MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus sp. JDR-2 chromosome

Total Repeats: 142585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_012914	TAA	2	6	539940	539945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794491
11003	NC_012914	CGT	2	6	539979	539984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794491
11004	NC_012914	CAT	2	6	539988	539993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794491
11005	NC_012914	TTC	2	6	540035	540040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794491
11006	NC_012914	ATC	2	6	540064	540069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794491
11007	NC_012914	ATG	2	6	540134	540139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_012914	ATT	2	6	540178	540183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_012914	TGCA	2	8	540237	540244	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11010	NC_012914	GA	4	8	540392	540399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_012914	CCA	2	6	540421	540426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11012	NC_012914	T	7	7	540460	540466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_012914	CTA	2	6	540527	540532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11014	NC_012914	AG	3	6	540559	540564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_012914	TGCA	2	8	540624	540631	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11016	NC_012914	TAC	2	6	540647	540652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11017	NC_012914	TCA	2	6	540673	540678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11018	NC_012914	GA	4	8	540779	540786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_012914	CCA	2	6	540808	540813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11020	NC_012914	CAC	2	6	540833	540838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11021	NC_012914	AT	3	6	540850	540855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_012914	TCC	2	6	540859	540864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11023	NC_012914	TTC	2	6	540914	540919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11024	NC_012914	TAC	2	6	540958	540963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11025	NC_012914	GA	3	6	541092	541097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_012914	CCA	2	6	541119	541124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11027	NC_012914	ACCACA	2	12	541145	541156	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11028	NC_012914	TCC	2	6	541170	541175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11029	NC_012914	CAAA	2	8	541189	541196	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11030	NC_012914	AG	3	6	541233	541238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_012914	AT	3	6	541287	541292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_012914	ATT	2	6	541300	541305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_012914	GAAT	2	8	541314	541321	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_012914	AGG	2	6	541367	541372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_012914	ATG	2	6	541390	541395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794492
11036	NC_012914	TCG	2	6	541415	541420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794492
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11039	NC_012914	GGA	2	6	541551	541556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794492
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11042	NC_012914	GCT	2	6	541824	541829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794492
11043	NC_012914	CGGC	2	8	541835	541842	0 %	0 %	50 %	50 %	251794492
11044	NC_012914	GCG	2	6	541919	541924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794492
11045	NC_012914	ATT	2	6	541987	541992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_012914	CCG	2	6	542138	542143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794493
11047	NC_012914	CAG	2	6	542209	542214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794493
11048	NC_012914	CAA	2	6	542222	542227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794493
11049	NC_012914	CTTC	2	8	542281	542288	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11050	NC_012914	ATC	2	6	542301	542306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11051	NC_012914	AATA	2	8	542361	542368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_012914	TGA	2	6	542425	542430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_012914	AGG	2	6	542494	542499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_012914	ATGG	2	8	542538	542545	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_012914	CAT	2	6	542563	542568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11056	NC_012914	CAT	2	6	542572	542577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11057	NC_012914	CATG	2	8	542738	542745	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11058	NC_012914	CAG	2	6	542749	542754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11059	NC_012914	TTC	2	6	542790	542795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11060	NC_012914	AAC	2	6	542872	542877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11061	NC_012914	ACA	2	6	542924	542929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11062	NC_012914	CATGG	2	10	542932	542941	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11063	NC_012914	CAG	2	6	543000	543005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11064	NC_012914	GCG	2	6	543029	543034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_012914	GTA	2	6	543077	543082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794494
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11068	NC_012914	TCC	2	6	543189	543194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794494
11069	NC_012914	ATC	2	6	543207	543212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794494
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11075	NC_012914	CGG	2	6	543466	543471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794494
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11082	NC_012914	CAG	2	6	543868	543873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794495
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11084	NC_012914	GAA	2	6	543895	543900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794495
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11086	NC_012914	CGT	2	6	543985	543990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794495
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11092	NC_012914	ATA	2	6	544205	544210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794495
11093	NC_012914	CTC	2	6	544214	544219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11094	NC_012914	CTA	2	6	544267	544272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11095	NC_012914	TCTAC	2	10	544291	544300	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11096	NC_012914	TCCC	2	8	544378	544385	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11097	NC_012914	GTA	2	6	544395	544400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_012914	AAT	2	6	544410	544415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_012914	GATG	2	8	544439	544446	25 %	25 %	50 %	0 %	251794496
11100	NC_012914	CTT	2	6	544503	544508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794496
11101	NC_012914	GTCA	2	8	544601	544608	25 %	25 %	25 %	25 %	251794496
11102	NC_012914	ATG	2	6	544672	544677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794496
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11105	NC_012914	TCT	2	6	544886	544891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794496
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11107	NC_012914	TTC	2	6	545027	545032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794496
11108	NC_012914	GAGCTG	2	12	545040	545051	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	251794496
11109	NC_012914	GTTT	2	8	545089	545096	0 %	75 %	25 %	0 %	251794496
11110	NC_012914	AGC	2	6	545149	545154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794496
11111	NC_012914	GCAG	2	8	545156	545163	25 %	0 %	50 %	25 %	251794496
11112	NC_012914	CGG	2	6	545167	545172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794496
11113	NC_012914	T	8	8	545282	545289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_012914	CGG	2	6	545330	545335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11115	NC_012914	ATTTT	2	10	545344	545353	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_012914	TAA	2	6	545377	545382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_012914	ATA	2	6	545416	545421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_012914	AAGG	2	8	545432	545439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_012914	TTA	2	6	545558	545563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794497
11120	NC_012914	GCA	2	6	545613	545618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794497
11121	NC_012914	CTG	2	6	545644	545649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794497
11122	NC_012914	GCT	2	6	545668	545673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794497
11123	NC_012914	TGTA	2	8	545712	545719	25 %	50 %	25 %	0 %	251794497
11124	NC_012914	CGC	2	6	545897	545902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794497
11125	NC_012914	CAT	2	6	545932	545937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794497
11126	NC_012914	GCT	2	6	545955	545960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794497
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11128	NC_012914	GCT	2	6	546117	546122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794497
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11131	NC_012914	ATCG	2	8	546267	546274	25 %	25 %	25 %	25 %	251794497
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11144	NC_012914	A	7	7	546833	546839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11147	NC_012914	GTG	2	6	546975	546980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11151	NC_012914	A	6	6	547084	547089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11152	NC_012914	AGC	2	6	547129	547134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11156	NC_012914	CCGA	2	8	547260	547267	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11157	NC_012914	AGA	2	6	547268	547273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11158	NC_012914	TCT	2	6	547295	547300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11159	NC_012914	GAG	2	6	547357	547362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11226	NC_012914	GAGAC	2	10	550240	550249	40 %	0 %	40 %	20 %	251794502
11227	NC_012914	CAAA	2	8	550292	550299	75 %	0 %	0 %	25 %	251794502
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11232	NC_012914	GGC	2	6	550415	550420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794502
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11235	NC_012914	GAAG	2	8	550515	550522	50 %	0 %	50 %	0 %	251794502
11236	NC_012914	GCT	2	6	550530	550535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794502
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11240	NC_012914	GTAG	2	8	550695	550702	25 %	25 %	50 %	0 %	251794502
11241	NC_012914	CGG	3	9	550738	550746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794502
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11243	NC_012914	GTAT	2	8	550777	550784	25 %	50 %	25 %	0 %	251794502
11244	NC_012914	GTT	2	6	550796	550801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794502
11245	NC_012914	GCA	2	6	550808	550813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794502
11246	NC_012914	CTT	2	6	550815	550820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794502
11247	NC_012914	GAAG	2	8	550844	550851	50 %	0 %	50 %	0 %	251794502
11248	NC_012914	CCG	2	6	550852	550857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794502
11249	NC_012914	CAT	2	6	550889	550894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794502
11250	NC_012914	TTA	2	6	551008	551013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794502
11251	NC_012914	GGC	2	6	551046	551051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794502
11252	NC_012914	TTA	2	6	551110	551115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794502
11253	NC_012914	CCT	2	6	551137	551142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11254	NC_012914	GCA	2	6	551265	551270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11255	NC_012914	GAAG	2	8	551390	551397	50 %	0 %	50 %	0 %	251794503
11256	NC_012914	GCG	2	6	551415	551420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794503
11257	NC_012914	T	7	7	551438	551444	0 %	100 %	0 %	0 %	251794503
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11260	NC_012914	CGC	2	6	551529	551534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794503
11261	NC_012914	CATG	2	8	551570	551577	25 %	25 %	25 %	25 %	251794503
11262	NC_012914	CGC	2	6	551628	551633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794503
11263	NC_012914	TCA	2	6	551750	551755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794503
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11265	NC_012914	TTTGC	2	10	551873	551882	0 %	60 %	20 %	20 %	251794503
11266	NC_012914	TGGA	2	8	551953	551960	25 %	25 %	50 %	0 %	251794503
11267	NC_012914	AGA	2	6	552000	552005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794503
11268	NC_012914	GCG	2	6	552007	552012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794503
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11273	NC_012914	CGA	2	6	552230	552235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794503
11274	NC_012914	ACA	2	6	552289	552294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11275	NC_012914	GC	3	6	552310	552315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11276	NC_012914	TCT	2	6	552391	552396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794504
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11282	NC_012914	AAT	2	6	552580	552585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794504
11283	NC_012914	GAGC	2	8	552605	552612	25 %	0 %	50 %	25 %	251794504
11284	NC_012914	GTT	2	6	552644	552649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794504
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11289	NC_012914	AAG	2	6	552770	552775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794504
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11300	NC_012914	CGC	2	6	553228	553233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794504
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11304	NC_012914	GA	3	6	553485	553490	50 %	0 %	50 %	0 %	251794504
11305	NC_012914	GCG	2	6	553507	553512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794504
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11309	NC_012914	TGT	2	6	553668	553673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11310	NC_012914	AGG	2	6	553687	553692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11311	NC_012914	GCTG	2	8	553708	553715	0 %	25 %	50 %	25 %	251794505
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11317	NC_012914	TGCT	2	8	554047	554054	0 %	50 %	25 %	25 %	251794505
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11321	NC_012914	CGTTA	2	10	554354	554363	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11322	NC_012914	A	7	7	554382	554388	100 %	0 %	0 %	0 %	251794506
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11343	NC_012914	T	6	6	555456	555461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11344	NC_012914	TGC	2	6	555520	555525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11346	NC_012914	TGC	3	9	555710	555718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11348	NC_012914	TGC	2	6	555787	555792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11351	NC_012914	GC	3	6	555923	555928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11352	NC_012914	AACT	2	8	555941	555948	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11353	NC_012914	CTG	3	9	555979	555987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11354	NC_012914	TGC	2	6	556003	556008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11355	NC_012914	AT	3	6	556021	556026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11356	NC_012914	TGC	2	6	556055	556060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11357	NC_012914	GCA	2	6	556161	556166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11358	NC_012914	GC	3	6	556192	556197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11359	NC_012914	AACT	2	8	556210	556217	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11360	NC_012914	CTG	3	9	556248	556256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11361	NC_012914	TGC	2	6	556272	556277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11362	NC_012914	AT	3	6	556290	556295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11363	NC_012914	TGC	2	6	556324	556329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11364	NC_012914	TCA	2	6	556361	556366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11365	NC_012914	GC	3	6	556460	556465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11366	NC_012914	GGC	2	6	556466	556471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11367	NC_012914	TAAT	2	8	556480	556487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11368	NC_012914	TGC	2	6	556501	556506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11369	NC_012914	CAG	2	6	556524	556529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11370	NC_012914	TCA	2	6	556654	556659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11371	NC_012914	A	7	7	556711	556717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11372	NC_012914	AAAG	2	8	556793	556800	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11373	NC_012914	GAA	2	6	556909	556914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794507
11374	NC_012914	GAA	2	6	556966	556971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794507
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11474	NC_012914	TG	3	6	561427	561432	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11476	NC_012914	AG	3	6	561499	561504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11477	NC_012914	GA	3	6	561509	561514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11478	NC_012914	CAT	2	6	561515	561520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794511
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11484	NC_012914	TGGG	2	8	561951	561958	0 %	25 %	75 %	0 %	251794511
11485	NC_012914	ATCCGC	2	12	562029	562040	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	251794511
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11487	NC_012914	ATT	2	6	562119	562124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794511
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11489	NC_012914	TGC	2	6	562219	562224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794511
11490	NC_012914	ATG	2	6	562237	562242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794511
11491	NC_012914	CTG	2	6	562269	562274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794511
11492	NC_012914	GCCG	2	8	562337	562344	0 %	0 %	50 %	50 %	251794511
11493	NC_012914	ACGG	2	8	562547	562554	25 %	0 %	50 %	25 %	251794511
11494	NC_012914	CGG	2	6	562639	562644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794511
11495	NC_012914	CTG	2	6	562740	562745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794511
11496	NC_012914	CCGT	3	12	562877	562888	0 %	25 %	25 %	50 %	251794511
11497	NC_012914	AACG	2	8	562944	562951	50 %	0 %	25 %	25 %	251794511
11498	NC_012914	AG	3	6	562968	562973	50 %	0 %	50 %	0 %	251794511
11499	NC_012914	GCC	2	6	562987	562992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794511
11500	NC_012914	GCC	2	6	563010	563015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794511

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