MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus sp. JDR-2 chromosome

Total Repeats: 142585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
129001	NC_012914	TTG	2	6	6519380	6519385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251799656
129002	NC_012914	GAT	2	6	6519395	6519400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251799656
129003	NC_012914	CCT	2	6	6519424	6519429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129004	NC_012914	AT	3	6	6519518	6519523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129005	NC_012914	GAA	2	6	6519694	6519699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251799657
129006	NC_012914	GCT	2	6	6519730	6519735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251799657
129007	NC_012914	CCG	2	6	6519943	6519948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251799657
129008	NC_012914	CAT	2	6	6519978	6519983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251799657
129009	NC_012914	TTG	2	6	6520023	6520028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251799657
129010	NC_012914	TTG	2	6	6520033	6520038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251799657
129011	NC_012914	CAG	2	6	6520070	6520075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251799657
129012	NC_012914	CTT	2	6	6520082	6520087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251799657
129013	NC_012914	ACA	2	6	6520150	6520155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251799657
129014	NC_012914	TCG	2	6	6520222	6520227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251799657
129015	NC_012914	TTC	2	6	6520246	6520251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251799657
129016	NC_012914	AGC	2	6	6520305	6520310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251799657
129017	NC_012914	TCC	2	6	6520349	6520354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129018	NC_012914	CTC	2	6	6520389	6520394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129019	NC_012914	ACCG	2	8	6520454	6520461	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129020	NC_012914	TGC	2	6	6520504	6520509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251799658
129021	NC_012914	T	6	6	6520570	6520575	0 %	100 %	0 %	0 %	251799658
129022	NC_012914	CTTT	2	8	6520618	6520625	0 %	75 %	0 %	25 %	251799658
129023	NC_012914	CTG	2	6	6520657	6520662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251799658
129024	NC_012914	CTG	2	6	6520678	6520683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251799658
129025	NC_012914	AAC	2	6	6520736	6520741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251799658
129026	NC_012914	AATC	2	8	6520748	6520755	50 %	25 %	0 %	25 %	251799658
129027	NC_012914	CGG	2	6	6520838	6520843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251799658
129028	NC_012914	T	6	6	6520896	6520901	0 %	100 %	0 %	0 %	251799658
129029	NC_012914	CCT	2	6	6520915	6520920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129030	NC_012914	TCT	2	6	6520961	6520966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251799659
129031	NC_012914	TCT	2	6	6521053	6521058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251799659
129032	NC_012914	AAC	2	6	6521253	6521258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251799659
129033	NC_012914	CTT	3	9	6521354	6521362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251799659
129034	NC_012914	GT	3	6	6521461	6521466	0 %	50 %	50 %	0 %	251799659
129035	NC_012914	T	6	6	6521480	6521485	0 %	100 %	0 %	0 %	251799659
129036	NC_012914	CTT	2	6	6521509	6521514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251799660
129037	NC_012914	AAG	2	6	6521552	6521557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251799660
129038	NC_012914	ACG	2	6	6521595	6521600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251799660
129039	NC_012914	CTT	2	6	6521642	6521647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251799660
129040	NC_012914	GTT	2	6	6521682	6521687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251799660
129041	NC_012914	TCTCG	2	10	6521743	6521752	0 %	40 %	20 %	40 %	251799661
129042	NC_012914	GAG	2	6	6521757	6521762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251799661
129043	NC_012914	CTT	2	6	6521788	6521793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251799661
129044	NC_012914	TGC	2	6	6521829	6521834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251799661
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129046	NC_012914	GTA	2	6	6521937	6521942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129047	NC_012914	ACAAA	2	10	6521967	6521976	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
129048	NC_012914	CCTA	2	8	6521991	6521998	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
129049	NC_012914	GA	3	6	6522170	6522175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129050	NC_012914	TGTC	2	8	6522300	6522307	0 %	50 %	25 %	25 %	251799662
129051	NC_012914	CAA	2	6	6522409	6522414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251799662
129052	NC_012914	TGA	2	6	6522427	6522432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251799662
129053	NC_012914	CTC	2	6	6522437	6522442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251799662
129054	NC_012914	AAG	2	6	6522476	6522481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251799662
129055	NC_012914	TAA	2	6	6522577	6522582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251799662
129056	NC_012914	TTG	2	6	6522753	6522758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251799662
129057	NC_012914	T	6	6	6522848	6522853	0 %	100 %	0 %	0 %	251799662
129058	NC_012914	CGC	2	6	6522897	6522902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129059	NC_012914	ATT	2	6	6523098	6523103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251799663
129060	NC_012914	CCG	2	6	6523106	6523111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251799663
129061	NC_012914	CGA	2	6	6523112	6523117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251799663
129062	NC_012914	TCC	2	6	6523187	6523192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251799663
129063	NC_012914	TTGC	2	8	6523210	6523217	0 %	50 %	25 %	25 %	251799663
129064	NC_012914	CTG	2	6	6523222	6523227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251799663
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129066	NC_012914	TGC	2	6	6523286	6523291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251799663
129067	NC_012914	TTTC	2	8	6523377	6523384	0 %	75 %	0 %	25 %	251799663
129068	NC_012914	ACA	2	6	6523460	6523465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251799663
129069	NC_012914	CAG	2	6	6523510	6523515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251799663
129070	NC_012914	TCC	2	6	6523529	6523534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251799663
129071	NC_012914	CCA	2	6	6523593	6523598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	251799663
129072	NC_012914	CTTC	2	8	6523866	6523873	0 %	50 %	0 %	50 %	251799664
129073	NC_012914	AAT	2	6	6523987	6523992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251799664
129074	NC_012914	CCG	2	6	6524016	6524021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251799664
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129085	NC_012914	CTG	2	6	6524429	6524434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251799665
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129087	NC_012914	TGCGC	2	10	6524630	6524639	0 %	20 %	40 %	40 %	251799665
129088	NC_012914	GAT	2	6	6524675	6524680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251799665
129089	NC_012914	TCT	2	6	6524780	6524785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251799665
129090	NC_012914	GGAC	2	8	6524787	6524794	25 %	0 %	50 %	25 %	251799665
129091	NC_012914	CCT	2	6	6524824	6524829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251799665
129092	NC_012914	TAAGCT	2	12	6524844	6524855	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	251799665
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129097	NC_012914	CAA	2	6	6525040	6525045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251799666
129098	NC_012914	GCC	2	6	6525132	6525137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251799666
129099	NC_012914	TTCC	2	8	6525151	6525158	0 %	50 %	0 %	50 %	251799666
129100	NC_012914	CGG	2	6	6525214	6525219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251799666
129101	NC_012914	GTC	2	6	6525242	6525247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251799666
129102	NC_012914	CTTCG	2	10	6525254	6525263	0 %	40 %	20 %	40 %	251799666
129103	NC_012914	CAG	3	9	6525304	6525312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251799666
129104	NC_012914	CTGA	2	8	6525319	6525326	25 %	25 %	25 %	25 %	251799666
129105	NC_012914	CGATC	2	10	6525373	6525382	20 %	20 %	20 %	40 %	251799666
129106	NC_012914	GCC	2	6	6525468	6525473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251799666
129107	NC_012914	TCT	2	6	6525532	6525537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251799666
129108	NC_012914	GTT	2	6	6525539	6525544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251799666
129109	NC_012914	AGT	2	6	6525571	6525576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251799666
129110	NC_012914	GCT	2	6	6525583	6525588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251799666
129111	NC_012914	ATG	2	6	6525626	6525631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251799666
129112	NC_012914	GCC	3	9	6525650	6525658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251799666
129113	NC_012914	CG	3	6	6525688	6525693	0 %	0 %	50 %	50 %	251799666
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129115	NC_012914	CTT	2	6	6526097	6526102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251799666
129116	NC_012914	ACG	2	6	6526179	6526184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251799666
129117	NC_012914	GAA	2	6	6526187	6526192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251799666
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129127	NC_012914	CAT	2	6	6526698	6526703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251799667
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129134	NC_012914	A	7	7	6527072	6527078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129135	NC_012914	GCA	2	6	6527085	6527090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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129148	NC_012914	CAAA	2	8	6527982	6527989	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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129151	NC_012914	GA	3	6	6528120	6528125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129152	NC_012914	AGCAA	2	10	6528158	6528167	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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129202	NC_012914	CGTA	2	8	6530250	6530257	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129203	NC_012914	ACT	2	6	6530264	6530269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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129228	NC_012914	ACC	2	6	6531381	6531386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129229	NC_012914	AAT	2	6	6531406	6531411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129230	NC_012914	GGAC	2	8	6531412	6531419	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129231	NC_012914	CGG	2	6	6531424	6531429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129232	NC_012914	TGA	2	6	6531506	6531511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129233	NC_012914	CAG	2	6	6531553	6531558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251799671
129234	NC_012914	CTG	2	6	6531592	6531597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251799671
129235	NC_012914	CG	3	6	6531640	6531645	0 %	0 %	50 %	50 %	251799671
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129242	NC_012914	T	7	7	6531985	6531991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129243	NC_012914	GTC	2	6	6532007	6532012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251799672
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129469	NC_012914	CCG	2	6	6544011	6544016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129470	NC_012914	CTT	2	6	6544068	6544073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129471	NC_012914	TCGC	2	8	6544180	6544187	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129472	NC_012914	GTT	2	6	6544370	6544375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129473	NC_012914	CTT	2	6	6544385	6544390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129474	NC_012914	TCC	2	6	6544411	6544416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129475	NC_012914	TTA	2	6	6544425	6544430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129476	NC_012914	TAA	2	6	6544439	6544444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129477	NC_012914	CTT	2	6	6544448	6544453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129478	NC_012914	TGG	2	6	6544523	6544528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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129480	NC_012914	CCT	2	6	6544553	6544558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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129482	NC_012914	ATC	3	9	6544672	6544680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129483	NC_012914	AGG	2	6	6544703	6544708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129484	NC_012914	ATC	2	6	6544759	6544764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129485	NC_012914	GGCT	2	8	6544780	6544787	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129486	NC_012914	GTG	2	6	6544829	6544834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129487	NC_012914	GT	3	6	6544844	6544849	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129488	NC_012914	GTA	2	6	6545007	6545012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129489	NC_012914	GT	3	6	6545014	6545019	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129490	NC_012914	ATG	2	6	6545039	6545044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129491	NC_012914	TCC	2	6	6545065	6545070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129492	NC_012914	CACGA	2	10	6545166	6545175	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
129493	NC_012914	GAC	2	6	6545179	6545184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129494	NC_012914	CAC	2	6	6545192	6545197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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129496	NC_012914	TCC	2	6	6545531	6545536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129497	NC_012914	GCC	2	6	6545656	6545661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129498	NC_012914	GC	4	8	6545663	6545670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129499	NC_012914	AAT	2	6	6545680	6545685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129500	NC_012914	GCT	2	6	6545720	6545725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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