MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus sp. JDR-2 chromosome

Total Repeats: 142585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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142002	NC_012914	GCC	2	6	7156355	7156360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251800219
142003	NC_012914	CCG	2	6	7156379	7156384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251800219
142004	NC_012914	AGC	2	6	7156502	7156507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251800219
142005	NC_012914	CCG	2	6	7156512	7156517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251800219
142006	NC_012914	CAG	2	6	7156528	7156533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251800219
142007	NC_012914	CCGGC	2	10	7156546	7156555	0 %	0 %	40 %	60 %	251800219
142008	NC_012914	GTA	2	6	7156582	7156587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251800219
142009	NC_012914	CTC	2	6	7156627	7156632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251800219
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142011	NC_012914	TTC	2	6	7156736	7156741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800219
142012	NC_012914	CAG	2	6	7156789	7156794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251800219
142013	NC_012914	GCA	2	6	7156815	7156820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251800219
142014	NC_012914	GAG	2	6	7156844	7156849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251800219
142015	NC_012914	CGC	2	6	7156896	7156901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251800219
142016	NC_012914	GGT	3	9	7156905	7156913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251800219
142017	NC_012914	CCGT	2	8	7157006	7157013	0 %	25 %	25 %	50 %	251800219
142018	NC_012914	GCA	2	6	7157070	7157075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251800219
142019	NC_012914	CAT	2	6	7157080	7157085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251800219
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142022	NC_012914	ACG	2	6	7157258	7157263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251800219
142023	NC_012914	CGC	3	9	7157352	7157360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251800219
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142026	NC_012914	TCT	2	6	7157529	7157534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800219
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142028	NC_012914	GTC	2	6	7157615	7157620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800219
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142030	NC_012914	GTC	2	6	7157650	7157655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800219
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142042	NC_012914	ATGC	2	8	7158190	7158197	25 %	25 %	25 %	25 %	251800219
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142052	NC_012914	GC	3	6	7158603	7158608	0 %	0 %	50 %	50 %	251800220
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142105	NC_012914	GTC	2	6	7161416	7161421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800222
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142109	NC_012914	C	6	6	7161615	7161620	0 %	0 %	0 %	100 %	251800222
142110	NC_012914	TAA	2	6	7161628	7161633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251800222
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142112	NC_012914	TAA	2	6	7161706	7161711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251800222
142113	NC_012914	CCT	2	6	7161712	7161717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251800222
142114	NC_012914	GCA	2	6	7161724	7161729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251800222
142115	NC_012914	A	6	6	7161731	7161736	100 %	0 %	0 %	0 %	251800222
142116	NC_012914	TCT	2	6	7161829	7161834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142117	NC_012914	GA	3	6	7161836	7161841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142118	NC_012914	CTTC	2	8	7161881	7161888	0 %	50 %	0 %	50 %	251800223
142119	NC_012914	TGCT	2	8	7161935	7161942	0 %	50 %	25 %	25 %	251800223
142120	NC_012914	TAT	2	6	7161966	7161971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251800223
142121	NC_012914	TATT	2	8	7162043	7162050	25 %	75 %	0 %	0 %	251800223
142122	NC_012914	GGCT	2	8	7162087	7162094	0 %	25 %	50 %	25 %	251800223
142123	NC_012914	TTGGT	2	10	7162097	7162106	0 %	60 %	40 %	0 %	251800223
142124	NC_012914	TGC	2	6	7162145	7162150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800223
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142126	NC_012914	AAG	2	6	7162359	7162364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251800224
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142129	NC_012914	GTC	2	6	7162606	7162611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800224
142130	NC_012914	AAT	2	6	7162693	7162698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251800224
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142132	NC_012914	CTG	2	6	7162975	7162980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800224
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142136	NC_012914	TGA	2	6	7163106	7163111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142137	NC_012914	TGGT	2	8	7163213	7163220	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142138	NC_012914	GTAAA	2	10	7163230	7163239	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142139	NC_012914	TAG	2	6	7163275	7163280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142140	NC_012914	GAA	2	6	7163316	7163321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142141	NC_012914	AGT	2	6	7163333	7163338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251800225
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142150	NC_012914	AAT	2	6	7164029	7164034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251800225
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142166	NC_012914	CT	3	6	7164732	7164737	0 %	50 %	0 %	50 %	251800226
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142200	NC_012914	CTG	2	6	7165738	7165743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800226
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142205	NC_012914	CTG	2	6	7165945	7165950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142206	NC_012914	CTC	2	6	7165958	7165963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142207	NC_012914	TTATT	2	10	7165975	7165984	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142208	NC_012914	ATT	2	6	7166028	7166033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251800227
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142211	NC_012914	TCAGCT	2	12	7166115	7166126	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	251800227
142212	NC_012914	GC	3	6	7166274	7166279	0 %	0 %	50 %	50 %	251800227
142213	NC_012914	ACGG	2	8	7166289	7166296	25 %	0 %	50 %	25 %	251800227
142214	NC_012914	GCCA	2	8	7166326	7166333	25 %	0 %	25 %	50 %	251800227
142215	NC_012914	CTA	2	6	7166415	7166420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251800227
142216	NC_012914	CGC	2	6	7166436	7166441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251800227
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142218	NC_012914	CGC	2	6	7166541	7166546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251800227
142219	NC_012914	CG	3	6	7166566	7166571	0 %	0 %	50 %	50 %	251800227
142220	NC_012914	AAG	2	6	7166575	7166580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251800227
142221	NC_012914	TGT	2	6	7166622	7166627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251800227
142222	NC_012914	GCC	4	12	7166719	7166730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251800227
142223	NC_012914	TTG	2	6	7166739	7166744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251800227
142224	NC_012914	CTT	2	6	7166814	7166819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800227
142225	NC_012914	TTC	2	6	7166845	7166850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800227
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142227	NC_012914	GCCA	2	8	7166926	7166933	25 %	0 %	25 %	50 %	251800227
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142463	NC_012914	TTTTG	2	10	7178980	7178989	0 %	80 %	20 %	0 %	251800244
142464	NC_012914	ATC	2	6	7179027	7179032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251800244
142465	NC_012914	TTTTCT	2	12	7179038	7179049	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	251800244
142466	NC_012914	GCT	2	6	7179080	7179085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800244
142467	NC_012914	TTC	2	6	7179135	7179140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800244
142468	NC_012914	AGC	2	6	7179175	7179180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251800244
142469	NC_012914	AGC	2	6	7179205	7179210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251800244
142470	NC_012914	GCA	2	6	7179250	7179255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251800244
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142473	NC_012914	AGC	2	6	7179424	7179429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251800244
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142475	NC_012914	ATC	2	6	7179492	7179497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251800244
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142479	NC_012914	CTG	2	6	7179596	7179601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800244
142480	NC_012914	AAT	2	6	7179643	7179648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251800244
142481	NC_012914	CAT	2	6	7179701	7179706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251800244
142482	NC_012914	CAT	2	6	7179729	7179734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251800244
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142488	NC_012914	CG	3	6	7180124	7180129	0 %	0 %	50 %	50 %	251800244
142489	NC_012914	GC	3	6	7180149	7180154	0 %	0 %	50 %	50 %	251800244
142490	NC_012914	GCT	2	6	7180202	7180207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800244
142491	NC_012914	ATA	2	6	7180243	7180248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251800244
142492	NC_012914	CGT	2	6	7180272	7180277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800244
142493	NC_012914	AAC	2	6	7180281	7180286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251800244
142494	NC_012914	GAT	2	6	7180385	7180390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251800244
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142496	NC_012914	GC	4	8	7180445	7180452	0 %	0 %	50 %	50 %	251800244
142497	NC_012914	CAG	2	6	7180463	7180468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251800244
142498	NC_012914	GAC	2	6	7180557	7180562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251800244
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142500	NC_012914	AAGC	2	8	7180664	7180671	50 %	0 %	25 %	25 %	251800244

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