MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus sp. JDR-2 chromosome

Total Repeats: 142585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
142501	NC_012914	GCT	2	6	7180672	7180677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800244
142502	NC_012914	GTC	2	6	7180792	7180797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142503	NC_012914	CTG	2	6	7180972	7180977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800245
142504	NC_012914	CAA	2	6	7180987	7180992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251800245
142505	NC_012914	TCT	2	6	7181093	7181098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800245
142506	NC_012914	TAA	3	9	7181187	7181195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251800245
142507	NC_012914	ATT	2	6	7181257	7181262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251800245
142508	NC_012914	CTT	2	6	7181289	7181294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800245
142509	NC_012914	GTTT	2	8	7181341	7181348	0 %	75 %	25 %	0 %	251800245
142510	NC_012914	CTC	2	6	7181404	7181409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251800245
142511	NC_012914	CAT	2	6	7181634	7181639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251800245
142512	NC_012914	AGCA	2	8	7181671	7181678	50 %	0 %	25 %	25 %	251800245
142513	NC_012914	CTGC	2	8	7181730	7181737	0 %	25 %	25 %	50 %	251800245
142514	NC_012914	GC	3	6	7181740	7181745	0 %	0 %	50 %	50 %	251800245
142515	NC_012914	CCGCCT	2	12	7181790	7181801	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	251800245
142516	NC_012914	CT	3	6	7181832	7181837	0 %	50 %	0 %	50 %	251800245
142517	NC_012914	CTT	2	6	7181899	7181904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800245
142518	NC_012914	CGC	2	6	7181916	7181921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251800245
142519	NC_012914	GAAC	2	8	7181956	7181963	50 %	0 %	25 %	25 %	251800245
142520	NC_012914	TTC	2	6	7182011	7182016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800245
142521	NC_012914	AAT	2	6	7182127	7182132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251800245
142522	NC_012914	GCC	2	6	7182139	7182144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251800245
142523	NC_012914	CTG	2	6	7182153	7182158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800245
142524	NC_012914	CGC	2	6	7182166	7182171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251800245
142525	NC_012914	TGC	2	6	7182242	7182247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142526	NC_012914	AAC	2	6	7182301	7182306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251800246
142527	NC_012914	GGT	2	6	7182351	7182356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251800246
142528	NC_012914	GAAT	2	8	7182368	7182375	50 %	25 %	25 %	0 %	251800246
142529	NC_012914	CGA	2	6	7182391	7182396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251800246
142530	NC_012914	TTC	2	6	7182419	7182424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800246
142531	NC_012914	ACT	2	6	7182431	7182436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251800246
142532	NC_012914	TCC	2	6	7182461	7182466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251800246
142533	NC_012914	GCG	2	6	7182475	7182480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251800246
142534	NC_012914	TCC	2	6	7182494	7182499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251800246
142535	NC_012914	CTT	2	6	7182642	7182647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800246
142536	NC_012914	GTTT	2	8	7182650	7182657	0 %	75 %	25 %	0 %	251800246
142537	NC_012914	GAA	2	6	7182702	7182707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251800246
142538	NC_012914	GCT	2	6	7182798	7182803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800246
142539	NC_012914	CAT	2	6	7182867	7182872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251800246
142540	NC_012914	TTC	2	6	7182899	7182904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800246
142541	NC_012914	CCT	2	6	7182917	7182922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251800247
142542	NC_012914	TGA	2	6	7182933	7182938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251800247
142543	NC_012914	AGT	2	6	7182953	7182958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251800247
142544	NC_012914	AAT	2	6	7182963	7182968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251800247
142545	NC_012914	CGTTTG	2	12	7183080	7183091	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	251800247
142546	NC_012914	CAT	2	6	7183101	7183106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251800247
142547	NC_012914	GGA	2	6	7183145	7183150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251800247
142548	NC_012914	CTG	2	6	7183326	7183331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800247
142549	NC_012914	TCT	2	6	7183355	7183360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800247
142550	NC_012914	AAT	2	6	7183449	7183454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251800247
142551	NC_012914	TAA	2	6	7183528	7183533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251800247
142552	NC_012914	ACA	2	6	7183534	7183539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251800247
142553	NC_012914	TTC	2	6	7183540	7183545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800247
142554	NC_012914	TCG	2	6	7183580	7183585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800247
142555	NC_012914	AAC	2	6	7183617	7183622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251800247
142556	NC_012914	AGC	2	6	7183645	7183650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251800247
142557	NC_012914	CT	3	6	7183688	7183693	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142558	NC_012914	ATT	2	6	7183712	7183717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142559	NC_012914	ATAA	2	8	7183737	7183744	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142560	NC_012914	AAC	2	6	7183756	7183761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142561	NC_012914	TAA	2	6	7183785	7183790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251800248
142562	NC_012914	CG	3	6	7183791	7183796	0 %	0 %	50 %	50 %	251800248
142563	NC_012914	CTT	2	6	7183799	7183804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800248
142564	NC_012914	CTT	2	6	7183817	7183822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800248
142565	NC_012914	GCT	2	6	7183849	7183854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800248
142566	NC_012914	TAAAA	2	10	7183889	7183898	80 %	20 %	0 %	0 %	251800248
142567	NC_012914	T	6	6	7183915	7183920	0 %	100 %	0 %	0 %	251800248
142568	NC_012914	TAA	2	6	7183945	7183950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251800248
142569	NC_012914	CTC	2	6	7183953	7183958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251800248
142570	NC_012914	ACA	2	6	7184049	7184054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251800248
142571	NC_012914	TTCT	2	8	7184152	7184159	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142572	NC_012914	TAA	2	6	7184166	7184171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142573	NC_012914	TATG	2	8	7184177	7184184	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142574	NC_012914	A	9	9	7184225	7184233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142575	NC_012914	ACC	2	6	7184235	7184240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142576	NC_012914	GAC	2	6	7184286	7184291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251800249
142577	NC_012914	TGC	2	6	7184352	7184357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800249
142578	NC_012914	T	7	7	7184486	7184492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142579	NC_012914	GCT	2	6	7184530	7184535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142580	NC_012914	TAA	2	6	7184586	7184591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142581	NC_012914	GTG	2	6	7184661	7184666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142582	NC_012914	ATT	2	6	7184748	7184753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142583	NC_012914	TAT	2	6	7184854	7184859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142584	NC_012914	TAA	2	6	7184882	7184887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142585	NC_012914	CATT	2	8	7184892	7184899	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.