NC_012914	CG	3	6	52428	52433	0 %	0 %	50 %	50 %	251794084
1072	NC_012914	ATT	2	6	52442	52447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794084
1073	NC_012914	ATG	2	6	52458	52463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794084
1074	NC_012914	GTT	3	9	52523	52531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794084
1075	NC_012914	GAA	2	6	52556	52561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794084
1076	NC_012914	GGA	3	9	52642	52650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794084
1077	NC_012914	GAT	2	6	52805	52810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794084
1078	NC_012914	GGA	2	6	52825	52830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794084
1079	NC_012914	TGC	2	6	52857	52862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794084
1080	NC_012914	GGA	2	6	53017	53022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794084
1081	NC_012914	GAA	2	6	53023	53028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794084
1082	NC_012914	AGA	2	6	53115	53120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794084
1083	NC_012914	GCG	2	6	53123	53128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794084
1084	NC_012914	GAG	2	6	53147	53152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794084
1085	NC_012914	AGA	2	6	53176	53181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794084
1086	NC_012914	GCAG	2	8	53230	53237	25 %	0 %	50 %	25 %	251794084
1087	NC_012914	CT	3	6	53309	53314	0 %	50 %	0 %	50 %	251794084
1088	NC_012914	GAG	2	6	53354	53359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794084
1089	NC_012914	TGG	2	6	53417	53422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794084
1090	NC_012914	GAA	2	6	53423	53428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794084
1091	NC_012914	T	7	7	53492	53498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_012914	GCA	2	6	53505	53510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_012914	T	7	7	53514	53520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_012914	CAAA	2	8	53572	53579	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1095	NC_012914	AGC	2	6	53594	53599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_012914	GAATT	2	10	53620	53629	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_012914	AGG	2	6	53631	53636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_012914	TAA	2	6	53641	53646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794085
1099	NC_012914	CAA	2	6	53666	53671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794085
1100	NC_012914	CAA	2	6	53677	53682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794085
1101	NC_012914	CAA	2	6	53891	53896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794085
1102	NC_012914	AGC	2	6	54033	54038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794086
1103	NC_012914	AGA	2	6	54079	54084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794086
1104	NC_012914	CGAA	2	8	54101	54108	50 %	0 %	25 %	25 %	251794086
1105	NC_012914	GAA	2	6	54162	54167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794086
1106	NC_012914	CG	3	6	54175	54180	0 %	0 %	50 %	50 %	251794086
1107	NC_012914	A	6	6	54203	54208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_012914	T	7	7	54234	54240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_012914	TC	3	6	54380	54385	0 %	50 %	0 %	50 %	251794087
1110	NC_012914	TTA	2	6	54387	54392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794087
1111	NC_012914	ATA	2	6	54483	54488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794087
1112	NC_012914	CAT	2	6	54499	54504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794087
1113	NC_012914	TC	3	6	54507	54512	0 %	50 %	0 %	50 %	251794087
1114	NC_012914	TAC	2	6	54548	54553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794087
1115	NC_012914	TTGA	2	8	54554	54561	25 %	50 %	25 %	0 %	251794087
1116	NC_012914	GA	3	6	54560	54565	50 %	0 %	50 %	0 %	251794087
1117	NC_012914	GGC	2	6	54572	54577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794087
1118	NC_012914	GAT	2	6	54628	54633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794087
1119	NC_012914	T	6	6	54660	54665	0 %	100 %	0 %	0 %	251794087
1120	NC_012914	CGG	2	6	54666	54671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794087
1121	NC_012914	CTG	2	6	54677	54682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794087
1122	NC_012914	CTG	2	6	54719	54724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794087
1123	NC_012914	AGC	2	6	54776	54781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794087
1124	NC_012914	TCA	2	6	54831	54836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794087
1125	NC_012914	GCAA	2	8	54866	54873	50 %	0 %	25 %	25 %	251794087
1126	NC_012914	TGC	2	6	54876	54881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794087
1127	NC_012914	TTA	2	6	54919	54924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794087
1128	NC_012914	GCG	2	6	55004	55009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794087
1129	NC_012914	GGC	2	6	55018	55023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794087
1130	NC_012914	GAA	2	6	55025	55030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794087
1131	NC_012914	TC	3	6	55070	55075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_012914	AG	3	6	55077	55082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_012914	AAAC	2	8	55106	55113	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1134	NC_012914	AGG	2	6	55192	55197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_012914	GTC	2	6	55231	55236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794088
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1140	NC_012914	CTG	2	6	55375	55380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794088
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1151	NC_012914	TCCT	2	8	55810	55817	0 %	50 %	0 %	50 %	251794088
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1154	NC_012914	AT	3	6	55850	55855	50 %	50 %	0 %	0 %	251794088
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1158	NC_012914	CAAAG	2	10	56141	56150	60 %	0 %	20 %	20 %	251794089
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1167	NC_012914	GCTT	2	8	56639	56646	0 %	50 %	25 %	25 %	251794090
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1175	NC_012914	AGG	2	6	57091	57096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1187	NC_012914	TGT	2	6	57675	57680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794092
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1198	NC_012914	AACC	2	8	58116	58123	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1201	NC_012914	AACC	2	8	58192	58199	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1202	NC_012914	CATT	2	8	58252	58259	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1203	NC_012914	AACC	2	8	58269	58276	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1204	NC_012914	GCA	2	6	58327	58332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794093
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1211	NC_012914	A	7	7	58557	58563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1212	NC_012914	CAG	2	6	58602	58607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1247	NC_012914	AGGG	2	8	60354	60361	25 %	0 %	75 %	0 %	251794094
1248	NC_012914	AGG	2	6	60379	60384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794094
1249	NC_012914	TTA	2	6	60439	60444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794094
1250	NC_012914	CAT	2	6	60480	60485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794094
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1252	NC_012914	CGCTC	2	10	60521	60530	0 %	20 %	20 %	60 %	251794094
1253	NC_012914	GA	3	6	60570	60575	50 %	0 %	50 %	0 %	251794094
1254	NC_012914	GAA	2	6	60584	60589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794094
1255	NC_012914	AACC	2	8	60595	60602	50 %	0 %	0 %	50 %	251794094
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1257	NC_012914	GCC	2	6	60657	60662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794094
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