MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus sp. JDR-2 chromosome

Total Repeats: 142585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_012914	GCC	2	6	563061	563066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794511
11502	NC_012914	CTT	2	6	563144	563149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794511
11503	NC_012914	TCC	2	6	563190	563195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794511
11504	NC_012914	GGC	2	6	563196	563201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794511
11505	NC_012914	GAA	2	6	563229	563234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794511
11506	NC_012914	CAA	2	6	563348	563353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794511
11507	NC_012914	ATT	2	6	563373	563378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794511
11508	NC_012914	GCA	2	6	563389	563394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794511
11509	NC_012914	CCG	2	6	563420	563425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794511
11510	NC_012914	GGAG	2	8	563474	563481	25 %	0 %	75 %	0 %	251794511
11511	NC_012914	GCA	2	6	563549	563554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794512
11512	NC_012914	CAGGTT	2	12	563590	563601	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	251794512
11513	NC_012914	GAC	2	6	563607	563612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794512
11514	NC_012914	GCT	2	6	563628	563633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794512
11515	NC_012914	GCA	2	6	563634	563639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794512
11516	NC_012914	GGA	2	6	563640	563645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794512
11517	NC_012914	CGAT	2	8	563693	563700	25 %	25 %	25 %	25 %	251794512
11518	NC_012914	ATGG	2	8	563722	563729	25 %	25 %	50 %	0 %	251794512
11519	NC_012914	GGCTT	2	10	563757	563766	0 %	40 %	40 %	20 %	251794512
11520	NC_012914	TGA	2	6	563804	563809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794512
11521	NC_012914	CGA	2	6	563901	563906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794512
11522	NC_012914	GCCG	2	8	563910	563917	0 %	0 %	50 %	50 %	251794512
11523	NC_012914	CAT	2	6	563970	563975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794512
11524	NC_012914	AGCTGA	2	12	564011	564022	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	251794512
11525	NC_012914	G	6	6	564076	564081	0 %	0 %	100 %	0 %	251794512
11526	NC_012914	ATT	2	6	564116	564121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794512
11527	NC_012914	GAAC	2	8	564183	564190	50 %	0 %	25 %	25 %	251794512
11528	NC_012914	GAT	2	6	564205	564210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794512
11529	NC_012914	TTG	2	6	564263	564268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794512
11530	NC_012914	GAA	2	6	564282	564287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794512
11531	NC_012914	TCG	2	6	564305	564310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794512
11532	NC_012914	TAT	2	6	564337	564342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794512
11533	NC_012914	AGC	2	6	564478	564483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794512
11534	NC_012914	GGC	2	6	564484	564489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794512
11535	NC_012914	GGC	2	6	564508	564513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794512
11536	NC_012914	CGA	2	6	564597	564602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794512
11537	NC_012914	GGC	2	6	564622	564627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794512
11538	NC_012914	CGT	2	6	564645	564650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794512
11539	NC_012914	CGG	2	6	564867	564872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794512
11540	NC_012914	AACAA	2	10	564947	564956	80 %	0 %	0 %	20 %	251794512
11541	NC_012914	AGG	2	6	564967	564972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_012914	AAG	2	6	565015	565020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794513
11543	NC_012914	CAA	2	6	565226	565231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794513
11544	NC_012914	CTG	2	6	565233	565238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794513
11545	NC_012914	GCT	2	6	565248	565253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794513
11546	NC_012914	CAG	2	6	565272	565277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794513
11547	NC_012914	GA	3	6	565384	565389	50 %	0 %	50 %	0 %	251794513
11548	NC_012914	GTG	2	6	565449	565454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794513
11549	NC_012914	CTG	2	6	565461	565466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794513
11550	NC_012914	TTCGC	2	10	565491	565500	0 %	40 %	20 %	40 %	251794513
11551	NC_012914	CCG	2	6	565509	565514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794513
11552	NC_012914	GAAG	2	8	565556	565563	50 %	0 %	50 %	0 %	251794513
11553	NC_012914	GAG	2	6	565620	565625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794513
11554	NC_012914	GCT	2	6	565690	565695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794513
11555	NC_012914	GAG	2	6	565749	565754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794513
11556	NC_012914	GCG	2	6	565848	565853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794513
11557	NC_012914	AT	3	6	565935	565940	50 %	50 %	0 %	0 %	251794513
11558	NC_012914	CGGC	2	8	565966	565973	0 %	0 %	50 %	50 %	251794513
11559	NC_012914	CAG	2	6	566009	566014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794513
11560	NC_012914	GCG	2	6	566176	566181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794513
11561	NC_012914	GCA	2	6	566194	566199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794513
11562	NC_012914	ATCA	2	8	566271	566278	50 %	25 %	0 %	25 %	251794513
11563	NC_012914	CGG	2	6	566281	566286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794513
11564	NC_012914	GTT	2	6	566294	566299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794513
11565	NC_012914	GTAC	2	8	566356	566363	25 %	25 %	25 %	25 %	251794513
11566	NC_012914	T	7	7	566412	566418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_012914	GCT	2	6	566460	566465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794514
11568	NC_012914	CGGC	2	8	566483	566490	0 %	0 %	50 %	50 %	251794514
11569	NC_012914	GTC	2	6	566539	566544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794514
11570	NC_012914	CGC	2	6	566586	566591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794514
11571	NC_012914	GCC	2	6	566861	566866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794514
11572	NC_012914	GCCC	2	8	566914	566921	0 %	0 %	25 %	75 %	251794514
11573	NC_012914	CG	3	6	566965	566970	0 %	0 %	50 %	50 %	251794514
11574	NC_012914	GGC	2	6	566988	566993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794514
11575	NC_012914	GAT	2	6	567015	567020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794514
11576	NC_012914	TCG	2	6	567050	567055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794514
11577	NC_012914	ATA	2	6	567074	567079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794514
11578	NC_012914	GTT	2	6	567085	567090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794514
11579	NC_012914	GATG	2	8	567145	567152	25 %	25 %	50 %	0 %	251794514
11580	NC_012914	CAG	2	6	567160	567165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794514
11581	NC_012914	CAG	2	6	567178	567183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794514
11582	NC_012914	CGG	2	6	567255	567260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794514
11583	NC_012914	CG	3	6	567268	567273	0 %	0 %	50 %	50 %	251794514
11584	NC_012914	GCC	2	6	567301	567306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794514
11585	NC_012914	CGG	2	6	567354	567359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794514
11586	NC_012914	CAT	2	6	567409	567414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794514
11587	NC_012914	AT	3	6	567413	567418	50 %	50 %	0 %	0 %	251794514
11588	NC_012914	CTC	2	6	567419	567424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11589	NC_012914	AATG	2	8	567426	567433	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_012914	GCAT	2	8	567547	567554	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11591	NC_012914	TAT	2	6	567563	567568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_012914	AGATA	2	10	567601	567610	60 %	20 %	20 %	0 %	251794515
11593	NC_012914	ACA	2	6	567672	567677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794515
11594	NC_012914	TTTGT	2	10	567770	567779	0 %	80 %	20 %	0 %	251794515
11595	NC_012914	GAAG	2	8	567792	567799	50 %	0 %	50 %	0 %	251794515
11596	NC_012914	TCGC	2	8	567802	567809	0 %	25 %	25 %	50 %	251794515
11597	NC_012914	GAG	2	6	567811	567816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794515
11598	NC_012914	GA	3	6	567898	567903	50 %	0 %	50 %	0 %	251794515
11599	NC_012914	CTG	2	6	568063	568068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794515
11600	NC_012914	AAC	2	6	568070	568075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794515
11601	NC_012914	GAT	2	6	568078	568083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794515
11602	NC_012914	GCT	2	6	568089	568094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794515
11603	NC_012914	AGCA	2	8	568138	568145	50 %	0 %	25 %	25 %	251794515
11604	NC_012914	AGC	2	6	568160	568165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794515
11605	NC_012914	TA	3	6	568289	568294	50 %	50 %	0 %	0 %	251794515
11606	NC_012914	AAG	2	6	568304	568309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794515
11607	NC_012914	TTA	2	6	568372	568377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794515
11608	NC_012914	GCC	2	6	568393	568398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794515
11609	NC_012914	ACG	2	6	568533	568538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11610	NC_012914	CGC	2	6	568623	568628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11611	NC_012914	AC	3	6	568663	568668	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11612	NC_012914	ACC	2	6	568696	568701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11613	NC_012914	TGC	2	6	568705	568710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11614	NC_012914	TGC	2	6	568911	568916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11615	NC_012914	GCGA	2	8	569030	569037	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11616	NC_012914	GCT	2	6	569061	569066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11617	NC_012914	AGA	2	6	569112	569117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_012914	ATGT	2	8	569172	569179	25 %	50 %	25 %	0 %	251794516
11619	NC_012914	ATCA	2	8	569199	569206	50 %	25 %	0 %	25 %	251794516
11620	NC_012914	GCA	2	6	569215	569220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794516
11621	NC_012914	CAC	2	6	569231	569236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	251794516
11622	NC_012914	GAA	4	12	569305	569316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794516
11623	NC_012914	GAA	2	6	569348	569353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794516
11624	NC_012914	CAT	2	6	569383	569388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794516
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11632	NC_012914	GGC	2	6	569662	569667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794517
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11955	NC_012914	CGG	2	6	583773	583778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794526
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11957	NC_012914	GGA	2	6	583833	583838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11961	NC_012914	TGA	2	6	584019	584024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794527
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11964	NC_012914	CTG	2	6	584152	584157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794527
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11981	NC_012914	A	6	6	585262	585267	100 %	0 %	0 %	0 %	251794527
11982	NC_012914	CGG	2	6	585282	585287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794527
11983	NC_012914	TGCTC	2	10	585335	585344	0 %	40 %	20 %	40 %	251794527
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11985	NC_012914	GC	3	6	585383	585388	0 %	0 %	50 %	50 %	251794527
11986	NC_012914	CGCA	2	8	585394	585401	25 %	0 %	25 %	50 %	251794527
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11989	NC_012914	GAA	2	6	585555	585560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794527
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11991	NC_012914	AGG	2	6	585647	585652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794527
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11994	NC_012914	CGG	3	9	585800	585808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794528
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