MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus sp. JDR-2 chromosome

Total Repeats: 142585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_012914	GAA	2	6	684326	684331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794612
14002	NC_012914	GCTG	2	8	684354	684361	0 %	25 %	50 %	25 %	251794612
14003	NC_012914	CAG	3	9	684397	684405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794612
14004	NC_012914	CTT	2	6	684437	684442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794612
14005	NC_012914	GCCG	2	8	684454	684461	0 %	0 %	50 %	50 %	251794612
14006	NC_012914	CGT	2	6	684499	684504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794612
14007	NC_012914	TTA	3	9	684573	684581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794612
14008	NC_012914	TA	3	6	684627	684632	50 %	50 %	0 %	0 %	251794612
14009	NC_012914	A	6	6	684635	684640	100 %	0 %	0 %	0 %	251794612
14010	NC_012914	TAC	2	6	684641	684646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794612
14011	NC_012914	AT	3	6	684677	684682	50 %	50 %	0 %	0 %	251794613
14012	NC_012914	CTG	2	6	684715	684720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794613
14013	NC_012914	CTA	2	6	684756	684761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794613
14014	NC_012914	TA	3	6	684760	684765	50 %	50 %	0 %	0 %	251794613
14015	NC_012914	GCC	2	6	684783	684788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794613
14016	NC_012914	CTT	2	6	684793	684798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794613
14017	NC_012914	GCT	2	6	684876	684881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794613
14018	NC_012914	TTC	2	6	684933	684938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794613
14019	NC_012914	CAG	2	6	684945	684950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794613
14020	NC_012914	TGC	2	6	684953	684958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794613
14021	NC_012914	CGG	2	6	685023	685028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794613
14022	NC_012914	ATA	2	6	685103	685108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794613
14023	NC_012914	ATGG	2	8	685254	685261	25 %	25 %	50 %	0 %	251794613
14024	NC_012914	GCC	2	6	685325	685330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794613
14025	NC_012914	ATC	2	6	685333	685338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794613
14026	NC_012914	GGA	2	6	685374	685379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794613
14027	NC_012914	ATG	2	6	685405	685410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794613
14028	NC_012914	GCT	2	6	685539	685544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794613
14029	NC_012914	CCGG	2	8	685548	685555	0 %	0 %	50 %	50 %	251794613
14030	NC_012914	GC	3	6	685558	685563	0 %	0 %	50 %	50 %	251794613
14031	NC_012914	ATTT	2	8	685597	685604	25 %	75 %	0 %	0 %	251794613
14032	NC_012914	CTTG	2	8	685605	685612	0 %	50 %	25 %	25 %	251794613
14033	NC_012914	ACG	2	6	685672	685677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794613
14034	NC_012914	TCA	2	6	685739	685744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794613
14035	NC_012914	ATT	2	6	685789	685794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794613
14036	NC_012914	TTAC	2	8	685808	685815	25 %	50 %	0 %	25 %	251794613
14037	NC_012914	TTG	2	6	685832	685837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794613
14038	NC_012914	GTC	2	6	685963	685968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794614
14039	NC_012914	GCT	2	6	685983	685988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794614
14040	NC_012914	CTT	2	6	686065	686070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794614
14041	NC_012914	GCA	2	6	686088	686093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794614
14042	NC_012914	GTT	2	6	686185	686190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794614
14043	NC_012914	AAC	2	6	686338	686343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794614
14044	NC_012914	GCTG	2	8	686381	686388	0 %	25 %	50 %	25 %	251794614
14045	NC_012914	GAGC	2	8	686441	686448	25 %	0 %	50 %	25 %	251794614
14046	NC_012914	GGA	2	6	686520	686525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794614
14047	NC_012914	CAG	2	6	686671	686676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794614
14048	NC_012914	TTCG	2	8	686693	686700	0 %	50 %	25 %	25 %	251794614
14049	NC_012914	CTTG	2	8	686766	686773	0 %	50 %	25 %	25 %	251794614
14050	NC_012914	A	6	6	686803	686808	100 %	0 %	0 %	0 %	251794614
14051	NC_012914	CCCTG	2	10	686829	686838	0 %	20 %	20 %	60 %	251794614
14052	NC_012914	TCG	2	6	686857	686862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794614
14053	NC_012914	TGG	2	6	686867	686872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794614
14054	NC_012914	CGA	2	6	687047	687052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794614
14055	NC_012914	AAC	2	6	687091	687096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794614
14056	NC_012914	AAG	2	6	687112	687117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794614
14057	NC_012914	CCG	2	6	687122	687127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794614
14058	NC_012914	G	6	6	687135	687140	0 %	0 %	100 %	0 %	251794614
14059	NC_012914	GAA	2	6	687165	687170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794614
14060	NC_012914	TCACGA	2	12	687191	687202	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	251794614
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14062	NC_012914	TCC	2	6	687347	687352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794614
14063	NC_012914	CAAG	2	8	687600	687607	50 %	0 %	25 %	25 %	251794614
14064	NC_012914	CTT	2	6	687615	687620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794614
14065	NC_012914	GAA	2	6	687643	687648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794614
14066	NC_012914	GCA	2	6	687728	687733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794614
14067	NC_012914	AAG	2	6	687850	687855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794614
14068	NC_012914	GCCG	2	8	687873	687880	0 %	0 %	50 %	50 %	251794614
14069	NC_012914	GCG	2	6	687902	687907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794614
14070	NC_012914	TGCT	2	8	687941	687948	0 %	50 %	25 %	25 %	251794614
14071	NC_012914	GAA	2	6	687990	687995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794614
14072	NC_012914	TTG	2	6	688032	688037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794615
14073	NC_012914	CGG	2	6	688043	688048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794615
14074	NC_012914	CTG	3	9	688053	688061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794615
14075	NC_012914	CAT	2	6	688124	688129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794615
14076	NC_012914	ACG	2	6	688173	688178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794615
14077	NC_012914	CAC	2	6	688181	688186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	251794615
14078	NC_012914	CGT	2	6	688247	688252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794615
14079	NC_012914	GTG	2	6	688263	688268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794615
14080	NC_012914	GCAA	2	8	688338	688345	50 %	0 %	25 %	25 %	251794615
14081	NC_012914	AGG	2	6	688354	688359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794615
14082	NC_012914	AGA	3	9	688375	688383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794615
14083	NC_012914	TCGC	2	8	688389	688396	0 %	25 %	25 %	50 %	251794615
14084	NC_012914	GATG	2	8	688400	688407	25 %	25 %	50 %	0 %	251794615
14085	NC_012914	ACG	2	6	688449	688454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794615
14086	NC_012914	GCT	2	6	688496	688501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794615
14087	NC_012914	GAT	2	6	688538	688543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794615
14088	NC_012914	GAG	2	6	688548	688553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794615
14089	NC_012914	TC	3	6	688617	688622	0 %	50 %	0 %	50 %	251794615
14090	NC_012914	CTG	2	6	688659	688664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794615
14091	NC_012914	GCA	2	6	688708	688713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794615
14092	NC_012914	GAA	2	6	688800	688805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794615
14093	NC_012914	CTC	2	6	688813	688818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794615
14094	NC_012914	ACG	2	6	688855	688860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794615
14095	NC_012914	TGC	2	6	688903	688908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14096	NC_012914	AGAT	2	8	688929	688936	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14097	NC_012914	TTA	2	6	688944	688949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_012914	TGAACA	2	12	688958	688969	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	251794616
14099	NC_012914	GGC	2	6	689010	689015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794616
14100	NC_012914	GTC	2	6	689200	689205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794616
14101	NC_012914	CAT	2	6	689274	689279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794616
14102	NC_012914	TGC	2	6	689355	689360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794616
14103	NC_012914	GATCG	2	10	689400	689409	20 %	20 %	40 %	20 %	251794616
14104	NC_012914	GCG	2	6	689450	689455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794616
14105	NC_012914	GTG	2	6	689491	689496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794616
14106	NC_012914	AAG	2	6	689500	689505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794616
14107	NC_012914	GAT	2	6	689535	689540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794616
14108	NC_012914	GAG	2	6	689557	689562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794616
14109	NC_012914	CT	3	6	689617	689622	0 %	50 %	0 %	50 %	251794616
14110	NC_012914	AGC	2	6	689699	689704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794616
14111	NC_012914	ACG	2	6	689773	689778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794616
14112	NC_012914	CTTG	2	8	689846	689853	0 %	50 %	25 %	25 %	251794617
14113	NC_012914	CTT	2	6	689859	689864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794617
14114	NC_012914	GCC	2	6	689871	689876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794617
14115	NC_012914	GAA	2	6	689883	689888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794617
14116	NC_012914	TTG	2	6	689950	689955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794617
14117	NC_012914	TGG	2	6	689990	689995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794617
14118	NC_012914	AGC	2	6	690069	690074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794617
14119	NC_012914	AAC	2	6	690076	690081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794617
14120	NC_012914	AGC	2	6	690097	690102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794617
14121	NC_012914	CGG	2	6	690108	690113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794617
14122	NC_012914	CCA	2	6	690120	690125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	251794617
14123	NC_012914	AGACGA	2	12	690134	690145	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	251794617
14124	NC_012914	AGC	2	6	690160	690165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794617
14125	NC_012914	GCAT	2	8	690196	690203	25 %	25 %	25 %	25 %	251794617
14126	NC_012914	AGC	2	6	690235	690240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794617
14127	NC_012914	AGGA	2	8	690325	690332	50 %	0 %	50 %	0 %	251794617
14128	NC_012914	ATA	2	6	690367	690372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794617
14129	NC_012914	CTT	2	6	690391	690396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14130	NC_012914	AAG	2	6	690411	690416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14131	NC_012914	ATT	3	9	690450	690458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14132	NC_012914	AAT	2	6	690468	690473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14133	NC_012914	CCA	2	6	690560	690565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	251794618
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14139	NC_012914	ACG	2	6	690921	690926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794618
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14142	NC_012914	CTT	2	6	691025	691030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794619
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14152	NC_012914	T	6	6	691535	691540	0 %	100 %	0 %	0 %	251794619
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14157	NC_012914	CGGGG	2	10	691671	691680	0 %	0 %	80 %	20 %	251794619
14158	NC_012914	GGAAC	2	10	691692	691701	40 %	0 %	40 %	20 %	251794619
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14162	NC_012914	CGG	2	6	691971	691976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794619
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14165	NC_012914	TGG	2	6	692078	692083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794619
14166	NC_012914	AAGA	2	8	692097	692104	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14167	NC_012914	TAATT	2	10	692138	692147	40 %	60 %	0 %	0 %	251794620
14168	NC_012914	CCTG	2	8	692148	692155	0 %	25 %	25 %	50 %	251794620
14169	NC_012914	CTG	2	6	692170	692175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794620
14170	NC_012914	GCT	2	6	692177	692182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794620
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14195	NC_012914	CTGC	2	8	693599	693606	0 %	25 %	25 %	50 %	251794620
14196	NC_012914	CGTT	2	8	693617	693624	0 %	50 %	25 %	25 %	251794620
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14200	NC_012914	TGC	2	6	693914	693919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14203	NC_012914	ATA	2	6	694064	694069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794621
14204	NC_012914	CTG	2	6	694076	694081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794621
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14210	NC_012914	T	6	6	694335	694340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14211	NC_012914	TATT	2	8	694349	694356	25 %	75 %	0 %	0 %	251794622
14212	NC_012914	TTGC	2	8	694376	694383	0 %	50 %	25 %	25 %	251794622
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14217	NC_012914	TGCC	2	8	694624	694631	0 %	25 %	25 %	50 %	251794622
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14220	NC_012914	GAA	3	9	694724	694732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794622
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14232	NC_012914	AGA	2	6	695347	695352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794622
14233	NC_012914	ATG	2	6	695556	695561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794622
14234	NC_012914	ATCC	2	8	695564	695571	25 %	25 %	0 %	50 %	251794622
14235	NC_012914	T	7	7	695596	695602	0 %	100 %	0 %	0 %	251794623
14236	NC_012914	CAA	3	9	695632	695640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794623
14237	NC_012914	AAC	2	6	695660	695665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794623
14238	NC_012914	GGC	2	6	695699	695704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794623
14239	NC_012914	GTT	2	6	695721	695726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794623
14240	NC_012914	ATA	2	6	695805	695810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794623
14241	NC_012914	GGC	2	6	695876	695881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794623
14242	NC_012914	TCA	2	6	695901	695906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794623
14243	NC_012914	TGC	2	6	695923	695928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794623
14244	NC_012914	GTG	2	6	695942	695947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794623
14245	NC_012914	CGT	2	6	695971	695976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794623
14246	NC_012914	ATA	2	6	695985	695990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794623
14247	NC_012914	CGC	2	6	696001	696006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794623
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14249	NC_012914	CCT	2	6	696078	696083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14250	NC_012914	GAA	2	6	696149	696154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14251	NC_012914	GAA	2	6	696157	696162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14252	NC_012914	GTC	2	6	696195	696200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794624
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14256	NC_012914	TGCG	2	8	696408	696415	0 %	25 %	50 %	25 %	251794624
14257	NC_012914	CAT	2	6	696452	696457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794624
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14262	NC_012914	C	6	6	696547	696552	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14263	NC_012914	TCTGC	2	10	696565	696574	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14264	NC_012914	ATT	2	6	696644	696649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794625
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14269	NC_012914	CGG	2	6	696813	696818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794625
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14274	NC_012914	AT	4	8	697193	697200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14275	NC_012914	AAATA	2	10	697217	697226	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14276	NC_012914	GGA	2	6	697295	697300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794626
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14280	NC_012914	AAGCC	2	10	697478	697487	40 %	0 %	20 %	40 %	251794626
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14305	NC_012914	TTTTA	2	10	698960	698969	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14306	NC_012914	A	7	7	699005	699011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14307	NC_012914	TTG	2	6	699030	699035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794628
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14324	NC_012914	T	8	8	699686	699693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14325	NC_012914	ATG	2	6	699726	699731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14329	NC_012914	TAAT	2	8	700237	700244	50 %	50 %	0 %	0 %	251794629
14330	NC_012914	TAT	2	6	700296	700301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794630
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14335	NC_012914	A	6	6	700619	700624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14336	NC_012914	GTTT	2	8	700649	700656	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14337	NC_012914	CGG	2	6	700730	700735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794631
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14340	NC_012914	GGTT	2	8	700835	700842	0 %	50 %	50 %	0 %	251794631
14341	NC_012914	CTC	2	6	700862	700867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794631
14342	NC_012914	TTC	2	6	700904	700909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794631
14343	NC_012914	GTT	2	6	700924	700929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794631
14344	NC_012914	CGG	2	6	701009	701014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794631
14345	NC_012914	TGC	2	6	701022	701027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794631
14346	NC_012914	CG	3	6	701059	701064	0 %	0 %	50 %	50 %	251794631
14347	NC_012914	TCCG	2	8	701090	701097	0 %	25 %	25 %	50 %	251794631
14348	NC_012914	TTTTG	2	10	701180	701189	0 %	80 %	20 %	0 %	251794631
14349	NC_012914	GGC	2	6	701339	701344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794631
14350	NC_012914	ATC	2	6	701345	701350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794631
14351	NC_012914	TCC	2	6	701448	701453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794631
14352	NC_012914	TTG	2	6	701524	701529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794631
14353	NC_012914	AAG	2	6	701590	701595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794631
14354	NC_012914	TTCC	2	8	701656	701663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14355	NC_012914	CATT	2	8	701740	701747	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14356	NC_012914	GGA	2	6	701765	701770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14357	NC_012914	CTG	2	6	701803	701808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794632
14358	NC_012914	ACG	2	6	701912	701917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794632
14359	NC_012914	GAA	2	6	701918	701923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794632
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14361	NC_012914	AT	3	6	702035	702040	50 %	50 %	0 %	0 %	251794632
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