MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus sp. JDR-2 chromosome

Total Repeats: 142585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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141002	NC_012914	TTTC	2	8	7106539	7106546	0 %	75 %	0 %	25 %	251800174
141003	NC_012914	TCG	2	6	7106688	7106693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800174
141004	NC_012914	AAT	2	6	7106732	7106737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251800174
141005	NC_012914	GTT	2	6	7106741	7106746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251800174
141006	NC_012914	CGA	2	6	7106801	7106806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251800174
141007	NC_012914	TCCA	2	8	7106828	7106835	25 %	25 %	0 %	50 %	251800174
141008	NC_012914	CAT	2	6	7106863	7106868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251800174
141009	NC_012914	AAC	2	6	7107024	7107029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251800174
141010	NC_012914	ACA	2	6	7107070	7107075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251800174
141011	NC_012914	CAAT	2	8	7107153	7107160	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141012	NC_012914	ATC	2	6	7107239	7107244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141013	NC_012914	GAA	2	6	7107313	7107318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251800175
141014	NC_012914	TTG	2	6	7107455	7107460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251800175
141015	NC_012914	GTC	2	6	7107505	7107510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800175
141016	NC_012914	GGA	2	6	7107606	7107611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251800175
141017	NC_012914	CAT	2	6	7107628	7107633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251800175
141018	NC_012914	CTT	2	6	7107654	7107659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800175
141019	NC_012914	CTT	2	6	7107739	7107744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800175
141020	NC_012914	TGC	2	6	7107794	7107799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800175
141021	NC_012914	GCGG	2	8	7107835	7107842	0 %	0 %	75 %	25 %	251800175
141022	NC_012914	TCG	2	6	7107896	7107901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800175
141023	NC_012914	AGC	2	6	7107914	7107919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251800175
141024	NC_012914	AAG	2	6	7107968	7107973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251800175
141025	NC_012914	AAC	2	6	7108032	7108037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251800175
141026	NC_012914	TGC	2	6	7108055	7108060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800175
141027	NC_012914	GGC	2	6	7108104	7108109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251800175
141028	NC_012914	T	6	6	7108393	7108398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141029	NC_012914	AAT	2	6	7108416	7108421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141030	NC_012914	AAG	2	6	7108427	7108432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141031	NC_012914	TTC	2	6	7108436	7108441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141032	NC_012914	AC	3	6	7108446	7108451	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141033	NC_012914	TGT	2	6	7108452	7108457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141034	NC_012914	CAA	2	6	7108458	7108463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141035	NC_012914	ATG	2	6	7108473	7108478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141036	NC_012914	GAT	2	6	7108485	7108490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141037	NC_012914	CAAT	2	8	7108498	7108505	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141038	NC_012914	GAA	3	9	7108510	7108518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141039	NC_012914	CAT	2	6	7108553	7108558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251800176
141040	NC_012914	GGA	2	6	7108560	7108565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251800176
141041	NC_012914	CTG	3	9	7108566	7108574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800176
141042	NC_012914	ACA	2	6	7108597	7108602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251800176
141043	NC_012914	GA	3	6	7108636	7108641	50 %	0 %	50 %	0 %	251800176
141044	NC_012914	GGA	2	6	7108644	7108649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251800176
141045	NC_012914	TCGGC	2	10	7108780	7108789	0 %	20 %	40 %	40 %	251800176
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141049	NC_012914	TCT	2	6	7109017	7109022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800176
141050	NC_012914	CTG	2	6	7109052	7109057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800176
141051	NC_012914	ATCC	2	8	7109120	7109127	25 %	25 %	0 %	50 %	251800176
141052	NC_012914	TGT	2	6	7109141	7109146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251800176
141053	NC_012914	GGC	2	6	7109172	7109177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251800176
141054	NC_012914	GA	3	6	7109259	7109264	50 %	0 %	50 %	0 %	251800176
141055	NC_012914	ATC	2	6	7109280	7109285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251800176
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141058	NC_012914	GCA	2	6	7109364	7109369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251800176
141059	NC_012914	GGC	2	6	7109403	7109408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251800176
141060	NC_012914	ATG	2	6	7109442	7109447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251800176
141061	NC_012914	GGC	2	6	7109475	7109480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251800176
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141072	NC_012914	GA	3	6	7110082	7110087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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141089	NC_012914	CGG	2	6	7111034	7111039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251800177
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141103	NC_012914	AT	3	6	7111531	7111536	50 %	50 %	0 %	0 %	251800178
141104	NC_012914	TGT	2	6	7111621	7111626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251800178
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141108	NC_012914	AGA	2	6	7111840	7111845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141109	NC_012914	GCTGCA	2	12	7111852	7111863	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141110	NC_012914	CTT	2	6	7111870	7111875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141111	NC_012914	TTC	2	6	7111889	7111894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800179
141112	NC_012914	TCG	2	6	7111971	7111976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800179
141113	NC_012914	GCC	2	6	7112073	7112078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251800179
141114	NC_012914	GGAT	3	12	7112114	7112125	25 %	25 %	50 %	0 %	251800179
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141116	NC_012914	TTG	2	6	7112176	7112181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251800180
141117	NC_012914	CTT	2	6	7112184	7112189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800180
141118	NC_012914	GGCA	2	8	7112266	7112273	25 %	0 %	50 %	25 %	251800180
141119	NC_012914	CGCC	2	8	7112343	7112350	0 %	0 %	25 %	75 %	251800180
141120	NC_012914	CGC	2	6	7112355	7112360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251800180
141121	NC_012914	GCC	2	6	7112390	7112395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251800180
141122	NC_012914	TGA	2	6	7112397	7112402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251800180
141123	NC_012914	GAT	2	6	7112430	7112435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251800180
141124	NC_012914	GAA	2	6	7112518	7112523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251800180
141125	NC_012914	ATC	2	6	7112576	7112581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251800180
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141128	NC_012914	TTC	2	6	7112638	7112643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800180
141129	NC_012914	GCTC	2	8	7112670	7112677	0 %	25 %	25 %	50 %	251800180
141130	NC_012914	ATC	2	6	7112687	7112692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251800180
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141132	NC_012914	CCG	2	6	7112852	7112857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251800180
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141136	NC_012914	TGC	2	6	7113046	7113051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800180
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141139	NC_012914	CTT	2	6	7113162	7113167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800180
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141153	NC_012914	TGCC	2	8	7113727	7113734	0 %	25 %	25 %	50 %	251800180
141154	NC_012914	CGGC	2	8	7113740	7113747	0 %	0 %	50 %	50 %	251800180
141155	NC_012914	CTG	3	9	7113772	7113780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800180
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141157	NC_012914	TGTT	2	8	7113885	7113892	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141158	NC_012914	GTT	2	6	7113903	7113908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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141219	NC_012914	ATC	2	6	7117071	7117076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251800183
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141221	NC_012914	AGG	2	6	7117257	7117262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251800183
141222	NC_012914	TAAA	2	8	7117268	7117275	75 %	25 %	0 %	0 %	251800183
141223	NC_012914	TCC	2	6	7117284	7117289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251800183
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141227	NC_012914	GCC	2	6	7117485	7117490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251800183
141228	NC_012914	GATCGT	2	12	7117495	7117506	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	251800183
141229	NC_012914	GCA	3	9	7117510	7117518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251800183
141230	NC_012914	CGG	2	6	7117530	7117535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251800183
141231	NC_012914	CA	3	6	7117557	7117562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141232	NC_012914	AAT	2	6	7117601	7117606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141233	NC_012914	TGA	2	6	7117625	7117630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141234	NC_012914	TAA	2	6	7117757	7117762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251800184
141235	NC_012914	CGG	2	6	7117823	7117828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251800184
141236	NC_012914	TCT	2	6	7117835	7117840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800184
141237	NC_012914	GAA	2	6	7117844	7117849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251800184
141238	NC_012914	TGC	2	6	7117938	7117943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800184
141239	NC_012914	CTG	2	6	7117976	7117981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800184
141240	NC_012914	CCG	2	6	7117991	7117996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251800184
141241	NC_012914	TGCC	2	8	7118000	7118007	0 %	25 %	25 %	50 %	251800184
141242	NC_012914	CTT	2	6	7118063	7118068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800184
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141269	NC_012914	CTTT	2	8	7119134	7119141	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141270	NC_012914	T	6	6	7119139	7119144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141271	NC_012914	GCC	2	6	7119159	7119164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141272	NC_012914	ATC	2	6	7119173	7119178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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141274	NC_012914	ACA	2	6	7119241	7119246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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141277	NC_012914	A	6	6	7119390	7119395	100 %	0 %	0 %	0 %	251800185
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141290	NC_012914	A	6	6	7119897	7119902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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141320	NC_012914	CAATA	2	10	7121441	7121450	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
141321	NC_012914	AAC	2	6	7121567	7121572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251800187
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141332	NC_012914	GCT	2	6	7122079	7122084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800187
141333	NC_012914	ACT	2	6	7122086	7122091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251800187
141334	NC_012914	CTGA	2	8	7122101	7122108	25 %	25 %	25 %	25 %	251800187
141335	NC_012914	TATT	2	8	7122136	7122143	25 %	75 %	0 %	0 %	251800187
141336	NC_012914	TC	3	6	7122214	7122219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141337	NC_012914	GGC	2	6	7122232	7122237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141338	NC_012914	GCAGCC	2	12	7122397	7122408	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	251800188
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141341	NC_012914	CTG	2	6	7122463	7122468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800188
141342	NC_012914	CAC	2	6	7122560	7122565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	251800188
141343	NC_012914	TTA	2	6	7122610	7122615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251800188
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