MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus sp. JDR-2 chromosome

Total Repeats: 142585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_012914	TTA	2	6	661483	661488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794593
13502	NC_012914	ATT	2	6	661534	661539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794593
13503	NC_012914	GGCC	2	8	661650	661657	0 %	0 %	50 %	50 %	251794593
13504	NC_012914	TGC	2	6	661696	661701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794593
13505	NC_012914	AGC	2	6	661702	661707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794593
13506	NC_012914	GATC	2	8	661714	661721	25 %	25 %	25 %	25 %	251794593
13507	NC_012914	CTGG	2	8	661757	661764	0 %	25 %	50 %	25 %	251794593
13508	NC_012914	TCCT	2	8	661792	661799	0 %	50 %	0 %	50 %	251794593
13509	NC_012914	ATC	2	6	661815	661820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794593
13510	NC_012914	GCGG	2	8	661889	661896	0 %	0 %	75 %	25 %	251794593
13511	NC_012914	GGC	2	6	661916	661921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794593
13512	NC_012914	CGC	2	6	661941	661946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794593
13513	NC_012914	CGATG	2	10	661949	661958	20 %	20 %	40 %	20 %	251794593
13514	NC_012914	GC	3	6	661999	662004	0 %	0 %	50 %	50 %	251794593
13515	NC_012914	TTA	2	6	662042	662047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794593
13516	NC_012914	GTT	2	6	662067	662072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794593
13517	NC_012914	TGG	2	6	662095	662100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794593
13518	NC_012914	GC	3	6	662113	662118	0 %	0 %	50 %	50 %	251794593
13519	NC_012914	TCG	2	6	662230	662235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794593
13520	NC_012914	GCGTTC	2	12	662240	662251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794593
13521	NC_012914	AG	4	8	662263	662270	50 %	0 %	50 %	0 %	251794593
13522	NC_012914	GCT	2	6	662321	662326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794594
13523	NC_012914	GCT	2	6	662340	662345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794594
13524	NC_012914	TTTA	2	8	662371	662378	25 %	75 %	0 %	0 %	251794594
13525	NC_012914	CTTG	2	8	662396	662403	0 %	50 %	25 %	25 %	251794594
13526	NC_012914	TTG	2	6	662425	662430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794594
13527	NC_012914	GATCT	2	10	662442	662451	20 %	40 %	20 %	20 %	251794594
13528	NC_012914	TCT	2	6	662488	662493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794594
13529	NC_012914	GCGATG	2	12	662511	662522	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	251794594
13530	NC_012914	GCG	2	6	662542	662547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794594
13531	NC_012914	TCT	2	6	662596	662601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794594
13532	NC_012914	GCTTTG	2	12	662617	662628	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	251794594
13533	NC_012914	CTG	2	6	662653	662658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794594
13534	NC_012914	TTA	3	9	662740	662748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794594
13535	NC_012914	GCT	2	6	662756	662761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794594
13536	NC_012914	CAG	2	6	662769	662774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794594
13537	NC_012914	CGGG	2	8	662782	662789	0 %	0 %	75 %	25 %	251794594
13538	NC_012914	TGG	2	6	662884	662889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794594
13539	NC_012914	GTG	2	6	662913	662918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794594
13540	NC_012914	CG	3	6	662943	662948	0 %	0 %	50 %	50 %	251794594
13541	NC_012914	CGG	2	6	662992	662997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794594
13542	NC_012914	CGG	2	6	663025	663030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794594
13543	NC_012914	TGC	2	6	663061	663066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794594
13544	NC_012914	ATG	2	6	663090	663095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794594
13545	NC_012914	CGG	2	6	663137	663142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794594
13546	NC_012914	TGA	2	6	663181	663186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794594
13547	NC_012914	CAC	2	6	663209	663214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	251794594
13548	NC_012914	CGG	2	6	663242	663247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794594
13549	NC_012914	GTT	2	6	663261	663266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794594
13550	NC_012914	AAG	2	6	663318	663323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794594
13551	NC_012914	AGAGG	2	10	663326	663335	40 %	0 %	60 %	0 %	251794594
13552	NC_012914	CGAGT	2	10	663354	663363	20 %	20 %	40 %	20 %	251794594
13553	NC_012914	GCTTC	2	10	663447	663456	0 %	40 %	20 %	40 %	251794595
13554	NC_012914	AAC	2	6	663483	663488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794595
13555	NC_012914	CGG	2	6	663524	663529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794595
13556	NC_012914	GAA	2	6	663564	663569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794595
13557	NC_012914	A	6	6	663568	663573	100 %	0 %	0 %	0 %	251794595
13558	NC_012914	GCG	2	6	663680	663685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794595
13559	NC_012914	GGA	2	6	663717	663722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794595
13560	NC_012914	AGC	3	9	663737	663745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794595
13561	NC_012914	GGC	2	6	663787	663792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794595
13562	NC_012914	ATG	2	6	663829	663834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794595
13563	NC_012914	TGC	3	9	663854	663862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794595
13564	NC_012914	CTG	2	6	663916	663921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794595
13565	NC_012914	TTGTGG	2	12	663947	663958	0 %	50 %	50 %	0 %	251794595
13566	NC_012914	GCT	2	6	664020	664025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794595
13567	NC_012914	GAAG	2	8	664026	664033	50 %	0 %	50 %	0 %	251794595
13568	NC_012914	ACGTG	2	10	664153	664162	20 %	20 %	40 %	20 %	251794596
13569	NC_012914	GTC	2	6	664187	664192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794596
13570	NC_012914	TGCT	2	8	664193	664200	0 %	50 %	25 %	25 %	251794596
13571	NC_012914	TGA	2	6	664230	664235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794596
13572	NC_012914	AT	3	6	664389	664394	50 %	50 %	0 %	0 %	251794596
13573	NC_012914	CG	3	6	664413	664418	0 %	0 %	50 %	50 %	251794596
13574	NC_012914	AGA	2	6	664419	664424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794596
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13576	NC_012914	GGA	2	6	664444	664449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794596
13577	NC_012914	TGC	2	6	664470	664475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794596
13578	NC_012914	GCG	2	6	664494	664499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794596
13579	NC_012914	GCG	2	6	664509	664514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794596
13580	NC_012914	GCA	4	12	664516	664527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794596
13581	NC_012914	CG	3	6	664537	664542	0 %	0 %	50 %	50 %	251794596
13582	NC_012914	CTG	3	9	664565	664573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794596
13583	NC_012914	ACT	2	6	664710	664715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794596
13584	NC_012914	GGC	2	6	664751	664756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794596
13585	NC_012914	GGA	2	6	664759	664764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794596
13586	NC_012914	CGA	2	6	664771	664776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794596
13587	NC_012914	AAG	2	6	664784	664789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794596
13588	NC_012914	AAGG	2	8	664837	664844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13589	NC_012914	GCT	2	6	664885	664890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13590	NC_012914	CTG	2	6	665100	665105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13591	NC_012914	TGC	2	6	665175	665180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794597
13592	NC_012914	GGGAT	2	10	665192	665201	20 %	20 %	60 %	0 %	251794597
13593	NC_012914	AG	3	6	665208	665213	50 %	0 %	50 %	0 %	251794597
13594	NC_012914	GGT	2	6	665227	665232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794597
13595	NC_012914	CGC	2	6	665241	665246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794597
13596	NC_012914	AGC	2	6	665276	665281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794597
13597	NC_012914	TCT	2	6	665318	665323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794597
13598	NC_012914	ACA	2	6	665354	665359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794597
13599	NC_012914	TAA	2	6	665379	665384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794597
13600	NC_012914	CAA	2	6	665391	665396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794597
13601	NC_012914	GAT	2	6	665403	665408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794597
13602	NC_012914	CAG	2	6	665468	665473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794597
13603	NC_012914	AAG	2	6	665539	665544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794597
13604	NC_012914	TCC	2	6	665567	665572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794597
13605	NC_012914	CTT	2	6	665667	665672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794597
13606	NC_012914	CAT	2	6	665677	665682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794597
13607	NC_012914	TA	3	6	665721	665726	50 %	50 %	0 %	0 %	251794597
13608	NC_012914	TCC	2	6	665746	665751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794597
13609	NC_012914	TTTC	2	8	665805	665812	0 %	75 %	0 %	25 %	251794597
13610	NC_012914	TCCT	2	8	665825	665832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13611	NC_012914	ATGA	2	8	665916	665923	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13612	NC_012914	CTG	2	6	666000	666005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13613	NC_012914	GCAT	2	8	666075	666082	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13614	NC_012914	A	6	6	666093	666098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_012914	ATA	2	6	666194	666199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794598
13616	NC_012914	GAT	2	6	666211	666216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794598
13617	NC_012914	GCC	2	6	666277	666282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794598
13618	NC_012914	TCA	2	6	666332	666337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794598
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13620	NC_012914	AAG	2	6	666484	666489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794598
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13863	NC_012914	GCT	3	9	677978	677986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794607
13864	NC_012914	TGA	2	6	678011	678016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794607
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13872	NC_012914	GC	3	6	678314	678319	0 %	0 %	50 %	50 %	251794607
13873	NC_012914	AGC	2	6	678334	678339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794607
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13979	NC_012914	CGG	2	6	683151	683156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794612
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13981	NC_012914	TGC	2	6	683220	683225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794612
13982	NC_012914	CGG	2	6	683256	683261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794612
13983	NC_012914	TGC	2	6	683289	683294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794612
13984	NC_012914	GAC	2	6	683314	683319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794612
13985	NC_012914	CGG	2	6	683412	683417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794612
13986	NC_012914	GGC	2	6	683422	683427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794612
13987	NC_012914	CGGA	2	8	683495	683502	25 %	0 %	50 %	25 %	251794612
13988	NC_012914	AGCA	2	8	683506	683513	50 %	0 %	25 %	25 %	251794612
13989	NC_012914	GGAA	2	8	683587	683594	50 %	0 %	50 %	0 %	251794612
13990	NC_012914	GGAG	2	8	683626	683633	25 %	0 %	75 %	0 %	251794612
13991	NC_012914	CGTA	2	8	683673	683680	25 %	25 %	25 %	25 %	251794612
13992	NC_012914	CTTGG	2	10	683736	683745	0 %	40 %	40 %	20 %	251794612
13993	NC_012914	AGC	2	6	683829	683834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794612
13994	NC_012914	CAA	2	6	683881	683886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794612
13995	NC_012914	GCT	2	6	683918	683923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794612
13996	NC_012914	CGG	2	6	683982	683987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794612
13997	NC_012914	ATC	2	6	684033	684038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794612
13998	NC_012914	GAAG	2	8	684097	684104	50 %	0 %	50 %	0 %	251794612
13999	NC_012914	GAC	2	6	684166	684171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794612
14000	NC_012914	TGC	2	6	684231	684236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794612

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