MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus sp. JDR-2 chromosome

Total Repeats: 142585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_012914	AGC	2	6	635730	635735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794570
13002	NC_012914	GGAG	2	8	635744	635751	25 %	0 %	75 %	0 %	251794570
13003	NC_012914	CGT	2	6	635779	635784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794570
13004	NC_012914	TTGC	2	8	635791	635798	0 %	50 %	25 %	25 %	251794570
13005	NC_012914	CAG	2	6	635921	635926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794570
13006	NC_012914	CAG	2	6	635930	635935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794570
13007	NC_012914	CAGGA	2	10	635937	635946	40 %	0 %	40 %	20 %	251794570
13008	NC_012914	T	6	6	635972	635977	0 %	100 %	0 %	0 %	251794570
13009	NC_012914	GGAG	2	8	635987	635994	25 %	0 %	75 %	0 %	251794570
13010	NC_012914	T	6	6	636037	636042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_012914	CT	3	6	636059	636064	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13012	NC_012914	A	6	6	636098	636103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_012914	CCG	2	6	636221	636226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794571
13014	NC_012914	AAG	2	6	636316	636321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794571
13015	NC_012914	GGC	2	6	636342	636347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794571
13016	NC_012914	CAA	2	6	636458	636463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794571
13017	NC_012914	AAC	2	6	636567	636572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_012914	TAC	2	6	636595	636600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13019	NC_012914	ATA	2	6	636607	636612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_012914	ATGG	2	8	636617	636624	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_012914	TTG	2	6	636636	636641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_012914	GAG	2	6	636699	636704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_012914	TTC	2	6	636755	636760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13024	NC_012914	TGC	3	9	636790	636798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794572
13025	NC_012914	ACGG	2	8	636926	636933	25 %	0 %	50 %	25 %	251794572
13026	NC_012914	TAA	2	6	636994	636999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794572
13027	NC_012914	TAG	2	6	637003	637008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794572
13028	NC_012914	TCCGT	2	10	637019	637028	0 %	40 %	20 %	40 %	251794572
13029	NC_012914	CGG	2	6	637071	637076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794572
13030	NC_012914	TGC	2	6	637095	637100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794572
13031	NC_012914	CAGC	2	8	637132	637139	25 %	0 %	25 %	50 %	251794572
13032	NC_012914	AAGC	2	8	637216	637223	50 %	0 %	25 %	25 %	251794572
13033	NC_012914	GCG	2	6	637268	637273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794572
13034	NC_012914	TGTT	2	8	637521	637528	0 %	75 %	25 %	0 %	251794572
13035	NC_012914	CGG	2	6	637552	637557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794572
13036	NC_012914	GAA	2	6	637564	637569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794572
13037	NC_012914	CTG	2	6	637685	637690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794572
13038	NC_012914	TCC	2	6	637703	637708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794572
13039	NC_012914	CCT	2	6	637785	637790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794572
13040	NC_012914	ACG	2	6	637970	637975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794572
13041	NC_012914	GTT	2	6	638089	638094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794572
13042	NC_012914	GTC	2	6	638126	638131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794572
13043	NC_012914	AAC	2	6	638204	638209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794572
13044	NC_012914	GCC	2	6	638261	638266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794572
13045	NC_012914	ACGCTG	2	12	638285	638296	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	251794572
13046	NC_012914	CCG	2	6	638510	638515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794572
13047	NC_012914	GTT	2	6	638545	638550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794572
13048	NC_012914	AGC	2	6	638579	638584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794572
13049	NC_012914	CTA	2	6	638743	638748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794572
13050	NC_012914	GCC	2	6	638824	638829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794572
13051	NC_012914	GTT	2	6	638876	638881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794572
13052	NC_012914	GC	3	6	638926	638931	0 %	0 %	50 %	50 %	251794572
13053	NC_012914	CGA	2	6	638955	638960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794572
13054	NC_012914	TCC	2	6	638996	639001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794572
13055	NC_012914	GC	3	6	639060	639065	0 %	0 %	50 %	50 %	251794572
13056	NC_012914	GTC	2	6	639074	639079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794572
13057	NC_012914	GGC	2	6	639232	639237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794572
13058	NC_012914	TAC	2	6	639350	639355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794572
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13061	NC_012914	AGC	2	6	639422	639427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794572
13062	NC_012914	AT	3	6	639562	639567	50 %	50 %	0 %	0 %	251794573
13063	NC_012914	CTT	2	6	639578	639583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794573
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13069	NC_012914	CAT	2	6	639974	639979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794573
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13072	NC_012914	CAG	2	6	640058	640063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794573
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13078	NC_012914	AT	3	6	640350	640355	50 %	50 %	0 %	0 %	251794573
13079	NC_012914	CTTC	2	8	640363	640370	0 %	50 %	0 %	50 %	251794573
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13085	NC_012914	CG	3	6	640897	640902	0 %	0 %	50 %	50 %	251794573
13086	NC_012914	GC	3	6	641031	641036	0 %	0 %	50 %	50 %	251794573
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13092	NC_012914	CAT	2	6	641234	641239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794573
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13098	NC_012914	TA	3	6	641595	641600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_012914	CAGT	2	8	641675	641682	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13100	NC_012914	ATC	2	6	641685	641690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13101	NC_012914	AT	3	6	641712	641717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_012914	GA	3	6	641721	641726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_012914	TGG	2	6	641745	641750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794574
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13105	NC_012914	T	6	6	641776	641781	0 %	100 %	0 %	0 %	251794574
13106	NC_012914	TCC	2	6	641812	641817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794574
13107	NC_012914	GATT	2	8	641839	641846	25 %	50 %	25 %	0 %	251794574
13108	NC_012914	T	7	7	641932	641938	0 %	100 %	0 %	0 %	251794574
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13120	NC_012914	CAAG	2	8	642472	642479	50 %	0 %	25 %	25 %	251794574
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13122	NC_012914	CTG	2	6	642614	642619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794574
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13245	NC_012914	CTT	2	6	649441	649446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794582
13246	NC_012914	A	7	7	649456	649462	100 %	0 %	0 %	0 %	251794582
13247	NC_012914	GTA	2	6	649474	649479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794582
13248	NC_012914	GAC	2	6	649530	649535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794582
13249	NC_012914	GGT	2	6	649606	649611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794582
13250	NC_012914	TC	3	6	649745	649750	0 %	50 %	0 %	50 %	251794582
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13252	NC_012914	A	7	7	649900	649906	100 %	0 %	0 %	0 %	251794582
13253	NC_012914	GCTT	2	8	649917	649924	0 %	50 %	25 %	25 %	251794582
13254	NC_012914	CGT	2	6	649933	649938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794582
13255	NC_012914	TGA	2	6	649958	649963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794582
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13257	NC_012914	CCGT	2	8	650072	650079	0 %	25 %	25 %	50 %	251794582
13258	NC_012914	GTC	2	6	650140	650145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794582
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13261	NC_012914	AGGAG	2	10	650363	650372	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
13262	NC_012914	TGC	2	6	650390	650395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794583
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13297	NC_012914	ACG	2	6	651892	651897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13299	NC_012914	AAG	2	6	651968	651973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13300	NC_012914	CAG	2	6	652003	652008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13302	NC_012914	TAA	2	6	652172	652177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794584
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13304	NC_012914	AATG	2	8	652509	652516	50 %	25 %	25 %	0 %	251794584
13305	NC_012914	CTTT	2	8	652523	652530	0 %	75 %	0 %	25 %	251794584
13306	NC_012914	AT	3	6	652538	652543	50 %	50 %	0 %	0 %	251794584
13307	NC_012914	GCCG	2	8	652638	652645	0 %	0 %	50 %	50 %	251794584
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13310	NC_012914	CAATC	2	10	652797	652806	40 %	20 %	0 %	40 %	251794584
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13323	NC_012914	ATA	2	6	653509	653514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13324	NC_012914	TTC	2	6	653527	653532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13327	NC_012914	TTC	2	6	653632	653637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794585
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13338	NC_012914	AT	3	6	654194	654199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13339	NC_012914	AT	3	6	654229	654234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13340	NC_012914	TGGA	2	8	654235	654242	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13341	NC_012914	ACG	2	6	654275	654280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13344	NC_012914	CGCC	2	8	654415	654422	0 %	0 %	25 %	75 %	251794586
13345	NC_012914	GGA	2	6	654469	654474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794586
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13347	NC_012914	CTGG	2	8	654577	654584	0 %	25 %	50 %	25 %	251794586
13348	NC_012914	GTC	2	6	654653	654658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794586
13349	NC_012914	CT	4	8	654673	654680	0 %	50 %	0 %	50 %	251794586
13350	NC_012914	GAC	2	6	654686	654691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794586
13351	NC_012914	GCT	2	6	654724	654729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794586
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13354	NC_012914	GGAA	2	8	654817	654824	50 %	0 %	50 %	0 %	251794586
13355	NC_012914	ATT	2	6	654842	654847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794586
13356	NC_012914	TGAT	2	8	654888	654895	25 %	50 %	25 %	0 %	251794586
13357	NC_012914	CAA	2	6	654898	654903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794586
13358	NC_012914	A	6	6	655097	655102	100 %	0 %	0 %	0 %	251794586
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13361	NC_012914	TTAT	2	8	655131	655138	25 %	75 %	0 %	0 %	251794586
13362	NC_012914	TCGG	2	8	655192	655199	0 %	25 %	50 %	25 %	251794586
13363	NC_012914	CGC	2	6	655200	655205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794586
13364	NC_012914	AAC	2	6	655262	655267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794586
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13366	NC_012914	CGT	2	6	655437	655442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13487	NC_012914	TGC	2	6	660850	660855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794592
13488	NC_012914	GGC	2	6	660866	660871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794592
13489	NC_012914	ACT	2	6	660877	660882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794592
13490	NC_012914	AAC	2	6	660887	660892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794592
13491	NC_012914	AAG	2	6	660930	660935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794592
13492	NC_012914	AGGC	2	8	661018	661025	25 %	0 %	50 %	25 %	251794592
13493	NC_012914	CGAC	2	8	661027	661034	25 %	0 %	25 %	50 %	251794592
13494	NC_012914	CGGA	2	8	661153	661160	25 %	0 %	50 %	25 %	251794592
13495	NC_012914	GCA	2	6	661230	661235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794592
13496	NC_012914	TAA	2	6	661254	661259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794592
13497	NC_012914	CTG	3	9	661410	661418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794593
13498	NC_012914	TGGCC	2	10	661427	661436	0 %	20 %	40 %	40 %	251794593
13499	NC_012914	TGA	2	6	661450	661455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794593
13500	NC_012914	TCA	2	6	661459	661464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794593

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